ggKbase home page

NECEvent2014_4_3_scaffold_524_3

Organism: NECEvent2014_4_3_Clostridium_perfringens_28_16

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 MC: 2 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: 1558..3471

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Capsular polysaccharide biosynthesis protein n=2 Tax=Clostridium perfringens RepID=H7CSP9_CLOPF similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 637.0
  • Bit_score: 1229
  • Evalue 0.0
  • rbh
Capsular polysaccharide biosynthesis protein {ECO:0000313|EMBL:EIA18193.1}; TaxID=883064 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium pe similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 637.0
  • Bit_score: 1229
  • Evalue 0.0
capsular polysaccharide biosynthesis protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 98.3
  • Coverage: 637.0
  • Bit_score: 1210
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium perfringens → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1914
ATGGAGAAAGAAGGTAAAGTTAAGGCTCTGTTTTTGATGTCATTAGATACTCTAATAATAGTAAATTCTTATATATTAGCGTTTATAATAAGATTTAACTTTGATTTTATTATGGATGAAAGAAATGGATTGATATTATTTTTACCAGTAATAGTAATAATATATTTAATGATGCTATCTATATTTAAAATGTATAAGAGTATATGGACTATTGTAGGAATTGATGAAGTGGCTTTTGGATTAATAGCTTGTTTAATTGCTACAGGTATTATATTAATTACTAGCACAATTATATCAAGTATATATTATATAGATCATATTACAGTGCTTTTAGCAGGGCTATTTATAATGATTTTTACAATAGGAATAAGGGTGTCGTTTAGAATTTACAGAAGAATGATTTCACACGGCAGAGTTTTATTAAATTCAAGTAATATTAGTAATTTGGAAAAAATATTAATAATAGGAGCTGGTTCATGTGGACAGCTTATAATAGAAGAAGTTAGAAAACAAAATCCTATTAAACAGAAGGTCATTGGGGTTATAGATGATAATCCAAGTAAGATAGGTACGTATCTTAGGGGAATTAAAATTCTTGGTAATAGGAATAAAATTATAGCGATATCAGAAGAAAAAAATGTTGATTTAATACTAATTGCTATGCCTTCAGTTGATGGAAAAGTTAAGAAAGAGATTATAGAAATATGCCAAAGTACAAGGGCGAAAGTTAAAATAATTCCAGGAATGTATGAACTTATAGGAGGAAAAGTAAGTTTAAACAGAATGAGGGATATAGATTTACGGGATCTTTTAGGGAGAGAAGAAGTTATTTTAGATAAGCAAGGAATAAAGGACTATATAGAAAATAAAGTAGTTATGGTAACTGGTGGTGGAGGATCAATAGGATCTGAGTTATGTCGTCAAATAGCTAAATTTTCACCTAAATTACTTCTAATTTTAGATATTTATGAAAATAATGCATATGAACTTGAAAATGAAATTATAAGTAATTTTAAAAATCTAAAAGAAAAGGTATTAATAGCTTCTGTAAGAGAGGAAAAGCGTCTTGAAAATATATTTAATGAATATAAGCCACAAGTAATTTTTCATGCTGCGGCTCATAAACATGTTCCTCTTATGGAACGTAACCCAGAAGAAGCTATTAAAAATAATGTTATTGGAACATTAAATGTTGCAGAATGTGCACATAAATACGGAGCTGAAAGATTTGTATTAATTTCAACGGATAAGGCTGTTAATCCAACAAATGTGATGGGAGCTTCAAAAAGAATGTGCGAAATGATAATACAAGCTATAGATAAAAATTCTAATACGGAATTTGTTGCTGTAAGATTTGGTAACGTTCTTGGAAGTAATGGGTCTGTAATTCCATTATTTAAAAAACAAATTGCTAAAGGAGGACCAGTAACTCTTACTCACAAAAAAATAACAAGGTATTTTATGCTTATTCCAGAGGCTGCTCAGCTTGTTCTTCAGGCAGGAGCTTATGCAAAAGGTGGAGAAATATTTGTACTTGATATGGGTAATCCAGTACTAATATATGATTTAGCTAAAGATTTAATAAAGCTTTCAGGATTTGAACCAGAAATTGATATAAAAATAGAAATAACAGGTCTTAGACCAGGTGAAAAATTATACGAAGAACTTCTTATGGATGAAGAAGGGTTAAGAAAAACAAGTCATGAAAAGATATTTATTGCTAAGCCTGGGGAGTATGATTTTGAAATGTTAAAGTTAGGCGTAAATGCTTTAAAAAAAATTGCTGATCTTGGCGATGTGGAAACACTAAAAACAGCACTTCAATTTATTGTAAAGACATATAAAAGATTGGACACTGAAAATAATAGTGTCTTTAATGAAGTTGCGTTACATGAAGCAAGTGAAGCAATATAA
PROTEIN sequence
Length: 638
MEKEGKVKALFLMSLDTLIIVNSYILAFIIRFNFDFIMDERNGLILFLPVIVIIYLMMLSIFKMYKSIWTIVGIDEVAFGLIACLIATGIILITSTIISSIYYIDHITVLLAGLFIMIFTIGIRVSFRIYRRMISHGRVLLNSSNISNLEKILIIGAGSCGQLIIEEVRKQNPIKQKVIGVIDDNPSKIGTYLRGIKILGNRNKIIAISEEKNVDLILIAMPSVDGKVKKEIIEICQSTRAKVKIIPGMYELIGGKVSLNRMRDIDLRDLLGREEVILDKQGIKDYIENKVVMVTGGGGSIGSELCRQIAKFSPKLLLILDIYENNAYELENEIISNFKNLKEKVLIASVREEKRLENIFNEYKPQVIFHAAAHKHVPLMERNPEEAIKNNVIGTLNVAECAHKYGAERFVLISTDKAVNPTNVMGASKRMCEMIIQAIDKNSNTEFVAVRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIAKGGPVTLTHKKITRYFMLIPEAAQLVLQAGAYAKGGEIFVLDMGNPVLIYDLAKDLIKLSGFEPEIDIKIEITGLRPGEKLYEELLMDEEGLRKTSHEKIFIAKPGEYDFEMLKLGVNALKKIADLGDVETLKTALQFIVKTYKRLDTENNSVFNEVALHEASEAI*