ggKbase home page

NECEvent2014_8_2_scaffold_600_7

Organism: NECEvent2014_8_2_Clostridium_paraputrificum_30_98

near complete RP 49 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 3
Location: comp(7535..9550)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
hypothetical protein n=1 Tax=Bacillus sp. AP8 RepID=UPI00031CFF24 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 51.4
  • Coverage: 673.0
  • Bit_score: 691
  • Evalue 1.00e-195
  • rbh
ABC transporter {ECO:0000313|EMBL:KEZ85053.1}; TaxID=318464 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium sulfidigenes.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 49.0
  • Coverage: 667.0
  • Bit_score: 650
  • Evalue 2.20e-183
ABC transporter similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 45.2
  • Coverage: 677.0
  • Bit_score: 614
  • Evalue 2.70e-173

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sulfidigenes → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2016
ATGTATTCTAAAATGTCAGTTAGAAATGTCAAAAGAAGTTTTAAGGATTATGCAATATATTTCTTAACGTTAACTTTTGCTGTATGTATATTTTATTCTTTTAATTCTATATCATCACAAAAGGCAATGATGGATGTTACAAACAGTAAAGCTGAAATAATACAAATGCTTTCTAAAATAATTTCTATGACATCAGTGTTTGTGTCAATTATATTAGGATTTTTAATAATATATGCAAATAATTTTTTAATAAAAAGAAGAAAGAAAGAAATAGGGTTATATATGACCTTAGGTATGGGGAAAAGAAAGATATCCTATCTATTAATAAAAGAAACCTTTTTAATTGGACTCTTATCACTTGGGTTAGGTCTTATGGCAGGTGTAGTGGTATCTCAAGGATTATCTTTATTTACATCAAAACTATTTGAAGTGAATGTATCAAAGTTCAATTTTGTATTTTCTACTAACGCAGCTATAAAAACATCCTTATATTTTGGGCTGATATTTATACTTGTTATGATATTTAATACTTTGGTAATTTCTAAATATAAGTTAATAGATTTATTAAGAGCAGGAAGAAAAAATGAAAGCATAAAAATAAAGAGTACAAAAGTATCTTTTTTATTATTTCTATTATCAATAATTTTAATAGGAGTAGCCTATTTTATAATTTTAAAATTTGGATTTGATAATGGAATTAGCTATGTTCAAATTTCTGTTATCTTAGGCATAGTAGGGACAGTGTTATTGTTTTTATCTTTATCTGGTTTCTTAATTAATGCATTAGAAAAAAGTGAAAAATTTTATCTGAAGAATTTAAATATGTTTGTTCTAAGGCAGATAAATAGTAAGGTTAATACTACATATATTTCTATGTCAGTTATTTCTTTAATGTTATTTTTAACAATTACTCTCTTATCTACAGGGGTAAGTTTTAAGAATTCCTTACAAACAACTTTAAAAAATAACACTCCCTATGATGTGACTTTCTATTCATTTTCAACAGGGGATGAGGAAATTGCGAATATATCAAAATCTTTAGATAAAATAGGACTTGATTATAATAATGCTTTTAGAGAATATTTTTCATATAACTTGTATACAAGTAACGAAGGAATTAAGAAGTATATATATAACTATGGAAATGATAAAGTTAAAAAGAATTTGGATTCTTATGATAAGAATTTAGATTGTATTGCAATATCAGATTATAATAAGTTAAGAGCAATGGCTGGAGAAAGTACATTTAATCCACAAAAAGATGAAGTTATTCTAATATCAAATGTGAATGATTATGATAAGGCTGTGAATAAGTTTATAGAAAATAATAAAACAATGAGAATTGGTAACAACGATTATAGGATTATAAATAAAAAAGCTTTGAAAGATAATTTAGAAACAAGTGCATTAGCCACGAAGTTTATGGTAGCTGTATTACCTGATGAAGTAGTAAAGGATATGGAGATAAGTACTACTTATTTAAGTGGTAATTATAAGGAGAAGTCTGAGAAGATAGAGAATGAAATATATGATGTATTTACAGGATTTACAACAAGAAAATATGGCTATGATGAATATGGATTTATTTTAGGGGAAACTAGAGATATGGCTTATGATGCAAGCGTTGGAATGTCAGTTACAGTAATGTATATAGGTATATATCTAGGAGTAATATTTTTAATATCAAGTGCAGCAATATTAGCACTTCAACAATTATCAGAAGCAAGTGATAATATAGAAAGATATGAAGTGTTAAAGAAGATAGGAACATCAAGTAATAATATTAATAAAGCAGTGTTTTCACAAGTATTTATATATTTTATGATGCCTCTCACGATTGCTATAATTCACTCTATAGTAGGAATTATAATAGCTAGTAAAGTAATATCTATGTTTGGGGCGTCAAGTATTTTAGTATCAGCTATAATTACTGCAATAATAATTATAGTGGTTTATGGTGGATACTTCTTGACTACATATGTTGGATATAAGAATATAATTAAGGTAAGAAGATAA
PROTEIN sequence
Length: 672
MYSKMSVRNVKRSFKDYAIYFLTLTFAVCIFYSFNSISSQKAMMDVTNSKAEIIQMLSKIISMTSVFVSIILGFLIIYANNFLIKRRKKEIGLYMTLGMGKRKISYLLIKETFLIGLLSLGLGLMAGVVVSQGLSLFTSKLFEVNVSKFNFVFSTNAAIKTSLYFGLIFILVMIFNTLVISKYKLIDLLRAGRKNESIKIKSTKVSFLLFLLSIILIGVAYFIILKFGFDNGISYVQISVILGIVGTVLLFLSLSGFLINALEKSEKFYLKNLNMFVLRQINSKVNTTYISMSVISLMLFLTITLLSTGVSFKNSLQTTLKNNTPYDVTFYSFSTGDEEIANISKSLDKIGLDYNNAFREYFSYNLYTSNEGIKKYIYNYGNDKVKKNLDSYDKNLDCIAISDYNKLRAMAGESTFNPQKDEVILISNVNDYDKAVNKFIENNKTMRIGNNDYRIINKKALKDNLETSALATKFMVAVLPDEVVKDMEISTTYLSGNYKEKSEKIENEIYDVFTGFTTRKYGYDEYGFILGETRDMAYDASVGMSVTVMYIGIYLGVIFLISSAAILALQQLSEASDNIERYEVLKKIGTSSNNINKAVFSQVFIYFMMPLTIAIIHSIVGIIIASKVISMFGASSILVSAIITAIIIIVVYGGYFLTTYVGYKNIIKVRR*