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SCNpilot_expt_500_bf_scaffold_16223_1

Organism: SCNpilot_expt_500_bf_step10_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 53 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 15 / 38 MC: 13
Location: 51..2966

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Low density lipoprotein receptor n=1 Tax=Philodina roseola RepID=B2L3N0_PHIRO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 28.0
  • Coverage: 604.0
  • Bit_score: 241
  • Evalue 3.20e-60
Low density lipoprotein receptor {ECO:0000313|EMBL:ACC43983.1}; TaxID=96448 species="Eukaryota; Metazoa; Lophotrochozoa; Rotifera; Bdelloidea; Philodinida; Philodinidae; Philodina.;" source="Philodina roseola (Rotifer).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 28.0
  • Coverage: 604.0
  • Bit_score: 241
  • Evalue 4.50e-60

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Philodina roseola → Philodina → Philodinida → Bdelloidea → Rotifera → Metazoa

Sequences

DNA sequence
Length: 2916
ATGTTGTTTGAAACATTATTTTGCATGATTTTAATCGCTACAGAATTGCATGGATCATTCATATATACGATTGAGAAAAATTCCAAGACAGATATTGATTGTATCTACGCTTATATGACTGATATTAACTATGATTATAATCAAAATATTCATATAAATTATTTAACACCCTATTGTCGACGTTTATCATTCAATGATTCGATTATTGATGTAGAAGGAAATGTAGAAAATGTAATAACATTTCAAGATCTACATTCTCAACATGTGACAAGTGAAGAATTACTTCAATGGTCAAGTTCAATTGATATTATTCAGGATTATGAAATATATTTAACTATTAATAATAATTCAGAGTTTGCAGAAAGAAAGTTTTATAATTGTTCAAAATTTTGGTTTGGTTCTCGATGTCAGTATACATTTAATTTGAATCAATCGATTGAATCATTTGGTGATTTTGTTATTTCATCATTTCGTCGTCGAGAAACTTTCTTTTCAGAAGACAAAACATTTAGTTGTTATCCACATTTATCTGGATGTTACCGAGGTCCTGAACCGATGTGTTTAGATTGGCGTGAAATATGCGATGGTAAAATCGATTGTATTGGAGAGAATTTTGGTATTGATGAAAATCATTGTGAACAATTACAAATGAAGGAATGTCAAGAAAATGAATATCGATGCCATAGTGATGGACAATGTATTCCATTGGAATTTTTTCATGATGGTTTTACAAATAACGATTGTCTAGACGGAACTGATGAAGAACCTACGAGGAACCTTCAACATCGTTTCACTGAACATGATTTCAATTGTTTAACAACAATGTTCTTTAGTTGTGAAGAAAAACGTTGTCGGTCGGAATTCTTGTTTTCTTGCGGTGATGGGCAATGCATTCGTAGGAAAACATCAAACATTCATCAGAGTGATATTCGTTGTTTAAGCACAGATCGTGATCATACGTATGATTCTAGTCTACTTTACATTCCATTATATATTTCATTGGATTGTTATCTATCTGCATTCCATCAGTTTGAACATGATTTTTTTGTCAAAAACATTACAAATTTCGTTTCATTCGATCATTGTGCTATTGCGAATGTATCTATTACACCATCTGTTCAATTGATTTTAGCTTATTTTCATTTATATTATTCAAGTAAAACATTACCCGATAAATATGTCTCCGTCGTACGACCACATTTTATTTGTAATAATCTTGAACAGTACATATTTTTACCAGAACTAACATTTCGAATCTTAACTTTATATTGTTATCGGTCATTAGTAGTGTTCAGTAGAAAATATCGGGAAAATATATTCAATTGGATTGATTTAACTAAACGATTAAATATCGCATATTTGCATTTAATTAATAAACCAAAGAAATTCAGTCATAGTTACTATGACGAAGATGAACTTTCATCAAGCTATTCTCGATTGAATTCATCCACAAATATGGATACTAGATATCAATACTCACATATTTGTATTGGTGTATTCGAAGAAGATTATTTTTATCATACTAATTGTGAACTTTGGTCTTGTTACAATCCATATACTCGATGCGATGGATTCTTTCAGTGTTTAAATGGTATCGATGAGTTAGGTTGTCCAAGTCTCACTTGTAATGAAAATCAATTGGAATGTCATGATAATAACATCCCTTCGAAAATAAATTGTATTGATTATGATTATATTTATGAAGATACTTATCAACAAAAACTTTTCTATGTAAATCATTCTCTCGTTGACACGAAATATTTAGCTTGGAAAACGAAACATTTATTAACAACATCTGATAATTTGATAACTCTTCAACAACTGCAAATATATCATATTGATAATCATACAGAATTTTGTCAGTTAAATTTTTTTATTCTTGATAAAATGTTGACTTATTCACTTCGTTATTCGTCTCAATTATTTCTCGGTTATTTACCAGCAGTGGAAAATCTTTCCTCTCAACAAGAATATATCGACATAAAATCGAAAGAAAATTTTGTTCTCAATGAAGATTATCAATTTATTGAACATTGTTATCGTGGTATTCTTATCTATGAAAGTAAATCAAAGGCAAAACGATGTTTATGTCCACCGAATTATTTCGGTGATCGATGTCAATGGCGTTTAACATTACAAATTGAAAGATTGATTTTGACAGAAAAGAAAAGTTCAATCTTTGAAATCTTCATCTATCTCATCGATGATGAAACGAAAAGCATTGAAAATTATGAACAAATTCTCTATAATCCATCAACAGATTGTCAAATAAAATTTAATCGCTATTTATTATATTCAACACGACCAAAAAATGTCAATAAAACCTATTCATTACATATTGATATTTATGACAAAATAACTCTAAATTATTCAGGAAGTTGGTATTTACCAGTTGAATTTTCATTTCTCCCAGTTAATCGAATTGTAAGAAAATTGTTTTTACCATCGGACGTATCTTATCTAGCAAATAACTGTTCGTTATATTGTGGAATTCATGGTCAATGTTATAATTATATCAATTCCTATCGATCATTTTGTCGTAATAAAACCCAATGTTCATGTTCACCGGATTCGATCTGTTTGCATTCATCGATATGTTTATGTCCATTGAATAAATTCGGTTCAAAATGTTATTTAAAACATTCCGCTTGTCAACCGACGAATCCATGTCAAAACAATGGACAATGCATACCAGTTGATCAACGAATTCATCAGAATGATTTCATCTGTTTATGTTCGGAGAATTACTCCGGACGAAACTGTGAATTCAATTCGACAAAAATCGAAATTCATTTCGAAGAAACAAATATTCCACGAATTATATTCGCTCATTTTATAACTGCATTTCTCGGCACAAAACCACATGAACAAATGACAAAATTTCAGAAGATTCCATTCAATCAAAATTCTGTCACA
PROTEIN sequence
Length: 972
MLFETLFCMILIATELHGSFIYTIEKNSKTDIDCIYAYMTDINYDYNQNIHINYLTPYCRRLSFNDSIIDVEGNVENVITFQDLHSQHVTSEELLQWSSSIDIIQDYEIYLTINNNSEFAERKFYNCSKFWFGSRCQYTFNLNQSIESFGDFVISSFRRRETFFSEDKTFSCYPHLSGCYRGPEPMCLDWREICDGKIDCIGENFGIDENHCEQLQMKECQENEYRCHSDGQCIPLEFFHDGFTNNDCLDGTDEEPTRNLQHRFTEHDFNCLTTMFFSCEEKRCRSEFLFSCGDGQCIRRKTSNIHQSDIRCLSTDRDHTYDSSLLYIPLYISLDCYLSAFHQFEHDFFVKNITNFVSFDHCAIANVSITPSVQLILAYFHLYYSSKTLPDKYVSVVRPHFICNNLEQYIFLPELTFRILTLYCYRSLVVFSRKYRENIFNWIDLTKRLNIAYLHLINKPKKFSHSYYDEDELSSSYSRLNSSTNMDTRYQYSHICIGVFEEDYFYHTNCELWSCYNPYTRCDGFFQCLNGIDELGCPSLTCNENQLECHDNNIPSKINCIDYDYIYEDTYQQKLFYVNHSLVDTKYLAWKTKHLLTTSDNLITLQQLQIYHIDNHTEFCQLNFFILDKMLTYSLRYSSQLFLGYLPAVENLSSQQEYIDIKSKENFVLNEDYQFIEHCYRGILIYESKSKAKRCLCPPNYFGDRCQWRLTLQIERLILTEKKSSIFEIFIYLIDDETKSIENYEQILYNPSTDCQIKFNRYLLYSTRPKNVNKTYSLHIDIYDKITLNYSGSWYLPVEFSFLPVNRIVRKLFLPSDVSYLANNCSLYCGIHGQCYNYINSYRSFCRNKTQCSCSPDSICLHSSICLCPLNKFGSKCYLKHSACQPTNPCQNNGQCIPVDQRIHQNDFICLCSENYSGRNCEFNSTKIEIHFEETNIPRIIFAHFITAFLGTKPHEQMTKFQKIPFNQNSVT