ggKbase home page

NECEvent2014_4_3_scaffold_160_2

Organism: NECEvent2014_4_3_Clostridium_perfringens_28_16

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 MC: 2 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: 1226..3982

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
UPF0182 protein CPF_0011 n=1 Tax=Clostridium perfringens (strain ATCC 13124 / NCTC 8237 / Type A) RepID=Y011_CLOP1 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 918.0
  • Bit_score: 1818
  • Evalue 0.0
  • rbh
UPF0182 protein CPF_0011 {ECO:0000255|HAMAP-Rule:MF_01600}; TaxID=195103 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium perfringens (strai similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 918.0
  • Bit_score: 1817
  • Evalue 0.0
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 918.0
  • Bit_score: 1817
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium perfringens → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2757
TTGAAAAATAAGATACTTAATACAGTTCTTATTAGTATCTTACTTCTAGTTGTAGTTTTTTTCGTTTCAACTAATTTTATTATTAATGTTCAATGGTTTAAGGAAGTAGGATATTTAAATGTATTTTTTACTAAGCTTATAGCTATATGTAAGTTATTTGTACCTATATTTATTTTATATTTTTGTGTAATAGCTATATATTTATTTACTTTGAGAAAAAGTATTAGAAGCTTGGTAGGTGATACTAAGTTTAAGTCAGTTAAGAAGTACTTTTTATTATCAAATTTAGTAATATCAATATTAGGAGCTGGAGCTACTGCCACAACTCAGTGGTATAAAATTCTTCAATTTACTAATGCGGTTCCTTTTGGAGAAGTAGATCCTATTTTTAATAAGGATATATCTTTTTATGTTTTTAAATTACCTTTAGTACAGTCTCTTTTTAGTACAGCTATTTCCCTAATAATTATTTTAGTTCTTATAACAGTTATTATATATTTAGCTTTAGGATTTAAAGATAAAATTTATCAAAACAAGGATAACGTTATAAATATAAATAGTAAAACTTATGGAATAAGAAAGTTTGCAGGAAAACAACTAGCAGTTTTGGCTTCAGTATTATCCCTGCTTATAGGGTGTAGCTATTTATTAAAGTCATATAATTTAGTTTATAGTACTAGAGGAGTATCCTATGGAGCTGGTTATACAGATGTTAAAATAACAATGATATTTTATAAGGTTATAGCTGTAGCTTGTGTAATATCTTCAATAGTAGTTTTTATTTCAATTTTAAAGCTTAAATTTAGACCTATTATAATATCAATTGCATCAATTGCTGTACTTATTGTTTTAGAGCCTGTAGTAGCCATTTTTACTCAACAGTTTGTAGTTAAACCAAATGAAATGGAACTTGAAAAACCTTATATTTCATATAGTATTGATGCTACTAAAAAGGCTTTTAATATTGATGAGATTGAAGTTAAAGAAATGGAACCAAACGAGAATATAACTAGTGAAAAATTAGAAGATAATAAAGATATCATTGAAAACCTAAAGGTTAATTCAACAGGACCTTTATTAAGTTTTTATCAGCAAGTTCAACTTATAAAAAATTATTATGAATTTAATGATGCTGATACAGATAGATATAATATAAATGGTAAATATACGCAAGTATTTGTATCTCCAAGGGAAATAAACAGAGATTCTATGACTACATGGCAAAATAAGCATCTTAGATATACCCATGGGTATGGTTTAGCTATGAGTAGGGTTAATAGTGTAACAGAATTTGGACAACCTGACTTTGTTATGAAAGATATACCAACAGTAAATACAACAGATATTAATCTTGAAAATCCAAGAATTTATTTTGGAGAAAGTGATAATGATTATGTTATTGTAAATACTGAAGGGGGAGAGTTTGACTATCCAACAGGAGATACAGAAAATACATTTAACTATAATGGAACTGGTGGATTAAAGATGACACCTTTTAATAGAGTGTTATTTAGTATTTATGAAAGAAATCCTAAAATATTAATGTCTAGTTCCATAACTTCAGAAAGTAGAATAATTCTTAATCGTAATATAGTTAAGAGGGTTCAAGAAATAGCTCCGTTTTTAACTTATGATAGTGATCCATATATAGTAGTTCATGATGGAAGATTGGTTTGGATGATGGATGCATATACATCAACAGATAAGTACCCATTTTCAGAGCCTCATGAAGGAGTAAACTATATAAGGAATTCAGTTAAGGTTGTGGTTGATGCTTTTAATGGAAATGTAGATTTTTATGTAACAGATGAGAATGACCCTATAATTAATTGTTATTTAAAAATATATAAAGGTTTATTTAAGCCTTTATCAGAAATGCCAGAGGATTTAAAGGAGCATTTTAGATATCCTCAAGACTTATTTGAATTACAAAGTAAGGTATTAACAAAATATCATGTAGATGATCCTATTAAACTATTTACTGAGGAAGATTTATGGGATAGATCACTAGAGGTTGTTAAGCATGGAGGAGAGAACCTAAGTCAAGGAGATGAAGGTAAGGAAGAATCTATTCTTAATAAGGCAAAAGAAAATAAAAATAATGAAGCTGAAAATGAAGGCCTTTATCTTATGACGAAATTACCTGATGAAGAAAATGTTGAAATGATGCTTTTAGATTATTTTAATATGAGAGGTAAACAAAGTATGGTAGCACTTTTAGGAGCTAGAATGGATGGAGATAACTATGGAGAACTAGTTATGTATAAATTCCCTCCTCAAAGAACTATATATAGTCCAATTTTATTCAAGAATAGAATACAACAGGATCCTAACATTTCTAAGGAAATAAGTCTTTGGGCTGGAAAAGGATCAGAGGTTATATATGGTGATATAATTATTGTTCCTATAGAAGATTCATTACTATATTTAAATACAATTTATTTAAAGGCAAATTCAGAAAATAGTATGCCTGAGATGAAAAGAGTAATTCTTTCTAATGGAGATAAAATAGTTATAGAAGAAAATATAGAAAAGGCACTTTTAAAGCTATTTAATTATAGTTCATCTGAAGAGAATAAAAACTCAAATAAGGATGAAACTCCTAAGAATGAAATAACTTCAGATAACAGTGGAATAAAAGAAGCTGCTGATTTATTTAATAAAGCTATAGAGGCTCAAAAAAATGGTGACTGGGCAACTTATGGAGAGTTTATAAATAAATTAGGGGATATTCTAAACAAAATGTCACAAGAGTAA
PROTEIN sequence
Length: 919
LKNKILNTVLISILLLVVVFFVSTNFIINVQWFKEVGYLNVFFTKLIAICKLFVPIFILYFCVIAIYLFTLRKSIRSLVGDTKFKSVKKYFLLSNLVISILGAGATATTQWYKILQFTNAVPFGEVDPIFNKDISFYVFKLPLVQSLFSTAISLIIILVLITVIIYLALGFKDKIYQNKDNVININSKTYGIRKFAGKQLAVLASVLSLLIGCSYLLKSYNLVYSTRGVSYGAGYTDVKITMIFYKVIAVACVISSIVVFISILKLKFRPIIISIASIAVLIVLEPVVAIFTQQFVVKPNEMELEKPYISYSIDATKKAFNIDEIEVKEMEPNENITSEKLEDNKDIIENLKVNSTGPLLSFYQQVQLIKNYYEFNDADTDRYNINGKYTQVFVSPREINRDSMTTWQNKHLRYTHGYGLAMSRVNSVTEFGQPDFVMKDIPTVNTTDINLENPRIYFGESDNDYVIVNTEGGEFDYPTGDTENTFNYNGTGGLKMTPFNRVLFSIYERNPKILMSSSITSESRIILNRNIVKRVQEIAPFLTYDSDPYIVVHDGRLVWMMDAYTSTDKYPFSEPHEGVNYIRNSVKVVVDAFNGNVDFYVTDENDPIINCYLKIYKGLFKPLSEMPEDLKEHFRYPQDLFELQSKVLTKYHVDDPIKLFTEEDLWDRSLEVVKHGGENLSQGDEGKEESILNKAKENKNNEAENEGLYLMTKLPDEENVEMMLLDYFNMRGKQSMVALLGARMDGDNYGELVMYKFPPQRTIYSPILFKNRIQQDPNISKEISLWAGKGSEVIYGDIIIVPIEDSLLYLNTIYLKANSENSMPEMKRVILSNGDKIVIEENIEKALLKLFNYSSSEENKNSNKDETPKNEITSDNSGIKEAADLFNKAIEAQKNGDWATYGEFINKLGDILNKMSQE*