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SCNpilot_expt_500_bf_scaffold_22637_1

Organism: SCNpilot_expt_500_bf_step10_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 53 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 15 / 38 MC: 13
Location: comp(3..3503)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Low density lipoprotein receptor n=1 Tax=Philodina roseola RepID=B2L3N0_PHIRO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 35.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 778
  • Evalue 1.10e-221
Low density lipoprotein receptor {ECO:0000313|EMBL:ACC43983.1}; TaxID=96448 species="Eukaryota; Metazoa; Lophotrochozoa; Rotifera; Bdelloidea; Philodinida; Philodinidae; Philodina.;" source="Philodina roseola (Rotifer).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 35.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 778
  • Evalue 1.60e-221
NOTCH1; notch 1; K02599 Notch similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 25.8
  • Coverage: 128.0
  • Bit_score: 66
  • Evalue 5.30e-08

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Philodina roseola → Philodina → Philodinida → Bdelloidea → Rotifera → Metazoa

Sequences

DNA sequence
Length: 3501
CAAATCTATCTTGATTACAATGATGCATCCTTAGAAAATAAAACATTTTTTAATTGCACATCGTCAAGTTTTGGTTCTCAATGTCAATATCAAATTCCTTCTAGTCAATCATATTACTCAACTTTATATAAACTTACTCAATTGATTTATGAATCTCTCGGAAGTTTCACACGTACTTTGACTTGTTATACTCAACTTCAATGTGATCGTGGCACAGAATCATTGTGTTTAGCTTGGAGTGATATTTGTAATGGAGTAATTAATTGTCTAAACAATGGAGTAGATGAAAAAGGTTGCTGGCAACTCGAAGTTAATCAATGTCATGAAGATGAACATCGATGTCAAATTGGACAATGCATACCAAAATTATTTGTTGAGTTTGCTACAGGTACATCTGATTGTATCGATGTACCCGCATATAGCTGTGGAGCTTCTTATGAACCAGGATTTAAATGTGCTGACAAGATGAGTACCGATGGCGGTAGCGCTTTGACAGGTTCTTATGTTACAAATAGGGGAAGTCTCTTATTGGCTGCGATGCATTCAAGTAATAAAAGTTTATATTCAGAGCAGTGTTGGTCAGCATTCAAATGCCTTATTGATTCATCTTATTCAAAATTATGTCAACAAAATTCATACATAAATATTATTGCAACAACTTGTCCCGATATGATTTTCTATCCGAATATTCCTGTTTTATTTGGAAATATTTATTTAGCTTATAATAAAAGTCAATCGCAATACTGGAAAATCATATCATCTTCATTTACTTATGTCTGTTATAATACTGACCATTTCTTTAGTAATTTTACTAAAATATATTTTAACAATCTTACATGCCTTGTTAGTTCACAAATTCCTACAGTATTAAGACAAGGTCAGAAAAGACAGTTGTTACATTCTAATATTATATCAAGATTATATGAGAATCTGAAGAATTATCATTTGATCTATGATTATACAGTTGAAATCTGTAATCGATCATTGATGTATCAATGTAGAAATTCATCGAAATGTATTTTCATTTATCGTCTAATGAATCGTGTAAATGATTGCCCATATATGGACGATGAAAATATGGATTTTATCAAAACAACGAATGCTATGAATTTATTGAAGAAAACACATTTTAAATGTCGATATTCAGATAAATACATTAGTCAACTTTTAGTTGAAAATGGAAGATGTGATTGCAATGAAACTGGAAATGAGCACGGTTGTAATGATGAATATTTGGATCCAATTTCTAATCAAAATATAATAGTGTTCCAAGATATTTGTGATGGATATACGGATCTATTACCAATTTTGATTAATAACAAAAACGAAACAGATGAAACTGAATGCGAATATTGGCCATGCAGTAATATCTATACTCAAAATAATGGCGTATCGAACTGTCCGACTATTGAAGATGAAATACTTTATTATTCAAATAATCTATTATGTCTTTCATCTGTCACAGCTCAACTCCTTTATTTACCTAGTGAGAAATTCAATAATGGTCAGATTGATTGCCTCGGTGCAATTGACGAATACGTATGTAAACGAGAAGTTCCATTATCAATTTTTGCCGATATGAATCATACATTTCGATTTTTCTATTGTATGAATCAAACATCTCATTTATGTTTGTCGAGCAATGAGTTATGTAATGGTCATAATGACTGTGAAAATGGAGATGATGAACGATTTTGTACAATGGATACAATATATAATCAGACTAGTCAAGTTGGCCCTATTACTGGATTATTTCCCTATGGTACAATAGGAAAATCACTAGGTCAAAAGACGTTCAGACTACACAGCAACGATGAAGAGAATGCGGTGATCAGGATCAATGAAAATACAATGGTATCTCGTCGGTTGGATAGTCAAGTTATTTCAATATCTGACAGATTTCGTTGTCATTTTGGTATTCAGATTAGCTTCAATCAATCACAAACATCAACATGTTTTTGTCCACCGAATTACTACGGTCATCTCTGTCAATATCAAAATCAACGAATTAGTCTAGCACTTCAATTTCAAGCCTTATCAAATTCAGTAGGAACCGTATTTACAATAGTTGTTTTACTTATTGATAATACAACCGAACGAATCATTCATTCGTTTGAACAATTTAATTTTCTATCGTTAACCAATTGTAAAACTAAGTTCAATATTTATTTACTTTATTCAACTCGACCAAAACATTTCTACAACGAATATGCTATACATATCGATATCTATGAAACAGATTCATTCGAATACCGAGGAAGTTTATTATATCCAATTGAATTTCCATTTCTACCTGTTCATCGTCTAGCATATCTTGTTGAAATACCATCAAATGATATTCATGAACAAACTTGTTTCAATTATCGATGTATACATGGTCGATATACTAAATATTGGAAAAATTCCCGGCATTATACCTTTTGTCGATGCAATCAAGGATGGTCTGGCAAATATTGTCAAATTAGTCATCATTGTCAATGTTCGCCTGATTCGATATGTATCGATAAATCATCAAATAACCGATCGATTTGTATGTGTTCGAAGAATAAATTTGGTTCTCGATGTTATCTAACTGATTCTCAATGCAATTCAAATGCTAATTCAACATGTTTAAATGGTGGTCAATGTTTAATATCAAATCAAAAAGTTGCATGTCTTTGTCCGAATGAATTTAGTGGAGATCGATGTGAAAAATCAGTTAATCAATTGAATATTTCTTTTGAAGCTAATATCATTCAATCACAACAATATATATTTATTCATTTTCACGAAATTCCCTATAAACTTAGTTTGAATCCGAAAATTATGAGATCGAATACTTTCCGAACACTTTCAATGGACACTAAATCAGTATTGATTCGTCGTTCACAATCATTTGATCTTGTTTTTCTTGAATTATTTCCAAAGAAAACATATTATTTAATATTTGTTAACTATAATAGTAGTACACCACTTGCAATTAATATCAATAAAACAATGACATCATTAGATCGTTGTCCAAATATAACTGAATTATTTAATCGTACGTTTATTCAATGGCATATCATTCGTCAAATCAAATATTATCATTTACTATGTCGAAATCAAAATCTATCATCTTTTCATGATCAGATACATTTATGTTTATGTTATGATTTCCATGGAAAACGTTTAGCTAATTGTTTACAGTTTGATCATTATTTGACATATAATTGTTCAGGTCGAAGTGAATGTGAAAATGATGGTCAATGTTTTCAAGATGATCCAAGATGTCCAACAAAATCTATTTGTTTATGTAAACCTTGTTCTTACGGTAATCGATGTCAACATCGTACAAGTGGATTAGGTTTATCTCTCGATGCAATATTAAGTTATCATATTATCATCAAAATAAGTCTCATATTAACAATTATTTTTATGTTAGCAGGACTCATCAATGGCGCACTATCATTAATGACATTTAAAAATAAATCAGTTTGTACTGTTGGTTGTGGTTTATATTTACTAAGTTCATCGATTACA
PROTEIN sequence
Length: 1167
QIYLDYNDASLENKTFFNCTSSSFGSQCQYQIPSSQSYYSTLYKLTQLIYESLGSFTRTLTCYTQLQCDRGTESLCLAWSDICNGVINCLNNGVDEKGCWQLEVNQCHEDEHRCQIGQCIPKLFVEFATGTSDCIDVPAYSCGASYEPGFKCADKMSTDGGSALTGSYVTNRGSLLLAAMHSSNKSLYSEQCWSAFKCLIDSSYSKLCQQNSYINIIATTCPDMIFYPNIPVLFGNIYLAYNKSQSQYWKIISSSFTYVCYNTDHFFSNFTKIYFNNLTCLVSSQIPTVLRQGQKRQLLHSNIISRLYENLKNYHLIYDYTVEICNRSLMYQCRNSSKCIFIYRLMNRVNDCPYMDDENMDFIKTTNAMNLLKKTHFKCRYSDKYISQLLVENGRCDCNETGNEHGCNDEYLDPISNQNIIVFQDICDGYTDLLPILINNKNETDETECEYWPCSNIYTQNNGVSNCPTIEDEILYYSNNLLCLSSVTAQLLYLPSEKFNNGQIDCLGAIDEYVCKREVPLSIFADMNHTFRFFYCMNQTSHLCLSSNELCNGHNDCENGDDERFCTMDTIYNQTSQVGPITGLFPYGTIGKSLGQKTFRLHSNDEENAVIRINENTMVSRRLDSQVISISDRFRCHFGIQISFNQSQTSTCFCPPNYYGHLCQYQNQRISLALQFQALSNSVGTVFTIVVLLIDNTTERIIHSFEQFNFLSLTNCKTKFNIYLLYSTRPKHFYNEYAIHIDIYETDSFEYRGSLLYPIEFPFLPVHRLAYLVEIPSNDIHEQTCFNYRCIHGRYTKYWKNSRHYTFCRCNQGWSGKYCQISHHCQCSPDSICIDKSSNNRSICMCSKNKFGSRCYLTDSQCNSNANSTCLNGGQCLISNQKVACLCPNEFSGDRCEKSVNQLNISFEANIIQSQQYIFIHFHEIPYKLSLNPKIMRSNTFRTLSMDTKSVLIRRSQSFDLVFLELFPKKTYYLIFVNYNSSTPLAININKTMTSLDRCPNITELFNRTFIQWHIIRQIKYYHLLCRNQNLSSFHDQIHLCLCYDFHGKRLANCLQFDHYLTYNCSGRSECENDGQCFQDDPRCPTKSICLCKPCSYGNRCQHRTSGLGLSLDAILSYHIIIKISLILTIIFMLAGLINGALSLMTFKNKSVCTVGCGLYLLSSSIT