ggKbase home page

NECEvent2014_4_2_scaffold_6_68

Organism: NECEvent2014_4_2_Clostridium_butyricum_28_558

near complete RP 52 / 55 MC: 2 BSCG 50 / 51 MC: 4 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: comp(80497..82260)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Integral membrane sensor signal transduction histidine kinase n=1 Tax=Clostridium butyricum DKU-01 RepID=M8KH14_CLOBU similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.3
  • Coverage: 587.0
  • Bit_score: 1159
  • Evalue 0.0
  • rbh
Histidine kinase {ECO:0000313|EMBL:KHD16388.1}; TaxID=1492 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium butyricum.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.5
  • Coverage: 587.0
  • Bit_score: 1160
  • Evalue 0.0
multi-sensor signal transduction histidine kinase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 31.2
  • Coverage: 608.0
  • Bit_score: 311
  • Evalue 7.30e-82

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium butyricum → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1764
ATGAAAATTAATAGAGATTTATCAATAAAAAAACTAACTTTACTTATATTTTTATCAATATATATTATATTTTTAATAGTTACAGCTGTAAACTTATACTCTTATTCTAGGTATGAATTTAATAAAACAGAAAAGTTAATAAAAAACTTTAATTTAAGTTTAAGTACTCAAATTACTCAAAAACTTGACAATATAATTGACGTCTCAAAATATCCATTAATAATACCTGATATAGAAAAGCTTAACACTACACTATCTAATAATAATACTTATGATATAGAACAATATAATTATCTACTATATTTATGTGATATGATGCTTATTCAAAATAAGACTATAAATGGAGCTTACATATTCAATTTAAATGGAAATGGCGTATATACTGCTCGAAATAATAATAATGATTTATTAAAAAATCCATTTCATGAAAAGTGGTTTAACACTGCTGTAGATTCTTCAAATCAGGTTGAGATTTTCTCAAACTTTAATGCAACTAATGTTTTTAGGGATACAACTAAAAATGATGAAAGCTTAATTGCTATAACAAGAAAAATAATTGATATAAAATCACAAAAGACTACTGGAATTTTACTACTTACATTTTCTACAGATGAACTACTGTCATTGCTGACTTCAGATATTCCTTTTAATAATGAATCTGTTTATCTGTATGATTCTGAAAATAATTTAATAATTGGTACAGATGATGCTGAACACCAATATAATTACTCTGAATATATTGATCAAAGCAGTACTGTTCCTGAACTAGTTTATTCTAAAGATAATGAAAAACATATAGTATGCTATAATAACTTGCAATCATCCGATTGGACAATCATAAATACAATTCCAAAAGATGATGCTTATCATATTGATGTATTATATTTACTTTTCTTCTTAAGTAATTTAATTTTTTGCTTAATATTATTTATTGTAATTTATCTATTTTTCTTAAATAGAATATTCAATCCAATAAAATCACTTATTGAAAATATGGGAAGTAAAGTTGAAACTAACTTGAATTACAACTTCGCTTATAATAAAAATGATGAAATAGGGATACTAATTAATTCTTATAATGATATGAAAACTAGAATAAACACTTTAATTACTATAAATTATAAAAATCAAATAGAACAAAAAGAATTAGAGTTAAAACAACTACAAAATCAAATTAATCCTCATTTTATATATAATACATTAGAATCTATACACATGATGGCTGAAATAAATGATGATCCTGAAACTTCAACAATGGCAGAATATTTTGGAACTATAATTAGATATAGTATGAATAGGCGTATTAATACAGTTAAATTAAAAGATGAAATTGAAATAATAAATAACTACATCTACCTTCAAAGAATTCGCTTTGATTCTTTATTCACAATTGAAAATCTTGTTACTGATGATGTTCTTAATTGTGAAATAATAAAAATGATAATTCAGCCTTTAATTGAAAATTCAATATACCATGGATTAAGCGAATGTGATGGAAATGGTAAAATAATTATTCAAGCTTTAAAATCCAATGATAATTTAATAATTACTGTCTCTGATAATGGAATTGGAATCGATGATAAAACACTTGAATCTTTAAATGATTATATTAATGATAAAAATGAACTTTTTAATGGAATTGCTTTAAGAAATATAAACAAACGTTTAAAACTTAATTATGGAGAAGAATATGGTCTTGAAATAACAAGTATACTTGGAAAAGGAACCTCTATGATACTTACCATTCCTTATATAATTAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 588
MKINRDLSIKKLTLLIFLSIYIIFLIVTAVNLYSYSRYEFNKTEKLIKNFNLSLSTQITQKLDNIIDVSKYPLIIPDIEKLNTTLSNNNTYDIEQYNYLLYLCDMMLIQNKTINGAYIFNLNGNGVYTARNNNNDLLKNPFHEKWFNTAVDSSNQVEIFSNFNATNVFRDTTKNDESLIAITRKIIDIKSQKTTGILLLTFSTDELLSLLTSDIPFNNESVYLYDSENNLIIGTDDAEHQYNYSEYIDQSSTVPELVYSKDNEKHIVCYNNLQSSDWTIINTIPKDDAYHIDVLYLLFFLSNLIFCLILFIVIYLFFLNRIFNPIKSLIENMGSKVETNLNYNFAYNKNDEIGILINSYNDMKTRINTLITINYKNQIEQKELELKQLQNQINPHFIYNTLESIHMMAEINDDPETSTMAEYFGTIIRYSMNRRINTVKLKDEIEIINNYIYLQRIRFDSLFTIENLVTDDVLNCEIIKMIIQPLIENSIYHGLSECDGNGKIIIQALKSNDNLIITVSDNGIGIDDKTLESLNDYINDKNELFNGIALRNINKRLKLNYGEEYGLEITSILGKGTSMILTIPYIIN*