ggKbase home page

NECEvent2014_8_3_scaffold_1143_1

Organism: NECEvent2014_8_3_Clostridium_paraputrificum_30_11

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 50 / 51 ASCG 14 / 38 MC: 1
Location: 174..3839

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Uncharacterized protein n=1 Tax=Lachnospiraceae bacterium 2_1_46FAA RepID=F3BBR1_9FIRM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 49.0
  • Coverage: 949.0
  • Bit_score: 903
  • Evalue 2.40e-259
  • rbh
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:EGG82372.1}; TaxID=742723 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Lachnospiraceae.;" source="Lachnospiraceae bacterium 2_1_46FAA.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 49.0
  • Coverage: 949.0
  • Bit_score: 903
  • Evalue 3.40e-259
alpha-L-arabinofuranosidase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 50.1
  • Coverage: 707.0
  • Bit_score: 678
  • Evalue 4.70e-192

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Lachnospiraceae bacterium 2_1_46FAA → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3666
TTGAGAAAGAAGAGAATATTAAATTTATTGTTATCGTTTACTTTGATTGTATCATGTGTTTCTCCCATATCAGTGGTTAGCGCTAAGAATATTAAGGAAGATGTAAACATTGAAAAAAACTTAATAGGATATTGGGATTTTAATGAAGGAACACTAACTAACAAAGCAAATAGTGATAAGAATGGAGAGCTCATAGGTAAAGGAATATCTATTAAAGACTCAGATATGGGAAAATCCCTTTACTTTGGTAGTGATTCTGATAGTTATATGAAGGTTCCTGAATTTATAAATACTGGTGCGAAACCATATACCATATCAATGTGGTACAAGTATGATGAGAATGTAACAACTCATAATAATACTGTATTAGCTCAACAAGATGGTAATGGTAGATCGTTACTATTATTAACTTCTACTAATAAATATAGAAGTTTTGTTAATGCACAAAATGTAGATAGTAATACAGATGTAGATATAAGTATTTGGCAACATGTATCAATGACAATAGATCCAGAATCTAATAAAATAAAGTACTATATAAATGGTAAATTTGACTCGGAAAAAGATGCAGGAAATAATAAAGTAGATGCATTAACAAGTTTATTAATAGGAAGGCATAAAAATGGTGGAAAAGATCCAGACTCAATGAAAGGGGAAATAGATGAGGTCCGTGTATATGATAGAATCATAAATGATAGTGAAGCAAAGGCTATATATGAATCAGTAAAATCACCTAATAAAACAATTGAAGATAATCTAATAGGACATTGGAACTTTGATGATGGAAATGTAGACAACTTAGTTGGAGATAAAGATGGAAAATTAATAGGTAATAATGTAGCTATAGGAAAATCAAGTAACGAAGAGTTGGGGAATTCATTAATCTTTAATAAAGGTAATGATAGTAGTCTAAAGATTGATAATTTCATTAATACAGGTAAAAATCAATATTCCTTCTCTTTGTGGTATAAAACCGGAGAAGTTAGTAAAGATAACCATACAGCGTTACTACAACAAGGGGATGCTGGAAGATCTTTATTAACACTTCGCCTAGATAATAAGTATGGTTCATATGTTAATGGTGCAGATGTTTTATCCACTAATACAGTAACTAAGGGAACTTGGCAAAATGTTATTATAACTACTGATCCTAAGTCAAATAAAGTTAAGTATTACATTAATGGAGAACTTGATGGGGAATATGATGCTGGAGATAACTCAGTTGATGAGATGACTAGCTTAATAATAGGAAATCATAAAAATCCTAATGCAGAAAATCCACAACAATTTGTAGGAGAAATAGATGAAATTAGGGTATATGACTATGCAATTGGTAAGGATATAGCAAAAGAAATATATGAAGATAAAGTAGATAAAAACGTAAAATTAAAATTAAATCCAAATGAAGTTGAACGTTCAATTGATCGTGCTACTTTTGGAATTAATCATAGATATTCATTTAATGGATATGGAAGCTTTGACTCTGAAACAGGAAAGATGAGGGAAGACTTTACAGAACTTTATAAAAATGCAAATTTTGGTTCTCTAAGATATCCAGGTGGTACTATCTCAAATTTATTTAGATGGAAAGACTCTATAGGAGATTCATCTAATAGAAAAAATCAAATTCATGGATTCTATAGTGCAGCTAAAGGAATAGAGCCTAACTTTGGATTAGGAGAAGTAGCTACATTTGCTGATGAAAACAATTCTGAAATAGTTTATGTATATGGATTAGGTAGAGGTTCAGCACAAGATGCTGCAGACTTAGTTGAATATCTTAATGCTGAAGTAGGTACAAATCCAAATGGGGGAATCGAATGGGCAAAGGTTCGTGAGAAAAATGGACATCATAATCCTTATAATGTAAGATTCTTTGAAATTGGTAATGAAATGAACCAAGGTGGAGTTGATGGATCAACTTCACAAATGTATTGGACTGCTTATGATGGAAAAGCTCTAGATCATTATATTAATGGTGGAACTATAAATATAACAAAACAAGAAGTTGTAGAACCAGAAGAATGGAATGCATCAACAGCTAAGAGTAATGGTGAACCTAACCAAGTTAAGTATATGAGATATGCTAATACAATACCGGGTAGAGGAAGTGATACTCAAGAGGATTATAAAAAAGATGAATTTACGGCAGTAAAAAAAGACTCAGTGCATGTATATGTTAATGATGTTGAATGGACTGTAGTAGAAAATATTAAAAATACTGGTGCTGAAAATGTAGTGGAAGTTAATTACTTTAATGGGGAACTATTATTTGGTGATGGAGTAAATGGAAACATACCTAAAGAAGGTGCTACTATAAAAGTATCATATACAGTTGAAAAAGATGGATTTATCCAAGTGTCACAAGCAATGAGAGATACAATTAAGCAAATAAATGAATTATCTGGAACTGATAAAGAAATTCAGGTATATTCAAGTTTTGAAACAGAAGGTTTTGTAAAAACTATGAATCAAAATAATTATAATGATTTATATGATGGTTTAACTATACATCCATACTCAGGTACTCCAACAGGTTCAGGAGAAGATTTCTATGACTCTGCAATGAAGCTAGCAGATAAAAATGGTATTGCTCATGTTCAGAAATACGTTGATTTAATGCCAGAAGGAAAGGTGCCTGTAATTTCTGAATTTGGTATATTTAGATCTACCAATCCACTATTAAGATCTCAGACACATGCTGTATATATAGCTAAATGTTTAATGGAATATGTGAGATTAGGTAGTCCATATATTCAAAAACATTGTTTAGTAGATTGGTACAGTGAAGGTGCAGATTCATTAGGACCAACACAACAAGCTGTAATACAAGCAGTACCTCAAGAGGGCGCTGATACATCAACAGGTGAAGGTAATTATAAGTTTTTCTCAACACCTTCTGCCCATGTATTTGAAATGTTAAATGGAATGTTTGGTAATGAGATTATAAGTAGTAACTTCAGTTATATGCCTAAGTTTGCTAGTACTGTTGATGTATTCAATGCATTAGCCAGTAAGGATGAAGAGGGTAATATTTATTTAGCTGTAGTTAATCTAGATAAGAATGAGAAAAGAAATATAGAAGTTCAAGTTGATGGTGTAGACTTAACTAATAAGGTGGTTGATGTGCAGAAGCTTGCTGGAGATTCGTTTAGTGAAGAAAATACTTTAGATAATCCTAATAATGTTGAGATAGAAAAATCCAAATTTGTAGTAGATAATGAAGGTATGAATTTAGAATTAGATCCTCACTCATTTACTATACTAAAAATAAATAACAAAGAAGAAGTGAAAGCAGTTGATAAATCTAAATTAGAAGAGTTAGTTAAAGCTAGTGAAGCTAAGAATGAAGGTGATTATACAGCAGAAACATGGGCAGTATTTAAAAATGTTTTAAGTGAAGCAAGGTTAGTTTTAAATAACTCAGATGCAACTCAAGAGGAAGTTGATAATATAGTTAATAGTTTAAAAAGTGCTTTATCTAATTTAAAAGAGATAGAGAAAGAAATACCAAAAGATGAAGATAATAATGGAGGTAAAGAAGAGAATGATAATGAAGGTAGTAATCCACCAAAAACTGGAGATGTATCTTCACCTATTATGGCCTTGGCTTCAATACTTACATTAAGTGGAGTATATTTATTTAGGAATAAAAAACATAAGTGA
PROTEIN sequence
Length: 1222
LRKKRILNLLLSFTLIVSCVSPISVVSAKNIKEDVNIEKNLIGYWDFNEGTLTNKANSDKNGELIGKGISIKDSDMGKSLYFGSDSDSYMKVPEFINTGAKPYTISMWYKYDENVTTHNNTVLAQQDGNGRSLLLLTSTNKYRSFVNAQNVDSNTDVDISIWQHVSMTIDPESNKIKYYINGKFDSEKDAGNNKVDALTSLLIGRHKNGGKDPDSMKGEIDEVRVYDRIINDSEAKAIYESVKSPNKTIEDNLIGHWNFDDGNVDNLVGDKDGKLIGNNVAIGKSSNEELGNSLIFNKGNDSSLKIDNFINTGKNQYSFSLWYKTGEVSKDNHTALLQQGDAGRSLLTLRLDNKYGSYVNGADVLSTNTVTKGTWQNVIITTDPKSNKVKYYINGELDGEYDAGDNSVDEMTSLIIGNHKNPNAENPQQFVGEIDEIRVYDYAIGKDIAKEIYEDKVDKNVKLKLNPNEVERSIDRATFGINHRYSFNGYGSFDSETGKMREDFTELYKNANFGSLRYPGGTISNLFRWKDSIGDSSNRKNQIHGFYSAAKGIEPNFGLGEVATFADENNSEIVYVYGLGRGSAQDAADLVEYLNAEVGTNPNGGIEWAKVREKNGHHNPYNVRFFEIGNEMNQGGVDGSTSQMYWTAYDGKALDHYINGGTINITKQEVVEPEEWNASTAKSNGEPNQVKYMRYANTIPGRGSDTQEDYKKDEFTAVKKDSVHVYVNDVEWTVVENIKNTGAENVVEVNYFNGELLFGDGVNGNIPKEGATIKVSYTVEKDGFIQVSQAMRDTIKQINELSGTDKEIQVYSSFETEGFVKTMNQNNYNDLYDGLTIHPYSGTPTGSGEDFYDSAMKLADKNGIAHVQKYVDLMPEGKVPVISEFGIFRSTNPLLRSQTHAVYIAKCLMEYVRLGSPYIQKHCLVDWYSEGADSLGPTQQAVIQAVPQEGADTSTGEGNYKFFSTPSAHVFEMLNGMFGNEIISSNFSYMPKFASTVDVFNALASKDEEGNIYLAVVNLDKNEKRNIEVQVDGVDLTNKVVDVQKLAGDSFSEENTLDNPNNVEIEKSKFVVDNEGMNLELDPHSFTILKINNKEEVKAVDKSKLEELVKASEAKNEGDYTAETWAVFKNVLSEARLVLNNSDATQEEVDNIVNSLKSALSNLKEIEKEIPKDEDNNGGKEENDNEGSNPPKTGDVSSPIMALASILTLSGVYLFRNKKHK*