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rifcsplowo2_01_scaffold_45415_1

Organism: RIFCSPLOWO2_01_FULL_Archaea_35_10b

near complete RP 34 / 55 MC: 4 BSCG 9 / 51 ASCG 32 / 38 MC: 1
Location: comp(2..4696)

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
Parallel beta-helix repeat protein n=1 Tax=Methanobacterium sp. (strain SWAN-1) RepID=F6D2F8_METSW similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 25.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 332
  • Evalue 1.70e-87
  • rbh
parallel beta-helix repeat-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 25.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 332
  • Evalue 4.80e-88
Parallel beta-helix repeat protein {ECO:0000313|EMBL:AEG17315.1}; TaxID=868131 species="Archaea; Euryarchaeota; Methanobacteria; Methanobacteriales; Methanobacteriaceae; Methanobacterium.;" source="Me similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 25.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 332
  • Evalue 2.40e-87

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Methanobacterium paludis → Methanobacterium → Methanobacteriales → Methanobacteria → Euryarchaeota → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 4695
ATGCATCGGTTTAGGCAGTTAGCTAATCTCATTGTTTTGGGATGGATTCTATTTTTTACAAGTATTGCTAATTCTGCATCATTACCTATTTTTGGTAATCTTTCTGCAAGTACACTAATAACTACAGACAATGTTCCAAACCCTTGGACATATGGTGTTAATCTAACAAATCTTCAAATTTATTTAAAAACAATGCTTTCAAGTGCAAATGCAATAAAATTTCAAATTCAAAATAGTCAAGGAGAAAGGTCTGTTAGTTATCAAGTTCAGGGAGCCAGCAACTCTGGCGGGGTTGTGTCTGGTAATACGATCACTTACCCAAATGTTTTTGATTATACGAACATAACCTATACAATTGGATCGTCCGAGCTTTCAAAAGTTATCACAATATCAAATGAAAGTGCTCCTACAAACTTTACATTCAAACTGCAGATTTCTGGTGTAAATTACACTCAAACTTCTTCTGGTGGGGTTACTTTTATTGATGAAACAACTGGCGAGCAGGTATGGTCAATATCTCCTCCAAACGGGTTTGATAGTACTCCAACTGTATTAGACGATAACACGCTCAATGTTTCTAGCCCAAAACTAGTTCATGCCTACTACACTATTAGAACCGCTGGACCAAATATATTTCTTGATCTAACAATAAACGAAACAAACATGTCTCAGTTCACTTATCCAATTTATATTGACCCTACTACACAGTCAGCATGCGGAACACTTAGTGCTTCCGGTGAGTATGAACTTAACCAAAGCGTTACAACAACATCAACTTGTTTCACAATTGATGCTGATGACATTGTATTGAATTGTCAAAACTATAATATCACTGGTGACGGTGGGTTTAGTGATTATGGAATCAATGTTGCTACCCAAGACAACGTTACAATAAAAAATTGCAATTTATATAATTTTGGTGCAGCGATAAGACTTACCTCTTCAAATAACTCTCTTGTTGAAAACAACACTGTTAATAACAGCTATTATTATGGAATTTATTTAACTGCAAGCGATAATAATACAATTCGTAATAATACTGCAAATTCATCTAAATATGGTACATATCTTTCTTCAAGTGATGATAATAATCTAACAAATAATACATTCAAAAGCCAAGAGTACTATGGTTTTTACTTGGAATACAGCCAGGGTAACAGGATAATAAATAACACCGCACAAGAAAGCGGAACACTTGACTTTTTGAACTCAGCTAGTTCTACTGATTATTGTAATAATCAGGTTTCTGACCTTGTTGGATCTGGTGGATTACCTGTAAACTATACGAATTCTTCTGTTACATGGGGTAATTTTTCAGCATCAGAAATTTTTCTTTGTAATGCTGATAATTCTGTCTTTAACAATCTAACTATAAATGGTTCTTCAACCCTTTTTAACAATGGTCTTTATTCTTATTTTACTGATAGTTCCCTATTTACAAATCTAACTTCAAATGAAAATAAGTATGGAGTATACATTGCTGCATATCCTAATTCAGGAATTGCAGTTAACTATAATAATGTTACATTTGGTACTTTCATAAACAATTCATATGGTATACAACTAAGTAGTGCTAATTATAGTATTGTTTCTAATAATCAAGTTTATAACAATACAGTATATGGTATAATCCTTGGTTTATCTTTCTTGAATAACTTCACACATAACACTTTGGAAAATAACACGGGCGATGCTTTTTTTGTACAAGGAACAAATAATCTTTTTGAAAACAATTCAGTTTTTTTCAACAAAGCAGAAGGTTTTGAATTCTACAAACCAACAAGCCTTGATGAGGGTAGGTATAATACTGTAAGAAACAACAATGTAAGCTATAATAGTGGCTATGCATTTCACATTAGGTCGGGTGCTTATTATAACACGATTATTTCGAATTACGCAACAAATAACAGTTTCGGCGGCTACCTAAATGCTGGATTCTATACAAATTTCACTAACAACACCATTGTTAACTATTTAAATAGTGCATTTTTTCTAACTTCTTCTGATGAAAATAATTTTTTTAATAATACAATCTCTGATACTGATAATGTTATAGGCTCTGCGATTTATTTAGCTACCTCTTCAGATAGAAATGTTTTTGATAACAATACAATCTCCTGGCGCGCCAGTGTTGGATTTTATTTATCACCTAATGTTGTTGGTAATAGAATAACAAACAATAAAATTTTGACTGGTTCTTCTTATGGGATATATGGCAATTCTAGTCATAGTAATATCTCTTATAATAAAATTGACAATACAACACAATGGGGGATTTATCTTACTGGTGACAATAATACGCTTGCTTATAACAATGTATCAAATGTTACTGGTTCCACGCTAGGTGCAAGTTTTTATTCACATAATGGTGCAGACAACAATACCTTTATTTCAAACCTTGCAATAGATTCCCTATTTCATGGATTCTGGTTTAATAGTTCAAATAATGCAACATTAACTAATAACAATGTAACTAACAGCACGACTTCCCAATATTATTTCAATTCAAATTCCAATGCAACTTTTACTGGAAATAATTATGCAACCTCCCCTTATTCTCTTTCAACTAAAGATATAATACTTGCTAATGGAAGCAATGTTACAACTCTCTATAATGGAGTTTACTATAATTTTTCATCTGATCATCTATCTTTATTTTTTAATAATGCAGTTAATGTTTCCATCCAAACATTGAACTTGACAGATGGCGGAGCATCTGCACTTGGATGCGCCAATTCTTCCTATCCAAAATGTACTCTAGTTACAAATAACTTTAGTGTTGTTAATATAACCAACAATTCAGCTACCGGAACAATTGGCCTTGGTCTTTATTATAATTTGTCAACTGGTTTGTCAAACATTTTTATTTCGAATTATTCTTCTGGTTGGGATAAAGTCGGTTCAACCTTACTAAATACCACTATTGGTTCAGTTAGGTTAGACGGGATAACAAGCTTTAGTACATTTGGTGCAGCAGATTTTGCAACAACTTATTATGTCAATATAACTGCTGGTAGTGGATGTGTTCCAGCTGATACAAGTAGTCATACGTCAATACAAGGAGCCATCAACAATGCTTCTAGTGGAAACATTGTTTATGTTTGTTATGATGGTGGAGTAGTTCATAATCAGTCAACTACAGTTGTTGTGAATAGACCGTTAAATATTCACGGAAAACAAAACGGAGTAATTGTCAATCTCACTTCCTCTAATACCAATAATGTAATTAATATCTCTGCAAATTTTGTAAATATTAGTAACTTTACAATAGTTAATGCAAGTGGCAGTGGTGCTGCAGGAATCTTTGTAAGTTATAACAATTCAAGAATTTATGGAAATATACTTAGAGCTAATTATTTTGGAGTTTATATTAATGGTTCTCATCATACAGTCTTTAACAACACAGCGTATAACAATAGTGCTGCTGGCTTTGGTCTCTATGGCTCCAGTTCTAATAATACCATATCTAATAATACGGGGTATAATACCTCTCAGAGTGCTTTTTTCCTGCAAACAAGTTCTAACAACACATTTACGAACAATATAGGATATAATAATAATTTTAGTTTTAATAGTGATTCATCTTCTAATAATAACACATTTACTAATAATTCTGCATACAACAATACAAATAATGGGTTTTCTTTTTCGTCCTCCTCATCAAACAACACATTATCCAATAACACAGCTTACAACAATTCTGTAACAGGATTTGTTTTTGAGGGTTCATCTTCTAATGAGGTAATACATAACAACACAGCGTATAATAACAATTTCTTTGGATATTTCTTTTCATCTTCATCAAACAATAGTATAACTAACAATACTGGATACAATAACACATATTATGGTTTCAATTTTGAATCATCTTCCTCAAACAACACATTATCAATTAATACTGCATACAACAACACTCAGAATGGATTCACCTTTGATTCATCCTCTAATAATATTCTCACCAACAACACAGCTTATGGAAGTGGAATCATAGGTTTTAACTTTGCATCCTCCTCTAACAACACAGTTTCAAACAACACAGCTTACAATAATACCTACAATGGTTTCGATTTTGAATCCTCATCATCAAACAATTCAGTAACAAATAACACAGCACATCTAAATTTACGATATGGGTTTGCCTTTGATTCTGGATCTAACAATACCTTAAATAACAATACAGCATATAACAATTCTCAATATGGTTTTTATTTTACTTCTGAAACTCTTACAAATCTTTCAGATAACAACGCAACTAATAACACACTAGCTCAATATCAATTTGATTCCAATTCAAACGTTACATTTACAGGCATTAATAGGGCATTACTAACCCCTCAGAATGTTTTTGATCTTAATATCACTGGAGGCAGTAATGTTACAACCTTAGTTTCTTCAACTTATAATAATTTTACTACAACATATGGAACAATCTTCTTTGACAATGCGACAAATGTTTCTATTAAACTAATGAATTTAAGTGATTCAGGTGCATCTTCCACTGGCTGTGGTAGTGTATTTACTGGAACATGTACTTTACTTACTCTAAGTAATAATGTAGTTAACATTTCAAATGCTTCAGCTACAGGCACTATTATTTTAGGTATGTTTTATAACACATCAACCAGCCCAACATCTTCAAATGTGTACATAGGTAAATATGTTACTGCTAACAGTGGCTGGAATCAGGTAGGCCAA
PROTEIN sequence
Length: 1565
MHRFRQLANLIVLGWILFFTSIANSASLPIFGNLSASTLITTDNVPNPWTYGVNLTNLQIYLKTMLSSANAIKFQIQNSQGERSVSYQVQGASNSGGVVSGNTITYPNVFDYTNITYTIGSSELSKVITISNESAPTNFTFKLQISGVNYTQTSSGGVTFIDETTGEQVWSISPPNGFDSTPTVLDDNTLNVSSPKLVHAYYTIRTAGPNIFLDLTINETNMSQFTYPIYIDPTTQSACGTLSASGEYELNQSVTTTSTCFTIDADDIVLNCQNYNITGDGGFSDYGINVATQDNVTIKNCNLYNFGAAIRLTSSNNSLVENNTVNNSYYYGIYLTASDNNTIRNNTANSSKYGTYLSSSDDNNLTNNTFKSQEYYGFYLEYSQGNRIINNTAQESGTLDFLNSASSTDYCNNQVSDLVGSGGLPVNYTNSSVTWGNFSASEIFLCNADNSVFNNLTINGSSTLFNNGLYSYFTDSSLFTNLTSNENKYGVYIAAYPNSGIAVNYNNVTFGTFINNSYGIQLSSANYSIVSNNQVYNNTVYGIILGLSFLNNFTHNTLENNTGDAFFVQGTNNLFENNSVFFNKAEGFEFYKPTSLDEGRYNTVRNNNVSYNSGYAFHIRSGAYYNTIISNYATNNSFGGYLNAGFYTNFTNNTIVNYLNSAFFLTSSDENNFFNNTISDTDNVIGSAIYLATSSDRNVFDNNTISWRASVGFYLSPNVVGNRITNNKILTGSSYGIYGNSSHSNISYNKIDNTTQWGIYLTGDNNTLAYNNVSNVTGSTLGASFYSHNGADNNTFISNLAIDSLFHGFWFNSSNNATLTNNNVTNSTTSQYYFNSNSNATFTGNNYATSPYSLSTKDIILANGSNVTTLYNGVYYNFSSDHLSLFFNNAVNVSIQTLNLTDGGASALGCANSSYPKCTLVTNNFSVVNITNNSATGTIGLGLYYNLSTGLSNIFISNYSSGWDKVGSTLLNTTIGSVRLDGITSFSTFGAADFATTYYVNITAGSGCVPADTSSHTSIQGAINNASSGNIVYVCYDGGVVHNQSTTVVVNRPLNIHGKQNGVIVNLTSSNTNNVINISANFVNISNFTIVNASGSGAAGIFVSYNNSRIYGNILRANYFGVYINGSHHTVFNNTAYNNSAAGFGLYGSSSNNTISNNTGYNTSQSAFFLQTSSNNTFTNNIGYNNNFSFNSDSSSNNNTFTNNSAYNNTNNGFSFSSSSSNNTLSNNTAYNNSVTGFVFEGSSSNEVIHNNTAYNNNFFGYFFSSSSNNSITNNTGYNNTYYGFNFESSSSNNTLSINTAYNNTQNGFTFDSSSNNILTNNTAYGSGIIGFNFASSSNNTVSNNTAYNNTYNGFDFESSSSNNSVTNNTAHLNLRYGFAFDSGSNNTLNNNTAYNNSQYGFYFTSETLTNLSDNNATNNTLAQYQFDSNSNVTFTGINRALLTPQNVFDLNITGGSNVTTLVSSTYNNFTTTYGTIFFDNATNVSIKLMNLSDSGASSTGCGSVFTGTCTLLTLSNNVVNISNASATGTIILGMFYNTSTSPTSSNVYIGKYVTANSGWNQVGQ