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OR_08142018_2_5m_0_2um_scaffold_5_345

Organism: OR_08142018_2_5m_0_2um_Sphingobacteria_36_111

near complete RP 49 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38 MC: 1
Location: comp(392022..396509)

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase n=1 Tax=Shewanella denitrificans (strain OS217 / ATCC BAA-1090 / DSM 15013) RepID=Q12MX5_SHEDO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 33.4
  • Coverage: 853.0
  • Bit_score: 384
  • Evalue 3.60e-103
ATP-binding region, ATPase-like protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 33.4
  • Coverage: 853.0
  • Bit_score: 384
  • Evalue 1.00e-103
Tax=RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 90.5
  • Coverage: 1495.0
  • Bit_score: 2703
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated → Sphingobacteria → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4488
ATGAGTAAAAGTGACAATAGAAAAGACATTGAACAGGATTTCATCTTGCTTTTCGAGAATGTTGCTCAAGGTGTTATTTATCTGAATAAAGACGGTAAAATTGCAGAAGCAAATCCAGCTGCTATTGATTTATTAGGGTTATCAGAAAATCAAATAATTGGAATAGAATCTGTTGATGCACGTTGGGCTACCATAAAGCCTGATTTTTCTATTTTCCCAGGTGAAGAACACCCAGCAATAGTTGCATTAAAAACTGGAAAGCCAGTTTTTAATGTTGTAATGGGTGTAAAACAAGCTGTTAAAAATAAATATGTTTGGATTTTAATAAATGCAGTTCCAGAATTTAAGGAGGGAGAAACAGAGCCTTATCGAGTATTTACCACATTTACAGATATTACCGATCAAATTGAATTAGAATCAAAGCTAAGACAGCGGAATAAGTTGTTGCATTTAATTTCAACTATTTCACAGCGGTTTATTAATATCCCTTTAAAACATTTGAATAATGAAATTAATGCTGCAATAAAAGAATTAGGTGAATTTTCCAAAGCGGATAGATTGGCCATTTTAGAGTATGATTATAAAAATGGTTTTGCTTATTATACACATGAATGGTGTGCCCATGGAATCGAATCTAAAAAAGAGGAATTGGCTAAAATTCCTTTGAATGAATTTGCGTCTTGGATTGAAATCTTACAAAAAGGAAATCCAATTAACATCCCAAATTCAGATCAATTAGAAGTAAATAGCCCAATTCGTAATTTATTAGATACGGGAAAAGTAATCAGCTTATTGGCAATACCCTTAATGGATGGTAACGATTGCATTGGTGTAATAGGATTAGAGTCCGTTAATCAACCACACTATTTTACTACTGTTGAACAAGACCTCTTAGGAATTTTTGCAGAGTTACTAGTGAATGTAAAAAACCGAATTTCAAATGAGCTGAAAATAAAGGAGAGTGAGATAAAGTATAAAGAAATTACAGAGAATATGTCTGATATGGTATGGACCATGGACTTAGACTTTAATATTACTTTTTGTAGCGCTTCCGTTATCAAAATATTTGGGTACACATCCCAAGAGTTTATTCAACTTAGTTATGACAAAATCTATACATCTGAAACAATTCAAAAAATTGAAACACTCTTAACAGAAATAAACCAGTGTCGAGTTAATGGTTCTATTAATGTAAATCAGGCCTGGACAATTGAAGTGGACTCTTTTAAAAAAGATGGCACTTACGCATGGTTTATTACTGAAATAAAACCACATTTTTCAGAAGATGGAATTTTAAAAGGATTTATAGCAACAACTCGCGATGAAACAATTCGAAAAAAGGCAAATGATGAATTAAGAAAGTCAAGATTTGATTTAGGAGAGCGATTGAAAGAACAAAAAGCAGTTTATGCTGTATCTACCTTAAGTCAAAATGAAGAATTAACACCGGAAGAATATTTTAATGAGATTGCTAATATTATTGTAGCTGGATTTCAAGATACCATACAAACGTATGTTCATATAGAATATAATGGAATTGATTATTTTTCAAATCAATTTAAAGTCACAGAAAATTTTCAAGAATTTAATATTCATGTTTCAACCCAAAATCAGGGGTGTATTAAAATATATATACCAGGAACTTTAGATTTTCTTAATGAAGAAATGGTAATGATTAATACCATTGTTGGTATAATTGAAAAGTTTAAGCAAATTAAACTAACCAAACGGGATATTATTGCTTCTGAAGAAAAGTTCAGAATTATTGCCAATAATACCTATAACTGGGAATTTTGGGAAGCGCCAGATGGGTATTTTATTTATCACTCTCCATCTTGTGAACGTATAACTGGATATTCGGCAGATGAACTTCTAACTGATTCAGCAATAACCCAAAAACTAATTCACCCAGACGACCTTACTAAATATGTTGAGCATAGAAATAAAGTTGTTGAAGAAAAGAAATCCGAAAAAGTTATTTTCAGAATTATCAATAGAAATAATGAAACAAGAATTATTGAACATGTATGCCAACCCATATTTAATGATCAAGGTATTTTTTTAGGAACTAGAGGAACTAATTTAGATATTACTGAAAATAAATTAGCCGAGGAAGCATTACTAGAGAGTAAAGAAAAATATAGAAGTTTAATTGAGAGTTCTGATGCTTCTATTTTCATGTTAGATTTAGAAGGAAGGTTTTTATATGTGAATGATAAAACAGCAGAAACATTTGGATTGCCCAAAGAATCTTTCATTAATAATGGACTCACTATTTATGATTTATCTTCTCCAGAATTGGCCAGTCAAAATATGGCAGAAGTAGAACATGTTTTTTTTTCAGGAAAGGGTAAGATAAAAGAATCTTCAAGAGTGATCAATGGCCAAATGTTTTGGTTTAGAAGTAGTATTCAGCCGGTAAAAAATAGTCAGGGTAATATATATGCTGTTTTTGTTAACGCCACAAATATTACTGAGCAAAAACTAGCAGAAGAACGTGTATTACAAAGTGAATTAAAATATCGAACTCTTTTTGCTGATTCACCCGACGGTTATTTAATTTTAAAAGATGGAATTTTTATTGATTGTAATAAAGCAAGTGAATTAATACTAGGTACAAATAGAGAGGGCATTATTGGCAAAGAAGCGAAAGATATTTCACCAGAATACCAACCAAATGGTCGCAAATCGGATGAGTTGGTACAAGAAGTAGTAGCTGAAGCTTTTGCTAATAAAACGACACAGTTTGAGTGGGTTCATTTAAAGCCTGATGGAACTCCTGTTTACATAGATATTAAACTCTCTGCAATTGACACATTAGATGAAAAATTTCTTCTTACTACTTGGAGAGATATTACTTCACAAAGGGAAGCAAAAGAGCTGATTAATAAATTGAGTAGTGCGGTTGAACAGAGCCCAATCAGTATTTTCATTACTGATCTAGATGGAAATATTGAATACGTAAATCCATTTACGATAACTACAACAGGCTATCAACAAGAAGAGTTGATTGGGCAGAATCCAAGAATTTTGAAATCGAGCTTTACCAATCCTAAAGTGTATGACGAGCTTTGGAGTACAATCACTAATGGTAAAGTATGGAGAGGGGTTTTAAATAATAGAAGGAAAAATGGTTCATTGTATTGGGAGTCTACTACAATTACACCTATTATTAACGAAGTTGGGGCAATTACTAGTTTCATTGCTATTAAGGAAGATATTACAGAACGAATTAAAATTGAGCATGAGATAAAGCAACTCAATACCAATCTAGAAAAGAAAATTGTAGAAAGGACCATCGAATTGCAAAACAGTAATGAAGAGTTAACAAAAGCCAAAAGTGAAGCAGAAGAAGCCAATCATGCTAAAAGTGAGTTCTTATCTAGAATGAGTCATGAACTTAGAACTCCTATGAATGCCATTCTTGGATTTGCACAGTTGCTAGAGATGGGGTCATTAGATTCCAAACAAGAAAAAGCAGTACACCATATTTTAAACAGTGGACAACACCTGTTGAACTTAATTAATGAAGTACTTGAAATATCAAGAATTGAAGCAGGTAAAATTTCTATCACTGTTGAAGCGGTAAAACTAAATAATGTTTTTAGAGATGTATTAGAAACATTAACTCCAACGGCTGATGCTTATGGAGTAAAATTGATTAATGAGCTTGAAGATAAAGCAGATATCTTTATAAGTGCTGATAAGCAGCGGATTAAACAAGTTTTACTTAATTTATTAAATAATGCTATAAAATACCATGATAAAAGAGGGTGGGTAAAATTATTCGCAACCGAAGTTATAAGAGATAATAAAACCATTATTCGTATTTGTGTATCAGATAATGGTCCGGGAATTGATGCCAATAATGTAAAAAAATTATTTACCCCATTTGAAAGATTAGGAGCAGAAAATAGTACAGTTGAGGGAACAGGATTGGGGTTATCGGTAGTTCAGCAATATGCATCTTTGATGGGAGGCACATGTGGTGTAGAGAGCAAGTTAAATGAAGGAAGTACATTCTGGGTAGAACTTCCTAGAACAAGCTCTTTTGTAGAATCCCTAAATGTTCATGCTCAATTAGAGCAAGTAGCGCTTAAAGAAAAGATCATTGATGAAGCGGTAGTATTATATATTGAAGACAACAGTTCAAATATTGAATTAGTGACCCAAATTTTATTAGCAAAGCGTCCCAACGTAAAATTAATAACTGCAGTTTACGGTAAACAAACTTTGGAATTGGCCCTTAAACATCAGCCCAATCTAATATTGTTAGATTTAAATCTGCCTGATATTCATGGATCTGAAGTATTTGAATTATTAAAACAACATGAAATAGCTAGGCAAATTCCCGTAATAATAGTAAGCGCAGATGCCATGCCTGCTCAGGTAAATAAATTATTGGAAGCTGGCGTTAAGCAATACTTAACCAAGCCTTTTGATGTCCCTGCTTTTCTACAAATAATTGATCAATATACTAACCATTAA
PROTEIN sequence
Length: 1496
MSKSDNRKDIEQDFILLFENVAQGVIYLNKDGKIAEANPAAIDLLGLSENQIIGIESVDARWATIKPDFSIFPGEEHPAIVALKTGKPVFNVVMGVKQAVKNKYVWILINAVPEFKEGETEPYRVFTTFTDITDQIELESKLRQRNKLLHLISTISQRFINIPLKHLNNEINAAIKELGEFSKADRLAILEYDYKNGFAYYTHEWCAHGIESKKEELAKIPLNEFASWIEILQKGNPINIPNSDQLEVNSPIRNLLDTGKVISLLAIPLMDGNDCIGVIGLESVNQPHYFTTVEQDLLGIFAELLVNVKNRISNELKIKESEIKYKEITENMSDMVWTMDLDFNITFCSASVIKIFGYTSQEFIQLSYDKIYTSETIQKIETLLTEINQCRVNGSINVNQAWTIEVDSFKKDGTYAWFITEIKPHFSEDGILKGFIATTRDETIRKKANDELRKSRFDLGERLKEQKAVYAVSTLSQNEELTPEEYFNEIANIIVAGFQDTIQTYVHIEYNGIDYFSNQFKVTENFQEFNIHVSTQNQGCIKIYIPGTLDFLNEEMVMINTIVGIIEKFKQIKLTKRDIIASEEKFRIIANNTYNWEFWEAPDGYFIYHSPSCERITGYSADELLTDSAITQKLIHPDDLTKYVEHRNKVVEEKKSEKVIFRIINRNNETRIIEHVCQPIFNDQGIFLGTRGTNLDITENKLAEEALLESKEKYRSLIESSDASIFMLDLEGRFLYVNDKTAETFGLPKESFINNGLTIYDLSSPELASQNMAEVEHVFFSGKGKIKESSRVINGQMFWFRSSIQPVKNSQGNIYAVFVNATNITEQKLAEERVLQSELKYRTLFADSPDGYLILKDGIFIDCNKASELILGTNREGIIGKEAKDISPEYQPNGRKSDELVQEVVAEAFANKTTQFEWVHLKPDGTPVYIDIKLSAIDTLDEKFLLTTWRDITSQREAKELINKLSSAVEQSPISIFITDLDGNIEYVNPFTITTTGYQQEELIGQNPRILKSSFTNPKVYDELWSTITNGKVWRGVLNNRRKNGSLYWESTTITPIINEVGAITSFIAIKEDITERIKIEHEIKQLNTNLEKKIVERTIELQNSNEELTKAKSEAEEANHAKSEFLSRMSHELRTPMNAILGFAQLLEMGSLDSKQEKAVHHILNSGQHLLNLINEVLEISRIEAGKISITVEAVKLNNVFRDVLETLTPTADAYGVKLINELEDKADIFISADKQRIKQVLLNLLNNAIKYHDKRGWVKLFATEVIRDNKTIIRICVSDNGPGIDANNVKKLFTPFERLGAENSTVEGTGLGLSVVQQYASLMGGTCGVESKLNEGSTFWVELPRTSSFVESLNVHAQLEQVALKEKIIDEAVVLYIEDNSSNIELVTQILLAKRPNVKLITAVYGKQTLELALKHQPNLILLDLNLPDIHGSEVFELLKQHEIARQIPVIIVSADAMPAQVNKLLEAGVKQYLTKPFDVPAFLQIIDQYTNH*