ggKbase home page

scnpilot_cont_500_p_scaffold_6923_3

Organism: SCNPILOT_CONT_500_P_Legionella_38_3_partial

partial RP 32 / 55 MC: 2 BSCG 33 / 51 MC: 3 ASCG 11 / 38 MC: 2
Location: 1680..5741

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Cell surface antigen Sca3 n=1 Tax=Rickettsia felis (strain ATCC VR-1525 / URRWXCal2) RepID=Q4ULM9_RICFE similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 26.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 253
  • Evalue 1.50e-63
putative outer membrane autotransporter Tax=RifOxyB12_full_OP3_50_7_curated UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 25.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 254
  • Evalue 9.30e-64
ompA; outer memberane protein OmpA similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 29.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 359
  • Evalue 4.10e-96

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RifOxyB12_full_OP3_50_7_curated → Omnitrophica → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4062
ATGCATAAAAGAAAATATTTCACGAAGGCAGTTTTAACCTCTACGATTTTTGCTGTTATTCCGGTAATTGCAGAAGCAGGATTAGTTCCTATTCCATTGTCAGGATTAAATTCCGGTGTTTTGCCTGATCTGGGGCAAGGGTATGACTACGCGTTACCTGGACTGACTTTTACAATACTGGATGCTGATAATATTGGTAGTACATTTATTCCTTTACTCGGGCTGAATGCATCTGTTGATTCCCTTTTGCCTGTTAATAACAATGAAACACTTAATTTTGCTGGTGGCGCTACTGTTACAGCGACAATAGGTTCATCAACGCCTTTGGGAACTATTAACTTACAAACAGCGAATAAGACAGTAAATTTTCAGGGCAACGTAAGTGCTGGCGTCATCAATTTTGCCGCTAATGCTAAAGCAAATTTGTCTGATACGGTGATCATTACTGCAAATGTAGATAACACTTCTGGCACAGCAGGAGAAGGAACGCTTCAATTTCAAGGGGGAGGACAAGTCATTGGAAATGTTGGTAACACCAACTCTTTGCAATTGATTACCGTCAACTCAGCTGGAAGTATTCAAAAATCAGTAGAGCTCGACGGTGCAGTGATAAATGTAGTAACAATTCATATTAATGACGATGGAACAGGCAATTCGGCTAATGGCTCAACGCTTAAATTAAATAACGCCGCAATGACGCTAAGTGCCAATATTACAGCTAACACTAATAACGAAGATATTCTTGATATCACAAACGCTGCTACTTTGACAGGTGATATTGGAGCAAATGGACAGGGATTCAATCTTATTCGAGTGGGAGCACAAAATAATACAAGTGTGAATGGAAATATTTTTGCTACGTTGACACAATTTCAAGGGAATAACACTTTATCTATAGGAAATGGAAACATTATTACAGGTGCTGTTGATTCTACTCTTCCTGGAACAGGAATATTGCAATTTATTGGAAGCGGGCAAGTAACTGGAAACATTGGTAACAATAATGCCATTTCGACGTTGCAGGTAAATTCTTCTGGTGGAGTAGGCAAACAAGTTGAATTAGATGGCACAGTTATTAAAATTAATACCATCAATACTGTTGGTGATGGGGTAAATGCGAGCACTTTATTATTAAATAGTGCAGGAGTGATGGCATTAACGGGGAATATAGCGCCCAGTAATAGTAATAATCTTGATATTTTGAATATTGCGAATATAGGGAATACAACGCTTAGCGGTAATATAGGCACGTCGACCAAAGCTTTTAATCTTCTCAAAGTGGGTCAAAATAGTGACACAACGGTTAATGGCAATATTGTTGCGACCACGACACAGTTTCAAAGTAATAAAACATTATCGCTCTCAGATGGCAGTATAGTCACTGGTAATGTAGATACAATTGCCGGAGGCGCTGGGACTTTGCAGTTCCTAGGAGGCGGTCGCGTTAGTGGAAATATGGGTAATGCTAATCCGCTAGAATTGATTAGTTTAAATTCCTTAGGCGGGAATAAAGTAGTTGAATTTGATGGAGCAGTGATAAAAGCAAATGCGATTAACATTGTTGGCGATGGGGCCAATGCTACCACGTTATTATTAAATAGTGCTGGAGTAATGGCGCTAACAAGCGATATCACAACGCAAGCAAATCTTATCGATGTTTTGAATGTCGCTAATGCAGGTCTAACGACGATTATTGGCAATATAGGTGGAGTAGGGCATAGCTTCGGTTTGATTAAAGTGGGGCAAAATGCAAACACTTCCTTGAGCGGCAATATCTTTGCCACGTTAACGCAATTTCAAGGGAATAATGTTTTAGCAATAGGAGAGAGTAATACCATCACGGGCAATGTTGATACGGCCCTTGGTGGAACCGGAATTTTGCAATTTGATGGCAGTAGTCGTGTTACTGGCAATATTGGTAACACGAATGCACTCAATCTAATGATTTTAAATGAAAATGGCGGTATCAAAACAATAGAATTAGATGGCGCCGTGGTTAAAGCTAATAGTATTAATATCGTAGGTGATGGCTTAAATCCAACGACATTATTGCTAAATGCAAATGGTAATATGGCCTTAACAGGAAATATTACGACGCAGGGAAATTTAATTGATATTTTAAATATTGCCAATGTTGGAGACACCACCATGGTGGGTAATATTGGTGGTGTAGGACATGCATTTGATCTGATTAAATTAGGACAAAACGCAAATACAAAGATTACCGGAAACATCTTTTCTACTGAGATGCAATTTCAGGGAGATAAGATTTTAAGCTTAGATAACAATAGTAATCTTAGTGGTAGCGTAGATACAATAACTCCGAATACAGGCACCTTACAATTTTTAGGTAATAGTACAATAACCGGTAATGTAGGTAATCTTTCTTTAGCTGCAGTAAATTTATTAGGCGCTGGAGATATAGTTAATTTTCAAGGAAATATTACCGCAAAAGCAGTAAATTTTTCGGCGAACGCAACAGCAAAATTAAGTGATGGCAAAATTATTGATGGGAGCGTTGATGCCACGGGCCCTGGAATTGGTGCATTGCAGTTTTTGGGGGCAGGACAAGTCACAGGAAATATTGGTGACACCAATGCGATTTCAACCCTGCTTGTGAACGCTGGCGGTAATACAAGCAGAACAGTTGAACTTGATGGAAATATTGTCAAAATCAATACGATTAATACTGTTGGCAATGGAGTGAATACGACTACTTTATTATTAAATAGCGCAGGGGCGATGAGCTTAATCGGAAATATTTCCCCTAGTGTTAGTGATAACCTCGATATTTTGAATGTCGCGAATGTTGGAAGCACAACAATAACAGGAAATATTGGCGCACAATCAAAATCGTTTAATCTGGTGAAAATAGGTCAAAATAGCGACTCAACTGTGAGCGGAAATATTTTCGCCACGACGACACAATTTCAAGGCAATAAAATATTATCATTTAGCGATGGAAGTAGCGTTACTGGAGCAGTGGATACGACAGTAGGGGGAAATGGGACATTACAATTTCAAGGAGGAGGGCAGGTTAGTGGCAATATAGGCAACGCTGCTCCACTTGGATTGATTAGTTTGAATTCTCTAGGTGGTACTAAAACCATTGAACTAGATGGTACGGTGATAAAAGCAAATGCTATTAACATTGTTGGTGATGGAGCCAACCCTACCACCTTATTATTAAATAGCCCAGGTGCAATGGCATTAACAGGAGATATTACAACTCAGGGCAATTTCATCGATACGTTGAATGTAGTCAATGCTGGCGTAACCACGATTGTTGGTAATCTTGGCGGCATAGGGCATGGGTTCAATTTAATTCAAATTGGAGAAAATGCAGATATTAATATCACAGGAAATATTTTCGCCAAATTAACACAATTTCAAGGCAATCACGTTCTTACCTTGAGCCCAAACAGTAACATTTTTGGGGCGATAGATAGTAATGCTGTCAGTACAGGTACCTTACAATTTTTAGGTGATAGTACAGTAACAGGGGATATTGGTGATGCCTCTTTAGACGCAGTGAATTTATTGGGCGCAGGGAGCGTTGTTAATTTTGAAGGGGATGTCATTGCGAGTTCTGTCAATTTTATGGCTGATGCAACGGCTAATCTTAGCGATGGGAAAGTCATTACAGGACCTGTTACCACTTCATTAAATGATCAAGGAACATTAGTCTTTCTAGGCGCAACCAATGTTGTCTCGCCAATCGGCGGCCCAGAGACCTTGAAGCTTGTTTCCATGCAAGGTACGGGTGGGAAAATTGTTAACTTAAATAATAATATTTTTGCCACCAATACGAGTGTGAATAATGGCGGAACATTATTTGTAAATGGATCACAAACTGTTAATGGAAATTTGTCTGTTATTAATAATTCTGTCTTAAGCTTAACTACAAACGCAAATCCGCTTACGGTAACAGGAAACTTTGATTTAGGCACGGGTACTTCATTTGCATTAAATATGGGAAATTTGCTTGCGGCGGGTTCTGTTAATGCTTTGGGTATTGCAACTGGGTGCAAACTTGCATGTGATCCCGGTTACCTCAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1354
MHKRKYFTKAVLTSTIFAVIPVIAEAGLVPIPLSGLNSGVLPDLGQGYDYALPGLTFTILDADNIGSTFIPLLGLNASVDSLLPVNNNETLNFAGGATVTATIGSSTPLGTINLQTANKTVNFQGNVSAGVINFAANAKANLSDTVIITANVDNTSGTAGEGTLQFQGGGQVIGNVGNTNSLQLITVNSAGSIQKSVELDGAVINVVTIHINDDGTGNSANGSTLKLNNAAMTLSANITANTNNEDILDITNAATLTGDIGANGQGFNLIRVGAQNNTSVNGNIFATLTQFQGNNTLSIGNGNIITGAVDSTLPGTGILQFIGSGQVTGNIGNNNAISTLQVNSSGGVGKQVELDGTVIKINTINTVGDGVNASTLLLNSAGVMALTGNIAPSNSNNLDILNIANIGNTTLSGNIGTSTKAFNLLKVGQNSDTTVNGNIVATTTQFQSNKTLSLSDGSIVTGNVDTIAGGAGTLQFLGGGRVSGNMGNANPLELISLNSLGGNKVVEFDGAVIKANAINIVGDGANATTLLLNSAGVMALTSDITTQANLIDVLNVANAGLTTIIGNIGGVGHSFGLIKVGQNANTSLSGNIFATLTQFQGNNVLAIGESNTITGNVDTALGGTGILQFDGSSRVTGNIGNTNALNLMILNENGGIKTIELDGAVVKANSINIVGDGLNPTTLLLNANGNMALTGNITTQGNLIDILNIANVGDTTMVGNIGGVGHAFDLIKLGQNANTKITGNIFSTEMQFQGDKILSLDNNSNLSGSVDTITPNTGTLQFLGNSTITGNVGNLSLAAVNLLGAGDIVNFQGNITAKAVNFSANATAKLSDGKIIDGSVDATGPGIGALQFLGAGQVTGNIGDTNAISTLLVNAGGNTSRTVELDGNIVKINTINTVGNGVNTTTLLLNSAGAMSLIGNISPSVSDNLDILNVANVGSTTITGNIGAQSKSFNLVKIGQNSDSTVSGNIFATTTQFQGNKILSFSDGSSVTGAVDTTVGGNGTLQFQGGGQVSGNIGNAAPLGLISLNSLGGTKTIELDGTVIKANAINIVGDGANPTTLLLNSPGAMALTGDITTQGNFIDTLNVVNAGVTTIVGNLGGIGHGFNLIQIGENADINITGNIFAKLTQFQGNHVLTLSPNSNIFGAIDSNAVSTGTLQFLGDSTVTGDIGDASLDAVNLLGAGSVVNFEGDVIASSVNFMADATANLSDGKVITGPVTTSLNDQGTLVFLGATNVVSPIGGPETLKLVSMQGTGGKIVNLNNNIFATNTSVNNGGTLFVNGSQTVNGNLSVINNSVLSLTTNANPLTVTGNFDLGTGTSFALNMGNLLAAGSVNALGIATGCKLACDPGYLK*