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NECEvent2014_4_3_scaffold_243_5

Organism: NECEvent2014_4_3_Clostridium_perfringens_28_16

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 MC: 2 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: comp(2056..4383)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
GGDEF/EAL domain-containing protein n=1 Tax=Clostridium perfringens F262 RepID=H7CS42_CLOPF similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 775.0
  • Bit_score: 1517
  • Evalue 0.0
  • rbh
GGDEF/EAL domain-containing protein {ECO:0000313|EMBL:EIA18531.1}; TaxID=883064 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium perfringens similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 775.0
  • Bit_score: 1517
  • Evalue 0.0
diguanylate cyclase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 99.1
  • Coverage: 775.0
  • Bit_score: 1504
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium perfringens → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2328
ATGACGCATAGACCTATGCTCAATAAGATAAAACTTTTTTTTATAGTTCAAATTATATTAAGTTTTTTAGTTTTGGCAGGAACATTACTTTCTATATTGGTAATACCATCACACTTACCAGACTACTTTATATGGGCCATAGCCTTTTCATTTTGGGTTTTTCAATGTGGCTTTAGTACAATCTTTGCATTTAGATATAGAATTTCTAAAAGTTCTCTAAGCACCATAAAATTAAGCTTTATATTAATTGGAAGCATACAAATTTTAATAACCTTAGCAACAAACTTGTTTGGTATATTTGACCTTCCAATTTTTAATACACTAATAATAAAAAACTTTCAATTTTTAATATTATCATTAATATTTATTGTAATGATTTATAAACTTATAAAAGATATGCTTAAGTATAGGGTTTTAAAGGATTATATTATTCGTGATTCATTTTTTACCTTTATACCTTTTGCTTTTATTATTTATAAAAATTCTAAATACTTTATATCTTCAATATATTTCTTAGATGATTCAGTATATAGTTTGGCTCTATTAAATATAAACAGCTTAAGGATTTTTTTAGAAGGATTTCTTATTATATTGATCTTTGTAAAAACTATTTATTTAAGAGGAAATAAAAAAAGTAGCTTTCTATTATTAATATATTTTTATGTCTCAAATCTTAACTGCTATATAATCTCATATTTTAATAGCAAGTTACTTTTTTCTCATTATTTATATCAAGGTATTGGAATCTACTTTATATGTCCAATATTATTAATGCTTTCTATATATTATTCAATTACAGAACAAGAAAAAGCTCCAGATCAAGTGCTATTTGATGATTCCTATATGAATATAAATAACTCATGGATAAGTATTACTATTGGAATTTTCCCAGTATCCTTTTCAGCTATAGATATAATTGCATCCTCTATAGCAAGTGGTGATTTTAACGGCATAGAAAGCTTAGTAATTATACTTCTTGTTATGATTTTACTAGTATGTAGAGATGTTATATTAAGAAAAGATAATCTAAGATTAATTGAAAGTGTTAAGAGGGCTAATGAAATAGATTTTTTAACTAATATGTATAGTAGAAATTATTTTTTAAAGAAACTTGAAACCATAAATACTGATTATGCACTTTTCTTTATAGATATAAAGAGCTTTAAGGACATTAATAATATTTTTGGACATGTTGTTGGTGATAAGGTATTAGTAGAAGTTGCAAATAAATTTAAAGAACTTAAACTACTTCTAGGTAAAAATGTTTTCTACTGTAGATATAGCGGAAATGAATTTGCCTTAATCTCTAAATTAGATCAAGTTGATCTTATATTAAAATTTTTTAGAGACCTTGAAAATATAAAATTTCAACATAACTCTGATTTAATACATATAAACTTTAATATTGGATATTCATTAAATGATTCAAATATTAACTTAGACTTACTAATTCAAGAAACAGATTATGCTCTAATGAGAGCTAAGAAGCTTAAAGGTCCTAATAACTCTATACTTATGTATGATGATAATTTAAAAACTGATTTAGAACATATGAATATATTAAAAAAGGATTTTAAAAATGATCTTTTAACAGGCAAGTTTCATTTAGTCTTCCAACCTAAAGTTTGCGTAAAAACATTAAAAATAGTAGGTTTTGAAACTCTACTTCGTTGGAAACATGATAAACTAGGTGAAATTTCTCCTTGTAAGTTTGTACCTATAGCTGAAAACTTAGGTGAAATTTCTTCCCTTGACTTATATGTTTTTAAAAAGTCCTGTGAATTTCAAAGATGCTTAATAGATAAGGGGATAAAATTAAAGTGTAGTGTAAATTTATCCTTAAACACTTTAAAATCCTATGAAAAAATCAATGAAATTCTAAATATTTATAAAGAATATAAAATTCCAAAACATTTAATAACAGCAGAAATATTAGAAAATGTATCACTAAATAATAATGCTAAAACAATCTCTTATATTAATCTTCTTAGAGAAAATGGAATTTGTATATCCATAGATGACTTTGGTACAGGCTATTCTTCTCTTAGCCAAATATCTAATCTGTATTTTGATGAATTAAAGATTCCAAGAGAGTTTGTAATAGATGCAAGAACCCCTAGTAAATTAGCTGTTATTGAAGCAATATCTATATTAGCCAAAAAATTAAAGGTAACCTCTGTTATTGAAGGGGTAGAAAATTATGAGGACTTCAAATTATTTAGTAGTTTAGGATTTGATATTGTTCAAGGATATTATTTCTCTAAACCCTTAACTAAATCTGAAATAATAGATTATATAAAAGTTAATATTAATAACAAAATAAGCTAG
PROTEIN sequence
Length: 776
MTHRPMLNKIKLFFIVQIILSFLVLAGTLLSILVIPSHLPDYFIWAIAFSFWVFQCGFSTIFAFRYRISKSSLSTIKLSFILIGSIQILITLATNLFGIFDLPIFNTLIIKNFQFLILSLIFIVMIYKLIKDMLKYRVLKDYIIRDSFFTFIPFAFIIYKNSKYFISSIYFLDDSVYSLALLNINSLRIFLEGFLIILIFVKTIYLRGNKKSSFLLLIYFYVSNLNCYIISYFNSKLLFSHYLYQGIGIYFICPILLMLSIYYSITEQEKAPDQVLFDDSYMNINNSWISITIGIFPVSFSAIDIIASSIASGDFNGIESLVIILLVMILLVCRDVILRKDNLRLIESVKRANEIDFLTNMYSRNYFLKKLETINTDYALFFIDIKSFKDINNIFGHVVGDKVLVEVANKFKELKLLLGKNVFYCRYSGNEFALISKLDQVDLILKFFRDLENIKFQHNSDLIHINFNIGYSLNDSNINLDLLIQETDYALMRAKKLKGPNNSILMYDDNLKTDLEHMNILKKDFKNDLLTGKFHLVFQPKVCVKTLKIVGFETLLRWKHDKLGEISPCKFVPIAENLGEISSLDLYVFKKSCEFQRCLIDKGIKLKCSVNLSLNTLKSYEKINEILNIYKEYKIPKHLITAEILENVSLNNNAKTISYINLLRENGICISIDDFGTGYSSLSQISNLYFDELKIPREFVIDARTPSKLAVIEAISILAKKLKVTSVIEGVENYEDFKLFSSLGFDIVQGYYFSKPLTKSEIIDYIKVNINNKIS*