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SCNpilot_cont_300_bf_scaffold_238_15

Organism: SCNPILOT_CONT_300_BF_Flavobacteriales_36_9

near complete RP 52 / 55 MC: 7 BSCG 51 / 51 MC: 6 ASCG 13 / 38 MC: 1
Location: 20755..27573

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
RHS repeat-associated core domain protein containing protein n=1 Tax=Chryseobacterium sp. CF314 RepID=J2JQA1_9FLAO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 55.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1640
  • Evalue 0.0
  • rbh
RHS repeat-associated core domain protein containing protein {ECO:0000313|EMBL:EJL69990.1}; Flags: Precursor;; TaxID=1144316 species="Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavoba similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 55.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1640
  • Evalue 0.0
RHS repeat-associated core domain similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 37.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1330
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

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Taxonomy

Chryseobacterium sp. CF314 → Chryseobacterium → Flavobacteriales → Flavobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 6819
TTGGAATACGACACCTCTGGCTATGCAGAAAATGATCAGACAGGAGGGCAAAATATAATATCAGCAATAAATCTAACAGATCCACTTGCTCCTACAGTTAATGCGGAAATGAATGTCAGTGAGTCTGGAGCATTGACCTATATGTTGCCCATAGAACTTTTAAAAGGGGTCAACAGTTTCCAGCCAAATGTTGCATTGTCATATAACAGCCAGAGCGGTAATGGTCAAGCTGGCTGGGGTTGGAATATTGTTGGTCTTTCAACGATTAATCGTGGAGGCAAGAGTAAAGAAGTCGATGGTGTTACAAGGGGACCTCAATTTAATGATAGTGATCCTTTTTATTTGGATGGACAAAGATTATTAAAGATCACAGATAATGAATATGTTACCGAGATTTTTTCAAAGATAAAAATTACAAAGCAAACTGCTGGGGAGTATCAGTTCATTGTAAAATATACCGACGGACGAATTGCTAAGTATAAAGAATTAGTAACGGGGCAATATTATATCTCTACAATTGTAGATGCATTGGACAATCAGATTCATTATACTTATGAAGTTGCCAACAATGTTCCTGTATTAACAAAAATATCTTACGGAGGAACTAGTGTGGCTACCGATAAATTTTATGTTAATTTTTTATATAAAGCTCGTCGATATAATATTAAGATATTCAGAAATGAAATAGAGTTTATCAACTCACGAATACTATACGAAATCAATACTGGCTCGATTTACAATGCTCTATATCGAAAATATTCGCTTGTGCACGATTATATCAGTGAAAACAGTGTAGAAAGACTGGTCGAAATAGACGTGGAAAATGATGGCGGAGCTAAGCTTAAACCCTTACTTTTTAAGTATAATGTAACGAATGCTGCGAAAATAACTTTGGGACAAGGAAGTAATGGTTTTCCACTTGGCATCGGGTATTATAATAATCCAAGACCGCAGGATGTTGTCGGCTTAGGAAGCGCAACTGTTGGTAATTTTACAGGAAAAAATTTAGAAGCAGTCTATCAGGTTAAACTACGTAATGGCAGCTATGGTGTACAAAGCAGCCGTTTACAAAGATTTTCCAATCTTTCTACCAGTTCAAGCTCAACTTTTTATGCAGGTAAAACTCTAGGGAAAATTGGAAAAATTAAGGATAATGATCAGCTGATCACAGTTAAAGTAAATTACTTGGATAATGCTAATATAGATAATGAATATGATTCTGTAAACGATAATCTACGAGATGAGGTCAATTTTATTACACAGGACCTTAAAACGGGCGAGCAGATTACTGTAAAATATATTTTGAAAGGAGGTCTTATATCGAGAGAAAATTTTCATGCTAATGATGATCCTTATTCCGATCCTGACGGTGGAACCCCACATAACCCATCTTACATTTACAGAAGGGATACAAGCGAGAGAACCTATGTATCAGGAGATTTTAATAATGATGGATTGATTGATTTTCTAGTTTACGAGACTGCTAATTTTAATCGTCCAGCTAAATTATATTTTCTTGAAGTAGGAAAAAAAACACCAGTAGCTGATATTAATCAATTTCCGGTTTCATTAGGTAATCTTTCTATAGAAAATAAGGATGTTTACCCTATAGAAATAGATGGTGACGGGATTTCTGAATTAATGGTGGTATCGAAATATCCTTCGAAATATGATGTTTATAAGGTTGATTTTCAACAGAACACACTTACAGCATTATTGACTGATCAAAGCCTGAGTCATTTCGGAAATGATACCCCAATCTATTTTGGAGATTTTAACGGAGATGGTTTAACCGATTTCCTAACACCACAGAGGGTCTACGAAATTCCAAAGGATGAGGATAGCAGCGGGACTAAAATAGGTGCGGTTTTCTACAATATAGAACATGACAATCTTTTATGGTGGAAATATACGAGTAACGGCAAACAATTTTTGAAAGCAGAGGAAAACTACACCGAACAGAAAATCTTCTATCTTAAGCCTTCGCAAAATAATGTTATCAAAAGATCTACATTTTGGCAAAAATTCTGGGATGGACAGCCAGATGAATATGCTTATACCCGATACGCTACCCAAAACATCATAATAACGGATTTTGATGGTGATGGAAGATCTGATATAATGACACTGAACAAAGTGGGAAGAGCAAAATATGATGTAGATGGTAGGCTTGCAGAAGTTAAGGTTGAGAATTTGGGAAATACATTTTTTTTCAGACCCAACTTTAAATGTGTAAATCCTTCTTATCCATTTAATACTGTTAACTATGTGGTAATGGCAAACCAGTGTGCATCTCCTTTGGTAGCTCAAGGCTTAACTGCATATGAAATGATAACCCATACGACAGGTTTCAATTCTTCCATCAGTAATCAGGTAAATTTATATCTTAATAAAAATTTGCAAGGTGGTACATTTACAAAGAAAAAATCAGAATCAGTTACCAATTTGGTAATTTCCCCATTATCTCTCGTATTATCAAATACAGATTTTAATAGATTGAATGTTTATAAATCAGGATTTTATATTCATGATCCGGTTGCAAGATTTGATACTCGGATTACAGTCAATAATGAAAGTTTTCTTGAAACACAGATACAGGAGGTGGACAATTCGTCTTCAGTCCTACAGAAGGTAGAATACCGTAATATGGCTCAAGCCATTGATCCTGATCTGCTTTCCTGGGGAATAGAGAGAGACTATTATGAGGAATTAACTTATATCTTCAATCCTCAACCGGAGCTAAAATATCCATATTACACGCATAACTCCAATGGCAGTTATTATATGGTCAATAAAGTCCATACTTTATTTGATAATAAAATACTTACCAAGGAATACAGGTTTGAAAACGGAATCCAAAATCTTGAAGGGAAAGGATTTCTAGGTTTTCAGAAAACCTATGTCAGTGATCCGTATGAATCTACATTCTCCAGCGGAAAATACAGAGTAAAAGATCCGGTAAAAGCTATTTTCTGGAAAATCCAAACCAAAGATCCTTTGATGGATAATTCTGTTATAAAATCTACCTATGGAGGAATTAAAACATTCTTTACAGAAAATTATAGTGTAAATCAGAAATTTAAAATTGGAAATCAATATATCATCCTTTCTACACAAGAATCTTCTGTTGATAATCTTAAAAAGATATTTATCAACAAACGCTACGATTATGATCCAAATGATGATTTTAAACTCAAATTTGCCTATACCGATTACAACAGTATAGGCTCTACCAGAGTAGCATATACTTATAAACCGGAATCTACTAATGGAGACCATTATTTCTATGGTAAAATAGATACTTCTGAAAATATAACTTACAGAGACGGGTTATCTTTTACAACCAGAGAAACAAATAATTATTTTAATAACGGGCTGGTTTCTGAGGTATATAAATATTCCAATGATTCTACCGCACCGCCAATAGTAACATCGTACGAATATTATAATAATGGGAATCTGAAAAAAGAAACGTTGTCCGTCTCCGGTCTTCCGTCACAATCTACATCTTATGAATATGATGATACCCAGCGCTACATAAATAAAACAACAACTCCGGACGGATTATTTTCCTCTGCTGTTATCAATACGTTAGGCAGAATGTCCGAAGAAACTTCGTCATTAGGCCTGAAAACCTATTATAATTATGATAGTTGGGGCAATATTGCTGAGATTACGGATTACCTAGGTAAAAAAACCACGATATCCAAGACTGCTTCCAATATTGCAGGTGGCGTTTATAACCTTTCCAAAAAAAGAGAAGGAGGCACAGAAAGCATTGTTACATTTGACAAGTTTGACCGCGAAATCCAATCCAAGACACAATCTATCAATGGGAAATGGATTGTTGCAAAAACGGAGTATGATCTTTTTGGAAGGAAAATAAGATTTACAGAACCCTATTTTGAAGGAGAAACTCAGCAATGGAATGAAATTAAATACGACGAGCTTAGCAGACCTAAAGAAAATAAGCTTTACACAGGAAAAGTTATAAAAACCTGCTATGAAGGGATGATGGTAACCGTAGATGACGGCTACAAAAAAACATCCAAAACGATGGATGCAATGGGCAATGTCATCCGTCAGCAAGATCATGGGGGTGTAATAGGGTTTTCTTACTTTCCTAATGGTGCTCTTAGGGAAACAGACTATGACGGCATCAAAACAACGTTTGAAATAGATGGCTGGGGAAATAAAACCAAGATCACAGATCCGTCCGCAGGAATCTTCGAATATAAGTATGACAATCTCAGCAGAATAATACGAGAAGAAAACCCGAAAGGTTATACATTATACACCTATGACAGCCTGGGTAGACCTGATACAGAAAAAACTTATGGAAAAACTACTGCCGAAAATACGGCAATAGAGAAAACATATTCTTATAACGCAAATACAAAGTTACCAGAAAAGATTACCGGAACCAGTAACGGCAAAACATTTACCTATACTACGATATATGACCAGTATTTCCGGATAATGGGAAAAGTGGAACAGACTCCGGAGTTCACATATACAACCAGTAGCAGTTTTGATACATTTGGCAGAACAGAGATTGTAAGCAACACTGTAAAACTGAACGGCCTCAATTATACTACGCCTATTACTCTAATCAAAAACATTTACGACTCCAATGGAATTCTTGTACAGCAAAATGATCCTGTAACGGCAAAAATGCTTTGGCATATCTCAGAAGTTAATGCCCGCGGACAAACCAAACAGATGGAGTATGGCAATGGCTACACTATTACCAACAGTTACAGAAGCAGTGACAACTCCCTTACTGACATCCGTCACGTCAATAATACTACAGGAATTTCTGTAGTAGATATAGGTTATGACTATAATATGGATAAGGGCGTACTTAACTCCCGAAACAATCGAACATTTGGCAAGGGTGAGACCTATAATTATGATAAGCTCAACCGCCTTCTGACCGAAACCTTAAATGGTACGTTGGTTAATGAGTATACCTACGATCCGCGAGGAAGAATGACGTC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PROTEIN sequence
Length: 2273
