ggKbase home page

Infant_2_SPH1_7_1

Organism: Infant_2_SPH1

partial RP 0 / 55 BSCG 0 / 51 ASCG 0 / 38
Location: 563..2737

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Ornithine decarboxylase {ECO:0000313|EMBL:ADJ57328.1}; TaxID=1282 species="Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Staphylococcus.;" source="Staphylococcus epidermidis.;" UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 724.0
  • Bit_score: 1486
  • Evalue 0.0
Ornithine decarboxylase n=2 Tax=Staphylococcus epidermidis RepID=D9CJB5_STAEP similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 1485
  • Evalue 0.0
Ornithine decarboxylase (EC:4.1.1.17) KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 90.5
  • Coverage: 724.0
  • Bit_score: 1378
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Staphylococcus epidermidis → Staphylococcus → Bacillales → Bacilli → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2175
ATGAAATTTTTAAAGGTTGGTACTTCTGAAACAGCAAGAGATTACTTTAACAGTGACAGGGAGATTGTTTCTATCTATGATAATAGTACGGATTTAATTGATTTAGGAGCAATAATTTTAATGGATTATGAAATCGATTTCATAGATTTGTTAAAAGAAGAAAAATTAGATGTGCCTGTATTAGTAATTACTAATTATGAGAATGTTAATAATAAACATTCAAATGAAAAAAGAAATATTGAATCTGTTGATTTCATAATTGACATTAATAATTTTAATATTGACTACGTTTCCAAAAAATTAGATTATTTAATATCTAAATATGAAAAAAATATACTTCCTCCATTTTTCAATACCTTAGCTAATTATTCTGACAGAGGTAATATTCAGTTTGATTGTCCAGGACATCAAGGTGGACAATATTTTGCAAAACACCCAGCTGGAAAACAGTTTTATAAATTTTTTGGGGAAAATTTATTTAGATCAGACATTTGTAATGCAGATGTTGATTTAGGAGATTTGTTAATTCATGAGGGTCCTGCTGTGGAAGCACAAAAACATGCTGCTAAAGTATATAATGCAGATAAAACTTACTTTGTTATGAATGGATCTACGACATCTAATAATATTGCTATAACTTCTGCAATAATGCCAGATGATTTAGTGTTATTCGATAGAAACAACCATAAGTCTGCTTATAATTCTGCTCTGGTTAAAGATGGCGGTCGTCCTGTCTATATGCAAACTTCAAGAGATTCTTATGGGTTTATAGGCGGTATATATCAAGAAGAATTTGATGAAGAACGATTAAGAGAAAGAGCTGCTAAAGTAGATCCAGAACGAGCAAAATGGGAAAGACCATTTAGATTAGCAATTATTCAATTAGGTACTTATGATGGAACGATTTATAACGCTAAACAAGTTATAGAAAAAATAGGTCATTTATGTGATTATATTTTATTCGATTCAGCATGGGTTGGTTACGAACAATTTATCCCATTGATGAAAAAATCATCTCCTTTATTGTTAGATTTAGATGAAAATGATCCAGGTATTTTAGTAGTACAATCAACACATAAACAACAAGCCGGTTTTTCTCAAGCTTCTCAAATTCATAAAAAAGATAAACATATCAAAGGTCAAAAACGTTATATTAATCATAAAAGATTCAATAATGCATATATGCAATATGCTTCAACATCACCATTTTATCCATTATTTGCTTCTTTAGATATAAATGCGAAAATGCAAGAAGGAGAATTAGGTGAAAAACTTTGGAATGATTGCTTGACTATTTCTACTAACGCTAGAAAAAAAATTCTAAACAGATGTAAATATATTAAGCCATTTATTCCAGAAAAAGTTCAAGGTAAAGATTGGGAAGAAGCTAACACGAAAGAAATTATAAGTAATTTAGATTATTGGAAATTTAATCCAGATGAAAAATGGCATGGATTTAAAGGATATGGTAATGAACAGTATTATATTGATCCTAATAAATTCTTATTAACAACTCCTGGAATTGACTCTAAAGATGATTCTTATATGGACTTTGGGATACCAGCTGTTATTTTAGCTAATTATTTACGTGAAAACGGAATTATACCAGAAAAAAATGATTTAAATTCTATTCTATTTTTAATGACTCCTGCTGAAGACACAGCAAAAATGAATAATTTAATTGCTAAATTAATTCAGTTTGAAAGATATATTGATCAAGATGCGCCTTTAGAAGTAGTTTTGCCTCGTCTATACTACAACAATTATGAAAGATATCAGAATTATACAATTAGAGAACTATGCCAAGAATTACATGATTTTTATAAAGAACATGATACAAAAGAATTTCAAAAGAAAATGTTTTTAAAAGATTATTTACCAGAGTATAAAATGAAACCTTATGACGCAAATATTGAATTATTAAAAAATAACGCTAAATTAGTTGAGTTAGATAATATTGTAGGAGAAATCGCTCTTGAAGGTGCACTCCCTTATCCGCCAGGTATATTTTGTGTAGTTCCAGGAGAGGCTTGGAGTGAAACAGCAAAAACATATTTCAAAATATTAGAAGAAGGTATTAATGAATTTCCTGGATTCGCTCCTGAAATTCAAGGCGTTTATTTTGAAGAAGTTGATAATCGAATTAAAGCATTCGGTTATGTGTTAGATAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 725
MKFLKVGTSETARDYFNSDREIVSIYDNSTDLIDLGAIILMDYEIDFIDLLKEEKLDVPVLVITNYENVNNKHSNEKRNIESVDFIIDINNFNIDYVSKKLDYLISKYEKNILPPFFNTLANYSDRGNIQFDCPGHQGGQYFAKHPAGKQFYKFFGENLFRSDICNADVDLGDLLIHEGPAVEAQKHAAKVYNADKTYFVMNGSTTSNNIAITSAIMPDDLVLFDRNNHKSAYNSALVKDGGRPVYMQTSRDSYGFIGGIYQEEFDEERLRERAAKVDPERAKWERPFRLAIIQLGTYDGTIYNAKQVIEKIGHLCDYILFDSAWVGYEQFIPLMKKSSPLLLDLDENDPGILVVQSTHKQQAGFSQASQIHKKDKHIKGQKRYINHKRFNNAYMQYASTSPFYPLFASLDINAKMQEGELGEKLWNDCLTISTNARKKILNRCKYIKPFIPEKVQGKDWEEANTKEIISNLDYWKFNPDEKWHGFKGYGNEQYYIDPNKFLLTTPGIDSKDDSYMDFGIPAVILANYLRENGIIPEKNDLNSILFLMTPAEDTAKMNNLIAKLIQFERYIDQDAPLEVVLPRLYYNNYERYQNYTIRELCQELHDFYKEHDTKEFQKKMFLKDYLPEYKMKPYDANIELLKNNAKLVELDNIVGEIALEGALPYPPGIFCVVPGEAWSETAKTYFKILEEGINEFPGFAPEIQGVYFEEVDNRIKAFGYVLDK*