ggKbase home page

Infant_2_SPH1_15_13

Organism: Infant_2_SPH1

partial RP 0 / 55 BSCG 0 / 51 ASCG 0 / 38
Location: 12610..15576

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Uncharacterized protein n=1 Tax=Staphylococcus epidermidis NIHLM037 RepID=J0PMG0_STAEP similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 1965
  • Evalue 0.0
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:EHM67339.1}; TaxID=904314 species="Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Staphylococcus.;" source="Staphylococcus pettenkoferi VCU012.;" UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 41.7
  • Coverage: 460.0
  • Bit_score: 397
  • Evalue 6.50e-107
RNA polymerase subunit alpha KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 27.8
  • Coverage: 959.0
  • Bit_score: 336
  • Evalue 3.60e-89

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Staphylococcus pettenkoferi → Staphylococcus → Bacillales → Bacilli → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2967
ATGAGAGATAAAATGAGAATAAAAGATTCACAATTATCAAATCGCTGTAAAAATCAATTAATAAAGAATGGTTATGATTATGTCTATCAATTAAAAAAATTAACTGATGATGATTTGAAAAATATAAAAAATTTAGGTGCTAAATCTATCCAAGAAATTCAGGAATTTAGAGATAGTATAACTTCTAAGAATAATGATGATATTATCATTCCTAAAGATATAACTATTGAAGCGTTGAAATCAATGAATATTGAAGAAGTAATTAATAGCGAAAATATTAAAAATATTATGAAAATAAATAATATAAAATTATTAGATGCAGTAATTGATTTGAGTTACGAAGATATAAAGAAATTTAGAAAAGTCGATAATCAACTTATAAGTGAAATTCAAAGTATTTGCAATAGATTAAGAGAAAAAATCAACTTAGTAGATAGAGACTTATTTAAATTAGTCTTAAACAATCCAGATAAAGATATTAGAAGGGTTATTTATGAAAATATACCCAAAACTCTTTTAAATTGCACAATAAAATATTTTTTTAAAAGCAGATATGTGAATGAACTCAATATTGAGGAACTTGGATTTTCTAACAAAGAAAGAAAAATAGTATTTACGTATAATTTGAATAAAATAGATAGATTATTATTAGTTTCATACGATGATTTATTAAATATACCGGGTATAGCTAAAAAAACTTTGAATGACATTTTTGAAAAGTTATTTAAATACGTTGTTGTACAAAACAAAAATGAAATCTTTATAGGTGATATTTCGAGAATATATCTAAAAAAGTCACCGTATAATTATTTATTAGTCATGAGAGAAAAGCAATTAAATAATATTTTAGTTAATTTAGATAACGTTATTAATGAAGTATTAAATAATGAACAATTTTCCATTAGCTATAAATTAGATTTGTTAATAGAAAATCAATTTATAACTAAACGTATAAAAGAAATGATATTTAATGAAGATATAGAGCAAGAAATAGTATATTCATTTATAAAAAATAATTCTTATATGTATAGAAAAAAGGAAATATGTGATGAACTAACCTCTCATTTTACCAATTTAAATGTTTATAAATATTTTAATAATTTAATAAAACTAGATTTAATATCAATTGATGAATTTGGTAACGTGTATTCAAAAAAGTATTCGATTTTATCATATGTAACTGATAATTATAATGAGAACGTATTAGAAATGATGAAACTTCGACTAGAAGGTAAGACCCTAGAAGAGATTGGTAATGCTATTGGAGTTACTAGAGAACGAGTGAGACAGTTAGTAAAAAAAGTTACTAGTAGCACGAAACAAACTTTTAAAGAAGATGAAAATGCATATTGGTTTAGTAACTATAATTTAGATAAAAAGCAATATGAATCGTTGTTCAAAGATAACTTATATTACTATTTATCTAATAGATATGAAAAAGGTATTAAGTTATGGAAAGATATTCTTAATGATGAAAAAGCCTCTGTAAAATTGAAAAAAAGGGTGCGAGATGAATTACAAAAAGGAAAAATTGTAATTGATAATAAATTAATTCCTAAGACGAAAACAAGTATTATTGATTATGTATTAGAAGAATTTGGAAAAGAGACATTACATATTAATGATTTATTAGAAATAATTAATTTATTTCTCGAAGAACAGAGGTTAGATAAAGAAGTATTCGATATTGATATTAGATATTTAGAAAATAGATTAAGTGATACTTCGAATGCAGTAAGTCGTGGAAAAAAATATTATAGATACTATGCATATGATGAATATGATTGGGATTTATTTTATGAAAAAATTAATTTCAAAGAATGGAAAGATCTTGAAATATCGACATTAATTTTGTTTAAGTATCACTCGTTACTTATGGAAAAATATAATATTAAACATGAAAATGAGTTACATAATATTATTAGAAGAACAAGTGAAAAGAGACGTGATTTAAATATAGAATTAACAAGAATGCCTAATATAGCAATTGGCAACGTGGATAGAGAACAACAAGTAAAAGATTTTATGTATGAATATGCTCCTCTTCATGTAGATGAATTCGTTCAGTTATATTACGAAACATTTGGAGTTAAAGAGCAAACATTTCGAGCTAATTATCTAAAGTATATAGACGATTATATTGTAGATGATTATATTAAAAAAGACTTTGTTTCTATTAATGAAGAATCTCTTAGTTGTGTCAAAAATGTTCTTGACGGTAAAGAGTTTATGTTTATAGAAGATTTAAAAAAAGAATTAAATCAGGTTGATACAGACTTACAAATCATCTTAAAATATTTAGATTATAAAACTTTTAGTTCGTATATATTAAAAAATAAATATGAGACAACCATTAATTATTATAACGAAAAATTTTATAATAATATGGACATTGTTGACTTAACAAACATAGATAAAAGAATATGGAACTTAAGTTCATTTGGATCATGGCTATATGACAAGTATAAAACTATGGAATTATTAGAATTCTCTCCTAAGAAGTATATTACAAGGAAAAAACTGAATGAGATAGGTCTAACACCGAATGTTTTAGAAGATTTTAGACATAAAGTGTTAGAAAAATTAGATGATGACAAAGTATGGTCAATAAGTGCAATTATTGTTGTTGTTGATAATGAAAAAATTGATTCTTTTGGTTTTGAACCTATATTTTATCGATCTATTTTGAGAGGATTGGAAAATATATATAGTAATAAAATAGGAGGGAATTATCTTCTAAAAAAAGATCAAGATTTTAGAGTTAGTGATTTAATTGAAGAAGAAGTTATGAAAGTGAAAATGATAGATATTTTTGATTTAACTGAAATCATTAATGAGAAGTATAATATAAATTTAGAATATTATAAATTAATCGAGTCAATTAAGAGGACCGATATGTATTATGATGAAATTATGGAAAAAATTTATTTAGATTTGAATTATTACTATGAGGAGTTTGAATATTAA
PROTEIN sequence
Length: 989
MRDKMRIKDSQLSNRCKNQLIKNGYDYVYQLKKLTDDDLKNIKNLGAKSIQEIQEFRDSITSKNNDDIIIPKDITIEALKSMNIEEVINSENIKNIMKINNIKLLDAVIDLSYEDIKKFRKVDNQLISEIQSICNRLREKINLVDRDLFKLVLNNPDKDIRRVIYENIPKTLLNCTIKYFFKSRYVNELNIEELGFSNKERKIVFTYNLNKIDRLLLVSYDDLLNIPGIAKKTLNDIFEKLFKYVVVQNKNEIFIGDISRIYLKKSPYNYLLVMREKQLNNILVNLDNVINEVLNNEQFSISYKLDLLIENQFITKRIKEMIFNEDIEQEIVYSFIKNNSYMYRKKEICDELTSHFTNLNVYKYFNNLIKLDLISIDEFGNVYSKKYSILSYVTDNYNENVLEMMKLRLEGKTLEEIGNAIGVTRERVRQLVKKVTSSTKQTFKEDENAYWFSNYNLDKKQYESLFKDNLYYYLSNRYEKGIKLWKDILNDEKASVKLKKRVRDELQKGKIVIDNKLIPKTKTSIIDYVLEEFGKETLHINDLLEIINLFLEEQRLDKEVFDIDIRYLENRLSDTSNAVSRGKKYYRYYAYDEYDWDLFYEKINFKEWKDLEISTLILFKYHSLLMEKYNIKHENELHNIIRRTSEKRRDLNIELTRMPNIAIGNVDREQQVKDFMYEYAPLHVDEFVQLYYETFGVKEQTFRANYLKYIDDYIVDDYIKKDFVSINEESLSCVKNVLDGKEFMFIEDLKKELNQVDTDLQIILKYLDYKTFSSYILKNKYETTINYYNEKFYNNMDIVDLTNIDKRIWNLSSFGSWLYDKYKTMELLEFSPKKYITRKKLNEIGLTPNVLEDFRHKVLEKLDDDKVWSISAIIVVVDNEKIDSFGFEPIFYRSILRGLENIYSNKIGGNYLLKKDQDFRVSDLIEEEVMKVKMIDIFDLTEIINEKYNINLEYYKLIESIKRTDMYYDEIMEKIYLDLNYYYEEFEY*