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NECEvent2014_5_2_scaffold_9_22

Organism: NECEvent2014_5_2_Clostridium_paraputrificum-rel_30_55

near complete RP 49 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 2
Location: comp(22986..28049)

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
F5/8 type C domain protein n=1 Tax=Clostridium spiroforme DSM 1552 RepID=B1C411_9FIRM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 56.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1881
  • Evalue 0.0
  • rbh
F5/8 type C domain protein {ECO:0000313|EMBL:EDS74395.1}; TaxID=428126 species="Bacteria; Firmicutes; Erysipelotrichia; Erysipelotrichales; Erysipelotrichaceae; Erysipelatoclostridium.;" source="[Clos similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 56.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1881
  • Evalue 0.0
glycosyl hydrolase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 41.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 804
  • Evalue 6.00e-230

Lists

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Notes

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Taxonomy

[Clostridium] spiroforme → Erysipelatoclostridium → Erysipelotrichales → Erysipelotrichia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5064
ATGAAATTTAAGCGTATCATTAATAGTTTACTTAGTGCCGCTATGATAGTGAATTTAATTCCATTTAATGCAATGACAGTTTCAGCTAAAACTTCACCTAACGTAAATTTGGCATTAAACAAGAATGTAATTGCAAGTGCTGAGTACAGTACCATGCCTGCTAGCAATTTAACAGATGAAGATGAGGGGTCTAGATGGTCATCAGAAAGTAAACCAGTTCAGTGGGCATATGTTGATTTAGGTCAGGAAGAAGAGTTAAATTATTTTCGAATGATCTGGGAAAGCAATGAAAATTATGCCTCAAGCTATAATATTTATGTATCTAATGATATTAACAATTGGGGGGACCCAGTAGCTGTACAAGCAGGTAATACTACAAAAATATCTGAAAATTTATTAGAAGAATCTGTAAAAGGAAGATATGTAAAGTTAGAAGTAACTGAACAAAAGGGCTATCCTAACGTTTCTTGCAGTGATTTTAAAGTAATGTTAAAAGATTCATCTATGCCTGATGAGCAAGATCCATCAGAAAATATTGCTTTAGGAAAAGAAGTTTTTGTTAGTGATTCTGAAACAAGTTCTTTAAGTGGAGATAAAGCTGTTGATGGTGATACTACATCAAAAGGATCTCGTTGGTCTGCAACTGGAAAGCCAGCTTGGATTTATGTAGATTTAGGTAAAAAACAAGATATAAAAACAATTAATTTATTTTGGGAAAGAAGAAATGCTACAAAGTATGAAATACAAATAGCTGACACATTAAGTAACCCTATGAATGATAATGACTGGAAAACAGTACAAAGTTTCACTGAAAATCCATCTAGAAAGGATCAAAAAATCATTCTAGATAAAGTATATAATGCAAGATATGTAAGATTATATATCAATGAATATACTGCAGATGATCCTGATGGAATTGTTACATGGAATTCTGTTTCACTTTATGAAATGGAGGTTTATGGGGGAGATACTAAAAAAAGCATCTCTGATATTGTAAATTCTATTAATATTGAATCTCCTAAGAAAGGTGATAAAAAGCTAGATATTTCTAATTTACCAAATGAAGATGGTTTTATTGTTGAATATAATGGTACTGATTATGAACAAGTAATTGGTGAAGATTTAACAATTTATGAACCTATAACTGATGTTACTGTAAACGTCTCATTTAAAGTTACTAATGAAGAGACTAAAGAGTACAAGTTCAAAGAATGCGCTATAAAAGTTCCTGGTAAATATACAAATGAAGAAGGGGAGAATGTTTCTCCAGTTGTAATTCCTGAACTTCGTGAATGGAAAGGAAGCAAAGGAAACTTTACAATTTCAAATTCGTCTAGAATTATTGTTCCTTCAGAACTTAAAGAAATGGCTGAAACTTTTGCTGAAGATTATAAGGCAATGAGCGGTAAAACATTAAAGGTAGTTTCAGGAGTAACACCTAAGGCTGGAGATATTTCTTTTACTTTAACAAAGGATCAATCTAAAGGTTTACAAGATGAAGGATATTTAATGGATATTTCTGATTATATTACAGTAGAAGCTGAAACAGAAACGGGTTCTTTTTGGGCAACAAGAACAATATTACAGATTTTAAAACAAAATAATAATATTACAATTCCAAAAGGAGTTACAAGAGATTATCCACTATACGAAGTAAGAGGATTTATTCTTGATGTAGGTCGTAAGACATTTACTATGGATTATTTAGAACAAATAGTAAAGGAAATGTCATGGTATAAATTAAATGATTTCCAAGTTCATTTAAATGATAACCTAATTCCGTTAGAAAACTATTCTTCTGCTGGTAAAGATCCAATGGAAGCTTATTCTGCATTCCGTTTAGAGTCTGACATAAAAGAGGGCGGTAATAACGGATTAAACAAAGCTGATTTAACAAGCACAGATATGTTTTATACTAAAAATGAATTTAATGAATTCATTAAAACTTCAAGAATATATGGGGTTAATATTGTTCCTGAAATAGATACTCCTGCTCACTCTCTTGCACTAACTAAAGTACGTCCTGATCTACGTCACGGAACATGGGGACGTGATAATGATCACCTTGCTTTAAAAACAAAATATGATGAATGCTTAGAGTTTGTTAAGAGTATTTTTGATGAATACATGATGGGTGAAGACCCAGTATTTGATGACCAGACGATCATTCATGTAGGAGCAGATGAATATAATGCAGATAAAGAATCCTACAGAAAATTTGCAGATGATATTTTAGAGTATGTTCAAGATACAGGAAGAACTGCACGTATATGGGGAAGCTTATCTCAATGTAGAGGTACAACTCCTGTAAGAAGTGAAAAGGTACAAATGAATTTATGGAACTTTGGTTATGCTAACATGGATGAAATGTACGAACAAGGCTTTGATTTAATTAACTGTAATGATGGTAACTACTATATTGTTCCTAACGCAGGGTATTATTATGATTATTTAAATGATAATACTATGTATAACCTACCAATTAATTCTATTGGTGGTGTTACTATTCCTGCTGGTGATGATCAAATGATTGGTGGTGCATTTGCTGTATGGAATGATATGACTGACTATCTTGATAATGGTGTAAGTGAATATGATGTTTATGATCGTATTGGTGTAGCAATGCCATTATTTGCTGCAAAACTATGGGGTAAAAATGACTTATCATTAGATGAAGCAAAAGAAAAAATTAATGAAATTGGAGAAGACCCTAGAGTAAACTTTGATTATGATGTAGAAACAAAATCTGAAAATATTGCACAATATAATATGGACGATTTAAAAGATTCATCATCTAATGGATATAATTTAGCTTCAGGAAGTAATGCGGAAATTAAAGAAGAAGATGGTAAAAACGTTTTAGAGTTAAAGGGTAATGAAAGCTACGTTCAATCTAAGTTAAATACAGTAGGATTGAATAATGATTTACGTGTAAAGGTTAAGCGTACTTCAAATAGTAAAGAAGAACAAATTTTATTTGAATCAGAATACGGTTCTATAAAAGCAGTTCAAAAGGATACTGGAAAAGTTGGTTTCTCAAGAGAAAATTATGATTATTCATTTAATTATGAACTACCTGTAAATGAATGGGTAGAATTAGAATTTAAGAATGAGTTAAATCAAATTTCTTTATATGTAAATGGAAACTTAGTGGATACCTTAGGTGATGGAGAAAAAGTAGAAGGAAGACCATTACTTGCAACTAATATGTTCCCTATGCAATATATTGGAAGCAAAACTAAATCATTTATAGGATATGTAGATGATATAAGATTAGCTAAAAATGCAGAATATGCTTCCACTATAGAATTAGATTATGCAGTATGGAATGCTAGTGAATATTTAAAAGAAAATAAAAACCATAAACTAAGTGCATTAATAAAGGATTCTAAGAAGATATTTACTAAATATAATCCAACATCACAAGAAATTAGCGAAAAAGCTAATGAAATTAATGCAATATTAAAGGATTTAGATTTTGAAAAAGCTGATTATTCTAGAGTAAATGCATATTTATCTTTAATTCCAGAAGACTTATCTCCATATACAGAAGAAAGTGTAAATGTATTGTTATTTGTAAAGAATAGCATTAGAGGAGACTTACCAGCTTCATTACAGTCTACAGTAGATGGATACGAAAAATCATTAGCATCTGCATTAAATGGATTGGTAGCAAAACCTATAAAAAATGTTAATTATATTGATAATTCAATAATTAAAGCTACAGCTTCTAGTTATCAAAAAGATGGATCTGATCCTAAAAATGTATTAGATGATAACACTGGAACTATGTGGCATACAGATTGGAATGTAACTACAATGCCTCATTGGATTGACCTTGAAATGGACGAGCCAACTAAGGTAAATGGATTGACATATGTTCCTCGACAAAGTGGACTTAATGGAACTATTACTAAATACGAGATTCAAGTAAGTGATGATGGTGTTAACTATACAAAGGTTAAGGAAGGAACCCTGGCAAGAAATTCTGAAGCAAAAATTATTGAGTTTGATGCAGTTACAACTAAACATGTAAGATTAGTTGCACTAGAAGCAGTAAATAATAATGGAACAGCTTCTGAAATTAAATTGTATGCAGTGGATGTAAAAGCAGATCTTGAAGGTTTAAATAAACTTATTGCTCAAGCTTCAGCTATTGAAGATCAAGGATTTACAGTAGATTCTTGGAAAACTCTTCAAGATAAGATTGTAGAGGCAAAAGCTTTAGTAGATTCAGAAGAACCAAATGCAAATGATGTTGAAATTATGAAAACAGAATTATCAGTTGCAATGGTTAGTTTAATATTAGAAGACAACACAGTTGAAGTGGATAAATCTCAATTAGAGGATCTATATAATAAGGTTAAGTCCCTAGAAAAGGATGATTATACTGAGGAGAGCTGGAGTTTATTTATCAAAGCATTAGAAAAGGCAAAAAGCGTGTTAAATGATGATTTAGCTACGCAAGAAGCAATTAATAATGCATTCAATGAGTTAACTGATGCTTACGATAAGCTTGTTAAAACAACACCAGAAGAAGAAATCTCAAAAGATGATTTACAAGCTTTCTTAAATAAAATAGAAGGCTTGGATACCTCTAAATATACACAAGCTTCCCTTAAAGTATTTGAGAATGCTGTTAAAAATGCTCAATTGGTATTAGATAATACTAATGCTTCAAAAGAAGAAATTGAAGCAGCATATAATAATCTTGCAGATGCATTATCTAAGCTTGAAGTAAAAGTGGATAAAACTAGACTAATAAAGTTATATAATAAACTTATTAAATTAGAAAAGGGAAATTATACAGATGGAAGCTGGAATAACCTAAAAAATGCTTTAGATTCTGCAAAAACTGTTATTGAAAATAAAGATGCCACAACAGAAGAAGTTGAAAAGGCAATAGCAGAATTGGAAAATGCATTTAACAATTTAAAACAAATAGAAGGACAAAGTGTAGCTACTGGAGATAATGCAAATATAGGTTTATGGTTTGCACTTTTAGTTATATCTGTTGCAGGAGCTTGTTTTGTAGTATTAAAAAAAGAAAATAAAATAAGTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1688
MKFKRIINSLLSAAMIVNLIPFNAMTVSAKTSPNVNLALNKNVIASAEYSTMPASNLTDEDEGSRWSSESKPVQWAYVDLGQEEELNYFRMIWESNENYASSYNIYVSNDINNWGDPVAVQAGNTTKISENLLEESVKGRYVKLEVTEQKGYPNVSCSDFKVMLKDSSMPDEQDPSENIALGKEVFVSDSETSSLSGDKAVDGDTTSKGSRWSATGKPAWIYVDLGKKQDIKTINLFWERRNATKYEIQIADTLSNPMNDNDWKTVQSFTENPSRKDQKIILDKVYNARYVRLYINEYTADDPDGIVTWNSVSLYEMEVYGGDTKKSISDIVNSINIESPKKGDKKLDISNLPNEDGFIVEYNGTDYEQVIGEDLTIYEPITDVTVNVSFKVTNEETKEYKFKECAIKVPGKYTNEEGENVSPVVIPELREWKGSKGNFTISNSSRIIVPSELKEMAETFAEDYKAMSGKTLKVVSGVTPKAGDISFTLTKDQSKGLQDEGYLMDISDYITVEAETETGSFWATRTILQILKQNNNITIPKGVTRDYPLYEVRGFILDVGRKTFTMDYLEQIVKEMSWYKLNDFQVHLNDNLIPLENYSSAGKDPMEAYSAFRLESDIKEGGNNGLNKADLTSTDMFYTKNEFNEFIKTSRIYGVNIVPEIDTPAHSLALTKVRPDLRHGTWGRDNDHLALKTKYDECLEFVKSIFDEYMMGEDPVFDDQTIIHVGADEYNADKESYRKFADDILEYVQDTGRTARIWGSLSQCRGTTPVRSEKVQMNLWNFGYANMDEMYEQGFDLINCNDGNYYIVPNAGYYYDYLNDNTMYNLPINSIGGVTIPAGDDQMIGGAFAVWNDMTDYLDNGVSEYDVYDRIGVAMPLFAAKLWGKNDLSLDEAKEKINEIGEDPRVNFDYDVETKSENIAQYNMDDLKDSSSNGYNLASGSNAEIKEEDGKNVLELKGNESYVQSKLNTVGLNNDLRVKVKRTSNSKEEQILFESEYGSIKAVQKDTGKVGFSRENYDYSFNYELPVNEWVELEFKNELNQISLYVNGNLVDTLGDGEKVEGRPLLATNMFPMQYIGSKTKSFIGYVDDIRLAKNAEYASTIELDYAVWNASEYLKENKNHKLSALIKDSKKIFTKYNPTSQEISEKANEINAILKDLDFEKADYSRVNAYLSLIPEDLSPYTEESVNVLLFVKNSIRGDLPASLQSTVDGYEKSLASALNGLVAKPIKNVNYIDNSIIKATASSYQKDGSDPKNVLDDNTGTMWHTDWNVTTMPHWIDLEMDEPTKVNGLTYVPRQSGLNGTITKYEIQVSDDGVNYTKVKEGTLARNSEAKIIEFDAVTTKHVRLVALEAVNNNGTASEIKLYAVDVKADLEGLNKLIAQASAIEDQGFTVDSWKTLQDKIVEAKALVDSEEPNANDVEIMKTELSVAMVSLILEDNTVEVDKSQLEDLYNKVKSLEKDDYTEESWSLFIKALEKAKSVLNDDLATQEAINNAFNELTDAYDKLVKTTPEEEISKDDLQAFLNKIEGLDTSKYTQASLKVFENAVKNAQLVLDNTNASKEEIEAAYNNLADALSKLEVKVDKTRLIKLYNKLIKLEKGNYTDGSWNNLKNALDSAKTVIENKDATTEEVEKAIAELENAFNNLKQIEGQSVATGDNANIGLWFALLVISVAGACFVVLKKENKIS*