ggKbase home page

rifcsplowo2_01_scaffold_28671_3

Organism: RIFCSPLOWO2_01_FULL_Archaea_Pacearchaeota_32_9

partial RP 26 / 55 MC: 2 BSCG 5 / 51 ASCG 17 / 38 MC: 1
Location: comp(1767..5864)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
T1SS secreted agglutinin (RTX) Tax=RBG_13_Pacearchaeota_36_9_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 30.6
  • Coverage: 811.0
  • Bit_score: 326
  • Evalue 1.90e-85
Ig family protein id=5046016 bin=GW2011_AR4 species=GW2011_AR4 genus=GW2011_AR4 taxon_order=GW2011_AR4 taxon_class=GW2011_AR4 phylum=Archaeon tax=GW2011_AR4 organism_group=Woesearchaeota organism_desc=gwa2_.45_18 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 27.1
  • Coverage: 719.0
  • Bit_score: 183
  • Evalue 1.90e-42
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 25.5
  • Coverage: 596.0
  • Bit_score: 130
  • Evalue 4.10e-27

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RBG_13_Pacearchaeota_36_9_curated → Pacearchaeota → DPANN → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 4098
ATGAAAAGAACATCCTGCTTATTATTAGGTTTATTTTTTCTTATGCTAGTTGTTCCAATTGTTTGTTCTAAAGATATTGCTTATGTTGTAAAGACAACTTCTGAAATCCAGATTGAAAATGTTTTTTCAGAATTAAATTACAGCTATGATGTGATAACTGATTCTCAGATTTCAACAACTAATTTTTCAACATATAGAATGGTTCTTGTTGGAGATGATACATTCACAACAGCAAGCATAAGCAAGCTGAAAGATGCTATTGTGCAGCAAAACTCGCTTATACTTAATTCTAAATATTATTACAAGACTGGAACAAATACTCAATGGGGATGGAGCAGTGGAGTATCTTCTATAACAAGCCCTAGCAGCTTGAAAAATAATGAAAATTCAAATACAATTATAATAACTGCGGGTGTTCCGCTGAATTTTAATGGTTATTCTATATCAGATATAAATCTAAAGAGTTCTATCCTTGCAGGGCAGAAACCAACTGGAATAATTGTTGTAACTTATAAAAATGGCGGAACTATCGCAGATGCAGTTGTTGCTTTTGTTAATCCGGGAGCACAAATGTTAAATGGAAAAGTAACAAAAGGCAGGAGCTTGTTTTTTGGAATTACTAAACCTCAATCATGGACTGCTGAGACAAGACTGCTTTTTAAAAATTCACTTAACTGGGCAATAAAAGGGCAGGATAAAGATGGGGATGGATTTTTTGATGATATTGACTGCAATGATAATAATGCGGCAATAAATCCAAATGCAACTGAAATAGCTTATAATGGAATTGATGAAAATTGCGATGGAAAAGATTTGGCTGATGTTGATGGAGATGGATATTGCAAAGCAGGATATGTTATGCAGAATAAGCTGCTTCAATGCAACAAGGAAACCGGAAGCATAGGAACAGACTGCAATGATAATGATTTAAGCATAAATCTGGGAGCTCTTGACTTAACAAAAAACTGCATTAATGACGCTCCAATATTAGCTTCACAAATTCCTTCTCAAACATGGAATGAAGATGAATCAAAGACTCTTGATTTGAAGGGAGGGTATTTTAGCGACCCAGAGGGAGATGTTCTTAGCTATAGTTTTATTTCTGCTTCAAATTCAAATATAAATGCTGTGAGTTTGGGAAATGGAGTATTTAATTTAAGCAGTGATGGGGATTGGTTTGGCAATGGGACAATCATATTAAGAGCTTCTGATGGGAATAAGAGCATTGATGCAAGTGTAAATGTTGCTGTTGTTCCGGTGAATGATGCGCCAATCATAATCAAACCAATAGAAAGCCAGACATGGAATGAAGATGAATCAAAGATAATGGATTTGAAAAGCGGGTATTTTTTTGATGTTGAAGGAAGCAGTTTAGTTTATAGTTTTGTTTCTGCTTCAAACTCAAATATAGTTGTTCAGAATTTAGGGGGAGGAATATTTAATTTAAGCGCTGCAGGAGATTGGAGCGGGGCAGGAAGTTTTATATTAAGAGTTTCTGATGTGGATAAGAGCATTGATGCAAGTGTAAATGTTGCAGTTAATGGATTGAATGACGCGCCAATACTGGTTTCTCAAATTCCGACTCAAAGTGTAAATGAAGATGAAATAAAAATAGTTGATTTGAGAGGATATTTTGCTGATATAGATGGAGACGCGCTTTCTTATAGTGTTGTATCTGTTTCAAATTCAAATATTGCAGTTAATAGCTTAGGCAATGGAAGATTTAATATCACTAGTGGAATAAACTGGAATGGGGAAGGAAGTTTTGTGATAAGAGCTTCTGATGGGGAGAAGAGCATTGATGCAAGTGTAAATGTTGCTGTTGTTCCGGTGAATGATGCGCCGGTTATTGATAATATTGCAGATAAAGATTATTTTGCGGGACAGCTTGTGAAAATAATTCCAAGTGCGATTGATGCTGAAGGAAATAATGTAACTTTTGGATTTTCTTATCTGCTTAATTCTTCAGGAGAGTGGCAGACTAATATAGGAAATGAGGGAAGTTATACTATTACTGTAACTGCAAGCGATGGAGCCGGGGGAATAAGCAGCAAAAGTTTTGTTTTGACTGTAATGCCGAGAGCAATCATTAATGAAATTTCTTCTGGAACAAATGACTGGATTGAACTTTATAATCCCTTGAATATAGAAATAAATCTTGCTGAATGCTATCTTGAAAACAATGCTAATAATAAACTAGATTTAAGCGGAATAATTGAAGGAAAAAGTTTCAGAGCGTTTGACTGGAGCGCTGGATTAAATGGAGAGGGGGATTCTGTCAAGCTTGTTTGTGATGGAAGTATGCTTGATGAAGTTGCTTATGGAAATGCTTCAGGAAATGCTCCAATAGCTGCAGAAGGTCAATCAATTGGAAGAATAATTGATGGAGCAGACAGCGGAAATAATTCTGCTGATTTTAAAATATTTGAAGCGCCAACAAAGAACTTAAGAAATAATGCAGATATGGTTATTCCGGGTGTTAATTTAATAAGCCCAAACAATGGAACAGTGTTTAATGAGAGAAATATTAATTTTGAGGTAAATGTAAGTGATAATTCAAACTCGCTAAACTGCGAGGTTTATGGGGATTTTTTTGGAGGAAGGTTTATCATAATAAAACAACTAATTATTTCATTAATTAACGGCAATGGCATTGGAAATTTTTCAGTTCAAGGATTAACTGACGGGACATACACCTGGAATGTAAGATGCTCTGACAATACCAATAATGTATTTGGAGAAAACCGGACATTTATTGTCAGTGCTCCGGATGCTCCGGTGCTTAGTGCAATTGGAAGCAAGAGCGCGCTTGAAAATCAGACACTCACATTTAATTTAACAGCAAGCGACCCTGAATCAGATATTGCAAGATATTATGCTGAAGGATTGCCTGTTGGAGCAGGTCTAATAAATAAAACATTTTTATGGAAACCTGCATTTAATCAAAGTGGAATATATAATATTATATTTTTTGTAGAAGATTCAACTGGGCTAAAAGATAGCGAAACAGTTAAAATAACAATTACAGAGGTAAAACAACCTCCAGTATTTAGTGATGCGCTTCAATGTGTTAATAAGTCAAGCAAAATAGCAATTGAAATAAAAAACCCGGACAAAGGAGATGAATTTAATATTGGAGACAAAATTGAAGCAAGTGTGAAAGTAAAAAATAATCTTAATGAAACACTTAACGGTTATTTGAGGGTATATCTGTATGATGGAAAAGAGGAAAATGCAGCTGCAGAAGAAAAAGTGAAAATCAAGCTTGAGAAAGGAGATTCAGAAACACTGGATTTTGCCCTTGAAATTCCGCATGATGCAGAAGAAGGAGAAGATTTTGTGGTTTATGCTGTTGTTGAAAATGACTACTGCAATTCTGCTTATAATGAAATTTTGGTTGAAAGAGAAGACGATAGAATTATAATTGACAGGTTTGCAATAAGCCCGGCAGAAATTTATTCTGGAAGCGCGGTTGATTTTACAATCAAGATTAAAAATATTGGAAATGATGAGCAGGAAGATGTGCAGATTAAGCTGAGCAATGCTGAGCTTGGGATTAATCTGCAGTCTGACAAGTTTGACATTGAGGGTTATGGTGATGATGATTCAGTTACAAAATATTTCCAATTTACAATACCTGAAAATACAACTGCAAAAAGCTATGAAATAAAGTTAACTGTTAATTATGGAGAAGTTGAAACAGCTTCACAAAATCTTATTGTAAGTGAAAAAGAAATTGCTAATGTAAATGAAGCAACATTAAATCAAACATATCAGGCAAATACTGAAGTATATACTGGAGAAGGTTCAACAACGCAAGCAAATACCGGAACTTATACTGGAGCAACTTACACTCTTGCAAACAAGCAAGAAAGCACAACATATGCCGGCGAGGAAGCTGAGCAGGCATTGAGGATTTATTCAGAAAGCAGAAGCGCTAAAAGTGCAAAGTCAATAAAAGATTATGCAAAGCTGCCAGATTATATGCAGGACCCAAAAATAAGAATGATGCTGACTATACTTAATATAATTTTTATAATTGGAATAATTGTGGTTATGATTAAGATTTTCATGTTTGCTACAAGACGAAGGAGATAA
PROTEIN sequence
Length: 1366
MKRTSCLLLGLFFLMLVVPIVCSKDIAYVVKTTSEIQIENVFSELNYSYDVITDSQISTTNFSTYRMVLVGDDTFTTASISKLKDAIVQQNSLILNSKYYYKTGTNTQWGWSSGVSSITSPSSLKNNENSNTIIITAGVPLNFNGYSISDINLKSSILAGQKPTGIIVVTYKNGGTIADAVVAFVNPGAQMLNGKVTKGRSLFFGITKPQSWTAETRLLFKNSLNWAIKGQDKDGDGFFDDIDCNDNNAAINPNATEIAYNGIDENCDGKDLADVDGDGYCKAGYVMQNKLLQCNKETGSIGTDCNDNDLSINLGALDLTKNCINDAPILASQIPSQTWNEDESKTLDLKGGYFSDPEGDVLSYSFISASNSNINAVSLGNGVFNLSSDGDWFGNGTIILRASDGNKSIDASVNVAVVPVNDAPIIIKPIESQTWNEDESKIMDLKSGYFFDVEGSSLVYSFVSASNSNIVVQNLGGGIFNLSAAGDWSGAGSFILRVSDVDKSIDASVNVAVNGLNDAPILVSQIPTQSVNEDEIKIVDLRGYFADIDGDALSYSVVSVSNSNIAVNSLGNGRFNITSGINWNGEGSFVIRASDGEKSIDASVNVAVVPVNDAPVIDNIADKDYFAGQLVKIIPSAIDAEGNNVTFGFSYLLNSSGEWQTNIGNEGSYTITVTASDGAGGISSKSFVLTVMPRAIINEISSGTNDWIELYNPLNIEINLAECYLENNANNKLDLSGIIEGKSFRAFDWSAGLNGEGDSVKLVCDGSMLDEVAYGNASGNAPIAAEGQSIGRIIDGADSGNNSADFKIFEAPTKNLRNNADMVIPGVNLISPNNGTVFNERNINFEVNVSDNSNSLNCEVYGDFFGGRFIIIKQLIISLINGNGIGNFSVQGLTDGTYTWNVRCSDNTNNVFGENRTFIVSAPDAPVLSAIGSKSALENQTLTFNLTASDPESDIARYYAEGLPVGAGLINKTFLWKPAFNQSGIYNIIFFVEDSTGLKDSETVKITITEVKQPPVFSDALQCVNKSSKIAIEIKNPDKGDEFNIGDKIEASVKVKNNLNETLNGYLRVYLYDGKEENAAAEEKVKIKLEKGDSETLDFALEIPHDAEEGEDFVVYAVVENDYCNSAYNEILVEREDDRIIIDRFAISPAEIYSGSAVDFTIKIKNIGNDEQEDVQIKLSNAELGINLQSDKFDIEGYGDDDSVTKYFQFTIPENTTAKSYEIKLTVNYGEVETASQNLIVSEKEIANVNEATLNQTYQANTEVYTGEGSTTQANTGTYTGATYTLANKQESTTYAGEEAEQALRIYSESRSAKSAKSIKDYAKLPDYMQDPKIRMMLTILNIIFIIGIIVVMIKIFMFATRRRR*