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NECEvent2014_6_7_scaffold_1569_5

Organism: NECEvent2014_6_7_Clostridium_paraputrificum_30_154

near complete RP 49 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: 2500..5553

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Pectin lyase fold-containing protein n=1 Tax=Erysipelothrix rhusiopathiae (strain Fujisawa) RepID=F5WR42_ERYRF similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 55.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1138
  • Evalue 0.0
  • rbh
Pectin lyase fold-containing protein {ECO:0000313|EMBL:BAK31224.1}; TaxID=650150 species="Bacteria; Firmicutes; Erysipelotrichia; Erysipelotrichales; Erysipelotrichaceae; Erysipelothrix.;" source="Ery similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 55.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1138
  • Evalue 0.0
pectin lyase fold-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 55.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1138
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

Erysipelothrix rhusiopathiae → Erysipelothrix → Erysipelotrichales → Erysipelotrichia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3054
ATGATAGTTTTAAATTTTACTGTAAAAATAATATCAACTCATAAGGAGGAAAAAATGAAACGTATATTTCGAAAAGCAATAGTTTATTTTACTGTACTAGCAGTACTTATTTCAAATGTAAGTATTTCATCAGTAAAAGCTATGGAAAAAAGTGATGAAGGAATCATAGTTTATGCAAGTGATTATGGACTTGATTCAACAGGTGAAAAAGATAATGCTAAAGCTTTAGTTAATATGTTTGAAGCTATTAGGGAAATAGGTGAGAATGGGGATAAGGTTACTTTAAAGTTTGATAAAGGTATTTATCAAATTCATAAAGAGAATGCTCCAGTAAGAGAGGTACATACATCAAATACAGATAGTGTACGTTTTCCTAACAAATCAATTGGTATTTTAATTGAGAACCAAAATAATTTAACTATAGATGGAAATGGATCACAGTTTATTATTAATGGTGATATGATGGCCTTAGCTATTATGCACTCAGAGAATATAACAGTAAAAAATGTAAATATAGATTATCAAATTCCTACAACTTCTGAGATGACTGTGCTTGATTATGATAATGAAAATAAGACTATAGATTATTTTATTCCTGAATATCTTAATTATGAAATTCAAGGAGCGAATATTATATGGAAGTCAGAACAAAAATCTGATGGAGGGTACTATTGGACAGAAAAAAATGATCATCGTAATTATGGTATATCAGTAAAGTATCCAACAGAGTTAATGGGAAGATCATATTATTCAAATAGTAATCCATTTACAAATGCACAATCAATAGAGCAGCTAGATGATTCGAGAGTTAGAATTAAATACTCTTCAAACCCAGCATTTGAAGTTGTAAAGGGAATGAATTTTCAATTAGTATCAAACGCTGAGCGTCCAACAGCTGGTGCTTTTGTATGGGAAAGCAAAGATATTAATGTAATTAATACAAAGATATCATACATGCATGGATTTGGATTCTTAGTTCAAATGGCAGAAAACGTTTCTTTTGATGGTATACGTATGGAAACAGATATTGAAACAGGACGTAATACTTCAAGCTTTGCTGATGGAATTCATATTTCAGGTGCAAAGGGAAAGATAGAAATAAAAAATTCCTTCTTCAATAATACTCATGATGATCCTATCAATATTCATGGGACATTTACTCGTGTTGAAGAAAAGTTAGATAGCAATACATTGAGATTAAAATATATTCATAATCAACAAGGAGGATTTCCACAATATCATCCAGGAGATAAGGTGGTATTTTATAGTCGTGATACACTAGAATCAAGAGATGAAGAAAAGGAATATACAGTAAAAAGTGTAGAAGGACCATCAAAAGATAATCTTAAAGAGATGATTGTTGAATTTGAAGAAGAAGTACCAGATTATTTAACAGAGAAAGTTGGAAATGAACCAAAGTTTGTAGCTGAAAATGCAACATATACTCCAGAGATTTATATTAAAAACAACGAGTTTAAAAATGTATTTACTCGTATGATCTTAGCAACATCACGTAAGAAGATAGTTATTGAAGACAATTATTTTGAAGCTCCTTCAATGGCAACATTATTTTTCTCAAATGACTCTGATGAATGGTATGAATCAGGTCCAATTCGTGATCTAGAAATAAGAAATAATACATTTAAAATACGTAGCTTAGGTCGTACTTGGTGGAAGTATGCTCCAGCAATATATTTTCATCCAGTAACTAAAGGTGGAGGATTACCAGATGAATCCAACCCTATTCATAAGAATATTTTGATTGAAGAAAATAAGTTTTATTTAGAAAGTGATGGGGCTTTACGTGCTGAAAGTGTTGAGAATCTAACATTTAGAAATAATGAAATATATAGATTAGATCCAAGTGTTGATTTAAGTATAGAAGGTTCTAACAAATTATATGTAGGTAACAATAGCAATTTAGAACTAACTTATGATGGAAATGTTGTAACTGGTCCAACATCATTACCAGGAGGTCCAGAATCTAATTCAGGAACTGTAGCTAATGTATTAGAATTTAAAAATAGTAAAAATGTTGTTGTAGAAAACAATTATTATGATGATGGATTAAGAAAGAATGTATTAATTGAGGGGATGGATAGCAAAAATTTAAAGCTTAAAGATGATTTAAATGTACTAAATAATAGAGAAAAAACTGAACCTTCAGATGTTGTTAGTAATATACAATATGCATCAACTAATCCTGAAGTGGTAAGTATTGATAGTAATGGGAAGATGACTGCAAACAAAGAAGGTACAGCAGAGGTATTTGCATATTATGTTTGGAATGGTACCATTATTGAGTCTAATAAGAAGGAAATAACAGTTTTAAGCTCTGAAAATACTTTCGAGAATGAATTGGAATTTAAATCAGAGGTAATTACTATTGATGGAGACAATGGTACAAGCTTTGAGTTTAAAGAAGATATTAATCCAAGTGAAGTAGAATATACAATTCATGATTCTCAAATTGTAAAATTAGAAGGAAACACCTTTTATGGTTTAAAAACAGGTTTAGCAAGAATTACAGTAAGATATAAGGGAAGTGAAAAAACAGTCTTTGCTATAGTAAATGGTAAAGATGATCAAAAGGTTTTAAACTCTTTAATAAATATTGAAGATAAAGATAGTAATTCAACTGCTTCAGATGATAGCATTACAATAACTCGTAAAGCAGGTAATGATTTGTGGGGAAGTGATAATACATTAAATAATTTAGTTACTATTGATTTGGAAAATGTTGATATTAATAATTTTACAGGGTTAGTAACAATTGATGGATTACCAGGACGTATGGCAAATAACTGGGACTCAGCATATTTCTTAATTATGAAAAAGAATGCAAATGGAACTGTTGATCGTAATAACTATTTATCTGTAGGTAAACGTGCTCATGCTGATGGATTTGGAACTGTTCATGAAGTTAATGCTATAGGAAGTGAGCATGCAACAGGGGATGTTAGTGAAAATGAAATTAAAAAAGCAACTTTTGCAATAGAAAAGCAAGGCAAAACAGTTAATTTATATTCTATAGTTGATGGCAAGAGGAATAAG
PROTEIN sequence
Length: 1018
MIVLNFTVKIISTHKEEKMKRIFRKAIVYFTVLAVLISNVSISSVKAMEKSDEGIIVYASDYGLDSTGEKDNAKALVNMFEAIREIGENGDKVTLKFDKGIYQIHKENAPVREVHTSNTDSVRFPNKSIGILIENQNNLTIDGNGSQFIINGDMMALAIMHSENITVKNVNIDYQIPTTSEMTVLDYDNENKTIDYFIPEYLNYEIQGANIIWKSEQKSDGGYYWTEKNDHRNYGISVKYPTELMGRSYYSNSNPFTNAQSIEQLDDSRVRIKYSSNPAFEVVKGMNFQLVSNAERPTAGAFVWESKDINVINTKISYMHGFGFLVQMAENVSFDGIRMETDIETGRNTSSFADGIHISGAKGKIEIKNSFFNNTHDDPINIHGTFTRVEEKLDSNTLRLKYIHNQQGGFPQYHPGDKVVFYSRDTLESRDEEKEYTVKSVEGPSKDNLKEMIVEFEEEVPDYLTEKVGNEPKFVAENATYTPEIYIKNNEFKNVFTRMILATSRKKIVIEDNYFEAPSMATLFFSNDSDEWYESGPIRDLEIRNNTFKIRSLGRTWWKYAPAIYFHPVTKGGGLPDESNPIHKNILIEENKFYLESDGALRAESVENLTFRNNEIYRLDPSVDLSIEGSNKLYVGNNSNLELTYDGNVVTGPTSLPGGPESNSGTVANVLEFKNSKNVVVENNYYDDGLRKNVLIEGMDSKNLKLKDDLNVLNNREKTEPSDVVSNIQYASTNPEVVSIDSNGKMTANKEGTAEVFAYYVWNGTIIESNKKEITVLSSENTFENELEFKSEVITIDGDNGTSFEFKEDINPSEVEYTIHDSQIVKLEGNTFYGLKTGLARITVRYKGSEKTVFAIVNGKDDQKVLNSLINIEDKDSNSTASDDSITITRKAGNDLWGSDNTLNNLVTIDLENVDINNFTGLVTIDGLPGRMANNWDSAYFLIMKKNANGTVDRNNYLSVGKRAHADGFGTVHEVNAIGSEHATGDVSENEIKKATFAIEKQGKTVNLYSIVDGKRNK