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NECEvent2014_4_7_scaffold_1874_2

Organism: NECEvent2014_4_7_Clostridium_perfringens_28_5

near complete RP 49 / 55 MC: 2 BSCG 48 / 51 MC: 2 ASCG 15 / 38 MC: 2
Location: 667..2580

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Capsular polysaccharide biosynthesis protein n=2 Tax=Clostridium perfringens RepID=H7CSP9_CLOPF similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 637.0
  • Bit_score: 1229
  • Evalue 0.0
  • rbh
Capsular polysaccharide biosynthesis protein {ECO:0000313|EMBL:EIA18193.1}; TaxID=883064 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium pe similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 637.0
  • Bit_score: 1229
  • Evalue 0.0
capsular polysaccharide biosynthesis protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 98.3
  • Coverage: 637.0
  • Bit_score: 1210
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium perfringens → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1914
ATGGAGAAAGAAGGTAAAGTTAAGGCTCTGTTTTTGATGTCATTAGATACTCTAATAATAGTAAATTCTTATATATTAGCGTTTATAATAAGATTTAACTTTGATTTTATTATGGATGAAAGAAATGGATTGATATTATTTTTACCAGTAATAGTAATAATATATTTAATGATGCTATCTATATTTAAAATGTATAAGAGTATATGGACTATTGTAGGAATTGATGAAGTGGCTTTTGGATTAATAGCTTGTTTAATTGCTACAGGTATTATATTAATTACTAGCACAATTATATCAAGTATATATTATATAGATCATATTACAGTGCTTTTAGCAGGGCTATTTATAATGATTTTTACAATAGGAATAAGGGTGTCGTTTAGAATTTACAGAAGAATGATTTCACACGGCAGAGTTTTATTAAATTCAAGTAATATTAGTAATTTGGAAAAAATATTAATAATAGGAGCTGGTTCATGTGGACAGCTTATAATAGAAGAAGTTAGAAAACAAAATCCTATTAAACAGAAGGTCATTGGGGTTATAGATGATAATCCAAGTAAGATAGGTACGTATCTTAGGGGAATTAAAATTCTTGGTAATAGGAATAAAATTATAGCGATATCAGAAGAAAAAAATGTTGATTTAATACTAATTGCTATGCCTTCAGTTGATGGAAAAGTTAAGAAAGAGATTATAGAAATATGCCAAAGTACAAGGGCGAAAGTTAAAATAATTCCAGGAATGTATGAACTTATAGGAGGAAAAGTAAGTTTAAACAGAATGAGGGATATAGATTTACGGGATCTTTTAGGGAGAGAAGAAGTTATTTTAGATAAGCAAGGAATAAAGGACTATATAGAAAATAAAGTAGTTATGGTAACTGGTGGTGGAGGATCAATAGGATCTGAGTTATGTCGTCAAATAGCTAAATTTTCACCTAAATTACTTCTAATTTTAGATATTTATGAAAATAATGCATATGAACTTGAAAATGAAATTATAAGTAATTTTAAAAATCTAAAAGAAAAGGTATTAATAGCTTCTGTAAGAGAGGAAAAGCGTCTTGAAAATATATTTAATGAATATAAGCCACAAGTAATTTTTCATGCTGCGGCTCATAAACATGTTCCTCTTATGGAACGTAACCCAGAAGAAGCTATTAAAAATAATGTTATTGGAACATTAAATGTTGCAGAATGTGCACATAAATACGGAGCTGAAAGATTTGTATTAATTTCAACGGATAAGGCTGTTAATCCAACAAATGTGATGGGAGCTTCAAAAAGAATGTGCGAAATGATAATACAAGCTATAGATAAAAATTCTAATACGGAATTTGTTGCTGTAAGATTTGGTAACGTTCTTGGAAGTAATGGGTCTGTAATTCCATTATTTAAAAAACAAATTGCTAAAGGAGGACCAGTAACTCTTACTCACAAAAAAATAACAAGGTATTTTATGCTTATTCCAGAGGCTGCTCAGCTTGTTCTTCAGGCAGGAGCTTATGCAAAAGGTGGAGAAATATTTGTACTTGATATGGGTAATCCAGTACTAATATATGATTTAGCTAAAGATTTAATAAAGCTTTCAGGATTTGAACCAGAAATTGATATAAAAATAGAAATAACAGGTCTTAGACCAGGTGAAAAATTATACGAAGAACTTCTTATGGATGAAGAAGGGTTAAGAAAAACAAGTCATGAAAAGATATTTATTGCTAAGCCTGGGGAGTATGATTTTGAAATGTTAAAGTTAGGCGTAAATGCTTTAAAAAAAATTGCTGATCTTGGCGATGTGGAAACACTAAAAACAGCACTTCAATTTATTGTAAAGACATATAAAAGATTGGACACTGAAAATAATAGTGTCTTTAATGAAGTTGCGTTACATGAAGCAAGTGAAGCAATATAA
PROTEIN sequence
Length: 638
MEKEGKVKALFLMSLDTLIIVNSYILAFIIRFNFDFIMDERNGLILFLPVIVIIYLMMLSIFKMYKSIWTIVGIDEVAFGLIACLIATGIILITSTIISSIYYIDHITVLLAGLFIMIFTIGIRVSFRIYRRMISHGRVLLNSSNISNLEKILIIGAGSCGQLIIEEVRKQNPIKQKVIGVIDDNPSKIGTYLRGIKILGNRNKIIAISEEKNVDLILIAMPSVDGKVKKEIIEICQSTRAKVKIIPGMYELIGGKVSLNRMRDIDLRDLLGREEVILDKQGIKDYIENKVVMVTGGGGSIGSELCRQIAKFSPKLLLILDIYENNAYELENEIISNFKNLKEKVLIASVREEKRLENIFNEYKPQVIFHAAAHKHVPLMERNPEEAIKNNVIGTLNVAECAHKYGAERFVLISTDKAVNPTNVMGASKRMCEMIIQAIDKNSNTEFVAVRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIAKGGPVTLTHKKITRYFMLIPEAAQLVLQAGAYAKGGEIFVLDMGNPVLIYDLAKDLIKLSGFEPEIDIKIEITGLRPGEKLYEELLMDEEGLRKTSHEKIFIAKPGEYDFEMLKLGVNALKKIADLGDVETLKTALQFIVKTYKRLDTENNSVFNEVALHEASEAI*