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NECEvent2014_6_3_scaffold_124_28

Organism: NECEvent2014_6_3_Clostridium_paraputrificum_29_53

near complete RP 49 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 16 / 38 MC: 1
Location: 24270..28874

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Value Algorithm Source
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:CDE29551.1}; TaxID=1262968 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Ruminococcaceae; Ruminococcus; environmental samples.;" source="Ruminococ similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 32.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 691
  • Evalue 2.00e-195
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 32.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 667
  • Evalue 1.00e-188

Lists

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Notes

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Taxonomy

Ruminococcus sp. CAG:90 → Ruminococcus → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4605
ATGCGAAAGAGAATTATATCCGCTGTATTAGTGATAGGACTTGTTATTGGTTACATTCCATTTCAAAGTTTTGCTGCGGAAATTGGAGATAATGGAAAGGTTATCAATGGAGACTATGTGATTGCAGTAAATACAAATGCAGACCCCAATAATAAACAGAGTAGTGGGACATTAGTATTTGATAGCATGGGAGGAAGAGGGACAACTTCTTTAGAAAATGAACTAAATCAAGAGGCAGAAGATATAGATTTTATTGTAGATGGAAGCGATACCAAAGTAGAGAATAAAAACTTATTCTCAAGACTTTTAGGAGTAGGAGACATATATTCTATAGGAGATGAGAAAAAATTTTATCAAGGAAGGACATATGTTTGCATAGGAGTTTATGATAAGAGTTACATATGGATGGAAAAAAGCATGAAGAATGATTATGATGCTGCTGGAAAGACAAATGATGCAGCAGAAGATATGCGTTCGACTTATGAAAGTAAGCCTTATGAAGTTCTTATGGAATTGAGTGATAATAAATTCCCCTATAATGATGGGTCTGGAAAATTATCTATTCTTTTAGAACAGACTAGTAATGGGTCATCAGGGTTTTATGCAGGTGAAAGTGGAATTACAGCTATACATATTAATATACCGAAAGCAGCAGAGTATACAAAAGGACGTCTTTCGTCTACAAATGGGCTGCTTGTACATGAAGGGCAACATGCAATATTTAGAAATTTGACTTGTGGAGGAGATGCTCAACTGGCATCAAAGTATCGTTGGTTAGATGAGGGACTAGCAGTAGCTAGCATGGACTATACATGGGGTGGAAGTGATCCTTCAGGCTGGTTTGATTATATTAAAGGAAATCCTCAGATTAGGAATGGTTCTGCACTTGTATATAGTTCTTATAGAAATTCTTCTGCACAAGATTATGCAATGCCAGATTTATTTGTCAGATATCTGGCAAATCAGAAGTCGAAAGGATATAAACCAATAGAGTTTTTCCAAGGTATTTATAGAGTGACGGCAACTGGTAAAGACACAAAAACTTTCATGAATGATGTTTTTAAAGCAGCAGGACTTAAAGATGAAAATGGTAATGTACTTACATTTGACAAGTCTTTGGTGCAGTTCTATGCAGCGATTATTGCTCAAGATAAAGATGGAGTTTATGGTTTTTATGGTGATCCGGTAGTTTTAAATAAGCTTAATGATTATCCTATTTATATGGGGGAAAGCGGAAAACCAGTTATGCTTTCTGGAACAGCGGCTATTGTTCTGAAAACTGAAAATGGAGAATTTAAAGTACCGTCAGATGGTGGAAAAGACATTCGATATATTGCAGTAAATAGATCGGATACGGTATCTAAGCCTTCTAAAGGATCAGGTACAGCAGCAGATCCTTATAAGATTGAGAAAGCTTCAGACCTTTTTTATATAGCAAGTAATCAGAGTTGCCATTTTATTTTGACAAGTGATCTGGATTTAACAGGAAGTACTTATATTAGTGCAGGATGGTTTGGTGGAAGCCTTGATGGTAGAGGATATACAATAAAAGGTCTTAAACAGCCATTAATAGAAAGAAACAAAGGTACAATTAAAAACTTGAATATTGAAGCGGATTTTAAAAGTGATTATCAGGCCTATACTGGAGCACTTGCCAACATTAATGAAGGAAAGATATTAAACAGTAGTGTTAAAGGAAACTTCGATATACAGATGACAGGAACCGGGTATGGGGTTGTTCAGACATTTGGAGGGCTTGTTGGAAGAAATGAAGTATCAGGTGTTATACGAGAGTCTTTTGTTGATGCAAATATAAATGTGAAATTTGGATTTAGTCATGGATCAGCAGGGGCATTAGTTGGAAAAAATTCAGGTGCTATAGAAAACTCTTATGCACGTGGTTACTTGAATGTGATACAGGATAATAGAGGGGATTACAAATTTTATGTTGGAGGTATCACTGGAGAACTGACTAGAGATATGGGGTTAGGTGCAACACTGAAAAATTGTTATAGTACAACCCAGATAAGCACAAGAGCAGTTAGTGATTCAAATAAGCAAGCAATAGGTAGACTTTATGGTCAAGATCAAAATATTTCAGTAAATAGTGTAAGTCAATCTTATGCTTTGGATGGTATGGATGCAGTTGGTAAAACCACATCTGGAATTGATGGGGAAATTTATTCGAAAACTTCAGATCAACTTAAGAAAGTTGCAACTTATGTAAATTGGTCATTTAATAGTATTTGGAAAATACAAGAAGGAAAAGATTATCCGGTATTTATAGAAGCATCAGATATTAAAACTATTTCGGTTTCAGTACCACAAATAGAAAAAGAACGTTATGTAGGAGAAGAACTTTTACTTTATTCTGCAAAATTAATTGTAAATGGTACGGCAGTTCCCCTTACAAATGATATGATTAATGGTTTTGACAGTAGTACTGAGGGAGTGAAAACAGTAACTGGTAACTATAAGAATAAGGTATTTCAATTCGATGTTACAGTAAAAGCTCCTAAGTCAGTAGATAAACTTGAGATTTCAAAAGCTGGTAAAACTTCTTATGTTCAAGGTGAAGAATATAGTAGTGCAGGTGTTGTATTGATGGCAACATTAGATGGTACACCATATCATTATATAAAAAGTGGATTTAAAAGTGATTTAGATGGTATTCTATTGGATAATCAAAATAGGGTAACATTTAGTTACTATGATGGCAAAGTTAGTCAAGAGATTACTGTGAAAAAGGATGAGCCAAAAGCATTGACTGTTGTTAATCCTATGAATAAAGTAGATTATTATTCAGAAGACAAATTAGACTTTTCAGGTATGGGTATTCAGATTACATATGCTTCTGGAAAGAAATCTTCGGTTTTAAGATTTGATGAACTTAAAGGGAATGGAATACGCTTAGTATTGGATAATAACGGTAAATTTACTACTGTGGATTCTGATACAGTATTAACAGAAAAAGAGAATGGTACTAATATATATGCTTGCTTTGGAGACAAAAATCCAAACGAGTTTGGTTCAATATTTGCAAGATTAGCCAAAATTACTGTAAAGCCAAAATTGCATTTAGATAGTCAAATTTTCTTATTAGGTCAGAATGTTACAAGATTTGATTTATTTACAGATATGGTTGTAGGAGGAGAAGGAAATTATAAGTTTGAGATTGTTGAAGGAAAATTACCAAAGGGAATCAGAGAAGTTAAGAATATGCCTGGAAGTACTAGAATACTTTTTGAGGGAACACCTACAGAGGTTGGAGAGACAAGAGTTGTTTATAAAATTTCAGATTCTGTAGGAAATACTACTTTAACAGATATTATTTTTGTAGTGAATCCTCCATCAAGTGTAGCTGAGGTAGAATCATTTAGTATAACGAATGCTAGAGAATCTTATCCAGCTGTCATTAAAGGTACAACAATTGAACTTATTGTACCAGCAGATATACAGTTGAGTTCATATTGGGCGTCTGTGAAATTATCAGATGGAAGTAACTATTATCCAGATCCTAATATGCCACCTATAGTAAAAGAGGGAATACAAACATTAGCTATTATTGCTCAGGATAAAAAGACAATTAAAGAGTATACAGTGTTAATTAAGAGGGCAACACAAAATATGCAGCCTTTAGATAAACCTAAAAATCTAGTTTGGGATTCCAATACTAATACTTTAAGTTGGGATTCTGTGAATAATGCAGAAAGTTATATTGTTAATATAGCTCCTGAAGGTGAAGTTTCTTACATGGTAAGTACTTCAGAAAATAAACTTAATCTGAAAGATGTAGTTCAGAAATCAGGAAATATTGGTCTAAGTGTATTTGCTATTGGTGATAATATAAATACATATACTGGTAAGTCTTCTGAAATAACTGTTTCTTATGTAGCACCACCACAGATAAAGTATATTAGTGTTAATCCAAAGAAAATAGAAGCATTTAAAGGTCATAATACACAATTTAAAGTAACGATTTCAGCAAACAGTAATGCAGATAAAAGTGTAACATGGTCTATTGAAGGAGCTTCAAGTGCTAGTACTTCAATTGATTCAAAAGGTGTGCTTACAATAGGGGATGATGAGACTTCATCAGAAGTACAGGTAATTGCAACATCTAATCATGATCCAAGTAAAAAAGCAAGGGCAGTTGCTACGATTAAAGAGTTACCAAAACTAAATACTCCATCAGGTCTTATTTGGAAGGGACAAGTTGCTACATGGAATGCTGTTGATAATGCAAATGGTTATAGTGTTGAGCTATATAAGGATGGTATCAAGGTAGGAGAAAGTCAAGAAACTAATAATACACAGTTTGATTTTACCAATAAAATGAAAGAAGCTGGGATATACAAATTCCGTGTTATTGCTTTAGGTGATGGAAAAACTATAGCAAATAGTGATGAAGCAGAAAGTCTAGAATATAATTATATAGTTGATATCAATCATGATGGGAAGGTAGATATGCTAGATTTAGCAATAGTATCAGAAAAGTATAATTTGAAAAGTACTGATGTTGGATATATCAAAGACTGTGATTTAAATAATGATGGGATAATAGATATATATGATATTGTTATGGTAGCAAATAAAATAAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1535
MRKRIISAVLVIGLVIGYIPFQSFAAEIGDNGKVINGDYVIAVNTNADPNNKQSSGTLVFDSMGGRGTTSLENELNQEAEDIDFIVDGSDTKVENKNLFSRLLGVGDIYSIGDEKKFYQGRTYVCIGVYDKSYIWMEKSMKNDYDAAGKTNDAAEDMRSTYESKPYEVLMELSDNKFPYNDGSGKLSILLEQTSNGSSGFYAGESGITAIHINIPKAAEYTKGRLSSTNGLLVHEGQHAIFRNLTCGGDAQLASKYRWLDEGLAVASMDYTWGGSDPSGWFDYIKGNPQIRNGSALVYSSYRNSSAQDYAMPDLFVRYLANQKSKGYKPIEFFQGIYRVTATGKDTKTFMNDVFKAAGLKDENGNVLTFDKSLVQFYAAIIAQDKDGVYGFYGDPVVLNKLNDYPIYMGESGKPVMLSGTAAIVLKTENGEFKVPSDGGKDIRYIAVNRSDTVSKPSKGSGTAADPYKIEKASDLFYIASNQSCHFILTSDLDLTGSTYISAGWFGGSLDGRGYTIKGLKQPLIERNKGTIKNLNIEADFKSDYQAYTGALANINEGKILNSSVKGNFDIQMTGTGYGVVQTFGGLVGRNEVSGVIRESFVDANINVKFGFSHGSAGALVGKNSGAIENSYARGYLNVIQDNRGDYKFYVGGITGELTRDMGLGATLKNCYSTTQISTRAVSDSNKQAIGRLYGQDQNISVNSVSQSYALDGMDAVGKTTSGIDGEIYSKTSDQLKKVATYVNWSFNSIWKIQEGKDYPVFIEASDIKTISVSVPQIEKERYVGEELLLYSAKLIVNGTAVPLTNDMINGFDSSTEGVKTVTGNYKNKVFQFDVTVKAPKSVDKLEISKAGKTSYVQGEEYSSAGVVLMATLDGTPYHYIKSGFKSDLDGILLDNQNRVTFSYYDGKVSQEITVKKDEPKALTVVNPMNKVDYYSEDKLDFSGMGIQITYASGKKSSVLRFDELKGNGIRLVLDNNGKFTTVDSDTVLTEKENGTNIYACFGDKNPNEFGSIFARLAKITVKPKLHLDSQIFLLGQNVTRFDLFTDMVVGGEGNYKFEIVEGKLPKGIREVKNMPGSTRILFEGTPTEVGETRVVYKISDSVGNTTLTDIIFVVNPPSSVAEVESFSITNARESYPAVIKGTTIELIVPADIQLSSYWASVKLSDGSNYYPDPNMPPIVKEGIQTLAIIAQDKKTIKEYTVLIKRATQNMQPLDKPKNLVWDSNTNTLSWDSVNNAESYIVNIAPEGEVSYMVSTSENKLNLKDVVQKSGNIGLSVFAIGDNINTYTGKSSEITVSYVAPPQIKYISVNPKKIEAFKGHNTQFKVTISANSNADKSVTWSIEGASSASTSIDSKGVLTIGDDETSSEVQVIATSNHDPSKKARAVATIKELPKLNTPSGLIWKGQVATWNAVDNANGYSVELYKDGIKVGESQETNNTQFDFTNKMKEAGIYKFRVIALGDGKTIANSDEAESLEYNYIVDINHDGKVDMLDLAIVSEKYNLKSTDVGYIKDCDLNNDGIIDIYDIVMVANKIK*