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NECEvent2014_3_4_scaffold_327_16

Organism: NECEvent2014_3_4_Clostridium_butyricum_28_15

near complete RP 52 / 55 MC: 2 BSCG 50 / 51 MC: 4 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: 15505..17352

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
O-antigen polymerase n=1 Tax=Clostridium butyricum DKU-01 RepID=M8K9I6_CLOBU similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 98.7
  • Coverage: 615.0
  • Bit_score: 1203
  • Evalue 0.0
  • rbh
WsaB {ECO:0000313|EMBL:KJZ84809.1}; TaxID=1523154 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium sp. IBUN125C.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 98.7
  • Coverage: 615.0
  • Bit_score: 1198
  • Evalue 0.0
O-antigen ligase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 53.7
  • Coverage: 616.0
  • Bit_score: 671
  • Evalue 2.90e-190

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sp. IBUN125C → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1848
ATGGAAAACTTAAAGAAATTCTGTAAGGAAAAATCAATAACATTTTTCTTTCCTATTGCACTTGTTCTGACAATCGTACCTTTAATTGTGCGTATGAGAATATCTGAACCTGATGAAGATACATTAAAATTATACGGTTCTAGTGCAAATTCAGATTTATTTACTCAAAATAAAGAAATCTGTTTAATCTTTCTATCTGCAATAATTTTGATTATTGCCATAACATGTTTCAAAAAATTCTACGAGAAAAAAGATAAATTAATCAATATAATGATAATTTGTTCTTTAATTTTTCTTGGTTTCACTTTCTTATCAACATTATTCTCAAAATATAAGCACGTTGCTTTTTGGGGAATATATGACAGATCAGAAGGTTTTATAACAATAGCATGTTATATTCTTTTATTCATATACTCAATTTATACTTTTAAAAAGACTGAGGAATTTAAGTTTATACTTATACCTATTCTTATTTTAGTTTATATCAATGGTTTCTTAGGTCTATTCCAATATTTTGGCTCTGACTTAATAAAAACAAGTTTAGGTGGATTAATTGCTATTCCTAGTTCTTATAATATTGATCCTAGTAAATTATCCCTTGCATATGAATCAGGTACTATTTATGGTACTCTATACCACTACAATTATGTAGGAAGCTTTACAGCCCTTGTATTGCCTATTTTATTCGGTGCATGCGTTATAGAAGATGACATATTCTTAAAACTTCTTTCTATGGGTGGCTGTGTTACTGGTTTATGGCTTCTATTCGGAAGTACATCCCGTGCTGGTCTAATAGGATTTGGTGCAATAATTGTTTTTGCATGTATATTCTTTGGTAAATTACTATTAAAGAAGAAAAAAGCAATTCTTATTACAATTGCATGTTTAGCAGTATTTACTGTAGGTTTAAACTTTGCAACAAGCGGAAAAATATTCAATAGAATACCTAGTTTAGTTGCTGATGGATTAAGTTTATTTAAAAGCAATACAGATTTTGATTACAGAGATCATATTCCTGTAAAAAATATAGAACATATAGATAATAATATTGTGCTAACATTACCTACAGATACCTTAACAATATCTTTTGAAAACAATGATTATGTATTTAGAAATTCTACAAATGAAGTTGTAGATTATAAATCAGAATTTAATTCAAAAATTAAAGCATATGATTATATTACAACAGATGCTAATTTCTCTAATATTTCATTTAGATCTGGTAAGATAAAGTCAAAGACAAAAAATGATGGTCTTATGCTTATATTAAATGGAAATTCTAGTGAATTCATGTTTATAACAAGAGATGATAATAGTATGCATTTAATAGATCCTAAAACATTAGAAGAAATTGATTTAGAGTTCCCTGAAACTATAGGATTTAACGGAAAAGAAAAACTAGCATCTGCAAGAGGATACATATGGTCAAGATCACTTCCATTACTAAAAGATACACTTATCTTAGGTTCTGGTCCTGATACTTTCTCATTTGATTTCCCTCAGCATGATATGTTAGGTAAGCTTTACGCTTATGGAACTACTAATATGATTATAAGTAAGGCCCATAACTTATTCCTTCAAATTGGACTTAATAATGGTGTTGTTGCCTTGATTGCTTTTGTTATATTAATAATGGTTTATATTGTTGATAGCTTTAAGTTATACGCATTAAAAAATAAATATGACGAAAAACAAATTCTTGGATCAATTCTTGCCTTAAGTGTTATAGGTTACTTATTTACAGGTTTATTCAATGACTCAGTAATATGTGTAGCTCCTATATTCTGGATTATACTCGGAGTAGGTGCCGCAGTTAACTTTATAAATAAAAAAGCTGAAAATAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 616
MENLKKFCKEKSITFFFPIALVLTIVPLIVRMRISEPDEDTLKLYGSSANSDLFTQNKEICLIFLSAIILIIAITCFKKFYEKKDKLINIMIICSLIFLGFTFLSTLFSKYKHVAFWGIYDRSEGFITIACYILLFIYSIYTFKKTEEFKFILIPILILVYINGFLGLFQYFGSDLIKTSLGGLIAIPSSYNIDPSKLSLAYESGTIYGTLYHYNYVGSFTALVLPILFGACVIEDDIFLKLLSMGGCVTGLWLLFGSTSRAGLIGFGAIIVFACIFFGKLLLKKKKAILITIACLAVFTVGLNFATSGKIFNRIPSLVADGLSLFKSNTDFDYRDHIPVKNIEHIDNNIVLTLPTDTLTISFENNDYVFRNSTNEVVDYKSEFNSKIKAYDYITTDANFSNISFRSGKIKSKTKNDGLMLILNGNSSEFMFITRDDNSMHLIDPKTLEEIDLEFPETIGFNGKEKLASARGYIWSRSLPLLKDTLILGSGPDTFSFDFPQHDMLGKLYAYGTTNMIISKAHNLFLQIGLNNGVVALIAFVILIMVYIVDSFKLYALKNKYDEKQILGSILALSVIGYLFTGLFNDSVICVAPIFWIILGVGAAVNFINKKAENK*