ggKbase home page

NECEvent2014_8_3_scaffold_157_1

Organism: NECEvent2014_8_3_Clostridium_perfringens_28_18

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 MC: 1 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: 3..1742

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
PdpB n=2 Tax=Clostridium perfringens RepID=B1BUM1_CLOPF similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 579.0
  • Bit_score: 1178
  • Evalue 0.0
  • rbh
PdpB {ECO:0000313|EMBL:EDT14563.1}; TaxID=451755 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium perfringens E str. JGS1987.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 579.0
  • Bit_score: 1178
  • Evalue 0.0
PdpB protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 29.3
  • Coverage: 317.0
  • Bit_score: 145
  • Evalue 5.20e-32

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium perfringens → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1740
ATTATGAACATTGAAGTTATATATTTAACTAAAAGTAATATTAATATGATACATAAATTAAAGGTTCTGTTACCTAATTATTTGTTTTTAAAGAGTAATTCAAAAGGATATAGAAATAATATTATTAATTATTTGGATTTTATAAAGAAGGATATTCCTTTAGAAATGATTCCATGGATAATTTCTGAAGAATATAATAAAATAATAGATTTAAGTAGTATTACAAGTTATTTATTAGATACTAGTGGAATTCATAGGATATTTTTCACTTCAAAGTTAGACAATACTCTTCAAAATATTTGTGTATTTCTACCGGAAGATTATTCTAGAGAAAAAAGTTATTCAATAGTTGTACATTTAGCACCGGCAGTATCGGGAAATTTTATAAAGTTTCATAGTCAGAAGTCTTATAAATCTAATGTAATTTTTGTTGAAATTTCAACTAGGGGCGTAACACAAGGAAGTTATATAGGAGAATATGCAATATTAGAAAATATAAAAATTTTAAAAGAGATTTTAAAATTAAAAAAATATACTTTCAATTTTATAGGTTATTCAACAGGTGCATTTGCAGTTTGGGCATTAGCAGAAAATTATCCTGATATGGTTAATTCTATTGTAACAATTTCTGGTTTTCCTTATTATAGAAACTTGTGTAACTTAACTAATATACCGATTTTAAATATATCTGGAGATAATGATGATATGATTAAAAGATCATTTGAAGAACCAACCAATTTCTTTAAGAATAAAAATCCACAATATAAAGGATTATTACTTAAAGAAGCAGATCATCTTACAATCATGAACACTCTATTTAGTAAGTATGTTATAAATACATTAATAAACAGAAATCCAAATGAAATTATCAATGTATCATTTAGGACTGAAAGAATGAGACATAATAAAACAAAATACATAGAAATATTAAGTTATAAAGATTATTATGGAAAAATTGATATTGAGTTTTATAATGAACAAATTAATATAAATATTGAAAATATTACTAGTTTTATATTTTATGTTCCTTCAAATTTTAAAAATAAAAAATTTGATATTTATATAATAAATAATAATATAAAGCAAAAATTCACTATAAAAGATACTGATAAATTATTGTTTAAATATTTTAAAAATAGATTTATATTAATTGATGAAGAAGTATTAGAAGTTAATTTAATAGATAATATTAAGGGAATGGGACTGTTAGATATATATATGGATAGTATTAAAATATTATTTCGGAATACTACAAATGATGAAGTTCGCAAAAGTATGTATAAAGTTGCAAAAACAATGTCAAATTTAAAAACAATGGGATATAATCCGAATGTTAATGTTAATTATAAAATAGAATGTATAGATTATTTTCATAAAGATAATTATTGTAACGATAACATAATTCTAATTAATGAAGGAGAAAATAATTTTTTTGAAGAAATAATTCACAAACTTCCTATTAAACCGTATTGCAATGGGTTTTATTATAACGATGAATTTATAGAAGGTGATTATTGTATATTATTTATAACTAAGAATCCATATAATGATAAGAAAAAGCTTCTTATCATTTATTCAACAAAATATGAACTATTTAATTCTAATTATTTTTTAAGAAATTTTATAATACCAAGTTATTCAAATGGTTTAAATCAATGGTTAAATGGAGACGCCTTAATATATAAAGATAAAGAATATATAGTAATTAATTCGATAGGTTGTCCGATTAAATTTAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 580
IMNIEVIYLTKSNINMIHKLKVLLPNYLFLKSNSKGYRNNIINYLDFIKKDIPLEMIPWIISEEYNKIIDLSSITSYLLDTSGIHRIFFTSKLDNTLQNICVFLPEDYSREKSYSIVVHLAPAVSGNFIKFHSQKSYKSNVIFVEISTRGVTQGSYIGEYAILENIKILKEILKLKKYTFNFIGYSTGAFAVWALAENYPDMVNSIVTISGFPYYRNLCNLTNIPILNISGDNDDMIKRSFEEPTNFFKNKNPQYKGLLLKEADHLTIMNTLFSKYVINTLINRNPNEIINVSFRTERMRHNKTKYIEILSYKDYYGKIDIEFYNEQININIENITSFIFYVPSNFKNKKFDIYIINNNIKQKFTIKDTDKLLFKYFKNRFILIDEEVLEVNLIDNIKGMGLLDIYMDSIKILFRNTTNDEVRKSMYKVAKTMSNLKTMGYNPNVNVNYKIECIDYFHKDNYCNDNIILINEGENNFFEEIIHKLPIKPYCNGFYYNDEFIEGDYCILFITKNPYNDKKKLLIIYSTKYELFNSNYFLRNFIIPSYSNGLNQWLNGDALIYKDKEYIVINSIGCPIKFK*