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NECEvent2014_5_7_scaffold_474_1

Organism: NECEvent2014_5_7_Clostridium_perfringens_28_149

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 MC: 1 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: comp(79..5142)

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
F5/8 type C domain protein n=1 Tax=Clostridium perfringens (strain ATCC 13124 / NCTC 8237 / Type A) RepID=Q0TR08_CLOP1 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 3341
  • Evalue 0.0
  • rbh
F5/8 type C domain-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 99.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 3341
  • Evalue 0.0
F5/8 type C domain protein {ECO:0000313|EMBL:EDT72968.1}; TaxID=488537 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium perfringens D str. J similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 3332
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

Clostridium perfringens → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5064
ATGAATAAGAGAAAAATAGCAGCTATAATTTTAGCTACGATGATTACAAATCTTTCTGCTACAACAATTGATGTTTTAGCACAGGAATTAAACACTAAAAACAATTCTAAGGTAGAAGTTAGTCATGATGATGAATCACATCAAGCAAGGGTAAGTAAGTTTGATTTATATAATAGTGATAAATTAGACGCTTATAATCAAGAATTTCAAGTCAGCAGATCAAATATAAAATCCATAAATAATAATGGTGGAAAGTATAATAGTTCTACTATTGATAAAGCCATAGATGGCAATCTAGAAACTCATTGGGAAACAGGAAAACCTAATGATGCAAATTTCACAAACGAAGTAGTAGTTACATTTAATGAAATAACTAATATAGATAGAATTGTATATTCTGCAAGAAGAGACTCTGCAAGGGGAAAAGGCTTTGCAAAAGAATTTGAAATATATGCTTCTCTTAAAGATGAGGGAGATGATTTTAATTTAGTAAGCAGTGGAGAATATACAGAATCAACTAGAGATTTAGTTGAAATAAAGTTTAATCCAACTGACTTTAAAAGATTAAAGTTTAAGTTTAAAAAGGCTGACCAGAACTGGGCTTCAGCAGCAGAATTTATGTTTTATAAAGAAGATAAATTAAATGAAAAGTTTAATGGATTATTTACAGATTCTAGTATGAATAAAGTATCTGAGGAATTTAATACATTAGAGAAATTAAATGCCTTTGAGAATGAATTAAAAGATCATCCAATTTATGATTTATACAAGGAAGGACTAAATAATGCTAGAGCTATTTTAACAGAAACTTCTGAGAATCCTACTAAGGCAACTTTAGGACAAATAACATATAATCTTAATGATGATTATAATAATCAATATAGAATGCCTTATAAAAATATAAAAGCAATAAAAAATAATGGAAGACATTATGCTGCTCAAAATATTGAAAAGGCTATTGATAATGATGTAAATACTTATTGGGAAACAGGAACATTAAATAGTTCTTCTTTTAACAATGAAGTTGAGGTTGAGTTTAATGATTTAGTAACTTTAGATAGAATAGTTTATGGTTCTAGACAAAGTGACTTAAAGGGCTTTGCTGAAGAGGTTTATATATATGCTTCTAGAACAAGTAAAGGGGATACATATAAGTTAGTTGCTACAGGGGCTCATGAAGCTACTAAGGGATTAGTTGAAGCTAAATTTGAGCCTACAGAATTTAAAAGAGTTAAGTTTAAATTTAAGAAATCTAAACAAAATTCTGCAACTTTAAATGAATTAATGTTTTATAAACCAGATGAAGTTTATTCTTCAATACCTAAGCTTTTCACAGATGGTACTATGAGTGAACTTAGTGAAGAGTTTAATAGTTTAGAAAAAATAAATGCCTTTAAAGAAAAAGCTAAAAATCATCCATTATATAATGACTTTAACGAAACTATAGAATTAGCCGAATCATTAATTTCTAATCCAAGAAAAGAGGATGTACTTGAATTAGAAATGAGAGGAGATTCTATAAGTGAAGCTAAAAAGAGAAAGGTATGGAATTTCCAAGACTGGCAAATAACAGGACTATCTGCTAGAGCTGGAGATAAAATAACTGTATATGTGGATGTAGCAGAAGGTGATCCTACTCCAACATTATTATACAAACAATCTTTAACTCAACATGGTGGAGCAACAAGCTTCCAATTAAAGCCTGGTAAAAATGAAATAACTATACCAGAAATAAATTATGAATCTAATGGAATACCTAAGGATGTTATTCAAGGGGGAGATTTATTCTTCACTAATTACAAAAGTGATAGTCAAAAGAGAGCACCAAAGGTAAGAATAGAAGGTGCAAGCAAATATCCTGTATTTATTCTAGGAAAATCAGATGAAAATGAAGTAATGAAAGAGTTAGAAGCCTATGTTGAAAAAATTAAAGCAGAACCTAAGACTACTCCAAATATTTTTGCAGTAAGTTCTAACAAGTCATTAGAATTTGTACAAGCTACCTATGCTTTAGATTGGTATAAGAAAAACAACAAAACTCCAAAGTACACAGCGGAGCAATGGGATCAATATATAGCTGATGCTATGGGATTCTGGGGATTTGATAACTCAAAAGATGTTAATTCAGATTTTAATTTTAGAATAATGCCTATGGTTAAGAACCTTAGTGGTGGAGCATTCATGAATGCTGGAAATGGTGTTATAGGTATAAGACCTGGAAATCAGGATGCAATACTTGCAGCTAATAAAGGATGGGGTGTTGCTCATGAACTTGGACATAACTTTGATACAGGCGGAAGAACCATAGTAGAAGTAACAAATAATATGATGCCATTATTCTTTGAGTCTAAATATAAAACTAAAACAAGAATAACTGACCAAAACATATGGGAAAATAATACCTACCCTAAAGTTGGCTTAGATGATTATTCTAATAATGAGTTATATAATAAGGCTGACAGTACTCATTTAGCTCAGTTAGCGCCATTATGGCAATTATATTTATATGATAATACTTTCTATGGAAAGTTTGAAAGACAGTTTAGAGAAAGAGATTTTGGAAATAAAAATAGAGAAGATATATATAAATCTTGGGTTGTGGCAGCATCAGATGCTATGGAGTTAGATTTAACTGAGTTCTTTGCAAGACATGGTATTCGTGTTGATGATAAGGTTAAAGAGGATTTAGCTAAGTATCCAAAGCCTGATAAAAAGATCTATTACTTAAATGATTTAGCAATGAATTATAAAGGTGATGGATTCACAGAGAATGCAAAGGTATCTGTAAGCACAAGTGGTTCAAATGGTAATATAAAACTTTCATTCTCAGTAGATGATGAAAATAAAGATAATATACTTGGATATGAAATACGCAGAGATGGAAAGTATGTAGGATTTACTTCTAATGATAGCTTTGTTGATACTAAATCTAATTTAGATGAGGATGGTGTATATGTAGTAACACCATATGATAGAAAGTTAAATACCTTAAATCCAATAGAGGTAAATGCATTGCAACCAACTTTATCTGTAAACCCAGTGATTACACTAGCTTTAGGTGAGGAGTTTAATGAAGAAGAATATATTGTAGCTAAGGACATAAAAGGTAATTCTCTAAGTGAATCTGTAAAAGTTAAATCAAGTAATGTAAATACTTCTAAAGTTGGAGAATATGAAGTTTTATATAGCTTAGAAGATTCTAAAGGCAATGAATACACTAAAACTTCTAAGGTTAATGTTGTAAGTAGAAAAGAGTATATGAGTGATTTAACTCCTAAACAATCTTCAAATGGATGGGGAACTGTTAGAAAAGATAAGAGCATAAGTGGAGGAGTAATAGGTCTTACAAGAGATGGAGACTTTGTTGACTATAATAAGGGATTAGGTCTTCATTCAAATGCAGAGTATGTATATGATTTAGAAGGAAAAGATTATGACTACTTTGAATCTTATGTAGGTGTTGATAAAGCAATGTCATCTAGACCAGCCTCTTCAGTTATTTTTAAAGTTTTAGTTGATGGAGAAGAAAAGTTTAATAGTGGAGTAATGAGAAGTACAACACCTCAAAAATATGTTAAGGTGGATGTAAAAAACGCTAAGGAGCTAAAATTAATAGTAAATGATGCTGGAGATGGAGATAGTTCAGATCATGCAAGCTTTGGAGATGCTAAATTAGCTACTTTATCTTCAAAACCAATAATTAAAGGTGAAAATTTAGCTTATAGTATGGATGAAAAAGTAGATTTAATGGAAGGAATAACTGCAACAGATATTGAAGATGGAAATATAACTTCTAAAATACAAATAAAATCTTCAGACTTTGTTGAAGGAAAGTCAGGAATATTTACAGTTGTGTACTCAGTAACAGATAGTGATGGATTAACCTCTGAATGTTCAAGAACTATAGCAGTTACAGATAAAGAAACTCAATTATCTGATTTAAATTGGAAATCTGCAACTATAGGCTCAGGTTCTGTAAGAAAAGATAGAGCAGTAAGTGGAAATCAAATAAGATTATTAAATGAAGATAATTCTGTTGAAACCTTTGCTAAAGGAATAGGAACTCACTCATATTCAGAAATAGTTTATAATTCAGAAGGGTATGATATCTTTGACACTTGGGTAGGTATTGATAGACATGTTGCAGACAAAAAAGTTTCTAGTGTTAAGTTTAAAGTATATGTTGATGGAGAATTAAAGGCTGAAACAGATGTAATGAGAATTGATACTCCAAAGAAACGTTTAGTTGTAGATGTAAGAAACTCTAAAGAGATTAAATTAGTAGTAGATGTAGCTGATAATGGAAACACTTGGGATCATGCAGACTGGGCAGATGCTAAGTTTAGAAATTTAGCAGAGTATGATGCATCAGAGTTAAATAAGGCAATAGAAGAGGCTAAAAAATTAGACTTAAATAATTACACTGAAGAAAGTTCAGAAGCTTTAAAAAATGCAATATCAAAGGGAGAAGAAGCCTTACTTTCTAAGGATAAAGAGACAATAAATTCTGCCCTTGAAGAGTTAAATAAGGCAATGGATTCTTTAGTAAAAGTAGATTTAAATGCTGTTATTAATATACCAGATAAATATTTGCTTAAGTCCATTCAAAATCAATTAAATAAAACTGGAGATATAACTTTAGGGGACATGTACAGTTTAACTACATTAACATTAAGTGGAGTTGTTGATTTAACAGGCTTAGAAAATGCTAAAAATTTAGAAACTTTAAATATGTATTATAATGAAGTTAAAGACTTAAGACCTTTATCAAAATTAAAGAAGCTTAATACATTAAATGCACAAGAGCAATTTATTGCAGCAGGAGAGTTAAAGCCTTCTAATGGTAAAGTTATAGGTGACTCAAAAGTATATAATAGAGAAGGAAAAAATGTAGCTAAAACTATTAGAGTTGTTGATAAAAATGGAAATACAATTCTAGAACAAGATGCTAAAGATGAATTCACAATAAACACTAAGGATTTATCATCAGGATTATATGGTGTTCATGTATTATTTGAAGATGAAGGTTTTAGTGGAGTAATGTTCTATTTATTTAACGTATAA
