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scnpilot_solids2_trim150_scaffold_9293_2

Organism: SCNPILOT_SOLID2_TRIM150_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 16 / 38 MC: 16
Location: 221..2248

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5; EC=1.6.5.3;; NADH dehydrogenase subunit 5; TaxID=5755 species="Eukaryota; Amoebozoa; Discosea; Longamoebia; Centramoebida; Acanthamoebidae; Acanthamoeba.;" source="Acanthamoeba castellanii (Amoeba).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 89.9
  • Coverage: 674.0
  • Bit_score: 1233
  • Evalue 0.0
NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 n=1 Tax=Acanthamoeba castellanii RepID=NU5M_ACACA similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 89.9
  • Coverage: 674.0
  • Bit_score: 1233
  • Evalue 0.0
  • rbh
nad5; NADH dehydrogenase subunit 5 similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 52.2
  • Coverage: 668.0
  • Bit_score: 687
  • Evalue 3.70e-195

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Acanthamoeba castellanii → Acanthamoeba → Longamoebia → Eukaryota

Sequences

DNA sequence
Length: 2028
ATGTACTTATTGCCTTTATTATTTCCTTTGTTAAATCTTTTTATTTCTTGTCTTTTTGGTAAGTTTTTAGGAAAACGGGTTTTCTTTATTTTAGTAACTAATATGGTTTTGTCGACAATTTTTTCATTCTGAGTTTTTTATGAGGTAGGTTTAAATAAATCAGTTTGTTATGTAGATCTTGGTGCTTGATTTCATTTAGGTTTATTAAAACTAAATTGATTTTTTTTATTTGATAGTATTACTTCTGTTATGCTTGTACTTGTCGTTTTTGTTTCTTTATTGGTTCATCTATATTCAATTGATTACATGGCTGGTGATCCCCATATAATACGTTTCTTGGGTTATCTTTCGTTATTTACATTTTTTATGTTGATGTTGGTAACATCGGGTAATTTTGTACAGCTATTTCTTGGTTGGGAGGGTGTGGGCTTATCTTCTTACCTTTTGATAAATTTTTGATATACCCGAGTACAGGCAAATAAGTCAGCGATGAAAGCTATTATAGTTAATAGGTTTGGTGATTTTGGTATTTACTTTTCTCTTTTAATAATGTTTTTCTTCTTCAAAAGTTTTGATTTTGGTGTTGTTTTTAATTTAGTCCAATTTCTTAATATTCAACCTGATATATCTTTTTTAGGTTTTAAATTAAATAGAGTTGATTTTATTGTCATTTTTTTATTTTTAGGCGCAATCGGTAAATCAGCTCAGCTAGGCCTTCATACTTGATTGCCTGATGCGATGGAGGGACCAACACCTGTTTCAGCCTTAATTCATGCAGCAACTATGGTTACTGCCGGAGTTTTTGTTCTTATAAGATCCTCCCCTATATTGGAGTATAGTTTTTCTGGTTTGTTTTTGGTATCTTTAATAGGCGGTTTAACAGCACTGTTTGCGGGTACAGTTGGTTTAGTCCAATATGATATAAAAAAAGTTATAGCTTACTCGACATGTAGTCAATTAGGGTATATGTTTTTTGCTTGCGGCATGTCTAACTATTCTGTAGGTTTGTTTCATCTTTTTAATCACGGTTTTTTTAAAGCATTGCTTTTTCTTGGCGCCGGTTCAGTTATTCATGCACTTCTAGATGAACAAGATATGCGTAAAATGGGCGGTTTAATAAAATTAATGCCTTTAACGTATATAGCTATTTTAGTAGGCTCTTTGTCTTTAACCGGATTTCCATTTTTGACTGGTTTTTATTCTAAAGAAGTGGTTTTAGAAATTGCATTTTCTAAATTTTCAATCAACAGTTTTTTTGTTTATTGGTTAGGTGTATTTGCTGCTTTTATAACTTCGTTTTATTCTATTAGGTTGATATATCTTGTTTTTTTTGCAAAAACTAATTCATACGTTAAAGCCGTTAGCTCTTCTCATGAGTCCTCCTCTTTTATTTTTTACGTATTAAGTTTTCTAGGCTTCTTAAGTATTTTCATAGGTTTTATTTTCAAAGATCTTTTTATTGGGTTGGGTACTGATTTTTGGGCAAATTCAATTTTTAATCTTTATATCAATTCTGATATTTTGTATGCCGAGTTTTTGGATTATTACTATAAATTAATTCCATTAGGTTTTAGTATAGCTGGTCTTGTCTGCTCTTTATTTGTTTATTTTATAGTTTATGATTGTACTTTTTTTATTGTTAAAAATAGATTTTTTCGTTATTCTTATTTCTTCTTAGCTAAAAAATGATACTTTGATCTTCTATATAACAACATTTTTGTATTTAACTTATTAAGATCTTTTTATGTTCTTACTTTTAAAGTAATTGATAGGGGTTTAATTGAGTTTTTCGGTCCTTTAAGTTTTGTTAGATTGGTTAGTAAATTCTCCACTTTTCTTAGTTCACTTCAAACAGGGTTTTTATATAATTATATTTTTATTGTTTTATTGGGGTTAATGTTTTTTATAAAGTTAACTTTTTCCGTGTTTTTCTTCTATTTTAATGAGTTTTTTAATTTTGGTTTATTTGCGTGTTTATTAAGTTTAGTAATATTTCTGTCATTTGGTACTAAAAAACAAAATAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 676
MYLLPLLFPLLNLFISCLFGKFLGKRVFFILVTNMVLSTIFSF*VFYEVGLNKSVCYVDLGA*FHLGLLKLN*FFLFDSITSVMLVLVVFVSLLVHLYSIDYMAGDPHIIRFLGYLSLFTFFMLMLVTSGNFVQLFLGWEGVGLSSYLLINF*YTRVQANKSAMKAIIVNRFGDFGIYFSLLIMFFFFKSFDFGVVFNLVQFLNIQPDISFLGFKLNRVDFIVIFLFLGAIGKSAQLGLHT*LPDAMEGPTPVSALIHAATMVTAGVFVLIRSSPILEYSFSGLFLVSLIGGLTALFAGTVGLVQYDIKKVIAYSTCSQLGYMFFACGMSNYSVGLFHLFNHGFFKALLFLGAGSVIHALLDEQDMRKMGGLIKLMPLTYIAILVGSLSLTGFPFLTGFYSKEVVLEIAFSKFSINSFFVYWLGVFAAFITSFYSIRLIYLVFFAKTNSYVKAVSSSHESSSFIFYVLSFLGFLSIFIGFIFKDLFIGLGTDFWANSIFNLYINSDILYAEFLDYYYKLIPLGFSIAGLVCSLFVYFIVYDCTFFIVKNRFFRYSYFFLAKK*YFDLLYNNIFVFNLLRSFYVLTFKVIDRGLIEFFGPLSFVRLVSKFSTFLSSLQTGFLYNYIFIVLLGLMFFIKLTFSVFFFYFNEFFNFGLFACLLSLVIFLSFGTKKQNN*