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rifcsplowo2_01_scaffold_48626_1

Organism: RIFCSPLOWO2_01_FULL_Archaea_Pacearchaeota_32_9

partial RP 26 / 55 MC: 2 BSCG 5 / 51 ASCG 17 / 38 MC: 1
Location: 3..5135

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Value Algorithm Source
DNA polymerase II large subunit; K02322 DNA polymerase II large subunit [EC:2.7.7.7] Tax=CG_Pacearch_05 similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 49.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1287
  • Evalue 0.0
DNA polymerase, archaeal type II, large subunit (EC:2.7.7.7) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 35.3
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 603
  • Evalue 1.60e-169
hypothetical protein n=1 Tax=Nanoarchaeota archaeon SCGC AAA011-L22 RepID=UPI00037716FE similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 39.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 953
  • Evalue 3.80e-274

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

CG_Pacearch_05 → Pacearchaeota → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 5133
GAGATTCCCCTTGCAACAAATCTTGCTGAAAAAGTAGTTGGGCTTATCTCAACTCTTTATCCTCAGATAAATGATCCAAGAATTGTTAAAAGAATTGGAGAGCTTGAAAAAGAATACGGCACTTTGGATATAGCTGTATGCTTAAAAATTGCAGAAGAAATTGCAAAGGAGAAATTCTGCAAGTTTGATAGTTTGCTGCAGGCAATTGAAGCGGGAATTAGAGTTGGATTTGCTTATACTACTTTGGGGGTTGTAAGCTCACCTATTGAAGGATTTACTTTTTTGAAATTAAATAAAACTAAGGATGGAAAAGAATATTTTCAGGCGTATTTTTCTGGACCAATTAGAAGTGCAGGAACAACTGCCTCTTGTGTTGTGCTGATGATTACGGATTATTTAAGAGAAACATTTGGATTTGCAAAATATGATCCGGATGAAAAAGAAATTAAAAGAACGGCCGTGGAGATTCTTGATTTTCATGAGAGAATTACTAATTTGCAGTATTGCCCAACAGAAGAAGAAGCCTTGTTTTTAGCAGAGCATATTCCAATACAGGTTGCTGGAGAGCCATCAGAAAAGCTTGAAGTTTCAAATTTTAAAGATTTGCCTAGAGTAGATACTAATTTTTTAAGAAGTGGTTTTTGCTTGATACTTGCAGAGGGAATGGCTCAAAAAGCTCCAAAAGCGCTTAGAATTTTAAAAGGTTTAAGAGAAAAAGGATTTAAATTAACTGATTGGGATTTTCTTGAAGAGTATTGCAAGATACATGAGAAAAGAACAAAAGGAAGCGGGGATTCTTCACCAACTTATATGAAAGATATGGTTGCAGGAAGGCCGATATTTGGACATCCTTCACGTTCTGGAGCATTTAGGTTTAGATATGGGCGGTCAAGAGTCGCTGGATTTTCTGCTGCATCAATGCATCCAGCAACAATGGCTATCTCTGATAATTTTATTGCAGTAGGAACGCAACTTAAAATTGAAAAGCCAACAAAAGGGTGTGTGGTTAGTGTGTGTGATAGTATTGATGGTCCTATTGTCAAGTTTAAAGATGGAAGTGTAAAACAAATAAGGACTTTTGAAGAAACAAAAGGGATGTATAAAGATGTAGAGGAGATAATTTACGCAGGAGATATTTTATTTCCATTTGGAGATCTTGCAAATAGAAATCAAGTTTTAATAAAGCCTGGATATGTTGAAGAATGGTGGAATTTGGAATTGGAAAAAGTCGGGCAGAAAGTTGAGGATTATTATAATGTTGATTTTGAGAAAGCAATTGAACTATCAAAAGAGTTTAGAATACCACTTTATCCAAAATATATTTTTTATTGGAACCAGATAAGTTACGAGCAGTTTTTAGAATTTTTAAGATGGCTTTCTTATGCAAGGCTTACAGATAATTCTGGAGGGTATGGAGCATTTAGTCCAGAATTCTCTGATAATATAATTCCAAAAACAAAGCAAGGAAGTATATACAATGAGAAGATAATTCTTCCTTATAGCAGTTTTGAAAGAGAGAAGTTTGTTGTTGGGAAAAGGGCATTAGAGTTGTTGGGAATTGAACATGATATTGGAGTTGAGAATGTAATTATTTCTGAAATTGACAGCAGAGCGCTTTTTGCTAATCTAGGAGTCAATATTTCTTTACTTGAAAAACAAGATTATTTTATTGAAAAAGAAATTAATGCTCTTGCTGAAAAAGTTGTTGGGTTTGCTGAAAAAAATGTTTTGGAAGTCATTAATTTAATTTCTGAATTTGTTATCAAGGATAAAGCAGGGGAATTTATTGGAAGCAGGATGGGAAGGCCTGAAAAAGCTAAATTACGAAAACTGACAGGAGACCCGCACACACTTTTTCCAGTTGGAGAAGAAGGGGGAAGATTTAGAAGTGTGCAGGAAGCGTGCACAACAGATGGAGTTTTTTCTGATTTTCCAATTTATTATTGCGAGAAGTGCAAGAAAGATAATATTTATCCGAGCTGTGTTTTGTGCGGGGGAATTAATATTAAGAAATTCTTTTGCAGAGCGTGCAATAAAGAGATGAGTGAGAATAATTGTGAAGAGCATGGAAAGTGCCAGCCATATTCAAGAAGAAAAATAAATATTAAGGAATATTTTAATTATAATACTAAAATGCTTGGACTTGAGAACGGGCAGATGCCGGCTTTAGTTAAAGGTGTTAGGGGAATGTCTTCTGCAGAACATCTTGCTGAACCACTTGCTAAAGGAATACTTAGAGCTAGCTTGAATTTAAATGTGAATAAAGATGGAACAATTAGATATGATATGACTGAGCTGCCAATAACTCATTTTAAGCCAAAAGAAATATTTGTTTCTATTGAAAAGCTAAAAGAGATTGGGTATACTTTAGATATTTATGGAAAAGAGTTAGTGGATGATGAACAAGTGTTGGAGTTGATGCCCCATGATATAATTCTTCCGTGCTCGTCTGAATCTGGGGATGAAAGAGCAGATGAGGTATTTATTAATCTTGCAAAATTTATTGATTTGCTTTTAGTAAAGTTTTATGGGTTGGAGCCGTTTTACAATGTAAAAAAAAGAGAGGATTTGGTTGGGCATTTAGGTGTTTGCATGGCTCCGCATAATTGCGCAGGAGTTATTGCAAGAATTGTTGGATTTTCGAAAACTCAAGGATTATTGGCTAGTCCGTATATGCATGCAGCTATGAGACGGGACTGTTTTTATCCCACAACAAAGTTTGTTTATCTTGAAAATAATAAAATAAAAACTGAAGCTATTGGAAAATATGCGGAAGATTTAATTAATTCTGGAGCAAAAACAAAAAAGATAGATGCTTGTGGAACAGAGAGAATTGAGTTAGATAAGGAGATTTATGCGCTTGGAGCAGAGCCTGGAACAATGAAGCTAAAAAAGAAAAAAATAAAATATTTTATCAAAACTTCAGCTCCTGAAAAATGGGTTAAAATTAAAACCGCTTCTGGAAGAGAGCAAACAATGACTTCCACACATAGAATTGCTTATTTAGATAAGGAAAATAATTTCAAGACAAAAAAAGCAGAAGAATTTAAGGTTGGAGATAAAATTGCTTTGGTTAAAAATCTTAATTTACCTTTGAATAAAATAAGCAAAATAGAATCTTTAGATTTGCTTGAGATTTTACTTAATAATGTTCCGCAAGAGCATTTGAAAAAAATAAGATTGTGTGAATGCAGGGGGTTTTTCAGAGAGTTTGTTTGTAAAATCAGCAAGAAGAGATTTTGTGAGATTTTGAAAATGCCTAAAAATAAGAAATTGAGTGATTGGTATAAGAGAGTTCCGCTATCCGATATTAAGATACTTATTAATTACGGCTTAAAATTAGAGGATATTCCAAAAAATTCCACTTTAAGAACAATTTTTAATAATAAAAAATGGGATTTGAAATTAAAAATTGACAATAATTTAATGAGTGTTTTAGGGTATTATTCTGCTGAAGGATACTCAAGGCAAAATAAAACAGTTTCACAGGTTTGCTTTAGAATTATGGATTCCAAACAAAGAATAAAACTTGCAAAGGCAATTGAAGGAAGTTTTGGAATTTTGCCGAGTTTTGGAGAAGATAAAACAAAAATAACTATTGGAAATAAGATGGTTTATTATTTATTTAAGTATTATTTCAAAGCAGGAGAGGGGGCTTATAGAAAAAAAGTTCCGGATATTGTTTTTAATGTTAGTGATGAACTTGTTAAAGAGTATTTATCTGCTTATTTTGACGGAGATGGAACAATTTTGTGTTCTGGAGAAGGAAAAAGCCCTAGAAAGGCTGTTGTTTTCTATTCAGTTTCAAGAGAGCTTTTAGATGGAGTTTCACTTTTAGGAGCAAAGTTTGGATTATTTGGAAGATTTGCGCAAACTAAAGAAAGACTGCCTGGAAAAAAAGTTTTAGAAAGATATGCCTATTTGAAAAAAGAGCCAAAAACACATATATTAAATCATTTAACTTATTCTGGAAGAGATTTTTTTGAAATTGCCAAGATTTTGAGCCCTGAAAACTCCCATAAAAAAGAATTAATTGCAAAAGCTGTTAGTGAAGCTAAAAATTACAATGTTAAAGACAGAAAAGCTGTTTTCTTAGATAATTATTTGACTTGTCAAGAACTACCACTCAAAGAAGAGGGGCATAAAAATATTACCTCTTACATGGTTCTTGAGCACTGTCAGAATTCTACGAGCAATTTAAACCATCTATCACAGACGAGGAGAATTCTGAAGTTTGAAGAAAAAGGAGATATAATTATTGATTTTATTAAAGATGTAGTGTTTTTTGAAGAAAAAACTCCAAGCTATTGTTTTGAGATTGAGTGGGAGAGTGAAGCAGATAAGAATGTTTTATGGGGAGAACAGATATTAAATGCAAGGTGTGATGGAGATGAAGCTGCTGCAATGTTATTGCTTGATGTGCTGATTAATTTCTCGAAGGCTTATTTACCCGGGCATAGGGGGGGAACTCAGGATGCGCCACTTGTTTTAAATGGAAGAATTGTTGCAGGAGAGGTTGATGACCAGATTTTGGATTTTGAAGTTGTGGATCATTATCCACTGGAACTTTATGAAGCTGCTGAAAGAGGAGAACATTCTTCTAAAGTTAAGATCGAAATGGTTAAAAACAGGATTAAAGAAGAAAAAGATCCTTTTAGAAAAATAGGATATACGCATGAAACTAATGATTTTAACAAAGGAGTTTTGTGCTCGTCATACAAACAGATTCCGACAATGAGTGAGAAAGTTGAGAGAGAAATGGAGCTTGTGAGAAAGTTAAGGGCTGTTGACACTTCTGATGTTGCAAGGTTAATTATTGAAAGACACTTTATCAGAGACATTAGGGGTAATTTGAGAAAGTTTTCATCACAAGGATTTAGGTGTGTTAAGTGCAATTCAAAATTTAGAAGACCTCCTTTAAGCGGAGTGTGCTTGAAATGCGGAGGAAAAATAATATTTACAATCAATGAAGGAGGGATAGTAAAATATCTTGAGCCTGCTCTTGCCCTCGCAAATAATTATGACGTTCCGGTTTATGTTAAGCAGAATATTGAACTTACAAAGAGATATATTGAAAGCATTTTTGGAAGGGAAGAAACTAAGCAGGTTGATTTGAAACAGTGGTTTGGATAA
