ggKbase home page

NECEvent2014_4_7_scaffold_379_1

Organism: NECEvent2014_4_7_Clostridium_7_2_43FAA-rel_28_17_lowerCov

near complete RP 48 / 55 MC: 6 BSCG 46 / 51 MC: 5 ASCG 15 / 38 MC: 2
Location: 58..3321

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Uncharacterized protein n=1 Tax=Clostridium sp. 7_2_43FAA RepID=V9H2R5_9CLOT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 64.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1290
  • Evalue 0.0
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:EEH96984.2}; TaxID=457396 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium sp. 7_2_43FAA.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 64.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1290
  • Evalue 0.0
DNA/RNA helicase, SNF2 similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 40.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 807
  • Evalue 6.00e-231

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sp. 7_2_43FAA → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3264
ATGAATTTGAGAAATATGCTAAGCTCAGTATTAAAATTAGGATCTAGTATAGCTAAGAATAATGGTAAAAAATTATTAAAAGAAGGTTTTGTTAAGAAGATTATAAGTAAAAAAATAGATGATAGCTATCATATTTATGGAAGAGTTATAGATAGTAATATTGAATATAGTACACATATAAAATTTAACTTACAAGATGAAGTGAAATCTGTTAAGTGTACCTGTAATCAATTTGAGGAAAATAGTAGACAGATTAGAAATTATATATGTAGTCATATAACTGCAACTATGTATAAATTCTACTATGAAGCATCTAGTAAGCTAAAAAAACAAGAAAGTAATAATAGAAACAGTATTATTTCCAATACTCATCCTCATACTCATGCTAAACCTCATACTAATAATATTAATAACAATGATATTATTAGTAATGATATTAACAATAATGATACTAATACTTATAGTAATATTAACATTGATAGCAATATTTATAGCAATATTTATAGTGATAATAATATTAATAGCAATACAAATCCTAAGATTAAAGGTGGTACTAATAACAATAAAATCATTACTAATAGCAATAAAATTATTAATAATATAAATAAACCTTTAAACCTTGATATAAAAATAAAACAAGTTAAAGCTAATAATAAAAATGAATATTATCTTGAATTAAGAGCTGGAAAAGAAACAACTATAGCAGTTGAAGCATTAGGAAAATTTTTGTTTCATGAAGATAATAAATTTAAATATAAGGATTATTTAACTATAGATTTTTTAAGAGAAAAATTTAGGAAAGATAAAAGTAGAATAGTTAATGGAAGAAGCTTTAAGCTTTATGATAATGAGCTTAAGGATTTATTAAAATTAATAAATAGTAAAAAAGAAATAAACTTAAACTATGATTATATGAATTATACATCTTTAATTTATAAAGAGGATATTCCTTTAATTTTTACTATTAAGAAAAAAGCTGATGCTATAATAGTAAAACCTCAAAGGAAAAGCATAATCCCTTTAGATAGTAATAAAGATATATGGATATATGATAAGAAAATATATTTACCAACTGAAAAACAATTGAAATATTATAAGAATCTTTATGAAAAGTTAAAGGAAAGAGATAGTTTACTTTATAAAGATACAGATGATAACTTAAAAAAGATATTATTTATCCTAGGAGAAGTATCAAAGGATATTATTATTGATGAAACCATAAAAGAGCAAATAAATAAGATTAATACACCAAGATTTTATATATCAAAGGAAGGCTCTAATATTTATTGTACTCTAAAAATAGACTATGTTAATAGCTTAGAGGGAATGAAAGATAATAAAGCTATGGAAAAGCTTCAAATGGCTCTTGAGAGATATAGATTTATAAAAAAGGATGATAGATTCATATTTATAGGTGATGAAGAAGAAACTTACACCTTATTAAAAGAAGGAATAGAATTCTTAAATAAAATAGGAAGAGTAAGCTTATCTAAAGAGTTCAAAGATATGAATTTAATAGATTCCAATAGTATCTTTAGTTCTATAAAAGAAGAAAATGAAGGCTTTTATTTTGAATATAAGATAGAGGGATTAGAATATAGAGAAATTCCAGAGGTTTTAAATGAAATAAGAAAAGGTAGTAATTTCTATAGAACTAAGAAAAATAGCTTTCTAGATTTAAAGGATGAAAAAGTAATTGGATTTTTTAGAGGAATAGAGGAGTTAAATTTATTTAATAATGTGTATAAAGAAGAAATCTATGTGGATAAATTAAATTTGCTACATTTAGAAAATAATATAAAGAATAAAAAGCTTCCTTTTATTTCTGGAGAAGAAAAAATAAATATTTTATTAGAAAAGTTAAAAAATAAAGATAAGGAATATAGCCTTCCTGATAATTTAAATGCTAATCTTAGGGAATATCAAAAAATAGGCTATAACTGGCTAAGGACCATTGAAGATTTAGGTTTTGGTGGAATACTTGCAGATGATATGGGACTTGGTAAGACTATTCAAACTATAGCATTATTATTATCTATGGAAGGAAGGATAAGCTTAATTATTACACCTACTTCTGTTTTATATAATTGGAAAAATGAGTTTGAGAAATTTGCACCTACTTTAAAAATAGGAATTATTCATGGAAGTCTAAAGGAAAGAAGCAGAATTATAGATAACTATAAGGAATATGATGTTTTACTAACAACCTATGGAACCTTAAGAAGAGATTTAGAATTATATGAAGATAAGAGCTTTGATTTTTGTATAATTGATGAAGGTCAAAATATTAAAAATAGAACTTCAAAGGTTTCAGAAGCTGTTAAATCTATAAAGGCAAATACTAAAATAGCTTTAACAGGAACTCCTATTGAAAATACTTTGCTAGAATTATGGTCAATTTTTGATTTTATAATGCCTATGTATTTATTTTCTGTGGAAAAGTTTAAAGATAAATTTATGAAGGGTAATGATGAAGATTTAAAGGAATTAAAGGAACTTATATCACCTTTTATTTTAAGAAGGCTGAAAGAAGAAGTATTAGATGAATTACCAGAAAAGATAGAAAAGGAATATATAATTCCAATGGCAAGTAAGCAAAGACAAGTTTATAATTCTTATATGAAGGAAGTTAAAAAGAAGTTAAAAGAAAATAAGGATAATAAGATATTAATATTTTCTTTCCTTACAAAGCTACGTCAATTATGCTTAGATCCATCCCTTTTAATAGATGATTTTAAAGAAGAAAGTTCTAAAATAAAGGCCATTGAAGAAATTGTAGAGGAAGCTTTAGAAGCTAATAAGAAAATAATTATATTTTCACAATTTACATCAGCATTAAATAAAATAGGAAATAAGCTAAAAACTAATAATATAGAATATCTTTATTTAGATGGTAGCATTAAAGCCAAGGAAAGATTAAGATTAGCAGAAGAATTTAATGAAGGAAGTACAAATATATTTTTAATTTCTTTAAAGGCAGGAGGAGTAGGTCTTAATTTAACCTCTGCAAATATAGTTGTACACTTTGATCCATGGTGGAATCCAGCTGTAGAGGACCAGGCCACAGATAGAGCATATAGAATAGGTCAAAAAAATATAGTAGAAGTTATAAAGTTAATTTCTAAGGATACCATAGAAGAAAAAATTATTAGGCTACAAGAAGAAAAGAAGGAATTAATAAGTAAGGTAATTGACGGAAATATGTTAACAGGAGATAAATTAAATTCAATTACAGAGGAGGAATTACTAAATCTTTTTAGTTAG
PROTEIN sequence
Length: 1088
MNLRNMLSSVLKLGSSIAKNNGKKLLKEGFVKKIISKKIDDSYHIYGRVIDSNIEYSTHIKFNLQDEVKSVKCTCNQFEENSRQIRNYICSHITATMYKFYYEASSKLKKQESNNRNSIISNTHPHTHAKPHTNNINNNDIISNDINNNDTNTYSNINIDSNIYSNIYSDNNINSNTNPKIKGGTNNNKIITNSNKIINNINKPLNLDIKIKQVKANNKNEYYLELRAGKETTIAVEALGKFLFHEDNKFKYKDYLTIDFLREKFRKDKSRIVNGRSFKLYDNELKDLLKLINSKKEINLNYDYMNYTSLIYKEDIPLIFTIKKKADAIIVKPQRKSIIPLDSNKDIWIYDKKIYLPTEKQLKYYKNLYEKLKERDSLLYKDTDDNLKKILFILGEVSKDIIIDETIKEQINKINTPRFYISKEGSNIYCTLKIDYVNSLEGMKDNKAMEKLQMALERYRFIKKDDRFIFIGDEEETYTLLKEGIEFLNKIGRVSLSKEFKDMNLIDSNSIFSSIKEENEGFYFEYKIEGLEYREIPEVLNEIRKGSNFYRTKKNSFLDLKDEKVIGFFRGIEELNLFNNVYKEEIYVDKLNLLHLENNIKNKKLPFISGEEKINILLEKLKNKDKEYSLPDNLNANLREYQKIGYNWLRTIEDLGFGGILADDMGLGKTIQTIALLLSMEGRISLIITPTSVLYNWKNEFEKFAPTLKIGIIHGSLKERSRIIDNYKEYDVLLTTYGTLRRDLELYEDKSFDFCIIDEGQNIKNRTSKVSEAVKSIKANTKIALTGTPIENTLLELWSIFDFIMPMYLFSVEKFKDKFMKGNDEDLKELKELISPFILRRLKEEVLDELPEKIEKEYIIPMASKQRQVYNSYMKEVKKKLKENKDNKILIFSFLTKLRQLCLDPSLLIDDFKEESSKIKAIEEIVEEALEANKKIIIFSQFTSALNKIGNKLKTNNIEYLYLDGSIKAKERLRLAEEFNEGSTNIFLISLKAGGVGLNLTSANIVVHFDPWWNPAVEDQATDRAYRIGQKNIVEVIKLISKDTIEEKIIRLQEEKKELISKVIDGNMLTGDKLNSITEEELLNLFS*