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scnpilot_cont_500_p_scaffold_5102_4

Organism: SCNPILOT_CONT_500_P_Legionella_38_3_partial

partial RP 32 / 55 MC: 2 BSCG 33 / 51 MC: 3 ASCG 11 / 38 MC: 2
Location: comp(2370..6620)

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Value Algorithm Source
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01322}; Short=RNAP subunit beta' {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01322};; EC=2.7.7.6 {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01322};; RNA polymerase similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 95.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2672
  • Evalue 0.0
DNA-directed RNA polymerase subunit beta'''' n=2 Tax=Fluoribacter dumoffii RepID=UPI00031F5A20 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 97.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2694
  • Evalue 0.0
  • rbh
rpoC; RNA polymerase beta' subunit similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 95.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2648
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

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Taxonomy

Legionella drancourtii → Legionella → Legionellales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4251
TTGAGTACTCTAAACGACGATCCAATGAATGAACCAATGAGAAAAGCTCCTGTGATGAGCGACCTGCTTGGTATCCTTAAGCAACAAGGACAAAGCGAAGAGTTTGACGCGATTAAAATCGCGTTGGCCTCACCCGAATTAATTCGCTCTTGGTCATATGGTGAAGTAAAAAAACCAGAAACAATCAATTATCGTACATTCAAACCTGAACGAGATGGTTTATTCTGTGCCAAAACATTTGGCCCAGTAAAAGATTATGAGTGCTTATGTGGGAAATACAAACGACTTAAGCATCGCGGCGTTATTTGTGAAAAATGCGGTGTTGAACTTGCGCTGGCCAAAGTACGTCGTGAACGTATGGGGCACATTGAGCTTGCGAGCCCTGTAGCACATATCTGGTTCTTGAAGTCATTACCTTCCAGAATCGGCTTATTACTGGATATGACATTAAGAGACATTGAACGTGTTCTTTATTTTGAAGCGTTTGTTGTTGTTGATCCAGGAATGACTGAACTAGAGCGTGGTCAATTGCTCAATGATGAAGTATATCTTGATGCAATGGAACAATATGGTGATGAGTTTGATGCACGTATGGGTGCTGAAGCAATTCGTGATTTGCTGCGCCAAGTTGATTTGGAAGAGGAAATCAAGAGTTTACGCGAAGAGTTACCAACTACCAGTTCAGAAACAAAAATTAAAAAAATCACTAAAAGATTAAAACTGCTCGAAGCATTTTATGAGTCTGGTAATAAGCCAGAGTGGATGATTATGGATGTATTGCCTGTTCTTCCACCTGATTTAAGACCGCTAGTACCATTAGATGGTGGACGTTTTGCCACGTCAGATCTTAATGACTTGTACCGTCGTGTTATCAATAGAAACAATCGCCTGAAGAGACTTCTGGATCTAAATGCACCTGATATTATCGTGCGTAACGAAAAGAGAATGCTACAAGAATCAGTTGATGCGCTATTGGATAACGGCCGTCGTGGTCGTGCGATTACGGGTACTAACAAGAGACCACTCAAATCCTTAGCAGATATGATTAAAGGGAAACAAGGTCGTTTCCGTCAAAACCTATTGGGTAAACGTGTTGATTATTCGGGTCGTTCTGTAATTGTCGTGGGACCAACTTTGAAACTGCATCAATGCGGTCTTCCAAAGAAAATGGCTCTTGAATTATTTAAGCCATTCATATTCAGCAAACTTGAATTCCGTGGTTTGGCTACAACAATTAAAGCTGCCAAGAAAATGGTTGAGCGTGAAGAGTCAGTTGTTTGGGATATCCTAGACGATGTGATTCGTGAACATCCGATTTTGTTAAACCGTGCTCCTACGCTACATAGACTCGGTATTCAGGCATTTGAACCGGTATTAATTGAAGGTAAGGCGATTCAACTGCATCCTTTAGTTTGTACCGCGTATAACGCTGACTTCGATGGTGACCAAATGGCGGTTCACGTGCCATTGACTTTGGAAGCACAATTAGAAGCTCGTTCCTTAATGATGTCGACTAACAATATTTTGTCACCCGCGAGCGGTGAGCCAATTATTGTTCCCAGCCAGGACGTTGTACTTGGTTTGTATTATTTAACTCGTGAAAAAGTTAATGCATTAGGCGAAGGTAAGATTTTTGTTAGTGCTCAAGAAGCGCAGAATTTTTACGAGTCAGGTCATCTTGATATCCATGCTAAAATTAAAATCCGTATGGCAAAAGAAGACGGACCAGGGCACCATTTGGTAGAAACAACAGTTGGTCGTGCAATTCTTGCTGAGGTTTTACCTAAAGGTATGACCTTTGCGCAGATAAACCGTACCATGACCAAAAAAGTAATTACTAAGGTTATTGATACCTGTTATAGAAATTTTGGTTTGAAAGAAACTGTAATTTTTGCTGATAAGTTAATGTACACTGGCTTCAAGTATGCAACACGTTCTGGTATATCAATAGGTATTGAGGATATGGAAATACCTGATGACAAAGCCAGCATTATTGAGCATGCAGACAACGAAGTTCGGGAAATTGAATCTCAATTCCGTTCGGGTTTGGTAACCAATGGCGAACGTTACAACAAAGTAATCGATATTTGGTCCAGAACGAATGAATTAGTTGCTAAATCAATGATGAGTAAGATAGCAACAGAAGAAGCTGTTGATGCACAAGGTAAGCAAGTAAGACAAGAATCCTTTAACCCAATTTTCATGATGGCTGACTCAGGCGCTAGGGGTTCTGCAGCACAAATTAGACAGCTTGCTGGTATGCGTGGATTGATGGCAGCACCAGATGGCTCAATCATTGAAACACCAATTACTGCGAACTTCCGTGAAGGTTTGAACGTATTCCAATACTTTATTACAACTCACGGAGCTCGAAAAGGATTGGCGGATACCGCGCTAAAAACTGCTAACTCTGGTTACTTAACACGACGCTTAGTAGATGTGGCACAAGATGTAGTGATTACTGAAGACGATTGTGGTGTCGATACGGGTGTTTTAATGCAACCACTGATTGAAGGTGGTGATATCGTTGAACCGTTACATGAACGTGTATTAGGACGAGTCGTTGCATCTGATGTTTATATTCCTAATCAAAGTGAGCCGGTTGTAACTGCTGGTACATTGTTAGATGAAGAGTGGGTTGAAAAGCTGGAAAAACAGGGTGTGGACCAAATCCTGGTTCGTTCACCAATTACCTGTCAAACTCGCTTTGGATTATGTGCTAAGTGTTATGGTCGTGATTTAGCAAGAGGCCACCTCGTTAATACGGGGGAAGCTGTGGGTATTATTGCAGCTCAATCAATTGGTGAGCCTGGAACACAGCTAACAATGCGTACCTTCCATATTGGAGGAGCTGCATCTAGAGCAACAGCGGCGAATAATATTCAGATTAAAACAAAAGGGGTTATTCGTTTACATAACATTAAAACGGTAACTCATGAAAACAAAAACCTGGTTGCAGTATCACGCTCTGGTGAAGTTACTATTGTGGATGAGTTTGGACGTGAGCGCGAACGTTATAAGTTACCTTATGGTGCTGTAATCTCAGTTCACGATAATTCAGCTGTAGATGCTGGACAAGTTATTGCTACTTGGGATCCGCATACGCACCCAGTAATTTCTGAGGTAACTGGACATCTGAAATTTGTCGATTTAATTGATGGTATTACCATGAATCGACAAGCTGACGAATTAACAGGTTTGAGTAATATTGTAGTTATTGACGCAAAACAACGAAGTGCTGCGGGTCGTGATTTACGTCCTATGGTAAAACTTGTTGCTGAGAATGGTGATGATATTTATCTGGCTGGTACCAATGTTCCTGCCCAATATTATCTACCTGTGGATGCGATCGTTAATTTTGAAGATGGCAATCACGTGGGCATTGGAGATGTTATTGCACGTATTCCTCAAGAGCGTTCTAAGACACGTGATATTACAGGGGGTCTACCAAGGGTAGCCGACTTGTTTGAAGCACGTAAGCCTAAAGATTCAGCGGTTATGGCTGAAGTTTCAGGAATGGTTAGCTTTGGTAAGGAAACAAAAGGTAAGAGAAGATTAATTATTAATGTTTCTGAAGACCAATGTCATGAAGAATTGATTCCTAAGTGGAGACATATTTCCGTCTTCGAGGGAGAGCATGTTGAGCGCGGTGAAATTATCGCTGAAGGTGCACTCAATCCGCATGATATCTTACGATTACTTGGTGTTGGTGCATTAGCTAATTACATTGTAAATGAGGTACAAGACGTATATCGTTTACAAGGTGTAAAAATTAATGACAAACACATCGAAACAATTGTACGACAAATGCTACGTAAGCGTGTGATTACTTTTGCTGGGGATTCAAAATTCTTAGCAGGGGAGCAGATTGAAGAAAGCGTCTTGTTGCAAGAAAATGACAAACTTATTGCTGATGGAAAACAAACTGCCAGAGGGACACCTATATTACTGGGTATTACAAAGGCATCTTTGGCAACTGAGTCATTTATTTCAGCTGCTTCATTCCAGGAAACAACAAGAGTTCTAACTGAAGCTGCTGTGAGTGGTAAAGTTGATGATTTACGTGGGTTAAAAGAAAACGTGATGGTTGGTCGCTTGATTCCTGCTGGAACAGGTTACGCGTATCATCAAAGCCGTAAGGCAAAAAGAGCTAAGGCTGCAGCCGGTGAGCACCCAGTGCATACCGTTACTGCAAGTGATGTTGAGCATGCGTTAAGTGAAGCATTAAACGCAGATAATCAAGAGCACTAA
PROTEIN sequence
Length: 1417
LSTLNDDPMNEPMRKAPVMSDLLGILKQQGQSEEFDAIKIALASPELIRSWSYGEVKKPETINYRTFKPERDGLFCAKTFGPVKDYECLCGKYKRLKHRGVICEKCGVELALAKVRRERMGHIELASPVAHIWFLKSLPSRIGLLLDMTLRDIERVLYFEAFVVVDPGMTELERGQLLNDEVYLDAMEQYGDEFDARMGAEAIRDLLRQVDLEEEIKSLREELPTTSSETKIKKITKRLKLLEAFYESGNKPEWMIMDVLPVLPPDLRPLVPLDGGRFATSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLNAPDIIVRNEKRMLQESVDALLDNGRRGRAITGTNKRPLKSLADMIKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPTLKLHQCGLPKKMALELFKPFIFSKLEFRGLATTIKAAKKMVEREESVVWDILDDVIREHPILLNRAPTLHRLGIQAFEPVLIEGKAIQLHPLVCTAYNADFDGDQMAVHVPLTLEAQLEARSLMMSTNNILSPASGEPIIVPSQDVVLGLYYLTREKVNALGEGKIFVSAQEAQNFYESGHLDIHAKIKIRMAKEDGPGHHLVETTVGRAILAEVLPKGMTFAQINRTMTKKVITKVIDTCYRNFGLKETVIFADKLMYTGFKYATRSGISIGIEDMEIPDDKASIIEHADNEVREIESQFRSGLVTNGERYNKVIDIWSRTNELVAKSMMSKIATEEAVDAQGKQVRQESFNPIFMMADSGARGSAAQIRQLAGMRGLMAAPDGSIIETPITANFREGLNVFQYFITTHGARKGLADTALKTANSGYLTRRLVDVAQDVVITEDDCGVDTGVLMQPLIEGGDIVEPLHERVLGRVVASDVYIPNQSEPVVTAGTLLDEEWVEKLEKQGVDQILVRSPITCQTRFGLCAKCYGRDLARGHLVNTGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHIGGAASRATAANNIQIKTKGVIRLHNIKTVTHENKNLVAVSRSGEVTIVDEFGRERERYKLPYGAVISVHDNSAVDAGQVIATWDPHTHPVISEVTGHLKFVDLIDGITMNRQADELTGLSNIVVIDAKQRSAAGRDLRPMVKLVAENGDDIYLAGTNVPAQYYLPVDAIVNFEDGNHVGIGDVIARIPQERSKTRDITGGLPRVADLFEARKPKDSAVMAEVSGMVSFGKETKGKRRLIINVSEDQCHEELIPKWRHISVFEGEHVERGEIIAEGALNPHDILRLLGVGALANYIVNEVQDVYRLQGVKINDKHIETIVRQMLRKRVITFAGDSKFLAGEQIEESVLLQENDKLIADGKQTARGTPILLGITKASLATESFISAASFQETTRVLTEAAVSGKVDDLRGLKENVMVGRLIPAGTGYAYHQSRKAKRAKAAAGEHPVHTVTASDVEHALSEALNADNQEH*