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scnpilot_solids1_trim150_scaffold_811_38

Organism: SCNPILOT_SOLID_1_TRIM150_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 53 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 19 / 38 MC: 16
Location: comp(35564..38230)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Cytochrome c oxidase subunit 1+2; EC=1.9.3.1;; Cytochrome c oxidase polypeptide I+II; TaxID=5755 species="Eukaryota; Amoebozoa; Discosea; Longamoebia; Centramoebida; Acanthamoebidae; Acanthamoeba.;" source="Acanthamoeba castellanii (Amoeba).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 96.0
  • Coverage: 873.0
  • Bit_score: 1718
  • Evalue 0.0
Cox1_1; Cox1_1; K02256 cytochrome c oxidase subunit 1 [EC:1.9.3.1] similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 80.3
  • Coverage: 478.0
  • Bit_score: 817
  • Evalue 4.00e-234
Cytochrome c oxidase subunit 1+2 n=2 Tax=Eukaryota RepID=COX1_ACACA similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 96.0
  • Coverage: 873.0
  • Bit_score: 1718
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

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Taxonomy

Acanthamoeba castellanii → Acanthamoeba → Longamoebia → Eukaryota

Sequences

DNA sequence
Length: 2667
ATGCTTTTTAAATTAGTAAATGCGATAAATTACGAAGTTCTAATGATGATAAATAGATTATTAAATAATTTAACAAGCTTTTTTACTGATAATCGTTGGTTATTTTCGACTAATCACAAAGATATTGGTACTTTATATTTGATATTTGGTGGGTTTTCTGGTATTATAGGTACGATATTTTCTATGATTATAAGGTTAGAGCTAGCTGCTCCAGGTTCTCAAATATTGGGTGGTAATAGTCAACTTTATAACGTTATTATTACAGCTCATGCTTTTGTTATGATTTTCTTTTTCGTTATGCCTGTTATGATAGGTGGTTTTGGAAATTGATTTGTTCCTTTAATGATTGGCGCTCCTGATATGGCTTTTCCTCGACTAAATAATATAAGTTTTTGGTTACTACCCCCTTCTTTATTCTTATTATTATGTTCTTCACTAGTAGAGTTTGGTGCTGGTACCGGGTGAACGGTTTATCCGCCATTAAGCTCAATTGTAGCTCATTCTGGTGGTTCAGTAGATTTAGCTATATTTAGTTTACATCTTGCAGGTATATCATCTCTTCTTGGTGCTATAAATTTTATTACTACAATATTTAATATGAGGGTACCTGGTTTGTCTATGCATAAATTACCTTTATTTGTTTGATCCGTATTGATTACAGCCTTTTTGTTGTTATTTTCTTTACCTGTATTGGCTGGTGCTATTACTATGCTTTTAACAGATAGAAATTTTAATACTAGCTTTTTTGACCCATCAGGGGGCGGTGATCCTATTCTTTATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGCCATCCGGAAGTTTACATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATAGTTAGCCAAATTATTGGAACTTTTTCTAATAAGTCTATTTTTGGGTATATAGGTATGGTGTATGCTATGTTATCTATTGCAGTTTTGGGTTTTATTGTTTGAGCTCACCATATGTATACTGTTGGGCTAGATGTTGATACTAGAGCTTATTTTACTGCTGCAACTATGATGATCGCTGTTCCGACTGGTATAAAGATTTTTAGTTGGATTGCTACATTATGGGGGGGTCAAATAGTTAGAAAGACACCTTTACTTTTTGTTATAGGTTTCTTAATATTATTTACCTTAGGTGGATTGACCGGAATTGTTTTATCTAATGCCGGGCTTGATATAATGTTACATGATACTTATTACGTTGTTGCACATTTTCACTATGTTTTATCTATGGGTGCTGTTTTTGCCTTTTTTGCTGGATTTTATTATTGATTTTGAAAAATTTCTGGCTACACTTATAATGAGATGTACGGTAATGTTCATTTTTGGTTAATGTTTATTGGCGTTAATTTAACATTTTTTCCAATGCATTTTGTTGGTTTAGCAGGCATGCCGAGAAGGATCCCCGACTACCCTGATAATTATTATTATTGAAATATATTATCTTCTTTCGGTTCTATTATATCTTCGGTAAGTGTTATAGTATTTTTTTATTTAATATATTTAGCTTTTAATAACAATAATACACCTAAGCTGGTAAAATCTATCCATTCTATCTTTTCACCATATATTAGCTCCCTTACTCAACGTTTTTTAGCTGTTCCTTCGATTAAATCAGTATCTGATTCCTCATTCTTTAAGTTTAAGACATTTTTTGCATTTTTTATAGTTATTTTATTTGTTTTTTTTGCTTTTTATGATTCTTTACTGTGTTTAAACGATCATACTAACTCTTGAAAAATCGGTTTTCAAGATCCTACAACCCCCATTGCTTACGGTATTATAAAACTTCACGATCATATACTTTTTTTTTTAGCTGTTATACTATTTGTAGTTGGTTATCTTTTATTTTCAACTTATAGAAAATTCTATTACGGTGCGTTAAATAATGACCTTCCAGAATCGAAAAATATCTCTTTGTTTACCACATTAATAAATACTTATAAAGATAATTTATCCTTTAACGTTGTTAATAGAACATATAATATAAACCACGGTACAACTATAGAAATAATTTGAACTATTTTACCAGCTTTTATACTTTTATTTATTGCTGTTCCTTCTTTTGCGTTACTTTACGCTATGGATGAAATTATTGATCCCGTATTAACTGTTAAGGTAATAGGTCATCAATGGTATTGGAGTTACGAATATTCGGATTATTCTGTAGTTTATTCTAATAAATTATTTGATTATGATTCTATTGACCGTTTTGCTGCTATGGAGATGATGTACAAGGATATGGGTTACTTAAAAGATCGTTCTTTATTAAGTTACTTATATATACCTATGGTAATTCCAGAAACAACTATTAAATTTGATAGTTATATGATACACGAGGCTGAGTTAAATCTAGGTGATTTACGATTATTAAAAACTGATATGCCTTTGTTTTTACCAAAAAATACACATATTAGGCTTTTAATTACTTCTTCTGATGTTTTACATAGCTGGGCTGTTCCTTCTTTTGGTGTTAAAGTCGATGCTGTTCCTGGAAGATTAAATCAAACTTCTTTATATTTAAAAAATACAGGTACTTTTTATGGTCAATGTAGCGAACTTTGTGGTGTTAATCACGCATTTATGCCTATAGAAGTTTATGTGGTTAATCCTATTTATTTTTACAACTACGTCTATATTTATTTTAAAAATTTTAATTTAATATAA
PROTEIN sequence
Length: 889
MLFKLVNAINYEVLMMINRLLNNLTSFFTDNRWLFSTNHKDIGTLYLIFGGFSGIIGTIFSMIIRLELAAPGSQILGGNSQLYNVIITAHAFVMIFFFVMPVMIGGFGN*FVPLMIGAPDMAFPRLNNISFWLLPPSLFLLLCSSLVEFGAGTG*TVYPPLSSIVAHSGGSVDLAIFSLHLAGISSLLGAINFITTIFNMRVPGLSMHKLPLFV*SVLITAFLLLFSLPVLAGAITMLLTDRNFNTSFFDPSGGGDPILYQHLFWFFGHPEVYILILPAFGIVSQIIGTFSNKSIFGYIGMVYAMLSIAVLGFIV*AHHMYTVGLDVDTRAYFTAATMMIAVPTGIKIFSWIATLWGGQIVRKTPLLFVIGFLILFTLGGLTGIVLSNAGLDIMLHDTYYVVAHFHYVLSMGAVFAFFAGFYY*F*KISGYTYNEMYGNVHFWLMFIGVNLTFFPMHFVGLAGMPRRIPDYPDNYYY*NILSSFGSIISSVSVIVFFYLIYLAFNNNNTPKLVKSIHSIFSPYISSLTQRFLAVPSIKSVSDSSFFKFKTFFAFFIVILFVFFAFYDSLLCLNDHTNS*KIGFQDPTTPIAYGIIKLHDHILFFLAVILFVVGYLLFSTYRKFYYGALNNDLPESKNISLFTTLINTYKDNLSFNVVNRTYNINHGTTIEII*TILPAFILLFIAVPSFALLYAMDEIIDPVLTVKVIGHQWYWSYEYSDYSVVYSNKLFDYDSIDRFAAMEMMYKDMGYLKDRSLLSYLYIPMVIPETTIKFDSYMIHEAELNLGDLRLLKTDMPLFLPKNTHIRLLITSSDVLHSWAVPSFGVKVDAVPGRLNQTSLYLKNTGTFYGQCSELCGVNHAFMPIEVYVVNPIYFYNYVYIYFKNFNLI*