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rifcsplowo2_01_scaffold_84726_4

Organism: RIFCSPLOWO2_01_FULL_Archaea_35_10b

near complete RP 34 / 55 MC: 4 BSCG 9 / 51 ASCG 32 / 38 MC: 1
Location: comp(3665..6544)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Conserved repeat domain protein n=1 Tax=Methanobacterium sp. (strain AL-21) RepID=F0T991_METSL similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 26.2
  • Coverage: 823.0
  • Bit_score: 225
  • Evalue 3.00e-55
Conserved repeat domain protein {ECO:0000313|EMBL:ADZ09842.1}; TaxID=877455 species="Archaea; Euryarchaeota; Methanobacteria; Methanobacteriales; Methanobacteriaceae; Methanobacterium.;" source="Metha similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 26.2
  • Coverage: 823.0
  • Bit_score: 225
  • Evalue 4.30e-55
Cell surface protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 28.7
  • Coverage: 731.0
  • Bit_score: 202
  • Evalue 6.00e-49

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Methanobacterium lacus → Methanobacterium → Methanobacteriales → Methanobacteria → Euryarchaeota → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 2880
ATGCTTATGCAAGTATGTTATTGCTCAAACAGAAATATCTTTGTCGTAGTGTTGTTTTTATTTTTTATTTCAATTTCATCAGCAGCAACCTTATCAGTTAATGGAACAGGTGCAAATTGTTTAGTTGGAACACAAACAAATTATTCAACAATACAATCAGCAGTAAATGCTGCTTCAGCAGGGGATACAATTTATGTATGCAAAAACTCAACAGTAGGGTATACCGAGAGTATAGTAGTTAATCAATCAATTAATATATATGGAAATGAATCAGGTGTGAGTGTAATTGCTTCAAACTCGCTTCCAGTGTTTTGGGTTAATTCAACTTACTTTAATATTACTAATTTTACATTAAATGGAGGATATACAGGAATCAAGCTCAATTCAACTGCACACTTTTCTCATATTTACAATGTTACTGCCCATGGAGCCACAGAAGGCTTTTATATAATTTCAAATTACAATGTAATTAACAATAATACAGCACGTAACAACACAGACAATGGTTTTCTTCTTAACTTAAGCAATAATACAAATCTAACAAATAACATTGCATACAACAATACCTATAATGGATTTTTGCTTTTCCCAGGACATAATAACACCTTGACAAATAATACTGCATACAATCAGTCTTCTTTCTTTGGTTTTTCTCTCGAATTGGGTTCTAGCAATAATGTTCTAACAAATAATACGGCTTATCTAAATCAGGAGGGTTTTTACCTTAATGCAAGTTCTAGCAATAATCTTACTTTAAATACTGGCCGTAATAACACTGTGGCTGGCTTCCAAATAATGAATAGTTCTAGCAATAATAGGTTTGTCGGTAACACAGCACATAACAACAGTGCTGCTGGGTTTAGCTTAGTGAACTCTAGTAACAACAATTATCTTGCTAACAACACGGCTTACTCTAATCTTTTTGGTTTTAGTCTTAGTCTAAGTTCCAGCAACACTTTGGTTGATAATCTTGCATATGGCCATTCTTTTGGAAATTTTAATCTTGCAAACACTTCTAATGAAGCTTTGAATAATAATACTGCACATGGGGGCAATGTTGGTTTCTCTTTTTCAACTTCATCTAATGGTACTATCTCTAATAACACAGCATATAACAACACAATTATTGGTTTTCGTTTTATCTCTTTTTCATTGAATAATACCATCTTAAGCAATACTGCCTATAATAATTCAAATTTTGGTTTTAGTTTTGGTAGCTCATCTTCTAATAGCACTTTAACAAGCAATATAGCTTATAACAACTCACTTCACGGTTTTGATTTTGATTCTTCCTCAAACAACATCTTAAGCAATAACACAGCATATACAAATAGTTTTTTTGGTTTTAATTTTGCATCTTTCTCAAACAATACAATTTCCAACAATACTGCATACAGCAACTTATACCATGGTTTTGGTTTTGAAGAATCTTCTTTAAACAACACTCTTACTAATAACTCGGCATACCTCAATTCGCTGATCGGTTTTAGTTTTGATACCAGCCATAATAGCACGTTGTCTAACAATAGTGCTTACAACAATAGCCAGTCTGGTTTTGTTTTTAACAATACCAGTCAAATAAATTTATCTGGTAACAATGCAACTAATAATACACTAGTTCAATACCAAATAATCGATTATTCAAACGTAACCTTCACAGGAACAAACAGAGCATTACTAACACCTTCAACAGGATTAGACCTTAATATTACTAATGGCAGTAATGTTACAACATTAGTTTCTTCAACATACAATAACTTCACAACTTCATATGGTACAATCTTCTTTGATAATGCAAGAAATGTTTCTATTAAACTGATGAATTTATCAGATTCAGGAGCTTCTTCTACTGGCTGTAGTATATTTACTGGAACATGTACTTTACTTACTCTAAGTAATAATCTAGTGAATATATCTAATGCCTCAGCTACAGGCACTATTATTTTAGGTATGTACTATGACACATCAACCAGTCCAAGTGGCTGGAATCAGGTAGGCCAAACCGCTGTTGATACGGCAAATGGAACTGTGAGATATGGAGCTATAACCTCTTTTAGTACATTTGGAATAGTTAATTTTGTAGCCTCCTCTTCACCTCCATCATCAGGTGATTCTCCAGTTCAATCATTAGAAATAGATTATGATTTCACATGTTCAAATGAATCCTTAAACGGTTCATTAGAAGTATCAACTATATCAGGAGCAGAAGTTAGTCTAGTAGAATTATCTCCAACTTATATACAGCTAGAGAAAAAAGAAGCAGATTCTGATGGAAAGGCATTATTTACAATAACAGAAAATGGAACTTATAAGATAAGGGCTACTAAGTCAGGATATACCTCAGCTGAAGAAGATAATTTAGAATTTAATTTATGTGAAGAAAAAACTTCCGAAGCAGAATTAGAATGTACAACTAATAGTTATGAATGCTGCTCTGATTCAGATTGTGAACAGGGTTATGAATGTAAGGAGAATACCTGTTCAGTAATCCAATCTATCCCTCCTTCCAGTGGATCTGACGATGATGACCAACCAAAAGTTCTGGAAAAGCTTAATTCAGTACAAGAAGCGTTGGACAAGGCAAAATCAGAAGGAAGAGATATAACTGAAGCAGAGAAAAAACTCGTAGAAGCATTTGCAGCATATGAGGCAGGACAGTATGAAAAGGCGCAAGGATTAGCTGATCAATCTCTTTTGTTAATAAAAGATCAACAACCGCCAGGATCAAGGATTGAATCAAAACCCGAATCAGAACAGCAACAGTCTGATTCGCTTGGCCTTTTATTAATTGCTGGTTCAGTAGTTGTAGTTGTAATTATATTAGCTGGGGCGCATTTCTTCTTAAAAGGGGGAAACAAGGGCTTTAAATTCAAGAAATGA
PROTEIN sequence
Length: 960
MLMQVCYCSNRNIFVVVLFLFFISISSAATLSVNGTGANCLVGTQTNYSTIQSAVNAASAGDTIYVCKNSTVGYTESIVVNQSINIYGNESGVSVIASNSLPVFWVNSTYFNITNFTLNGGYTGIKLNSTAHFSHIYNVTAHGATEGFYIISNYNVINNNTARNNTDNGFLLNLSNNTNLTNNIAYNNTYNGFLLFPGHNNTLTNNTAYNQSSFFGFSLELGSSNNVLTNNTAYLNQEGFYLNASSSNNLTLNTGRNNTVAGFQIMNSSSNNRFVGNTAHNNSAAGFSLVNSSNNNYLANNTAYSNLFGFSLSLSSSNTLVDNLAYGHSFGNFNLANTSNEALNNNTAHGGNVGFSFSTSSNGTISNNTAYNNTIIGFRFISFSLNNTILSNTAYNNSNFGFSFGSSSSNSTLTSNIAYNNSLHGFDFDSSSNNILSNNTAYTNSFFGFNFASFSNNTISNNTAYSNLYHGFGFEESSLNNTLTNNSAYLNSLIGFSFDTSHNSTLSNNSAYNNSQSGFVFNNTSQINLSGNNATNNTLVQYQIIDYSNVTFTGTNRALLTPSTGLDLNITNGSNVTTLVSSTYNNFTTSYGTIFFDNARNVSIKLMNLSDSGASSTGCSIFTGTCTLLTLSNNLVNISNASATGTIILGMYYDTSTSPSGWNQVGQTAVDTANGTVRYGAITSFSTFGIVNFVASSSPPSSGDSPVQSLEIDYDFTCSNESLNGSLEVSTISGAEVSLVELSPTYIQLEKKEADSDGKALFTITENGTYKIRATKSGYTSAEEDNLEFNLCEEKTSEAELECTTNSYECCSDSDCEQGYECKENTCSVIQSIPPSSGSDDDDQPKVLEKLNSVQEALDKAKSEGRDITEAEKKLVEAFAAYEAGQYEKAQGLADQSLLLIKDQQPPGSRIESKPESEQQQSDSLGLLLIAGSVVVVVIILAGAHFFLKGGNKGFKFKK*