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NECEvent2014_5_8_scaffold_990_3

Organism: NECEvent2014_5_8_Clostridium_sporogenes-rel_28_12

near complete RP 51 / 55 MC: 4 BSCG 51 / 51 MC: 3 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: comp(2345..5464)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Bacterial membrane protein YfhO n=1 Tax=Clostridium sporogenes ATCC 15579 RepID=J7SHF2_CLOSG similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2107
  • Evalue 0.0
  • rbh
Bacterial membrane protein YfhO {ECO:0000313|EMBL:EDU39431.1}; TaxID=471871 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium sporogenes ATCC similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2107
  • Evalue 0.0
multidrug resistance protein B similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 32.9
  • Coverage: 906.0
  • Bit_score: 485
  • Evalue 2.90e-134

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sporogenes → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3120
ATGATCCGTCAAATACTCTTTAATGTAAAGCAATATTTGAACGAATTAATTACTAAAGATGATAAAATTTCTAGCCTTTTACGCTTTGGTATGATTGGTGTCATAAATACTGTTCATTATTACATATGGTATCTTTTACTTCTATATTTAAATATACCATATATTATAAGTCACACTATTGCTTTTACACTTAGTATGATTGGCTCATATTTTCTTAATTGCTACTTTACTTTTAAAACAAAACCAACTTTGAAAAAGTTTATTAAATATCCCCTTACTACTTTAGCTAATTATTTAATTTCCACATTTTCTTTAGTTTTATTAGTAAAAATTTTTCATATAAATAGTTCAACAGCTGTGCTTTGGGCTGCAATATTACCTATACCTATAACCTTCTTAGTGACTAAGCATATATTGAAAAATTCAGAATCTACTTCAACTATTAAGTTAGATATTAAATCAAAATTTATAGTTATTTTAAAGCTTTTATTACCCGTTATTTTTTTATTATTTTTTTCTATATCGTGTCATTTATACGCTTTATATCGTAAATATCATGGCTTTTTGTTCAGTGTATCAGGTACAGATAGCGACCTTCAATTTATGTACTTTATACCATTTATTCAAAAAGCCTTTTTATCACATCAACCTTTTTGGTCTTGGAGTTATGGTCTTGGCGGAGATATTTTTGGCCAGTTTATTTATTATTATACTACCAGTCCATTTTTTTACTTAATGTTACTATTAAGAAAATTACAATTGGGAAGCTGGACATTAGGGAATACTCTACAATGGAAATTATTATTTAGTATTCTAAAACAGTTTTTATCAATGTGTTTTTTATATTCTTTGCTAAAATATGAAAAAAAGAAAACTTACACTTCGCTTATAGGGGCTATGATCTATGGTGGTTGTATTAATTATATATGGTTTTCTTTGAGTTTTGACTTTATGGCAGATGCATATGTATGGTTACCTATTACAATATTGGGTTTTAGAATATATAATAAAACCGGGAAATGGCTTCTTTTTGTAATTAGTGCTTCATTAACAGTTGCAAACAGCTTCTATTTTGGATTTATCAGTTATATTTTTTATATAATCTTTATTATTACTTTTATAAAAATAGAGGGAACTACTTTCAAAAATAAACTATATTCATTTTTTTGCTCTATTTTTAAATATGCGGTTTTTGCTATAATGGCTTTAGGATTAGCCTCTATATCATTTATTCCTTCAGTTTATGCATTCTTTAACACTGATCGCTTTTCAAATATAGTAAATATCCCTCTTTTTTATGATAGTAGTTATATTTTAAAATTACCTGAAAAACTGTTCTTTTATAATAGTACATTAGGTTTTCCACTAATTATTTTAATTATTTTTGCCTTACCTTGGAAAAAGTTTTCTTCAATTACTAAGCGAAAAACAATTTTAGCAGGAATATTTTTTATTTTATATTTAACTCCATATTCCGGAAGTTTTTTTAACGGTTTTTCATATTCCTGTGATAGATGGTTTTATTTATTTATATTTTCAATAGCATATGCTATACCTGATTGGCTAGAAGAGAATGATAAGTTAAAAAGTTTAGGTTTTCATTTCTTCTCAATAGTTGCAATATTAATAATTTACTTTTATTATACAAAAATGCCTCGTGGATTTAATAACGTTATTCGTAATCTAAAGACCACTAAAATTATCAACCTTGTAATACTAGTATCAGGTTTAGTATCATTATTTACAATAATGTTAAAAAAATATATTTCTAAATACTTTACAACTAAACTTTTAGACTATATTATTGTTTTATGTGTTGCAACTGCTCTTTCATGTAATACAAATGCTTATTTAGCTATGAGAAAGCCTGATGTAACACATGATAAATTACAAAGTTCATCCATAGATAACTTAGAAGAAAAAACAATTTTTAATAAATATACTCCCACAAATAATGAATTTTATAGGACAATTTTTAGAGATTTAATTCACTTAAATGCACCAATGAATTATAATTATTATGGCACAAGTACCTATAACAGTATGATTGATGGGGTTCTTCATAAATGGTTAAAAGTTGATTATAATATTTTGAATACTAATGTTAGTCCCAGCACATATGAAAATTTTGATGATCGCTTATTCTTAGAAACTACCTTTGGTGTTAAATATTTAGTTAAAAATAAAACAAATCCATATACTCCTTCCTATGGGTATACGCTTAATAATGAAACTAATAATTATATTATATACAAAAATAGATATAATGTTGGATTTGATCTATGGTATCCAAATACTATAACTATAAAAGATTATAATAAAATGAATATAGCTCAGCAAGATTCAATACTTCTTCAAACAGCCATGGTTGACGAAAACCTACCTGAGTTGCCAAGAAGTGTTCCTTTTGATGATATAACAACAGAACTTTCATTAGAATGGCAGAATGCAATAACCAAAAATGCTAAATATAAAAATGGAATCTTAAAAGCTGATAAAAATGCTTCTATCATCATTCCTATAAAAAATAATAAAAAAGGAACTGATGGAGAAATATTATTTTCTATTAACTTGCAACCTACCAATGGTCAGAAATTTGTATTAAATGTTAATGGGAAAACCACAAAAAAAATGGAAGAAAATTATGCTTATACCTATCCTCTCAACAAATTTACTTTTAAATTGGATAATAATATTAATGCAGTAAAAATAAATATTTCAGAAGGAGATTACATCATTAGCGATACACACGTATGGTTTAATTCATATAAGTATTACACAAAATGGGTAAATGAACGCAATAAATATAATTTAGAAAATTTATATTTAAATGGCGGAGAGGTTAAAGGTAATATTAAAAATAATGAAAAAGGAATACTTGCTCTTAATATACCATTTTGTAAAGGCTGGTCAGCTAAAGTAGATGGAGAAAAGCAAGATTTAATAAAGGTAAACGGAATACTTACTGGATTGGTATTAGAGCCTGGATCTCATAATATTGAACTAAAGTATATACCACCAGGTTTAATTCCAGGAGCATGTTTAAGTATTGTTTTCTGCATAATAATAATTGTTTCTTATACTTTAAAATGTAAGCATAATTCTTTTAAAGATAATTAG
PROTEIN sequence
Length: 1040
MIRQILFNVKQYLNELITKDDKISSLLRFGMIGVINTVHYYIWYLLLLYLNIPYIISHTIAFTLSMIGSYFLNCYFTFKTKPTLKKFIKYPLTTLANYLISTFSLVLLVKIFHINSSTAVLWAAILPIPITFLVTKHILKNSESTSTIKLDIKSKFIVILKLLLPVIFLLFFSISCHLYALYRKYHGFLFSVSGTDSDLQFMYFIPFIQKAFLSHQPFWSWSYGLGGDIFGQFIYYYTTSPFFYLMLLLRKLQLGSWTLGNTLQWKLLFSILKQFLSMCFLYSLLKYEKKKTYTSLIGAMIYGGCINYIWFSLSFDFMADAYVWLPITILGFRIYNKTGKWLLFVISASLTVANSFYFGFISYIFYIIFIITFIKIEGTTFKNKLYSFFCSIFKYAVFAIMALGLASISFIPSVYAFFNTDRFSNIVNIPLFYDSSYILKLPEKLFFYNSTLGFPLIILIIFALPWKKFSSITKRKTILAGIFFILYLTPYSGSFFNGFSYSCDRWFYLFIFSIAYAIPDWLEENDKLKSLGFHFFSIVAILIIYFYYTKMPRGFNNVIRNLKTTKIINLVILVSGLVSLFTIMLKKYISKYFTTKLLDYIIVLCVATALSCNTNAYLAMRKPDVTHDKLQSSSIDNLEEKTIFNKYTPTNNEFYRTIFRDLIHLNAPMNYNYYGTSTYNSMIDGVLHKWLKVDYNILNTNVSPSTYENFDDRLFLETTFGVKYLVKNKTNPYTPSYGYTLNNETNNYIIYKNRYNVGFDLWYPNTITIKDYNKMNIAQQDSILLQTAMVDENLPELPRSVPFDDITTELSLEWQNAITKNAKYKNGILKADKNASIIIPIKNNKKGTDGEILFSINLQPTNGQKFVLNVNGKTTKKMEENYAYTYPLNKFTFKLDNNINAVKINISEGDYIISDTHVWFNSYKYYTKWVNERNKYNLENLYLNGGEVKGNIKNNEKGILALNIPFCKGWSAKVDGEKQDLIKVNGILTGLVLEPGSHNIELKYIPPGLIPGACLSIVFCIIIIVSYTLKCKHNSFKDN*