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NECEvent2014_5_1_scaffold_433_3

Organism: NECEvent2014_5_1_Staphylococcus_epidermidis_33_6

near complete RP 46 / 55 MC: 4 BSCG 45 / 51 MC: 1 ASCG 13 / 38 MC: 1
Location: 2947..7257

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
DNA polymerase III alpha subunit (EC:2.7.7.7) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2878
  • Evalue 0.0
DNA polymerase III PolC-type {ECO:0000255|HAMAP-Rule:MF_00356}; Short=PolIII {ECO:0000255|HAMAP-Rule:MF_00356};; EC=2.7.7.7 {ECO:0000255|HAMAP-Rule:MF_00356};; TaxID=176280 species="Bacteria; Firmicut similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2878
  • Evalue 0.0
DNA polymerase III PolC-type n=6 Tax=Staphylococcus epidermidis RepID=DPO3_STAES similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2878
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Staphylococcus epidermidis → Staphylococcus → Bacillales → Bacilli → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4311
ATGACAAATCGAGAAAAGTTTAAAGTGCTTGCCGATCAAATAAAAATATCAAATCAACTAGAACAAGATATTCTTGAACAAGGTGAACTCACTCGTATAGATGTTTCAAATAAAAACAGAACATGGACTTTCCAAATATCACTCCCACATTTTTTATCTCATGAAGATTATCTTCTTTTTACACATGCAATTGAAGAAGAATTTAAAGAAATAGCTACAGTAGCAATTGATTTTTCAATTAAAGATACCAACAATCAAGATGAGTTTGCTTTAAAATATTTCGGACATTGTATTGATCAAACACGATTGTCGCCAAAAGTGAAAGGTCAATTGAAACAAAAAAAACTCATTATGAGTGGAAATGTTTTAAAAGTCTTAGTTTCAAATGACATTGAGAGAAATCATTTTGATAAGGCATGTAATGGTAGTTTGGTTAAAGCATTTAGACAGTGTGGCTTTGAAATTGATAAAGTCGTTTTTGAAACAGATTCAACAAATCACGATGATGACCTTGCATCGTTAGAAGCACATATTCAACAAGAAGATGAACAAAGTGCAAGAGAAGCAACTGAAAAATTAGAAAAAATGAAAGCAGAAAAAGCGAAACAACAAGATAATAATGAAAGTACAGTGGAAAAATGTCAGATTGGAAAACCAATTCAGATTGAAAATATAAAACCAATTGAATCAATTATTGAAGAAGAATTCAAAGTAGCTATTGAAGGTGTTATATTTGATATTAACCTAAAAGAACTTAAAAGTGGACGTCATATAGTTGAGCTTAAAGTTACTGATTACACAGATTCACTTGTATTAAAAATGTTTACAAGAAAAAATAAAGATGACTTGGACCACTTTAAGGCACTTAGTGTTGGTAAATGGGTTAGAGCTCAAGGTCGTATTGAAGAAGATACTTTTGTTAGGGATCTTGTCATGATGATGTCAGATATTGAAGAAATTAAAAAGACACCTAAACAAGATAAAGCAGAAGATAAGCGTGTAGAGTTTCATTTACATACGTCTATGAGTCAAATGGATGGTATTCCTAATATTAGTGCATATGTTGAACAAGCTGCTAAATGGGGGCACCAAGCTTTAGCAGTAACAGATCACAACGTAGTACAAGCTTTTCCAGATGCACATAATGCTGCCGAAAAACATGGTATTAAGATGATTTATGGTATGGAAGGTATGCTAGTAGACGATGGTGTTCCTATAGCTTATAAACCAACAGACCGTAATTTAAAAGATGCAACATATGTGGTGTTTGACGTAGAGACAACAGGTCTTTCTAATCAATATGATAAAATTATTGAATTAGCTGCAGTAAAAGTGCATAACGGTGAAATTATAGATAAGTTTGAACGTTTTAGTAATCCACACGAAAGATTATCTGAAACCATTATCAACCTTACACATATCACTGATGATATGTTAACTGATGCTCCCGAAATTGAAGAAGTGTTAACTGAATTTAAAGAGTGGGTTGGAGATGCTATATTTGTAGCTCATAATGCTTCATTTGATATGGGATTTATTGACACAGGATATGAAAGGTTAGGCTTTGGACCTTCTACAAACGGTGTAATTGATACACTTGAGCTTTCACGTACAATTAATACCGAATATGGGAAACATGGTTTGAATTTCCTTGCCAAAAAATATGGTGTCGAATTAACGCAACATCATAGAGCGATTTATGATACAGAAGCAACAGCTTATATTTTTATAAAAATGGTTCAACAAATGAAAGAACTAGGTGTGAACAACCATCTAGAAATTAATAAAAAATTAACTAATGAAGATGCATATAAAAGAGCTCGTCCATCTCACGTTACACTCATTGTTCAAAATCAAGAAGGTCTTAAAAATTTATTTAAAATAGTTAGTGCTTCATTAGTTAAGTATTATTACCGTACGCCAAGAATTCCACGTTCTCTTTTAAATGAATATCGAGAAGGGATCTTGATTGGTACAGCTTGTGATGAGGGTGAATTATTCACAGCAGTAATGCAGAAGGATCAGTCGGAAGTAGAAAAAATAGCAAAGTTCTATGATTTTATAGAAGTTCAACCGCCTGCGCTTTATCAAGATTTAATGGATAGAGAATTAATACGAGATAATGAAACGTTAACACAAATTTACAAGCGATTAATAGATGCTGGTAAAAGCGCTAATATCCCAGTGATTGCTACTGGTAACGCGCATTATCTATATGAACATGATGCTATAGCCAGAAAAATTTTAATTGCATCCCAACCAGGGAATCCATTAAATCGTTCAACATTACCAGAAGCTCACTTTAGAACCACTGATGAAATGTTAGATGATTTTCACTTCTTAGGTGAAGAAAAAGCATATGAAATCGTTGTAACAAATACAAATGAGCTCGCTAATAAAATTGAAAAAGTGGTTCCTATAAAAGATAAACTATTTACGCCAAGAATGGATGGGGCTAATGAAGAAATTCGTGAGTTGAGTTATTCTAATGCGAAAAAACTATATGGTGAAGATTTACCACAAATTGTTATAGATCGCCTTGAAAAGGAATTAGATAGTATTATTGGTAATGGCTTTTCTGTTATTTACCTCATATCTCAACGTTTGGTGAAGAAATCGCTAGATGATGGTTATTTAGTTGGATCGCGTGGTTCAGTTGGTTCTAGTTTCGTAGCAACAATGACTGAAATTACAGAAGTTAATCCGCTTCCACCACACTACATTTGTTCACATTGTAAGACAAGTGAGTTCTTTGATGATGGTTCGGTTGGATCTGGATTCGATTTACCAGATAAAAAATGTCCTACTTGTGGTAATGAATTAATTAAAGAAGGACAAGATATCCCTTTTGAGACATTCCTTGGATTTAAAGGAGATAAAGTTCCAGATATTGATTTGAACTTTAGTGGTGAATATCAACCTAACGCTCATAATTACACAAAAGTATTGTTTGGTGAAGATAAAGTATTTCGTGCTGGAACAATAGGTACTGTTGCTGAAAAAACAGCTTTTGGTTTCGTAAAAGGTTACTTAAATGATCAAGGTATTCACAAACGTGGTGCTGAAATTGATCGGTTGGTTAAAGGTTGTACAGGGGTCAAACGTACAACTGGTCAACATCCTGGAGGAATCATTGTTGTACCGGATTACATGGATATTTATGATTTTACACCGATTCAATTCCCAGCAGACGACCAAAGTGCAGCGTGGATGACAACCCATTTCGACTTCCATTCAATACACGATAATGTCTTAAAATTAGATATATTAGGACATGATGACCCAACGATGATTCGTATGTTACAAGACTTATCAGGAATTGACCCCAAAACTATACCAGTAGATGATAAAGAAACAATGCAAATATTTAGTGGTCCTGAGAGTTTAGGTGTTACAGAAGACGAAATATTATGTAAGACAGGTACATTTGGTGTACCAGAATTTGGTACTGGATTTGTACGTCAAATGCTTGAAGATACTAAGCCAACGACATTCTCAGAATTAGTTCAAATTTCAGGTTTATCTCATGGTACGGACGTTTGGTTAGGTAATGCACAAGAGTTAATTCGTCAAGGGATATGTGACTTATCTAGTGTGATAGGCTGTCGTGATGATATCATGGTATATCTGATGTATGCTGGACTTGAACCGTCAATGGCTTTTAAAACGATGGAATTTGTACGTAAAGGTCGTGGCTTAACAGATGAAATGGTTGAAGCGATGAAGGAAAATAACGTGCCAGATTGGTATTTAGATTCTTGTCGTAAAATTAAATATATGTTCCCTAAAGCTCATGCCGCTGCTTATGTACTGATGGCTGTAAGAATTGCATACTTTAAAGTACATCATCCACTATATTATTATGCAGCATACTTTACCATAAGAGCTTCCGATTTTGACCTTATAACAATGATTAAAGATAAAACGAGTATTCGTAATACAGTTAAAGATATGTATTCACGATATATGGATTTAGGGAAAAAAGAGAAAGATGTATTAACTGTATTAGAAATAATGAATGAAATGGCGCATCGAGGTTTTCGATTGCAACCGATTAGTTTAGAAAAAAGCCAAGCTTTTGACTTCATCATTGAAGGGGATACATTGATTCCTCCATTCATTTCAGTGCCAGGACTTGGAGAAAACGTTGCACAAAGAATTGTTGAAGCGAGAGAAGAGGGACCATTTTTATCCAAAGAAGATTTAAATAAAAAAGCCGGCTTATCTCAAAAGGTTATTGACTATTTAGATGAATTAGGTTCATTGCCAGATTTACCTGACAAGGCACAATTGTCGATATTTGATATGTAA
PROTEIN sequence
Length: 1437
MTNREKFKVLADQIKISNQLEQDILEQGELTRIDVSNKNRTWTFQISLPHFLSHEDYLLFTHAIEEEFKEIATVAIDFSIKDTNNQDEFALKYFGHCIDQTRLSPKVKGQLKQKKLIMSGNVLKVLVSNDIERNHFDKACNGSLVKAFRQCGFEIDKVVFETDSTNHDDDLASLEAHIQQEDEQSAREATEKLEKMKAEKAKQQDNNESTVEKCQIGKPIQIENIKPIESIIEEEFKVAIEGVIFDINLKELKSGRHIVELKVTDYTDSLVLKMFTRKNKDDLDHFKALSVGKWVRAQGRIEEDTFVRDLVMMMSDIEEIKKTPKQDKAEDKRVEFHLHTSMSQMDGIPNISAYVEQAAKWGHQALAVTDHNVVQAFPDAHNAAEKHGIKMIYGMEGMLVDDGVPIAYKPTDRNLKDATYVVFDVETTGLSNQYDKIIELAAVKVHNGEIIDKFERFSNPHERLSETIINLTHITDDMLTDAPEIEEVLTEFKEWVGDAIFVAHNASFDMGFIDTGYERLGFGPSTNGVIDTLELSRTINTEYGKHGLNFLAKKYGVELTQHHRAIYDTEATAYIFIKMVQQMKELGVNNHLEINKKLTNEDAYKRARPSHVTLIVQNQEGLKNLFKIVSASLVKYYYRTPRIPRSLLNEYREGILIGTACDEGELFTAVMQKDQSEVEKIAKFYDFIEVQPPALYQDLMDRELIRDNETLTQIYKRLIDAGKSANIPVIATGNAHYLYEHDAIARKILIASQPGNPLNRSTLPEAHFRTTDEMLDDFHFLGEEKAYEIVVTNTNELANKIEKVVPIKDKLFTPRMDGANEEIRELSYSNAKKLYGEDLPQIVIDRLEKELDSIIGNGFSVIYLISQRLVKKSLDDGYLVGSRGSVGSSFVATMTEITEVNPLPPHYICSHCKTSEFFDDGSVGSGFDLPDKKCPTCGNELIKEGQDIPFETFLGFKGDKVPDIDLNFSGEYQPNAHNYTKVLFGEDKVFRAGTIGTVAEKTAFGFVKGYLNDQGIHKRGAEIDRLVKGCTGVKRTTGQHPGGIIVVPDYMDIYDFTPIQFPADDQSAAWMTTHFDFHSIHDNVLKLDILGHDDPTMIRMLQDLSGIDPKTIPVDDKETMQIFSGPESLGVTEDEILCKTGTFGVPEFGTGFVRQMLEDTKPTTFSELVQISGLSHGTDVWLGNAQELIRQGICDLSSVIGCRDDIMVYLMYAGLEPSMAFKTMEFVRKGRGLTDEMVEAMKENNVPDWYLDSCRKIKYMFPKAHAAAYVLMAVRIAYFKVHHPLYYYAAYFTIRASDFDLITMIKDKTSIRNTVKDMYSRYMDLGKKEKDVLTVLEIMNEMAHRGFRLQPISLEKSQAFDFIIEGDTLIPPFISVPGLGENVAQRIVEAREEGPFLSKEDLNKKAGLSQKVIDYLDELGSLPDLPDKAQLSIFDM*