ggKbase home page

PLM3-1_170_b2_sep16_scaffold_262_12

Organism: PLM6_170_b2_sep16_Ignavibacteria_34_7

near complete RP 51 / 55 MC: 6 BSCG 50 / 51 ASCG 12 / 38
Location: 8760..12350

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Type VI secretion system ATPase and inner membrane protein TssM Tax=Pelobacter carbinolicus (strain DSM 2380 / Gra Bd 1) RepID=Q3A0R1_PELCD similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 30.1
  • Coverage: 1218.0
  • Bit_score: 522
  • Evalue 6.70e-145
tssM; type VI secretion system ATPase and inner membrane protein TssM similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 30.1
  • Coverage: 1218.0
  • Bit_score: 522
  • Evalue 1.90e-145
Tax=RBG_16_Ignavibacteria_34_14_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 88.0
  • Coverage: 1173.0
  • Bit_score: 2083
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RBG_16_Ignavibacteria_34_14_curated → Ignavibacteriales → Ignavibacteria → Ignavibacteriae → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3591
GTGTTTCGTCCCCTCTCCTTAATAAGGAGAGGGGCGAGGGGTGAGGTCGAAAAGTATTACACAAATTTTATGAACGCCTTAATCAACATATTCAAAAGCCCGAAAGGTTTAGCAGCATTTGGAGCCATAGTACTTGTAGCCCTTATTGTTTTTCTTGGTTCAATTTTCGGGGTTAGCTGGATCTTTAGAATCATCATTATTGTTTTCATTCTGCTTATTGTTCTTTTGATATTTATGTATAAGAAAATGAAAAATGCTCAGAAAGCAAATCAAATTGAAAAATCAATCGGTATGCAAGCTGATGCTCAAATGAAAAATCTTTCTCCCGAAAAGAGAGCAGAGATAGAACAATTCAAGAAGCAATTAGAAGCTGCAATAACTTCATTAAAAAATTCCAAGCTTGCAAAAGGCAAGTTAGGTAAGTCGGCTCTTTACGCTCTTCCCTGGTACATGATTATCGGACCTTCTGCTGCAGGTAAAACAACTGCTATTCAAAATTCAGGACTTGAATTTCCATTTGGTAAAGAAGGTTTCAAAGGTGTAGGCGGAACAAGGAATTGTGATTGGTTTTTTTCTACAAAGGCAATCTTTTTAGATACCGCAGGAAGATATGTAACTCAAACTGGAGACAGGGTTGAATGGCTGGCCTTTTTAGATGTGCTAAAGAAAAACAGGCGAAGAAAACCCGTTAATGGTATTATCATCGCATTAAATATTGATGAAATTATTAATTGCGATAAAGATGAGCTTTTTGATCATGCAAAAAATATCAGGTCAAGAATTGATGAACTTATTGAAAACCTTGGAATAAATTTTCCGGTCTATTTTGTTTTTACCAAGTGCGATCTGGTTCAGGGTTTTGTAGAATACTTTTGTGATTTCAGTGAAATAGAACGTTCCCAGATATGGGGTGCTACTTTAACATCTCAGCAATTAATTAATACAAACCCAAAAGATGTATTTGAAAATGAATTTCAAAAGTTATCTGATAAAATTTTTGAAGTTAGAACAATCCGTTTAAGCAGCCCGCTAAAAAGGGAACAACGGAGAAAAGTTTTTTTATTCCCATTCCAATTTAAATCTCTTCAGCAGAAATTAACTCATTTAATAGGAGAAGTTTTTCAGCATAATCCTTACCAGGATAATCCGATTTTCCGGGGATTTTATTTTACAAGCGGAACCCAGGAAGGTGCACCTTTAGATATTGCAATTAAGGAAATTGCGCGGCAGTTTAACCTCCCCCAAACCACTAATGAGGATTCCCGGGAAATTATCGAGACAAAAAATTATTTTATTAAAGACCTGCTGAATGATATTGTAATCGGAGATCAGAATTATTCTGCAGGACATACTTCAGGTGCTGTTAAGAAACAAAGCTTTGCAAAAGTAGTAACAGTTTCTGCTTCAGCATTATTTTTAATTTTATTTTGCCTCTTTATAATTGTTGGTTATAATGGGAGCAGTGATCTGCTGGATAAAATAAAAAACACTTCCGAATCTTTTCAGAAAATCAATTGGAACCAGGACCTTCTCGATAATTTTACCGAAACAGAAAGATTAAGAGTGCTGATTAATAGTATAGAAAATGGTGAGGCTAACGAAGCATTTTTAAGTTTTGGTTTCGATAGAAGCGAAGAAACATTACCTGAGTTAAAACAATTATATATTAAAAAAACAGAGAGCTTTTTTACTCAGTTTATATTTGATGAAATAATTAAAAACCTAAATAATTATGCCAATGGTCAGGATTATTCCGGGGAAGAAATTTACAACTATTTAAAAGCATACCTGCTTCTTGGTAATCAGCGTTCTAAGCTGGATACAACTGAACAGAGATTTTTAGCTCATGTTTTCTTTAATATTTTAAATTCAAGATTTATAATGTCCAATCAAAGTGCTTCCTCTGCCGATAAAGATTCTTTAAAAAATTTATTAAGGAATTATATCTCATTTTATACCAGCCATCTTAGTGATAAAAACATTTACTCTGTTAGGAATGACAACCTGCTTGTTAGTATCGTTAGAGACAGGATACAGTACAGACCGAATCCGGAAAGTATTTATGCAAGATTAAAACAAAATGGTATAAGCCAGTTTCCCAACGAGCTTACTCTTGAAAAAGAAATTGGTGGAGGATATACATTTTTAAAAACTGATTTCAGAGTACCTGTTATCTTTACAGCAGACGGATGGAAAAATTATATTGAAGAAGCAATAATTGAAGAAAGCATAAATCCCGGTAAGGAAGATTGGGTTTTAGGAAAATCATATGTAAAGCCTGCAGGCGATTTCAACAGTGAAGAAATCAAGAAAAATCTTTTAGACTTATACTTCAATGATTATAAACAAACCTGGCTGCAATTTTTGGAAAGCATTCAGTTTACAAACTTTGAAACCGTTCCATTAGCTGCAGCTAATCTGAAAATTTTAAGCGACCCGGTTAATTCTCCCATTGTATTAATTTTAAAAACTGTTGGTAACCACCTTCAGGCTATTGTTGATATTCAGTCTCCTCAGGATACTAATACAAAATCCTTATACGCTAACCTGGAGTTAAATGAAAAAAATCTTAGCGAAATAAAAAGATATTTAAAGTTTGCTAAAAATCCCGATGGTTCTGCAAGTGCAGATTTAAATGCTGCTCTTTCACAATTTGGTATTATTAGTGGTGTACTGGAATCTATAAAAGGAGGACAAGACCTGACCAAAGATTATGCAGTAAAAGTTTTGGATAAAAGATCTCCTGAGTTTCCATCTTCACTGCAGGCTATAAAAGGTTCATTATATAATACTCCTTCTCTTCAAAACCTGTTTTCAATCCCTATAAAGCTATCCTGGAACGCAATACTTTCTGATGCGTCTTTATATATAAATCAACAATGGCGTAAAAAAGTTTTTGATGAGTTTAATAAATCTCTTGCCAGTTCTTTTCCTTTCAATGAGTCAGGCAGCGATGCACCATTAGAGGATTTTAAAGACTTTTTTAAACCTACTGATGGGATTATATGGACTTTCTTCAATAATGAACTTAGTGCTTTTATTAATAAAGAGAGATGGAAAACAAGTGAATGGGAAAATGAAGGGTTGAATGTTTCAAATGAATTAATAAATGCTTTAAAAAAAGCCGATGATATAAGCACCACTTTATTTAAAACCGGAGATTTAAATGTTGCTTTCAAATTAAAACCTCAGTTGCCTGAATCAAAATCTATTAATGGACTAAAACCAATTGTTGAACAAGTAAATCTTTATATTGATGGGGTGGAAGAACCGTATAGAATGGGATCCCCGTTCTGGAAAGATTATTATTGGCCCGGAGCTAAGGGTACTCCAGGTGCAAGATTGAACATTTCAATCAGAAGTTATGGAACAGATACAAAAACATTTAATGGTGAATGGGCATTCTTCAAGCTTTTAAATGATGCTTCTATAGCAAGAGGGGAGTCTTCTTCTCAATATAACCTTAATTGGTTCTTTTCAAAAAATAATTACGATGTTACTGTTTCATATCTGTTAAATGCCGGCAGCTCAAGAAATCCATTTTCAAAAAATTTTTTTAGTTCGTTTACTCTTCCAAATAAAATTAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 1197
VFRPLSLIRRGARGEVEKYYTNFMNALINIFKSPKGLAAFGAIVLVALIVFLGSIFGVSWIFRIIIIVFILLIVLLIFMYKKMKNAQKANQIEKSIGMQADAQMKNLSPEKRAEIEQFKKQLEAAITSLKNSKLAKGKLGKSALYALPWYMIIGPSAAGKTTAIQNSGLEFPFGKEGFKGVGGTRNCDWFFSTKAIFLDTAGRYVTQTGDRVEWLAFLDVLKKNRRRKPVNGIIIALNIDEIINCDKDELFDHAKNIRSRIDELIENLGINFPVYFVFTKCDLVQGFVEYFCDFSEIERSQIWGATLTSQQLINTNPKDVFENEFQKLSDKIFEVRTIRLSSPLKREQRRKVFLFPFQFKSLQQKLTHLIGEVFQHNPYQDNPIFRGFYFTSGTQEGAPLDIAIKEIARQFNLPQTTNEDSREIIETKNYFIKDLLNDIVIGDQNYSAGHTSGAVKKQSFAKVVTVSASALFLILFCLFIIVGYNGSSDLLDKIKNTSESFQKINWNQDLLDNFTETERLRVLINSIENGEANEAFLSFGFDRSEETLPELKQLYIKKTESFFTQFIFDEIIKNLNNYANGQDYSGEEIYNYLKAYLLLGNQRSKLDTTEQRFLAHVFFNILNSRFIMSNQSASSADKDSLKNLLRNYISFYTSHLSDKNIYSVRNDNLLVSIVRDRIQYRPNPESIYARLKQNGISQFPNELTLEKEIGGGYTFLKTDFRVPVIFTADGWKNYIEEAIIEESINPGKEDWVLGKSYVKPAGDFNSEEIKKNLLDLYFNDYKQTWLQFLESIQFTNFETVPLAAANLKILSDPVNSPIVLILKTVGNHLQAIVDIQSPQDTNTKSLYANLELNEKNLSEIKRYLKFAKNPDGSASADLNAALSQFGIISGVLESIKGGQDLTKDYAVKVLDKRSPEFPSSLQAIKGSLYNTPSLQNLFSIPIKLSWNAILSDASLYINQQWRKKVFDEFNKSLASSFPFNESGSDAPLEDFKDFFKPTDGIIWTFFNNELSAFINKERWKTSEWENEGLNVSNELINALKKADDISTTLFKTGDLNVAFKLKPQLPESKSINGLKPIVEQVNLYIDGVEEPYRMGSPFWKDYYWPGAKGTPGARLNISIRSYGTDTKTFNGEWAFFKLLNDASIARGESSSQYNLNWFFSKNNYDVTVSYLLNAGSSRNPFSKNFFSSFTLPNKIN*