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NECEvent2014_5_8_scaffold_250_21

Organism: NECEvent2014_5_8_Clostridium_sporogenes-rel_28_12

near complete RP 51 / 55 MC: 4 BSCG 51 / 51 MC: 3 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: comp(20702..22693)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Efflux ABC transporter, permease protein n=1 Tax=Clostridium sporogenes ATCC 15579 RepID=J7T4Y0_CLOSG similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 97.4
  • Coverage: 660.0
  • Bit_score: 1227
  • Evalue 0.0
  • rbh
Clostridium botulinum B2 450 B2_450_contig007, whole genome shotgun sequence {ECO:0000313|EMBL:KIS24056.1}; TaxID=1379739 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clos similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 660.0
  • Bit_score: 1260
  • Evalue 0.0
ABC transporter permease similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 94.2
  • Coverage: 667.0
  • Bit_score: 1193
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium botulinum → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1992
ATGATAATTATGTATTCTAAGATAGCTCTTAAAAATATAAAAAAGAGTTATAAGGATTATACTATATATTTTTTAACACTAATATTAGCTGTTTGTATATTTTATAGCTTTAATTCAATAGAATCACAAAAGGTACTTATTGAAATAAAATTTATGTCTGAAATAATGAAGGGCATTTCAGGTGTTTCAGTGTTAGTATCCATAATATTAGGTGGATTAATAGTGTATGCAAATAATTTTTTAATAAAAAGACGTAAAAAAGAGTTAGGAATTTATATGATTTTAGGTATGGGAAAAAGAAAGATATCTAGAATTTTAGTAACGGAGACCTTTATAGTGGGAGTTATATCTTTAGTTGGTGGACTTATATTAGGAATTGGAGTATCACAAGGGTTATCTACATTTACTTTAAAGTTATTTGATGTGGGAATGGATGAATATAAGTTTATAGTTTCAACAAGTGCTATAGGTAAGACTATATTATACTTTGGAACAATGTTTTTGCTTGTTATGATATTTAATGTATTTGTTATTTCTAAATATAAAGTTATTGATCTATTAATAGCCAACATAAAAAATGAAGACATAAAATTTAAAAATCCATTTATATATTTATTAACATTTGTTTTATGTTTAATATTTCTTGGATTTTCATATAAATCTTTGCTAGAGATACGTTTTGATTTAGAACGTAATATGTCTATACCAATAGCTCTTGCTATAGTAGGTACAGTATTATTTTTCTTTAGCTTAGCTGGAGTTATATTATATGTAACAAATAAAAACAAAAAGATATATTTTAAAGGGTTAAATATGTTTGTATTAAAACAAATGAACAGTAAAGTTAATACAAACTTTATATCAATGTCTTTAATATGTTTAATGCTATTTATTACAATAGTGGTATTATCTACAGGAATAAATTTTAAAAAAGTTAAAGAAGAAGAACGTAGAAAAATCACTCCCTTTGATGCCAGTGTAACGTTATACAATAAAGATGAAAACAAAAATCAAAAGAATCATATAGAAGATATGTTAAATAAAATTGATTTCCAAAAGAGTAAAAATGAAAAATATGCAGTTTACAATGATTATTATACAGGATTAAAAGCAAGTGAGTTATTAAAGATTGAGGAAAGAAATTTTGCACGTTATGATGTATATTTTAGTAAAATATCTGATTATAATAAAATTTTAAAATTAAAGGGTGAAAAAGAAATAACTTTAAATAAGAGTGAAGTTTTAATTTTATCAAGTTCAGGTGGTGCCATTAATCTAATTAATGAAAAATTAAAAAGTAATAGAAGAATTAATATAAAAGGAATAGAATATTTGGTTAAAAATGATAAAGTTATAGAAGAAAATCTTAAAACATCTTCCATTGCGGATAACTTTTGCACAGTAGTTATGAATGATGAATTTGTGTCTGATTATAAAATTAGCTCCTCAATACTTAATGTAATGTATTTAGATAAAAATAGAGAAGAGAATAATAAAAAATATAATAAAATTAATGATAATTATATTAAAGATGAGTATAAGAATTTAGATATTTCTATAGATGCCATTACCAAGGATGGGGTGTACTCTAAAAGTAAGGGAATAACAAGTATGATGCTATTTATTGCAATATATTTAGGAATAGTATTTTTAATAACTAGTATGGCAGTATTAGCTCTCCAACAATTATCAGAGGCTAGTGATAGCATAGAAAGATATAAAGCTTTAAAGAGAATTGGCGCAAACAAAAAAATGATAGACAAAACAATTTTCATTCAAACCTTGGCGTATTTTAGTCTTCCAGTGATTCTTGCGTTAATTCATTCAATGGTTGTAATTAAGATAATTAATGATCTTACCAGCATGATTATTAATACAATTAAATTTAGGTCTTCAATTTTAATAACTGTTTTAATATTTGTTATAGTTTATTTGGGATATTTCTATATAACCTATGCAGGATATAAAAATATAGTAAAAAGCAAAATTTAA
PROTEIN sequence
Length: 664
MIIMYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIESQKVLIEIKFMSEIMKGISGVSVLVSIILGGLIVYANNFLIKRRKKELGIYMILGMGKRKISRILVTETFIVGVISLVGGLILGIGVSQGLSTFTLKLFDVGMDEYKFIVSTSAIGKTILYFGTMFLLVMIFNVFVISKYKVIDLLIANIKNEDIKFKNPFIYLLTFVLCLIFLGFSYKSLLEIRFDLERNMSIPIALAIVGTVLFFFSLAGVILYVTNKNKKIYFKGLNMFVLKQMNSKVNTNFISMSLICLMLFITIVVLSTGINFKKVKEEERRKITPFDASVTLYNKDENKNQKNHIEDMLNKIDFQKSKNEKYAVYNDYYTGLKASELLKIEERNFARYDVYFSKISDYNKILKLKGEKEITLNKSEVLILSSSGGAINLINEKLKSNRRINIKGIEYLVKNDKVIEENLKTSSIADNFCTVVMNDEFVSDYKISSSILNVMYLDKNREENNKKYNKINDNYIKDEYKNLDISIDAITKDGVYSKSKGITSMMLFIAIYLGIVFLITSMAVLALQQLSEASDSIERYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLAYFSLPVILALIHSMVVIKIINDLTSMIINTIKFRSSILITVLIFVIVYLGYFYITYAGYKNIVKSKI*