PROTEIN sequence
Length: 1688
MNKRKIAAIILATMITNLSATTIDVLAQELNTKNNSKVEVSHDDESHQARVSKFDLYNSDKLDAYNQEFQVSRSNIKSINNNGGKYNSSTIDKAIDGNLETHWETGKPNDANFTNEVVVTFNEITNIDRIVYSARRDSARGKGFAKEFEIYASLKDEGDDFNLVSSGEYTESTRDLVEIKFNPTDFKRLKFKFKKADQNWASAAEFMFYKEDKLNEKFNGLFTDSSMNKVSEEFNTLEKLNAFENELKDHPIYDLYKEGLNNARAILTETSENPTKATLGQITYNLNDDYNNQYRMPYKNIKAIKNNGRHYAAQNIEKAIDNDVNTYWETGTLNSSSFNNEVEVEFNDLVTLDRIVYGSRQSDLKGFAEEVYIYASRTSKGDTYKLVATGAHEATKGLVEAKFEPTEFKRVKFKFKKSKQNSATLNELMFYKPDEVYSSIPKLFTDGTMSELSEEFNSLEKINAFKEKAKNHPLYNDFNETIELAESLISNPRKEDVLELEMRGDSISEAKKRKVWNFQDWQITGLSARAGDKITVYVDVAEGDPTPTLLYKQSLTQHGGATSFQLKPGKNEITIPEINYESNGIPKDVIQGGDLFFTNYKSDSQKRAPKVRIEGASKYPVFILGKSDENEVMKELEAYVEKIKAEPKTTPNIFAVSSNKSLEFVQATYALDWYKKNNKTPKYTAEQWDQYIADAMGFWGFDNSKDVNSDFNFRIMPMVKNLSGGAFMNAGNGVIGIRPGNQDAILAANKGWGVAHELGHNFDTGGRTIVEVTNNMMPLFFESKYKTKTRITDQNIWENNTYPKVGLDDYSNNELYNKADSTHLAQLAPLWQLYLYDNTFYGKFERQFRERDFGNKNREDIYKSWVVAASDAMELDLTEFFARHGIRVDDKVKEDLAKYPKPDKKIYYLNDLAMNYKGDGFTENAKVSVSTSGSNGNIKLSFSVDDENKDNILGYEIRRDGKYVGFTSNDSFVDTKSNLDEDGVYVVTPYDRKLNTLNPIEVNALQPTLSVNPVITLALGEEFNEEEYIVAKDIKGNSLSESVKVKSSNVNTSKVGEYEVLYSLEDSKGNEYTKTSKVNVVSRKEYMSDLTPKQSSNGWGTVRKDKSISGGVIGLTRDGDFVDYNKGLGLHSNAEYVYDLEGKDYDYFESYVGVDKAMSSRPASSVIFKVLVDGEEKFNSGVMRSTTPQKYVKVDVKNAKELKLIVNDAGDGDSSDHASFGDAKLATLSSKPIIKGENLAYSMDEKVDLMEGITATDIEDGNITSKIQIKSSDFVEGKSGIFTVVYSVTDSDGLTSECSRTIAVTDKETQLSDLNWKSATIGSGSVRKDRAVSGNQIRLLNEDNSVETFAKGIGTHSYSEIVYNSEGYDIFDTWVGIDRHVADKKVSSVKFKVYVDGELKAETDVMRIDTPKKRLVVDVRNSKEIKLVVDVADNGNTWDHADWADAKFRNLAEYDASELNKAIEEAKKLDLNNYTEESSEALKNAISKGEEALLSKDKETINSALEELNKAMDSLVKVDLNAVINIPDKYLLKSIQNQLNKTGDITLGDMYSLTTLTLSGVVDLTGLENAKNLETLNMYYNEVKDLRPLSKLKKLNTLNAQEQFIAAGELKPSNGKVIGDSKVYNREGKNVAKTIRVVDKNGNTILEQDAKDEFTINTKDLSSGLYGVHVLFEDEGFSGVMFYLFNV*