ggKbase home page

NECEvent2014_5_7_scaffold_2333_2

Organism: NECEvent2014_5_7_Peptoclostridium_sordelli-rel_28_6

near complete RP 49 / 55 MC: 2 BSCG 50 / 51 MC: 3 ASCG 13 / 38
Location: 1223..2782

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
MatE family protein n=1 Tax=Clostridium sordellii VPI 9048 RepID=T0DZ12_CLOSO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.2
  • Coverage: 519.0
  • Bit_score: 978
  • Evalue 1.90e-282
  • rbh
Polysaccharide biosynthesis protein {ECO:0000313|EMBL:CEQ09263.1}; TaxID=1505 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Peptostreptococcaceae; Peptoclostridium.;" source="Clostridium s similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 519.0
  • Bit_score: 983
  • Evalue 1.10e-283
polysaccharide biosynthesis protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 34.6
  • Coverage: 514.0
  • Bit_score: 351
  • Evalue 5.60e-94

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

[Clostridium] sordellii → Peptoclostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1560
ATGAGAAGAAAAAAACTTATAATAAACGCTTTGGTAATGACTTTTTCAACTATTATATTTGGATTTGTAGCTATGTTTTTTAGAGTTTACCTATCTAAAAAAATAGGTACTGAAGGAATGGGACTATATCAACTTATAATGTCTGTGTATATAATGTCTATTACTTTTTCTAGTGCAGGAATTAGGATAGCTATAACAAGACTTGTAGCAGAACAAGTTGGTAGAGGGAACAAAAAAGCTATTAAATCAATAGTTAATAAAGGCTGTATTTACAGTTTGTTTTTTAGTTTAATAACATCAGTTATTCTTTTTTATGGAGCAGAATATATAAGTCTAAACTTTTTAAATGATAAAAGGGCTATATCATCATTAAAGATATTATCATATAGCCTTCCTTTTATAGGTGTATCATCATGTTTAAGTGGATACTTTTATGGAGCAAGAGAAGTTGTAAAATCTGTTTCTGCTGAAATTATAGAAAATTTAATAATGATGGTAATAGTAATACTATCAATAAATATATTTATTGATAGTAGCATAGAAAAAGTATGTGCACTTATATGTGTAGGAATGGCTGTTGGGAGTATAATATCTTGCATTTATGCATATTTTTTATGTGCATTAAAGGTAAGAACTTTAAATAGAACAGCTTCACTTAGTAGTTACAGTGAATGTAAAATCATTGATATAACTAAAATAGCACTTCCTATAGCATCTAGTTCATATATACAAAGTGGACTTAGAACTATAGAGGATGTATTAATACCAAATGCTCTTAGAATGGCTGGAACATCTTTATCTACATCCTTATCTATATTTGGCATGATAAAAGGTATGGCATTGCCTATAATAAATTTTCCAGCTGTATTTTTAAGTTCTTTTGCAACTTTAATAATACCTGAAATTGCCGAAGCACACTCACTTAATAGAAATAAAATGGTTAACTTTATAATATCTAATGTGTTTAGAATAACTTTTATAATATCTATTTTTGCATCAGGTATATTTATAACATTTTCAAATGATATTGGATTTTTGGTATATAATAATAAGGAAATAGGGTCGATTATAAAAATTTTAGCTCCTGTAATTCCAATAATGTATCTAGAGAGAATTATGGATGGGATTTTAAATTCCTTAAATAAACAAGTAGCACTTTTAAAGATAAATTTAGTAGACATGATAATTAGAATATTAATAATATACTTTATAATACCAACAAGGGGCATAGAAGGTTTTATAATAGTTATATTTGTAAGCAATATTTTTAATTTTACATTGAATATGATTAATGTTTTAAAAGTTACTAACCTTCAATTTAATATTTTTAGTTGGGTATTAAAGCCTATAATATGTGTAAGTATATCAGCTATTTCAGCATATTACATAAGTAATGAGTTTTTAAGTAGACTTTTAGTTTCAATGGTTATATATGCTATAATGCTTATGGTGACAAGATGTGTAAGAATAAAAGATGTACGTTGGATATTTGATAGTTTTAGGTTAATAAAAGATGTAAACGTAAATAGTATAAAATTATATAATGATAGATATTTATAA
PROTEIN sequence
Length: 520
MRRKKLIINALVMTFSTIIFGFVAMFFRVYLSKKIGTEGMGLYQLIMSVYIMSITFSSAGIRIAITRLVAEQVGRGNKKAIKSIVNKGCIYSLFFSLITSVILFYGAEYISLNFLNDKRAISSLKILSYSLPFIGVSSCLSGYFYGAREVVKSVSAEIIENLIMMVIVILSINIFIDSSIEKVCALICVGMAVGSIISCIYAYFLCALKVRTLNRTASLSSYSECKIIDITKIALPIASSSYIQSGLRTIEDVLIPNALRMAGTSLSTSLSIFGMIKGMALPIINFPAVFLSSFATLIIPEIAEAHSLNRNKMVNFIISNVFRITFIISIFASGIFITFSNDIGFLVYNNKEIGSIIKILAPVIPIMYLERIMDGILNSLNKQVALLKINLVDMIIRILIIYFIIPTRGIEGFIIVIFVSNIFNFTLNMINVLKVTNLQFNIFSWVLKPIICVSISAISAYYISNEFLSRLLVSMVIYAIMLMVTRCVRIKDVRWIFDSFRLIKDVNVNSIKLYNDRYL*