ggKbase home page

scnpilot_solids2_trim150_scaffold_1789_curated_1

Organism: solids_Sphingobacteriales_2

near complete RP 50 / 55 MC: 1 BSCG 49 / 51 ASCG 11 / 38
Location: comp(3..3818)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
PKD domain containing protein n=1 Tax=Fulvivirga imtechensis AK7 RepID=L8K1M5_9BACT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 43.6
  • Coverage: 358.0
  • Bit_score: 275
  • Evalue 2.60e-70
PKD domain containing protein {ECO:0000313|EMBL:ELR73352.1}; TaxID=1237149 species="Bacteria; Bacteroidetes; Cytophagia; Cytophagales; Flammeovirgaceae; Fulvivirga.;" source="Fulvivirga imtechensis AK7.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 42.5
  • Coverage: 407.0
  • Bit_score: 274
  • Evalue 6.20e-70
PKD domain-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 34.3
  • Coverage: 613.0
  • Bit_score: 273
  • Evalue 4.10e-70

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Fulvivirga imtechensis → Fulvivirga → Cytophagales → Cytophagia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3816
ATGAGGGAGTTCTCTTTACGTTTATCTTTTCTGGTTTTGCTAACTACTGTGGCTGTAAAGGTTTCCTTTTCTCAGCAGTTCCAGACAAAACTTTCAGGTTGGAATGCCTATGTCCATTTACCGGGAGATTATGATCAAAACCCCACAAAATATTATCCATTAATTGTTTTTGTTCCCGGTCTGGGAGAGGTGGGTACCGATCCATCCTTATTATTGGTTTACGGCCCCAATAAATTTGTGGCAGATGGAAACCCAATGGAATTCATGGTAAATGGAGTTTTGGAAAAACCGATTCTCATTTCAATTCAACCGCCAAATGCCTGGTCGCCGGCAACAGGAATGAAACCCGTTTTAGATCAAATCATCCAGACCTGGAGAGTTGATACAAACAGGATCAACCTTACCGGATTATCTATGGGGGGCTGGGAAGTGGAAGGCTTCGTCAGCTTTTACGACATCAATTGGACAAAAGAAATTGCATCCATAGTTTCCATGTCAAGAGTGGAACCGGGGAACGCAGGTTATGATACTTTAAAAACTTTTGCTTTAAACGGAGGTAAGATTTGGGGCTTTGAAGGCACACTGGATCAGCGCTATATGGCGCGTGCGAGAGATGTGGTAAACCGTGTAGTGCCCGGAGCATACCGATATTATCAATATGACGGCGGACATTGCTGTTGGAATACCTGGTATGATCCCAATTGGAAAGATCCCTCAGACGGAGAAAGTATTTACACCTGGATGTTGAAGCAGAGAAGGGGAGGTGTGACGAGCACTGTCAACCAACCACCGGTTGTAAATGCCGGAAAAGATACCACGATCACAGCTCCTGCAAATTCGATTAACCTGAGCGGTTTCGCCTCTGATCCGGATGGTTCTATTTCAAAGATATTATGGTCGCAGGACTCCGGTCCAAATACTGCAATAATACAATCGCCCAATTCATTAAATACGGATATCAGAAATCTGGTGGCCGGTACCTATGTTTTTTCATTAAAGGCGACTGATAATCTTGGGCTTGCGTCTTCGGCAACTATGAAGGTGTCCCTGACTGCAACACAGGATAGTTTGCCCGTAGCCAATGCCGGATCAGACCAGATAATTACTTTGCCCCTGGACAGTGTCCAATTATCCGGGAGCGGCACTACATCATCAGGTTCAATTACAAAATATGCATGGTACCAGGTTTCTGGGCCATCGTCTGCGTATATATTGAATGATTCATCGGCTACTACATGGGTTCAAAATCTTATTGCGGGCCAATATACTTTTGCCTTTATTGTTACCAATGATGCAGGATTAAAAGACACATCGACAGTAAAGGTGACGGTAAACAATGCTTCAGCTCCGGCAGTAAGCATAAATGGAGGAAATAATCTGAATATTTCGGTTGACAGTACAACCCTCACCGGAGTGGCAAGCCCTTCGAATGGTTTGACAATAACTTCCTATTTATGGGAAGAGGTATCCGGAGGAACAGCTACCATTGTTACTCCGTCAGATAGTGCAACACATTTAACCGGATTGTCAAATGGAACCTACACTTTTAAACTCACAGTAAAACAAAGTGATGGACAGACTGCCAGTAGTACCATTAATCTGACGGTAACTTTAGGTTCTACAGGTACTACAACAGATTGCGGATGTACCTGGGTTTTTGATCCGGCGACGAGCGACAGTTCCCTGTATTGGGTTAATAATGGAAGAATAAAAGCAGGTGATGTAATCTGTTTAAAAACGGGGAGATTCAACCATGTAAGCTTTGATGGATTGATTGGCGCTCCCGGCAATCCGATTACCATTAAAAACTGTGGAGGGCCGGTTATTATCGGCAGCGATTTTACTTATATGTTCAGAGTAATGAACAGCAAGTACCTCCATATTACAGGAACCGGCGATCCCAATACATTTTATGGAATTAAGACCCAGCCATTTTTTACAAATCTGACCAGTGCAGCATATTCATTTAATGGTGTATTATCTAATATTGAAATTGATCATGTCTGGGGCGACTCTACGAGGGTATGGGGAATACAGTTAAAAACAACACCCGTTGACTATGATTCATTGACATGGCATCCTTATGGGGTTATCAATAATATCAAGATTCACGATTGTAAAATGTCAAATACCGGTGTTGAAGGATATTATATTGGTTATACCGATTATGATGTGCCGGTAAAAACCGCAAGTGGTACCACCATTAATGTAGATGCACCACGTATCGTAAACCTGGAATTCCATGATAACATTTCTTTGAATACCGGATGGGATGGGATGCAATTTGCAGCAGTGGATAATTTTGTTGCCTACAATAACTATATTCATAATTATGGAATGACAAATACCAGCGGCCAGATGGATGGTTTTATTCTGGGTGGCAGAACATGGGGAAGGATGTACAATAATTATATTGATTCGGGCGGATCTACCGGAATTCATCTGATGGGCTTCAACCAGAATGCACCACCCACCTTAATCTATAACAATCTTGTCATTAATGCCGGATGGGATGGAATCTGGACGGATGACAGGCCGGGTAGCAACGACAGATATCCCAATCAGAAATACTATATTTTCAACAACACCATTGTAAATCCTGCGCGTTACGGAGCAAATTTTTATAGCAGCAATGGTACGGTAAGTTCAGGCAACAGGTTTCAAAATAATTTAATCGTGAACCCGGCAAACAATTTTATCAATGAAGATAAAACAATGGCTGTTCCGGGGATGATAGATACAACACACAACTTTGGAATCAAGTCTTTGGCAATTGCAGGTTTCATTCCCGGTACATGGAAACTTTCCCCGTTTTCGCCTGCATATAATATAACCGGTGTAGATGCCAGTGCATTTTTTACTACAGATTACGATTACATGAACAGAAATGGTGTGTACGACATGGGAGCCTATATCAACGCTCCCGATACCATCACAGTTTTGACGGCTTATGCAGGTCAGGACATCCAGATTATGCTTCCAAAAAATTCAATCACATTAACAGGAGTGGGTATAGACCCCGATGGAGATACCCTGACTTATCAATGGACACAAATTTCCGGACCTTCATCCGCAACGATTGTGACTCCCGGAGTTGCTTCCACTGATATAAATAATTTAATTGCCGGAGTTTATAATTTTCAATTTCAGGTTTCAAATAGCAAGGGGCAATCAGCCCTGGATTCAGTGCTCGTAACCGTAATCACACCGCCAAACCAACCTCCGGTGGCTTATGCCGGCACTGATAAAAGCATAACTCTTCCTGCAAGTTCGGTAAACCTCGCAGGTTCAGGAACAGACCCCGATGGAAAAGTGGTCTCTTTTTTTTGGGGAAAAATCAGTGGCCCTTCTTCTTTTAATATTGTTTCGCCAAATTCTGCAGCAACCACGGTGAATGGCCTTGTAGAGGGAGTTTACCAGTTTCAACTTACAGTAACAGATGACAAAGGCGCTACAGGAACGGATATTGTTCAGGTTACCGTAAAAAGTGTTCCGAATAAAGCACCTACCGCCAATGCAGGTTCAAACCAAGTGATTACTCTGCCGGTAAATACAGTAACATTAAATGGCAGTGGCAACGATTCAGATGGTACGATTGCTTCTTATCTATGGACGAAAGTCAGTGGCCCCTCTTCCTTTAATATTGTCAATCCAAATTCCGCAAAAACAGATGTAAACGGACTTGTATCCGGGATTTATCAATTTCAATTAACCGTAACCGATGATAAGGGCGCCACTGGTACAGCATTCGTACAAGTAACGGTAAATGTTGCACCGAATAAAATCCCAACAGCGAATGCCGGTGCGGATCAAACG
PROTEIN sequence
Length: 1272
MREFSLRLSFLVLLTTVAVKVSFSQQFQTKLSGWNAYVHLPGDYDQNPTKYYPLIVFVPGLGEVGTDPSLLLVYGPNKFVADGNPMEFMVNGVLEKPILISIQPPNAWSPATGMKPVLDQIIQTWRVDTNRINLTGLSMGGWEVEGFVSFYDINWTKEIASIVSMSRVEPGNAGYDTLKTFALNGGKIWGFEGTLDQRYMARARDVVNRVVPGAYRYYQYDGGHCCWNTWYDPNWKDPSDGESIYTWMLKQRRGGVTSTVNQPPVVNAGKDTTITAPANSINLSGFASDPDGSISKILWSQDSGPNTAIIQSPNSLNTDIRNLVAGTYVFSLKATDNLGLASSATMKVSLTATQDSLPVANAGSDQIITLPLDSVQLSGSGTTSSGSITKYAWYQVSGPSSAYILNDSSATTWVQNLIAGQYTFAFIVTNDAGLKDTSTVKVTVNNASAPAVSINGGNNLNISVDSTTLTGVASPSNGLTITSYLWEEVSGGTATIVTPSDSATHLTGLSNGTYTFKLTVKQSDGQTASSTINLTVTLGSTGTTTDCGCTWVFDPATSDSSLYWVNNGRIKAGDVICLKTGRFNHVSFDGLIGAPGNPITIKNCGGPVIIGSDFTYMFRVMNSKYLHITGTGDPNTFYGIKTQPFFTNLTSAAYSFNGVLSNIEIDHVWGDSTRVWGIQLKTTPVDYDSLTWHPYGVINNIKIHDCKMSNTGVEGYYIGYTDYDVPVKTASGTTINVDAPRIVNLEFHDNISLNTGWDGMQFAAVDNFVAYNNYIHNYGMTNTSGQMDGFILGGRTWGRMYNNYIDSGGSTGIHLMGFNQNAPPTLIYNNLVINAGWDGIWTDDRPGSNDRYPNQKYYIFNNTIVNPARYGANFYSSNGTVSSGNRFQNNLIVNPANNFINEDKTMAVPGMIDTTHNFGIKSLAIAGFIPGTWKLSPFSPAYNITGVDASAFFTTDYDYMNRNGVYDMGAYINAPDTITVLTAYAGQDIQIMLPKNSITLTGVGIDPDGDTLTYQWTQISGPSSATIVTPGVASTDINNLIAGVYNFQFQVSNSKGQSALDSVLVTVITPPNQPPVAYAGTDKSITLPASSVNLAGSGTDPDGKVVSFFWGKISGPSSFNIVSPNSAATTVNGLVEGVYQFQLTVTDDKGATGTDIVQVTVKSVPNKAPTANAGSNQVITLPVNTVTLNGSGNDSDGTIASYLWTKVSGPSSFNIVNPNSAKTDVNGLVSGIYQFQLTVTDDKGATGTAFVQVTVNVAPNKIPTANAGADQT