LEYDTSGYAENDQTGGQNIISAINLTDPLAPTVNAEMNVSESGALTYMLPIELLKGVNSFQPNVALSYNSQSGNGQAGWGWNIVGLSTINRGGKSKEVDGVTRGPQFNDSDPFYLDGQRLLKITDNEYVTEIFSKIKITKQTAGEYQFIVKYTDGRIAKYKELVTGQYYISTIVDALDNQIHYTYEVANNVPVLTKISYGGTSVATDKFYVNFLYKARRYNIKIFRNEIEFINSRILYEINTGSIYNALYRKYSLVHDYISENSVERLVEIDVENDGGAKLKPLLFKYNVTNAAKITLGQGSNGFPLGIGYYNNPRPQDVVGLGSATVGNFTGKNLEAVYQVKLRNGSYGVQSSRLQRFSNLSTSSSSTFYAGKTLGKIGKIKDNDQLITVKVNYLDNANIDNEYDSVNDNLRDEVNFITQDLKTGEQITVKYILKGGLISRENFHANDDPYSDPDGGTPHNPSYIYRRDTSERTYVSGDFNNDGLIDFLVYETANFNRPAKLYFLEVGKKTPVADINQFPVSLGNLSIENKDVYPIEIDGDGISELMVVSKYPSKYDVYKVDFQQNTLTALLTDQSLSHFGNDTPIYFGDFNGDGLTDFLTPQRVYEIPKDEDSSGTKIGAVFYNIEHDNLLWWKYTSNGKQFLKAEENYTEQKIFYLKPSQNNVIKRSTFWQKFWDGQPDEYAYTRYATQNIIITDFDGDGRSDIMTLNKVGRAKYDVDGRLAEVKVENLGNTFFFRPNFKCVNPSYPFNTVNYVVMANQCASPLVAQGLTAYEMITHTTGFNSSISNQVNLYLNKNLQGGTFTKKKSESVTNLVISPLSLVLSNTDFNRLNVYKSGFYIHDPVARFDTRITVNNESFLETQIQEVDNSSSVLQKVEYRNMAQAIDPDLLSWGIERDYYEELTYIFNPQPELKYPYYTHNSNGSYYMVNKVHTLFDNKILTKEYRFENGIQNLEGKGFLGFQKTYVSDPYESTFSSGKYRVKDPVKAIFWKIQTKDPLMDNSVIKSTYGGIKTFFTENYSVNQKFKIGNQYIILSTQESSVDNLKKIFINKRYDYDPNDDFKLKFAYTDYNSIGSTRVAYTYKPESTNGDHYFYGKIDTSENITYRDGLSFTTRETNNYFNNGLVSEVYKYSNDSTAPPIVTSYEYYNNGNLKKETLSVSGLPSQSTSYEYDDTQRYINKTTTPDGLFSSAVINTLGRMSEETSSLGLKTYYNYDSWGNIAEITDYLGKKTTISKTASNIAGGVYNLSKKREGGTESIVTFDKFDREIQSKTQSINGKWIVAKTEYDLFGRKIRFTEPYFEGETQQWNEIKYDELSRPKENKLYTGKVIKTCYEGMMVTVDDGYKKTSKTMDAMGNVIRQQDHGGVIGFSYFPNGALRETDYDGIKTTFEIDGWGNKTKITDPSAGIFEYKYDNLSRIIREENPKGYTLYTYDSLGRPDTEKTYGKTTAENTAIEKTYSYNANTKLPEKITGTSNGKTFTYTTIYDQYFRIMGKVEQTPEFTYTTSSSFDTFGRTEIVSNTVKLNGLNYTTPITLIKNIYDSNGILVQQNDPVTAKMLWHISEVNARGQTKQMEYGNGYTITNSYRSSDNSLTDIRHVNNTTGISVVDIGYDYNMDKGVLNSRNNRTFGKGETYNYDKLNRLLTETLNGTLVNEYTYDPRGRMTSNSELGKYNYNTGDYKLQNIAFNTNGQSVNTQRGFASTTYNAFKSPLNITLAGKENLNFEYNILKGRYSMASTVTGVQKFYSSDFAVEIVKNGNRTEIINYLTGDPYSANYIKKTVLNGSSVVANETAGYFLHRDNIGSILAITKAADGAVIEQRYFDAWGNVKALLNSAGTLITDSQQLSTYNYFIDRGYTGHEHLWKAGLINMNARLYDPILRKFLSADNLVSDPYNTQSYDRYSYVLNNPLLNVDLDGNEITLGVAVIIAVGVAIFGKAIANMIQGIPFWYGMGKAATMGAIAGAISFGIGSVATSAFGQLLTVGKAAFEAGMHAISSGLMSAADGGKFGSGFWSGLISSAMASGVQSLGINFGASTRDNVVYNSFSKDMMKATMIAVGGFSGGISSAIAGGSFWKGFQQGLITSGLNHVAHWGAAALQQGSSFKVYDDDGNYVGKMKVKSYRTVNYDDGSKATELDLRFTPADNSGYDSFQWVQTVFTNDSSLGTNQYNVFNDPLPGSKGHDSSPYYWNKSRQNEMYDSKTNTYRFYDAPNREVNSMFNIFWRAEVSLVGINSSGAHALSTMKWGFNYYQNNSYLMMPLQPVIYNGRYKWLK*