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NECEvent2014_6_7_scaffold_1306_1

Organism: NECEvent2014_6_7_Clostridium_paraputrificum_30_154

near complete RP 49 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: 94..4446

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Value Algorithm Source
DNA polymerase III PolC-type {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356}; Short=PolIII {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356};; EC=2.7.7.7 {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356};; TaxID=632245 species="Bacteria; Firmicut similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 79.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2389
  • Evalue 0.0
polC; DNA polymerase III PolC-type (EC:2.7.7.7) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 79.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2359
  • Evalue 0.0
DNA polymerase III polC-type n=2 Tax=Clostridium butyricum RepID=B1R0V6_CLOBU similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 79.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2389
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

Clostridium butyricum → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4353
ATGAAAAGGATAAATGAAGTTTTTAGTGATTTTAATACTGGAAGCAACATAAGTACTGCCTTGGTTGAAAGTGCAGTTTTAAAGAAAAAATCTAAAACTTTAGAGTTAGCAATAAGTTCAGATAGATACATAGAAATACAGGAAATTGAAGAACTTAATAACTTCATTAAAAGAAGGTTTTATTTAGAGCATTCAAAGATTGCTGTAAATTATACTGAAGAAGTTAAGATGAAGCCTATAGAAGAGGAAATTAAGAATATAATATCTTATGTTTCTAATAAACATCCTTTTCTTAGGGTAGCTGTTAACAATTGTGATTATGAAATAAGTGGTAATACAATAACATTAAAGTTTAGAGTGCCTGTATCAACAATGTTTAGAGACTTAAAGTATGATAGGGAAATTAGGGAAGGCATAAAAAGCTTCTATGGTAAATCCTATAGTATAAAGTTTGTTGATAATGTAGATGCAGATGAATTAATTAGGCTTCAAGTAGAAGAAGAAAAGAAGAGAATGTCTATGATTAGGAATGAAATTAGGTCTACTGGACCATCTATTCCTAAGGATACTACCCCAACTGTTCCTAGTGAAGGGGATAAGGGTAAAGATGATAAGAAGTCTGGAAAGATGAATAATCCTTTCTTAATATTAGGTAGAAATTCTAATATTAAAGAATCATTAATAAGAATATCTGATGCCTCTCCTGAAGAGGGAAGAGTTGCCTTATATGGTGAACTATCTAATATGGAAACAAAGGAATTAAGAAGTGGTAAGATATTAGTTTCTTTTGATTTGTATGATGGAACAGGTTCTCTTACTTGTAAGTCATTCCTTAAGCCAGAGCAAGCTGATGATGTAATATCTAAGCTTAAAAAGGCTAGGGGAGTTAAGCTTTGTGGTAACTTAGGTTTTAGTAATTTCTCTGGGGAAGTTGAGATGATTGCAAATACCATAGTTGAAACAAAGGGACTTGAAAGGGTAGTAAGAAGAGATGAGTCAGAAGTTAAGAGAGTTGAGCTTCATCTTCATACTAAAATGAGTCAAATGGATGGTATGAGCAGTGCAGCTGACTTAATAAAGAGAGCAATGAGTTGGGGAATGAAGTCTATAGCTATAACTGACCATGGTGTTGTTCAATCTTTCCCTGAAGCACATAAGCTATTAGGAAGAAATAATCCTGATATGAAGGTTATTTATGGGGTGGAGGCTTACCTTGCTCCAGATAAAAAGCCTTCTGTGAGAAATATTAAGGGGCAAAGTCTTGATACTACTTATTGTGTATTAGATTTAGAAACTACAGGTTTTTCACCTAGGTTAGAAAAAATAACTGAAATAGGTGTAATGAAGTACCAAGATGGTAAGGTCATTGATAAGTTTAGCTGTTTTGTTAATCCAGAGAAATCAATACCTCCAAGAGTTGTTGAAGTAACTGGCATAACTGATGATATGGTTAGAAATGCTGAAACTATAGATAAGGTTTTTCCTAAGCTTTTAGAATTTATAAAAGATAGCGTTTTAGTTGCTCATAATGCTGAATTTGATGTTGGATTCTTAAGGCATGTTGCAAAAGAATTGGGTTATGAATTTGACTTTACATATTTAGATACCTTATCACTAGCTTATGAGCTATTCCCAGAGTATAAAACTTATAAGCTAGGAAGAATAGCTAAAAACCTTGGAATAAAGGTTGATGTTGCTCATAGAGCTTTAGATGATGTTGATACAACAGTTAAGGTATTTAAGGTAATGCTTGATATGTTAAAGGAAAGAGGAGTAAATACCTTAGAAGATATAGAAATTTATGCTTCTGATGAAACTGCTAAAAAGGAAGCTTTTAAGAAGTTAAGAACTCATCATGCTATTATTCTTGCAAAGGATTATGTGGGCTTAAAGAATTTATATAAGTTAGTATCCTATTCACATTTAGATTATTTCTATAAGAAACCTCGTATATTAAGAAGTATGTTTAAGAAGTATTCTGAAGGTTTAATTATAGGTAGTGCTTGTAGTGATGGAGAGCTTTATCAATCAATTCTACTTGGAAAGTCTGATGAAGAAATTGAAGCTATAGCAAGAGAATATGATTATTTAGAAATTCAACCTTTAGGTAACAATGATTATCTTATAAGAAATGGTGAAGTACCTGATAAAGAATATTTAAGAGAAATTAATAGAAAGATTGTAGCCCTTGGGGAAAAGCTAAATAAACCTGTTGTTGCAACTGGTGATGTTCATTTTATGGACCCAGAGGATGAAATTTACAGACGTATTTTAGAAGCAGGTCAAGGTTTTAAGGATGCAGATAATCAAGCGCCTTTATATTTAAGAACTACTGAAGAGATGCTTGAAGAATTCTCTTATCTAGGAAGAGATAAGGCTTATGAAGTGGTAGTTACAAATACAAATTTAATTGCAGATATGTGTGACCAAATAAGTCCAATATCTCCTGAAAAATGTCCTCCTCACATTGAAGGGTGTGAGCAAGAAATAAAGGATATAGCTTATGGTAAGGCACATGAGCTATATGGAGAAGAACTACCTGATATTGTACAGGAAAGATTGGATAAGGAACTTAATTCTATTATTCAAAATGGTTTCTCAGTAATGTATATAATTGCTCAAAAACTAGTTTGGAAATCTAATGATGATGGATATTTAGTTGGTTCAAGAGGATCTGTAGGTTCTTCTGTTGTTGCTTATATGACTGGTATTACAGAGGTTAATGCATTACCTCCACATTATAGATGCCCTAAATGCAAACATTCAGATTTTAATGATTATGGGGCTAAGAATGGTTTCGATTTACCTGATAAAGCTTGTCCTGTTTGTGGAGAAATGATGGATAAGGATGGAATGGATATACCTTTTGAAACCTTCCTTGGATTTAATGGGGATAAGGAGCCTGATATTGACTTAAACTTCTCTGGAGAATATCAAGCAAAGGCTCATAGATATACAGAAGTTATATTTGGTAAGGGTACAACATTTAAGGCAGGAACAATAGGTACAATAGCTGAAAAAACTGCCTTTGGATATGTTAAGAAATATTTTGAAGAGAGAAATACTCAAGCTAATAAAGCAGAGATTACTAGAATATCAAAGGGATGTACTGGAATAAAAAGAACAACTGGTCAGCACCCTGGTGGAATAATAGTTGTTCCTAAGGGAAGAGAAATATTTGAGTTTTGTCCAGTTCAGCATCCAGCTGATGACCCTAATTCAGATATTATAACAACACATTTTGATTATCACTCAATAGATTCAAACTTACTTAAGCTTGATATACTAGGACATGATGATCCTACAGTAATTAGAATGCTTCAAGATATTACAGGAGTAGACCCTCAAAAAATACCTTTAGATGATAAAGAAACTATGTCTATTTTCTCATCAACTAAAGCCCTTGGGGTTACACCTGAACAAATTAATTCTAAGGTTGGTACCTTTGGTATACCTGAATTTGGAACAAAGTTTGTTAGAGGAATGCTTTTAGATACACTTCCTAAGAGTTTCTCAGACTTATTATGTATATCTGGGTTATCCCATGGTACTGATGTATGGCTTGGAAATGCTAAGGATTTAATTGATGGAGGAGTAATTACAAGTATAAGTGATGCTGTATGTTGTAGAGATGATATTATGGTTTACTTAATTAAAATGGGTCTTGAACCTAATACATCCTTCAAGATAATGGAGCTTGTTCGTAAAGGTAAGGCTTTAAAGGATCCAGAAAAGTGGGCGGAGTATGAAAAAATGATGAGAGATCATGATGTACCTGAATGGTATATAGATTCTTGTAGAAAGATAAAATACATGTTCCCTAAGGCCCATGCAGCAGCTTATGTTATGATGGCATTTAGAATTGCATGGTTTAAGGTACATATTCCTTTAGCATATTATGCAGCATATTTCTCTATAAGAGCTAAGGCCTTTGATGCAGAGTATATGATTTTTGGAAAAGAAAAGGTTAGAGAAAAAATGAAGGAAATAAGCTTACAAGGCAATGATGCAGCTCCAAAGGATAAGGATATGTATGATGATTTGGAAATTGTACTAGAGATGTATGAAAGAGGCTTTAAGTTCTTACCAATAGATTTATATAAATCAGATTGGGATAAATTTAAAGTAGAGGATGATGCCCTTAGACCTCCTTTAAATAGTATTTCGGGAATGGGTAATGTGGCAGCTGAAGCTATATTTAATGCTGTTCATGAAGAAACTCCAATTAGTTCAATTGATAATTTAAAGAAACGTGCTAAAATAGGTAATTCTGCAGTAGATTTACTTAGAAAGTTTGGTTGCTTAAATGGATTATCAGAAAGTGATCAGGTAAGTTTCTTTGATGTAATTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1451
MKRINEVFSDFNTGSNISTALVESAVLKKKSKTLELAISSDRYIEIQEIEELNNFIKRRFYLEHSKIAVNYTEEVKMKPIEEEIKNIISYVSNKHPFLRVAVNNCDYEISGNTITLKFRVPVSTMFRDLKYDREIREGIKSFYGKSYSIKFVDNVDADELIRLQVEEEKKRMSMIRNEIRSTGPSIPKDTTPTVPSEGDKGKDDKKSGKMNNPFLILGRNSNIKESLIRISDASPEEGRVALYGELSNMETKELRSGKILVSFDLYDGTGSLTCKSFLKPEQADDVISKLKKARGVKLCGNLGFSNFSGEVEMIANTIVETKGLERVVRRDESEVKRVELHLHTKMSQMDGMSSAADLIKRAMSWGMKSIAITDHGVVQSFPEAHKLLGRNNPDMKVIYGVEAYLAPDKKPSVRNIKGQSLDTTYCVLDLETTGFSPRLEKITEIGVMKYQDGKVIDKFSCFVNPEKSIPPRVVEVTGITDDMVRNAETIDKVFPKLLEFIKDSVLVAHNAEFDVGFLRHVAKELGYEFDFTYLDTLSLAYELFPEYKTYKLGRIAKNLGIKVDVAHRALDDVDTTVKVFKVMLDMLKERGVNTLEDIEIYASDETAKKEAFKKLRTHHAIILAKDYVGLKNLYKLVSYSHLDYFYKKPRILRSMFKKYSEGLIIGSACSDGELYQSILLGKSDEEIEAIAREYDYLEIQPLGNNDYLIRNGEVPDKEYLREINRKIVALGEKLNKPVVATGDVHFMDPEDEIYRRILEAGQGFKDADNQAPLYLRTTEEMLEEFSYLGRDKAYEVVVTNTNLIADMCDQISPISPEKCPPHIEGCEQEIKDIAYGKAHELYGEELPDIVQERLDKELNSIIQNGFSVMYIIAQKLVWKSNDDGYLVGSRGSVGSSVVAYMTGITEVNALPPHYRCPKCKHSDFNDYGAKNGFDLPDKACPVCGEMMDKDGMDIPFETFLGFNGDKEPDIDLNFSGEYQAKAHRYTEVIFGKGTTFKAGTIGTIAEKTAFGYVKKYFEERNTQANKAEITRISKGCTGIKRTTGQHPGGIIVVPKGREIFEFCPVQHPADDPNSDIITTHFDYHSIDSNLLKLDILGHDDPTVIRMLQDITGVDPQKIPLDDKETMSIFSSTKALGVTPEQINSKVGTFGIPEFGTKFVRGMLLDTLPKSFSDLLCISGLSHGTDVWLGNAKDLIDGGVITSISDAVCCRDDIMVYLIKMGLEPNTSFKIMELVRKGKALKDPEKWAEYEKMMRDHDVPEWYIDSCRKIKYMFPKAHAAAYVMMAFRIAWFKVHIPLAYYAAYFSIRAKAFDAEYMIFGKEKVREKMKEISLQGNDAAPKDKDMYDDLEIVLEMYERGFKFLPIDLYKSDWDKFKVEDDALRPPLNSISGMGNVAAEAIFNAVHEETPISSIDNLKKRAKIGNSAVDLLRKFGCLNGLSESDQVSFFDVI*