ggKbase home page

SCNpilot_cont_500_bf_scaffold_34509_1

Organism: SCNpilot_cont_500_bf_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 53 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 24 / 38 MC: 16
Location: 1..1914

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Microtubule-associated protein 1A (Fragment) n=2 Tax=Hydra vulgaris RepID=T2MEF2_HYDVU similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 32.5
  • Coverage: 483.0
  • Bit_score: 151
  • Evalue 3.70e-33
uncharacterized LOC100206620 similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 32.5
  • Coverage: 483.0
  • Bit_score: 151
  • Evalue 1.20e-33
Microtubule-associated protein 1A {ECO:0000313|EMBL:CDG70471.1}; Flags: Fragment;; TaxID=6087 species="Eukaryota; Metazoa; Cnidaria; Hydrozoa; Hydroidolina; Anthoathecata; Aplanulata; Hydridae; Hydra.;" source="Hydra vulgaris (Hydra) (Hydra attenuata).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 32.5
  • Coverage: 483.0
  • Bit_score: 151
  • Evalue 5.20e-33

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Hydra vulgaris → Hydra → Anthoathecata → Hydroidolina → Cnidaria → Metazoa

Sequences

DNA sequence
Length: 1914
GATGTTAGATTAATTTTAAAAGGTGAAGTTCCTAAACTTTGTATTATGTGTGATAATATTCAGTCTAATAATGAACAAAGTGTATCCCATGAAGAAATTAAATCAAGTGAAGAAATTAAATCAAGTGAAGAAATTAAATCTAATGAACAAATTATATATGAAGATCAAAATAAATTTGATGGACAAATTACACCTGATGAACAAATATCTGATGAACAAAATATATCTGATGAGCAAATATCTGATGAACAAAATATAATTAATGAACAAATTACACCTGATGAACAAATATTTGATGAACAAAATATAATTAATGAACAAATTATACCAGATAAACAAATTACATTTAATGAAAAAATAATTAATGAACAAATTATAATTAATGAACACATTAAATCTGATGAACAAATTATATCTATTGAAAATATTGAAAAATATGATAATTTAACACAATCAAATGTTAATTTAAGTAAAATATCTAATATTAATATAATTAAATTATATGACATTGATATAAATCAAAATAATTATATTGATGAAAATAAATTAATTGATTGTGATACAAATAAATTACTTGATAATAATATAAATAAATTACTTGATAATAATATAAATAAATTACTTGATAAGGATATAAATAAATTATCTGAAGATACAAATAAATTAATTGATGATGATATAAATAAATTATCTGAAGATACAAATAAATTAATTGATAATAATATAAATAAATTATCTGAAGATACATATAAATTATTTGATGAAGATACAAATAAATTAATTGATGATGATATAAATAAATTACCTGAAGATACAAATAAATTATTTGATAAAGATAAAAATAAATTAATTGATATTGATGATAATAAATTACTTGATGATAATAAATTACTTGATAATAAATTACTTGATAATAATAAATTACTTAATGATAATAAATTACTTGATGATAATAAATTACTTGATGATAATGAATTACATAATAACAATAAAGTAAATATTAATAAACAAGATAATAATTTAAATGAACAACATATTAATGAATATAATATTAATAAACAAGATAATATTAATTTAAATGAACAAAGTATTAATAAACAATATGGTTCCATAGATAAATTAAAAATTTGTATTGATAAATCAAAAGATATTTATAAATTGTCTGATGACAATATAAAATTACTTATTGATAGTATAAATAAATTAACAGATAATATAAAATTATCTGATTCAAATAAAAATAAATTATCTGATTCCAATAAAAATAAATTACCAGAAGTTAATAAATTATCTGAATCCAATAAAAATAAATTACCAGAAGTTAATAAATTATCTGAATCCAATAAAAAATTACCAGAAGTTAATAAATTATCTGAATCCAATAAAAATAAATTACTAGAAGTTAATAAATTATCTGAATCCAATAAAAATAAATTACCAGAAGTTAATAAATTATCTGAAGTTAAATTATCTGAAATTAATAAATTACCAGAAGTTAATAAATTATCTGAAGTTAAATTATCTGAAATTAATAAATTACCAAAAGTTAAATTATCTGAAATTAATAAATTATCTGAAGTTAACAATTTGTCTGAAGTTAACAATTTATCTGAAGTTAACAAATTATCTGAAGTTAACAAATTATCTGAAGTTAAATTATCTGAAGTTAACAAATTACCTGAAGTTAAATTATCTGAAGTTAATAAATTACTTGAAGTTAAATCATCTGAAATTAATAAATTACTTAAAGTTAATAAATTACCTTATCTGAAGTTAATAATAAATTACTTGACAAAAATATTAATAAAATATATAATAATAAATTATCTGATAATAATAATATTAATAAAATATTTGATAATAAATTACCTCACAATAATATTAATAATTCATTTAATAATACTAATAAATTAG
PROTEIN sequence
Length: 638
DVRLILKGEVPKLCIMCDNIQSNNEQSVSHEEIKSSEEIKSSEEIKSNEQIIYEDQNKFDGQITPDEQISDEQNISDEQISDEQNIINEQITPDEQIFDEQNIINEQIIPDKQITFNEKIINEQIIINEHIKSDEQIISIENIEKYDNLTQSNVNLSKISNINIIKLYDIDINQNNYIDENKLIDCDTNKLLDNNINKLLDNNINKLLDKDINKLSEDTNKLIDDDINKLSEDTNKLIDNNINKLSEDTYKLFDEDTNKLIDDDINKLPEDTNKLFDKDKNKLIDIDDNKLLDDNKLLDNKLLDNNKLLNDNKLLDDNKLLDDNELHNNNKVNINKQDNNLNEQHINEYNINKQDNINLNEQSINKQYGSIDKLKICIDKSKDIYKLSDDNIKLLIDSINKLTDNIKLSDSNKNKLSDSNKNKLPEVNKLSESNKNKLPEVNKLSESNKKLPEVNKLSESNKNKLLEVNKLSESNKNKLPEVNKLSEVKLSEINKLPEVNKLSEVKLSEINKLPKVKLSEINKLSEVNNLSEVNNLSEVNKLSEVNKLSEVKLSEVNKLPEVKLSEVNKLLEVKSSEINKLLKVNKLPYLKLIINYLTKILIKYIIINYLIIIILIKYLIINYLTIILIIHLIILIN*