ggKbase home page

scnpilot_solids1_trim150_scaffold_1613_10

Organism: SCNPILOT_SOLID_1_TRIM150_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 53 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 19 / 38 MC: 16
Location: 10854..14873

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Putative ATP-dependent RNA helicase D1133L; EC=3.6.4.13;; TaxID=561445 species="Viruses; dsDNA viruses, no RNA stage; Asfarviridae; Asfivirus.;" source="African swine fever virus (isolate Pig/Kenya/KEN-50/1950) (ASFV).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 31.1
  • Coverage: 511.0
  • Bit_score: 213
  • Evalue 1.40e-51
Putative ATP-dependent RNA helicase D1133L n=1 Tax=African swine fever virus (isolate Pig/Kenya/KEN-50/1950) RepID=VF113_ASFK5 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 31.1
  • Coverage: 511.0
  • Bit_score: 213
  • Evalue 9.80e-52

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

African swine fever virus → Asfivirus → Viruses

Sequences

DNA sequence
Length: 4020
TTGTATTTAGGCGAAGTTGATGTTATTGATAAACCTATGTATGGATTTGGTAAGTTAAAATCAGAACGTGTAAAATCAGCATATGAATTAATACGCGCATGCGCTGTTAAAACATACAATGTTAATAACGGGGTGTTGTTATTAGATACAAGCTTAAGCGTTGGTAAAGCAAAAAGTTATTCTATAGTTTCAATAACTCCCAAAGCCGCTTGTTGGTTGCTGCGTAGTGTTGGATTAATGTGTATAGAACATGGTCAATTAATATCCATTAAGTGTAACCAATCGGCGTTATTATGTGATGTATTTAGCGATTCCCCTAAATATACATTTGAATCAATAGGTTGCGGGTTTAGTATTACCGCTTTAGGGCAAGGAACTTACTACGGGGTTACATTACAAGGTGATTCATGTGATGATTTACACAATGATTTACACAATGATTTACACAACGATTTACACAACGATTTACACAACGCACTAAGTGCCCGATTTCTATTAAGTGATTTTATCGTTTCACATAATACAATTACAGCTATATCAATCGCAATGAATTTTATTAATGTTTACCGAGAACAGTATCAAAAGTTGGCGCTTAAGGCCACTTCCCGTCGGCAACTATATGAGATAGATAAAGCCACTCCAAATGTATTCATATTGGGATTCGCCGGCACAAAAGCTGCTTTCATTCGCGACTTGTTGAAATATCCAGAATTCGGATTTATAACCCATAAGGAACGCGAGGAACTAAATAAATTACAAACAGCAGCATTATCTCACCGTCCTGAGGATATCAAAATCTACAAAGATGCCCTAATAAGATATAAAAAACGTATAACTAATAAAGCAAAAGGAGGTTTCTTTAGATTCTATGGATATAAAGAGTTTGTAAATAAGTTATTTAGTGATGCTACAACCGGCTCAAATGTCAACTTGACAGATCTTGATCATAAGTTTAAAGCCTCATTAGACAGAGGCGAAAAGATTACATATGAGGAGATTATAGGAAAAGAAATAACGGCTGGTAGATTACGTGTCAATCTCACTCTTTTGTCGCAATTTGAGAATTCTTTGATAATTTGTGACGAAATACATAATACTTACAACACCACATCAAAGAATAACTACGGTGCCGCTTTACAATTTGTATTAGATAGTATACAAAAATTACATGCTGTGTTTATGTCGGCAACGGCTATTAATACATCACCGGAAATTGTAGAAGTTATTAATTATCTAGTGCCAGTTGAACTAAAAGTCACACGTAAGGAGCTTTTTACTCCTGATAAGGAATTACTACCAGGCGCTATCAGTAAAATAGGTGATTTATTAATGGGTAGAATAAGTTTTGTCCAAGATCTCAGCCCAAAGTATTTCCCTAAACGTGAGATGATTGGCGAAACTGTAGTATTACCTGAGCTTGGAGAAATAAAATATTTAAAGATTATACGTTGTGGAATGAGCCAGGTGCACCAAAAAACTCTTAATGATTATGTTAATAAAGCACGCGGCGGCCAAATACCTAATTTAGAATCATTAATTGAACCATTAGATGAATCAGCGACACCAACTATACCAACCACAAATAGTAACACTGATGATGAAACATTAATCGAAGAAGAAGATGACGAATTAATTGTTGTTCGTAATACACCTTATAGTTACCATTTGATTCCTCCTGATGGTATAACCATCTATGACATGGTATTACCTGATCCTTCCAATCCTGACATCGGAATCTTTAAAAGCAGTGACGCGCGTAGTTTAATTCGTTCTGATAATGGCGATATTGATAACGAAAAGAGTAAACCAACCAGTGACTTAATTCGTAGTAAAAAGTTCAGTAATGCTAATAATGTCTACGTTGGTGATTTTCTACATGAGGATATTCTAATCAAATATTCAACTAAGTATGTTGAATTACTACGTTTGATAAGGGAGATCATGACGCGGGCTAAAGGTGACAAAGCCGCCGGTGCAAAGATAATGATTTACCACGAAAGAGTGAAGATGAGTGGTGTATTGATGATACAGGAGATATTGAAAGCAAATGGGGTATTGGATGAATCTAGTGAACCGGTTGAAAATACCCTTTGTTGTATTTGCGGTCAAAGATTCGATCAACATTCAACCGATAACACCATAAAGAAACAAAAAAGAACCAATGTGGATGCTGCTAATGAGTCCTTGGGCGACATCATGCCACATCAGTTCTATCCAGCAAGGTTTGTAATGGCGCACAGCGACCTTGAAAAGAATGTCATGGACGCGAGTTTAGCCAAATATAACGCAAGCAATAATGCCAATGGTTTGTATTTTAATATCCTAGTAGGTAGTAAAATTATTAAAGAATCATATGATTTTAAAGCAATTCAGCATCTTATTATTACCTCAATACCTAGCAAGATTCCGATTTTAATGCAGATTATTGGCCGAGCTGTCCGTAATTATAGTCATATTGATTTACCTCGTGATAAATGGAATGTATCAGTTTATATGCTTGCAAGTAGCGTATCTACTGAGTATGAACACTTGGAACTGATATCACCAGAATTATATCGTTACTTTGATAAAATTAAAGATTATCAACAAGTGCAATTAATAGAACAAGAAAACTATTCACGTTCAATTGACGTTGATATTAACTATGAAACTGTATCTAAGGGTGGTTTTGTTGATTTGGGTGTCTTGGAATACACCCCTAGGTATACGACAAAACCTACTGAAGCGTCAAAATTAAATTACAATACTTATTATGCTTATGGGTATGCTTACAAGGAACTATTGGATACATGCGCTAATATCAAACGTTTGTTTTATTTAAAACCAGTATACACATTCGATGAGCTTATGGAAGGTGTTCAAAACCCACCATTTAGTGTTGAAGTTAATCCTGCGCTAACTAACCCAGGAACCTTTGCGGCCGCGCTTCACCACCTATTACATACTTCAGATGACACTACAATCAATTATGTTGATGCTGTGATGGGCATGCAAGGTAGTTATCCATGGGAACGTATAGTCGATTATAATGATAAAACATTAGTTATTGATGGTATTGAATATAAGATTTGCAAATCAGGTGATTATTATATGTTGTTTCCGCATATTAATATGTTTACTAGTCCTTTTAGTAAAGTGCAATATGAATACAGCGAGAAAGGATTCTACAAGTCAATAGCTCAAGCCAATACAGCCGGAAATGAGGTTTATGCCGATATAGATACGTGGATCATGCAAACACATGTTAATAATACACATGGTGTAATGATTAATCTATCTACTTACATGGATAATAAAATAGCGACTATGGGTAGACTAAGGGCCAAGTTTGAATCACGTAGTGCAGAACAATATCGTGAATTCTTAGAATACCCAGAATGGTTCCAGTTGTATTATCTTGATGCCGTTATTGAGGACCTATTGACTGTTAAAGATGCTAAAATGAAATTACCACCTGTTACAACAAAACTATTGGAGTTTTTGGCTTCTTTGGATGTATTGATTACAGCCGGTGAAGTTAAAGTATATCGTGATGTTGTCAAAAGCTTTAATAAATTCGATTATGCTGGTAAAGATATTATCGGTTATACATCACGCGATTCTGTGCGACTTCTAGATACGAGTATTATGCGATGGTTCGAAACAAATAAAATCGCCCTAAATAAAAACATAGAATATAAAGATAACTCCCGTGTTGTAGGCTATTTCGAAATGGTTGGTGATAATATGAAGTTTAAGATAAGGAAAACATCAGCAAAAGCAACCACACATGGCGACTTAAGATTCTTGCAAAAGGGTATAGTTTGTAATACTAAAAAGAAGTTCGAATTATTGGAAATATTAGCCGAATTAGGTATTAGTGTGCGAGCAGGTGGGTATCATAAAATGCAGGTTGATCGTATATGTGCAACCATTAAAAACAAACTAATTGATTTAGAGATAAAGGAACGGGGTAAGCAATCTCGCACCAAATATGTGTATTCTTGGTGGGATGTTAAACCCAAATTAAAGTCCGATTAA
PROTEIN sequence
Length: 1340
LYLGEVDVIDKPMYGFGKLKSERVKSAYELIRACAVKTYNVNNGVLLLDTSLSVGKAKSYSIVSITPKAACWLLRSVGLMCIEHGQLISIKCNQSALLCDVFSDSPKYTFESIGCGFSITALGQGTYYGVTLQGDSCDDLHNDLHNDLHNDLHNDLHNALSARFLLSDFIVSHNTITAISIAMNFINVYREQYQKLALKATSRRQLYEIDKATPNVFILGFAGTKAAFIRDLLKYPEFGFITHKEREELNKLQTAALSHRPEDIKIYKDALIRYKKRITNKAKGGFFRFYGYKEFVNKLFSDATTGSNVNLTDLDHKFKASLDRGEKITYEEIIGKEITAGRLRVNLTLLSQFENSLIICDEIHNTYNTTSKNNYGAALQFVLDSIQKLHAVFMSATAINTSPEIVEVINYLVPVELKVTRKELFTPDKELLPGAISKIGDLLMGRISFVQDLSPKYFPKREMIGETVVLPELGEIKYLKIIRCGMSQVHQKTLNDYVNKARGGQIPNLESLIEPLDESATPTIPTTNSNTDDETLIEEEDDELIVVRNTPYSYHLIPPDGITIYDMVLPDPSNPDIGIFKSSDARSLIRSDNGDIDNEKSKPTSDLIRSKKFSNANNVYVGDFLHEDILIKYSTKYVELLRLIREIMTRAKGDKAAGAKIMIYHERVKMSGVLMIQEILKANGVLDESSEPVENTLCCICGQRFDQHSTDNTIKKQKRTNVDAANESLGDIMPHQFYPARFVMAHSDLEKNVMDASLAKYNASNNANGLYFNILVGSKIIKESYDFKAIQHLIITSIPSKIPILMQIIGRAVRNYSHIDLPRDKWNVSVYMLASSVSTEYEHLELISPELYRYFDKIKDYQQVQLIEQENYSRSIDVDINYETVSKGGFVDLGVLEYTPRYTTKPTEASKLNYNTYYAYGYAYKELLDTCANIKRLFYLKPVYTFDELMEGVQNPPFSVEVNPALTNPGTFAAALHHLLHTSDDTTINYVDAVMGMQGSYPWERIVDYNDKTLVIDGIEYKICKSGDYYMLFPHINMFTSPFSKVQYEYSEKGFYKSIAQANTAGNEVYADIDTWIMQTHVNNTHGVMINLSTYMDNKIATMGRLRAKFESRSAEQYREFLEYPEWFQLYYLDAVIEDLLTVKDAKMKLPPVTTKLLEFLASLDVLITAGEVKVYRDVVKSFNKFDYAGKDIIGYTSRDSVRLLDTSIMRWFETNKIALNKNIEYKDNSRVVGYFEMVGDNMKFKIRKTSAKATTHGDLRFLQKGIVCNTKKKFELLEILAELGISVRAGGYHKMQVDRICATIKNKLIDLEIKERGKQSRTKYVYSWWDVKPKLKSD*