PROTEIN sequence
Length: 1711
EIPLATNLAEKVVGLISTLYPQINDPRIVKRIGELEKEYGTLDIAVCLKIAEEIAKEKFCKFDSLLQAIEAGIRVGFAYTTLGVVSSPIEGFTFLKLNKTKDGKEYFQAYFSGPIRSAGTTASCVVLMITDYLRETFGFAKYDPDEKEIKRTAVEILDFHERITNLQYCPTEEEALFLAEHIPIQVAGEPSEKLEVSNFKDLPRVDTNFLRSGFCLILAEGMAQKAPKALRILKGLREKGFKLTDWDFLEEYCKIHEKRTKGSGDSSPTYMKDMVAGRPIFGHPSRSGAFRFRYGRSRVAGFSAASMHPATMAISDNFIAVGTQLKIEKPTKGCVVSVCDSIDGPIVKFKDGSVKQIRTFEETKGMYKDVEEIIYAGDILFPFGDLANRNQVLIKPGYVEEWWNLELEKVGQKVEDYYNVDFEKAIELSKEFRIPLYPKYIFYWNQISYEQFLEFLRWLSYARLTDNSGGYGAFSPEFSDNIIPKTKQGSIYNEKIILPYSSFEREKFVVGKRALELLGIEHDIGVENVIISEIDSRALFANLGVNISLLEKQDYFIEKEINALAEKVVGFAEKNVLEVINLISEFVIKDKAGEFIGSRMGRPEKAKLRKLTGDPHTLFPVGEEGGRFRSVQEACTTDGVFSDFPIYYCEKCKKDNIYPSCVLCGGINIKKFFCRACNKEMSENNCEEHGKCQPYSRRKINIKEYFNYNTKMLGLENGQMPALVKGVRGMSSAEHLAEPLAKGILRASLNLNVNKDGTIRYDMTELPITHFKPKEIFVSIEKLKEIGYTLDIYGKELVDDEQVLELMPHDIILPCSSESGDERADEVFINLAKFIDLLLVKFYGLEPFYNVKKREDLVGHLGVCMAPHNCAGVIARIVGFSKTQGLLASPYMHAAMRRDCFYPTTKFVYLENNKIKTEAIGKYAEDLINSGAKTKKIDACGTERIELDKEIYALGAEPGTMKLKKKKIKYFIKTSAPEKWVKIKTASGREQTMTSTHRIAYLDKENNFKTKKAEEFKVGDKIALVKNLNLPLNKISKIESLDLLEILLNNVPQEHLKKIRLCECRGFFREFVCKISKKRFCEILKMPKNKKLSDWYKRVPLSDIKILINYGLKLEDIPKNSTLRTIFNNKKWDLKLKIDNNLMSVLGYYSAEGYSRQNKTVSQVCFRIMDSKQRIKLAKAIEGSFGILPSFGEDKTKITIGNKMVYYLFKYYFKAGEGAYRKKVPDIVFNVSDELVKEYLSAYFDGDGTILCSGEGKSPRKAVVFYSVSRELLDGVSLLGAKFGLFGRFAQTKERLPGKKVLERYAYLKKEPKTHILNHLTYSGRDFFEIAKILSPENSHKKELIAKAVSEAKNYNVKDRKAVFLDNYLTCQELPLKEEGHKNITSYMVLEHCQNSTSNLNHLSQTRRILKFEEKGDIIIDFIKDVVFFEEKTPSYCFEIEWESEADKNVLWGEQILNARCDGDEAAAMLLLDVLINFSKAYLPGHRGGTQDAPLVLNGRIVAGEVDDQILDFEVVDHYPLELYEAAERGEHSSKVKIEMVKNRIKEEKDPFRKIGYTHETNDFNKGVLCSSYKQIPTMSEKVEREMELVRKLRAVDTSDVARLIIERHFIRDIRGNLRKFSSQGFRCVKCNSKFRRPPLSGVCLKCGGKIIFTINEGGIVKYLEPALALANNYDVPVYVKQNIELTKRYIESIFGREETKQVDLKQWFG*