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NECEvent2014_6_7_scaffold_2326_2

Organism: NECEvent2014_6_7_Peptoclostridium_difficile_29_7_partial

partial RP 33 / 55 BSCG 30 / 51 ASCG 7 / 38 MC: 3
Location: comp(354..3365)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Helicase conserved C-terminal domain protein n=81 Tax=Clostridium difficile RepID=T3G6S2_CLODC similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2008
  • Evalue 0.0
  • rbh
DNA helicase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2008
  • Evalue 0.0
DNA helicase {ECO:0000313|EMBL:CAJ70042.1}; TaxID=272563 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Peptostreptococcaceae; Peptoclostridium.;" source="Peptoclostridium difficile (strain similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2008
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Peptoclostridium difficile → Peptoclostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3012
AATGCTGAAGCTAAATTTGTTTTATACAAGTTAGCTAACCAATGCCCTGATGATGAGAATAAGACTGGTGGTTATGTTCGTGTTCCACATGAAAACTTAATAGTATCAATAGATATGGATAAAAACTATATTAAAAAACCTATATCTAAAGATTTAGATATAGTTTTATCTAAAAGAATTTATTCAAATGACTTTGTTAGTATTACTTGTATGCTGGTTAATAGTCAATCTGGGCCTAAGAAATATAATAATACTATTTTCCAGCCTGAACTAATGGTATTAGCTGAAGATAACAATGATTTAGAGTTTATAGATATTTTTACAGCTGGATCAGTAAATACTTTTAAAAAGTTAGATTCTGAGGAAATATCTTTAGACTTACTTTACCGAAATAAAAAAACTTTTGCTACTGGTCATGGTGTAGCTATAGATCAAGATATTCAAAATGATGCTTTAATAAAACTTTGTACTGAGTTTATTCCTCATTTTGAAGTACCTAAATTGGACTTTAATGTAGATGAATTAAGTGATGTTTCTAGAGAATTACTGTCTATGAAAAATTTATCAGATATCTCTGATCTTAGTAAAGATAAGAAAATATATTTTCTTTATAAGTTTGTTGATGCTTATGATATTTGGATAGATGATCTAGAAGAAGATTCAAAAGATCTTAGTGATGTTTTTAAAGATGTAGCATATGAGCATATAAAAAACTGCAGAGATACTAAGTCTAGAATGCTAGAAGGTATAAATTTAATTAAGTCTAATGATGAAGTATACAGAGCATTTTCTCTAATGAATAGAGCTATACTTATGCAAAGATGTCATTCTATACATATTACGGATAGACTCCCTGGATCTAATAACCTTGACTATATAGATTACTCAAATGATAATTCTGCTTGGAGACCATTCCAGCTTGCTTATATACTTACATGTTTATCTTCGATAGAAAATCCTGACTCTAAACATAGAGATTTAGTTGACCTTCTTTGGATCCCTACTGGTGGAGGTAAAACGGAGGCCTACTTAGGTCTATCTGCTTTTACTATCTTCTTAAGAAGAATAAGAAACAAAGAAAATGGTAACGGTACAGCTATCATAATGAGATATACACTAAGGCTATTGGCTGCACAACAATTCATAAGAGCAAGTATATTAATTTGTGCCTGTGAAATTATTAGAAAAGAAAATAAGTCTGAACTTGGGAAAAAAGAGATTTCTATTGGTTTGTGGATTGGGAGTGATCAAACTCCAAACTTTAATGATGAGGCAGAAGAAATGCTTAATAACTTAACAGGTAATAACATTAAGTTTAGATCTAGTATAAATAGTGAATATGAGTTAGATAATTTAAAATCAAAATATAATAAATTCCAATTACTAAAATGTCCTTGGTGTGGAACAAAACTTGTTAAAGAATGGGATAAAACTTCTAAAAAAGCTGTTGGTGATTGGGGCTATAGAATTAAATCTAGACCTAAGAAATTCTACTTATGCTGTCCTGAAGAAGATTGTTCATTTGAAGATATGTTACCTATACAAGTTGTAGATGAGGAGATTTATAATAACCCTCCAACACTTTTATTTGGTACAGTTGATAAATTTGCAATGATAACTTGGACTACAGAAGTAGCTAGTCTTTTTGCTTTAGATGATGATAATAGCAACTTATCTCCTGAGTTAATAATTCAAGATGAGCTTCATCTTATTTCTGGACCTTTAGGTACTATGGTAGGTTTATATGAAACTGCACTTGATGCTATGTGTAGCTATAAGGGTATAAAACCTAAGATTATAGCTTCTACTGCTACTATAAGAAAAGCACAAAATCAAGTTAAAAATCTATATAATCGTAATGTAGCTCAGTTTCCACCTCCAGGATTAACATCTAGTAACTCTTTCTTTGTTAAAGAGATGCCTTTAAGTAAAAAACGTGGCCGACTATATGTAGGTGTTATTCCATCTGGAAAAACTCAAGTTACTGTAGAGGTTAGACTTATGTCAGCATTACTCCAAAGACTTAAAATGATGGAGAATGTAGAGTTGAATTTATTGGATAAATATTGGACACTAGTATCTTATTTTAATAGTATCAGAGAATTAGGTAAGTGTAGCACACTTTTAAATGACGATATAAAAGACAACATGGAAAGATTATGTAAAAGAGTCTCAGCCCACCCTTATCAATCATTAAGGAACCTAAATGAACAAAGAGAGCTTACTAGTAGACTTACTTCTACTAAGATAAATACAACTTTAGATGAACTATCTAATACTCTTACTTCTAATAATTTAACTGTCGATACTCTATTAGCTAGTAATATGATTTCAGTTGGTGTTGATGTTGATAGATTAAATTTAATGGTAGTAGTTGGTCAGCCTAAGTTAACATCTGAATACATACAAGCTAGCAGTAGAGTTGGTAGAAGTAATGAAGGACTTATATTTACATTATATAATCCTACAAAAACAAGAGATAGATCTCATTATGAACAGTTCTTTAGTTATCATCAATCATTCTATAAATTTGTTGAACCTACTAGTATTACACCTTTCTCTGAACCAGCTAGAGAAAGAGGCATGCATGCAGTATTAATAAGTATGATTAGACATATTTTAGGACTTCAAGCTAATGATCTTGCAAGTCGATTTTCAAAAAATATGGATGGTGTAGAAGATTTAAAAAACTTCATAATAGATAGATCTATCGATATATTTAGAGAAAATAATCAAAATGCTGATGATAATATAGTAAATGAATTTAAATCTGAGATTTCATCTGAATTAGATATTATAATGGATTTATGGCATGATAAAGCTCAAATATCTGATAAAGATAATTTATTGCATTATTATAAGCGCCCTAGTAAATTTGATAATAAAATATATAATAATCTTTTAATTCCTTATGATAAGGATGTTATTACAAATGAAAAACAAACATTAAATTCTATGAGAAATGTTGATAAACAATGTACTGTTGAAATTATAGAATTGGAGGAAAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 1004
NAEAKFVLYKLANQCPDDENKTGGYVRVPHENLIVSIDMDKNYIKKPISKDLDIVLSKRIYSNDFVSITCMLVNSQSGPKKYNNTIFQPELMVLAEDNNDLEFIDIFTAGSVNTFKKLDSEEISLDLLYRNKKTFATGHGVAIDQDIQNDALIKLCTEFIPHFEVPKLDFNVDELSDVSRELLSMKNLSDISDLSKDKKIYFLYKFVDAYDIWIDDLEEDSKDLSDVFKDVAYEHIKNCRDTKSRMLEGINLIKSNDEVYRAFSLMNRAILMQRCHSIHITDRLPGSNNLDYIDYSNDNSAWRPFQLAYILTCLSSIENPDSKHRDLVDLLWIPTGGGKTEAYLGLSAFTIFLRRIRNKENGNGTAIIMRYTLRLLAAQQFIRASILICACEIIRKENKSELGKKEISIGLWIGSDQTPNFNDEAEEMLNNLTGNNIKFRSSINSEYELDNLKSKYNKFQLLKCPWCGTKLVKEWDKTSKKAVGDWGYRIKSRPKKFYLCCPEEDCSFEDMLPIQVVDEEIYNNPPTLLFGTVDKFAMITWTTEVASLFALDDDNSNLSPELIIQDELHLISGPLGTMVGLYETALDAMCSYKGIKPKIIASTATIRKAQNQVKNLYNRNVAQFPPPGLTSSNSFFVKEMPLSKKRGRLYVGVIPSGKTQVTVEVRLMSALLQRLKMMENVELNLLDKYWTLVSYFNSIRELGKCSTLLNDDIKDNMERLCKRVSAHPYQSLRNLNEQRELTSRLTSTKINTTLDELSNTLTSNNLTVDTLLASNMISVGVDVDRLNLMVVVGQPKLTSEYIQASSRVGRSNEGLIFTLYNPTKTRDRSHYEQFFSYHQSFYKFVEPTSITPFSEPARERGMHAVLISMIRHILGLQANDLASRFSKNMDGVEDLKNFIIDRSIDIFRENNQNADDNIVNEFKSEISSELDIIMDLWHDKAQISDKDNLLHYYKRPSKFDNKIYNNLLIPYDKDVITNEKQTLNSMRNVDKQCTVEIIELEEN*