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NECEvent2014_4_7_scaffold_644_14

Organism: NECEvent2014_4_7_Clostridium_7_2_43FAA-rel_28_17_lowerCov

near complete RP 48 / 55 MC: 6 BSCG 46 / 51 MC: 5 ASCG 15 / 38 MC: 2
Location: 12827..15130

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Group 1 glycosyl transferase {ECO:0000313|EMBL:CEP38766.1}; EC=2.4.1.52 {ECO:0000313|EMBL:CEP38766.1};; TaxID=1505 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Peptostreptococcaceae; Pept similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 40.3
  • Coverage: 770.0
  • Bit_score: 580
  • Evalue 4.20e-162
O-Antigen ligase family protein n=1 Tax=Clostridium difficile F501 RepID=T4BT38_CLODI similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 29.2
  • Coverage: 400.0
  • Bit_score: 183
  • Evalue 6.20e-43
group 1 glycosyl transferase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 31.6
  • Coverage: 351.0
  • Bit_score: 163
  • Evalue 3.20e-37

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

[Clostridium] sordellii → Peptoclostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2304
ATGAACAAATGCGAAAATATAAAAAAATATTTGCTGAATAGTTTTATATTTATTTTTGTTATATCAATGTTTAATAGGGAATTTTTACCTTTTGGAATAGATTTGAGGTATATACAGGTTTTACTAGCTATTATTTTAATAGGAGATGGAATGTATAGATTATACAAATCTAAAGATGAAAAAATAAAAGCAATTAAAATAAGTAATTTATTAATAATAATTTCGATATTTTACTTATATATTATGTTTGTTAATGTAAGATGGTTAAATAATGGTCTTATAATTAATATGTCTGATTTTATGAATATGATTATATTAAATATTTCTAACTTTTTATCAATACTAGTGTTTTATTTGTATAGGAAAGATTTAAATAATGATTTCATAAAGAATTTTATTATAATATCAGGGGTTTTGCTTATTATAAGTATGATTTTTATCTGGAATGGAATCGAACTTAAAAATATAATGGGTGGAAATTATAAAGGCTATTATACAGGAGAAGAGCATTTTAATTTTTTTGGACAAAATATAAGAATAGCTGGATATGCACAAGATCCTAATTATGCTAGCATGTTTATGATAATAATTATTACAGTATGTATGAAGTTTATTAAAGATAAATGGTGGAAAACATCTTTAGTGTTAATTTCAATATTAGGGTATTGTATTTCTTCATCTAGAACTATATTAATAGGAGTAATGGCATCTTTAGCAATAGTATTAGCTATAAGAATATTTAATAGATATAATAAAAATATTTGTGAGAGATTAGTGAATATTGGAACTGTATTTTTGTTGATTGGACCTTATTTGTTACTAAAAATATTAGATTTTGTTAACTATTCATTTGGATTAGTAACAATGAATACTAGATTAGTTATGTGGAGAGCAGCCAGTACTTTGTTTGAAAAAAGTCCTATAATAGGTAATGGGATCACTAGCTTTAGAAGTATGTTTGAAACTTATCCAAACGGATGGTATGTTCAAGCACATAGTACAATATTTCAATTGTTATCGGAAACTGGGATAATAGGACTTGTATTATTTATAATTATTTCAGTAATAATTATAAATAAAGTTGATTATTATGGAAAGTTTTTATACTTAGTATTTTTAATTTTTTCTCTAACTTATGAATTGGGATATCTATTATTATTTGCCTTTATGATTGGCTTACTACCTATAATGTTTGAAAAACATAATAATCCTAGATTGACAAAAGACAAGAATGGTAGTAAAAACATTCTTTTAATAGCTAACTCACTTGGAAAAGGTGGAGCTGAGCGGGTTATAGCTAATATTGCAAATAAAATGATTGAATATAATCACCAAGTTACAATAATTTTGTTCGATAATGAAATTGATTATGAACTTAATAAAAAAATAAATATAATTAATTTAGATACTAAAAAATATAATAGAATTTTAAGTGTAATTATTAGTGTATTTAAATTGAATAGAGTTATAGATTCTTTAAATCGTAATGAAGAGATTGATTTAATGACATCTCATCTTCCATTTTCTGATTTTATATGCAGACTATCAAAATATAGCAAGAACAATTTTTATGTTATTCATGGTGTTTATTCAATGTATGAAGAAAATGCTAAAGGTCTTTTAAAATACATTTTAAGGTTTACATATAATAATAGGAAAATAGTAACAGTTTCTAATGGTGTAAGTAAAGAGTTGATAGATAGGTATTATGTTAAACCAAAATATATTACAACAATATATTGCCCTATAAATATTGAAATGATTATGGATTTAAAAAATGAAATAATTAATTATAATAGAAAATACATAATGTTTTGTGGAAGGCTTGAAAAAATAAAAGATCCAGAGCTATTAATTAAGGCGTATAAACAAGGTAAGTTCTATAAGAACTATAATTTAATAATTATAGGAGAAGGAAGTGAAAGGGCTAATTTAGAATTATTATGTGCAAAAATGGGAGTCGATGAATTTGTGCAATTTATTGGTTGGGAAAAAAATGTGTACAAATGGATGGCAAATGCAGACCTACTAGTCTCTACTTCTAAATATGAGGCTTTTTCACTTGTTATCGCAGAAGCTTTAGCATGTGGTTGCAAGGTAGTTAGTATTGATTGTAACTATGGACCAAGAGAGATTTTGACAGAGGAATATAAAGAATTCTTAGTCTCAGAAGGAAACATTGACGAATTAATTAGAGTAATGAACAATGCTTTAATTAAATATCCATTAAACGGAGAAGAATGTATTGAAAAATTTAATATAAAAAATGTAGTTAATAATTATATTTCTTTAATAGATAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 768
MNKCENIKKYLLNSFIFIFVISMFNREFLPFGIDLRYIQVLLAIILIGDGMYRLYKSKDEKIKAIKISNLLIIISIFYLYIMFVNVRWLNNGLIINMSDFMNMIILNISNFLSILVFYLYRKDLNNDFIKNFIIISGVLLIISMIFIWNGIELKNIMGGNYKGYYTGEEHFNFFGQNIRIAGYAQDPNYASMFMIIIITVCMKFIKDKWWKTSLVLISILGYCISSSRTILIGVMASLAIVLAIRIFNRYNKNICERLVNIGTVFLLIGPYLLLKILDFVNYSFGLVTMNTRLVMWRAASTLFEKSPIIGNGITSFRSMFETYPNGWYVQAHSTIFQLLSETGIIGLVLFIIISVIIINKVDYYGKFLYLVFLIFSLTYELGYLLLFAFMIGLLPIMFEKHNNPRLTKDKNGSKNILLIANSLGKGGAERVIANIANKMIEYNHQVTIILFDNEIDYELNKKINIINLDTKKYNRILSVIISVFKLNRVIDSLNRNEEIDLMTSHLPFSDFICRLSKYSKNNFYVIHGVYSMYEENAKGLLKYILRFTYNNRKIVTVSNGVSKELIDRYYVKPKYITTIYCPINIEMIMDLKNEIINYNRKYIMFCGRLEKIKDPELLIKAYKQGKFYKNYNLIIIGEGSERANLELLCAKMGVDEFVQFIGWEKNVYKWMANADLLVSTSKYEAFSLVIAEALACGCKVVSIDCNYGPREILTEEYKEFLVSEGNIDELIRVMNNALIKYPLNGEECIEKFNIKNVVNNYISLIDK*