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SCNpilot_cont_500_bf_scaffold_4169_8

Organism: SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Niastella_43_130

partial RP 35 / 55 MC: 2 BSCG 36 / 51 MC: 4 ASCG 10 / 38 MC: 1
Location: 5991..8834

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-dependent receptor plug n=1 Tax=Dyadobacter fermentans (strain ATCC 700827 / DSM 18053 / NS114) RepID=C6VUU5_DYAFD similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 48.6
  • Coverage: 933.0
  • Bit_score: 927
  • Evalue 1.20e-266
  • rbh
Putative TonB-dependent receptor {ECO:0000313|EMBL:GAO43525.1}; TaxID=1220578 species="Bacteria; Bacteroidetes; Sphingobacteriia; Sphingobacteriales; Chitinophagaceae; Flavihumibacter.;" source="Flavihumibacter petaseus NBRC 106054.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 51.1
  • Coverage: 932.0
  • Bit_score: 952
  • Evalue 5.00e-274
TonB-dependent receptor plug similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 48.6
  • Coverage: 933.0
  • Bit_score: 927
  • Evalue 3.90e-267
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Flavihumibacter petaseus → Flavihumibacter → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2844
ATGGAATTAAATTTTCCTATTCCCTTTGGGTGGCCAAATTATGTCAGTAAATTGACGGCCTCCCCGGGAAAATTAACCAAAACGCTGTTGATTATGAAGTTAACTGCTATTCTTCTTCTGTCAGCATGCCTCCAGGTAAGTGCTATAGGATTCAGTCAGCAAATTACCTTGAAGGTCAAAAAAAAGTCACTCGAACAGGTCTGTTTAGAAATTGGTAAGCAAAGTGGGTATCAGTTTTTTTTTAATGAACGATTGTTGAAAGACGCTAAAAAAATTTCTGTTGAGTTGGAAAATTCTACCATTGAGCAGGCACTGTATGCATGCTTCAAAGATCAACCATTCAATTATGCTATCATAAAAAAAACAATAGTAATAACAAAAAAGGAAAATGTTAGCACGGATGTGATTATGGAGTATCCGCAGCCTCCTACAGAGATTAGCGGTAAGATTATGGATGAGAATGGTAATGTTCTGGCTGGGGCGACCATTAAAGTAAAAGGAAGGAATGAGACTGCAATAGCAGATGAAAATGGAAGGTTCGTCATTGCTGCTGATAAAGGCGATAGGCTAGTGTTTTCTTTTGTCGGCTTTGAGATGCAGGAAGTATTGATTGGAGAACGGAATAACATCAATATTGTAATGAAAATAGCAAGACAAAATCTTGATGAAACTGTGATCATAGGTTATGGTAAAACAAGCGTTCGAAAAAATACGGCTGCAGTGTCAACCCTCAGAGGTGAAAGCCTCTCTAACCTTCCTCTTCCTACATTGGGAGATGGTTTGGCTGGCAGAGTACCCGGTTTAATTGTAACAAGCAGTGGCGGTGGACCGGGTAAAGTGCCTACTATTTCAATTCGTGGCGGCGAAACGCCTGTTTATGTAATTGATGATATTATCTTAAGTGAGTTCGATTTTCGAACACTGAATATCAATGATATTGAAAATATCAGTTTTCTTAAAGATGCAGGGGCTGCCGGTATTTATGGGCTGGTAGCCGGAGGAGGTGTGGTTTTAGTTACTACCAAAAGAGGGAGTGCTGGTAAAATGTCAGCAAGATATGACTTCTCTTACGATTTGAGTCAGCCTACAATTTTAAGTAAGAAAATAACAAGCTATGAAGTTGCTTTAGCCATAAATCAGCGAGCTGCTAATGCAGGTGAGCTTCTCCCTTTTTCCGAGGAAGTACTTCAGAAATACCGTGATCAAACAGATCCTTTAAATTATCCAAACACGGACTGGCAAGGACTTACACTTAAAAAATTCGCACCACAAAAAAGGCATAACCTTTCTATTAGTGCAGGCAACAAGCAATTACAGTTTTATGGTTCGATCGGCTATTTTGACCAGGGAACTCTATTCACGTTTAACACTAACTGGCTTAAACGGTATAACTATAGGATGAATATAACCGGAAGCTTTGAAAAAATTGGTTTGAAAACAACATTAGGTATTTATGGAGTATCTGAAGAATTGAGAATACCAAGCAGCCAATACGGGTCGGGGTATTATTTTATTTGGGGGCATATACAGAATCGTAGTCCTATGGAGTCTGCTTTTGCTGATGAAGCACAAACCAGGTATGCAGCAGGCGCCGATAATCCACTTGTAGAGATGGATCCCCGTTCTGGCTATAATCGTACTGAAAATAGAAATCTGAACGGTTTATTAAATATTACCTGGTCTGTTCCCAAAATTGAAGGGCTTGAGGTTAGAGTAAATGGTAATTTCAGGCAGGATCAAAGCTGGAATAAAAGCTGGTCTGCTACAGCGCCTCAATACAGCGTAGGCAGCGATGTTCCATTAGCTCAAAATACTCCCAATCTTTCTGCTGGCGCAGGTAGCGGTTATTCTTATACATTACAGGCTCTATTAGGATATGACCGTACTTTTCTTAAAAAACACACAATTTCAGTTCTTGGCGGGTATGAGGAGAATTATGGCTATTCTGAAAATCTGAGCGCTTCCCGAACCAGTTATCTGTTTAATATCGATCAATTGTTTGCAGGGCCCAATGCAGGTATACAAAATAATGGATCGGCATCTGAAAATGCGAGAGCTGCCTATCTTGGACGTCTCAAATATGATTATCTCAGCAAATATTTTTTGGAGGGAAGCTTCAGATACGATGGTAATGGTAATCTTTTCCCCAAGGATAAAAGATGGGGTTTCTTTCCTTCGGCCTCTTTGGCATGGATAATCTCTAAAGAGGAATTCTTTGATTTATTTAACCAGGAAAACATACTTAATTACTTAAAATTAAGAACCTCTTATGGTACCGTTGGCCAAAACAGCAATGCTGGAAACTTCGACTATATACCAGGGTACAGTATTAATACACAGGCGTACGTAATAGATGGGCAGTTGGTTCCAGGGTTTGGTAATCCGGGTTTTGCAAGCCCGGATATCACCTGGTTTTCCCAGGAATCATTCAATATAGGAGCCGACTTTGCCAGTTTAAACAGCCGGCTAAGTGGAACCTTTGATTACTTCTATAATAGAACCATCAATTACCTGGCTTCTCCTTCCGGTGTCAGCTACACGGATCCTTTAGGCACAAATCTGCCCACAGTCAACTCGAACGGCGCATTCAGGCGGGCTGGCTATGAATTTAGCCTCCGCTATAACAACCGGATTGGCAATTTAGAATATAATGCAGGTGTAAATTTTGTGAAATTTGACCAATTATGGAAAGTGAATCCCAACGAAGATAGCGCTACATTGAAAAACCCTTCTACACGTACTACTCACCAAACAGGCTATTACGGTGCTGGATTACATACCTATGGATATTATCAAAGTGCTCAGGATATACTTCTGAATCCTACACTTAGTAATGCATCAGGC
PROTEIN sequence
Length: 948
MELNFPIPFGWPNYVSKLTASPGKLTKTLLIMKLTAILLLSACLQVSAIGFSQQITLKVKKKSLEQVCLEIGKQSGYQFFFNERLLKDAKKISVELENSTIEQALYACFKDQPFNYAIIKKTIVITKKENVSTDVIMEYPQPPTEISGKIMDENGNVLAGATIKVKGRNETAIADENGRFVIAADKGDRLVFSFVGFEMQEVLIGERNNINIVMKIARQNLDETVIIGYGKTSVRKNTAAVSTLRGESLSNLPLPTLGDGLAGRVPGLIVTSSGGGPGKVPTISIRGGETPVYVIDDIILSEFDFRTLNINDIENISFLKDAGAAGIYGLVAGGGVVLVTTKRGSAGKMSARYDFSYDLSQPTILSKKITSYEVALAINQRAANAGELLPFSEEVLQKYRDQTDPLNYPNTDWQGLTLKKFAPQKRHNLSISAGNKQLQFYGSIGYFDQGTLFTFNTNWLKRYNYRMNITGSFEKIGLKTTLGIYGVSEELRIPSSQYGSGYYFIWGHIQNRSPMESAFADEAQTRYAAGADNPLVEMDPRSGYNRTENRNLNGLLNITWSVPKIEGLEVRVNGNFRQDQSWNKSWSATAPQYSVGSDVPLAQNTPNLSAGAGSGYSYTLQALLGYDRTFLKKHTISVLGGYEENYGYSENLSASRTSYLFNIDQLFAGPNAGIQNNGSASENARAAYLGRLKYDYLSKYFLEGSFRYDGNGNLFPKDKRWGFFPSASLAWIISKEEFFDLFNQENILNYLKLRTSYGTVGQNSNAGNFDYIPGYSINTQAYVIDGQLVPGFGNPGFASPDITWFSQESFNIGADFASLNSRLSGTFDYFYNRTINYLASPSGVSYTDPLGTNLPTVNSNGAFRRAGYEFSLRYNNRIGNLEYNAGVNFVKFDQLWKVNPNEDSATLKNPSTRTTHQTGYYGAGLHTYGYYQSAQDILLNPTLSNASG