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scnpilot_solids1_trim150_scaffold_1509_1

Organism: SCNPILOT_SOLID_1_TRIM150_Sphingobacteriales_40_703

near complete RP 49 / 55 MC: 2 BSCG 49 / 51 MC: 1 ASCG 12 / 38
Location: 1..3429

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-dependent receptor plug n=1 Tax=Sphingobacterium sp. (strain 21) RepID=F4C1Y6_SPHS2 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 48.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1085
  • Evalue 0.0
  • rbh
Contig79, whole genome shotgun sequence {ECO:0000313|EMBL:KIO75884.1}; TaxID=1503925 species="Bacteria; Bacteroidetes; Sphingobacteriia; Sphingobacteriales; Sphingobacteriaceae; Pedobacter.;" source="Pedobacter sp. NL19.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 52.3
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1104
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor plug similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 48.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1085
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Pedobacter sp. NL19 → Pedobacter → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3429
CGCATTACCCTTAACCTGAAAGATGTCAGTATAACCCGTGTTTTTTCTGTGATACAGGAGAAGACGGATTATAAGTTTCTGTATAATAATGAGGATGTGCAGAATATTCCTTTAATAAGTATATCTGTGCGAGATGCTACCATCTCTCAGACTCTCGAAGAATGCTTTAAAAGTTTCCCCTTAATGTATCGCTTTGAGAACAAAACAATTATTATTTATAAAGTGCATAATGAAAATTTAAATTTATTAAAAAAGGTTTATAGAGAAGAAATAAAATACAGAGATTTAAGACCTCAATTTGAGATTAGCGGTAAAGTTGTGGATCATTCCGGGAAGCCGCTGGCGGGTGTTAGTGTTACCTTGCAAGGTAGCCCCAGTATAGGAACCACCACTGATCAAAATGGAAATTATACGCTTTCATTAGAAAAGGGAACAGGTACGCTGATCTTTACATCAGTCGGATTTTCTGATCAGGAGGTACAAATAAATGGCCAGCATACAATTAATGTTTCTTTAGAGGTTTCGATTTCATCTCTGAACCAAGTTGTCGTAATTGGATATGGAACCCAGGCTAAGAAAGATTTGACAGGGGCAATTTCCGTTGTTGATGTTAATAGTGTAAAAGCACAACCAGCATCCAGCGTTACTGAGGCTTTACAAGGTAAGGCTGCCGGAGTTAATATAATTAACGATGGGTCTCCCGGATCTACACCTTTAATAAGAATTAGGGGCTACAGTACAATAAATAATAATGATCCCTTGTACATAATAGATGGAGTACCTTATGAAGGAAATTTGAATTGGCTAAACCAGGATGATATTCAATCCATTCAAGTTTTGAAGGATGCATCTTCAGCATCAATTTATGGTTCAAGAGCCAACAATGGAGTAGTAATTATTACGACCAAGAAGGGTAAAGAGGGACCGATACAAGTAACATTAAATTCATATTACGGTAGTTCAGTTCCGATAAGATCGAGATTTCCTAAATTCTTAACGCCGACCCAATATGCTGAATATTTATTTAGATCGTACCAGAATGCGAATCTAAATCCGGGGCAGTCAATTGGGATTATGTATGGAACAGGATCAACACCCCAACTTCCTGAATATTTAATTGCAGGAAACGCTGCAGGTATGAATGTGACTTCCGCTGATGCTGATCCCTCAAAGTATAACCATGATCCTAAAAATTTCTATCAGATAACTAAAGCCAACCCCAATGGAACAGATTGGATGCGGGAAATTACACGTGATGCGCCAGTCCAAAATTATCAATTGGGATTATCTGGTGGGGGAAAGAATTCAGTGTACTCCCTTTCTTTTGGTTATCTGGATCAGCAGGGTATTGTACGCTATACTAGTTTTAGAAGATACAATGTGCGGTCCAATATGGAATTTCATATATTAAAAAATCATTTAACTGTTGGAGAAAATATTTTATTTAGCCGTACTGAGGGGATAGGATATTCTACCAATGTTGGTACTGCCGGAGCATATCAAACTAAATATGACCCTGTGGCGGATGTTTATAAGATCCAACCTATTATCCCGGTATATGATATTGCGGGAAATTTTGCTGGTGCCAGAGGTCCCACCCTTGGTGATGCCAAGAATCCTTTAGCATTGCTTTATAGAGGCAAGGACAATTATACTTGGGAAAATGCAACTTTTGGCAATGTATATGCTGAAACTGAAATAAAGGGGGTTAAATTAAGAACCAGTTTCGGATCAAACCTAACAAATTATAATAGCCAGATAATTAGCTATCCTGCTATGGAAGATGCTGTTAGTATTCCTACAAATGGTTATAGCGCTACTCAAGGATATGGTATCCAGTGGACATGGACAAATACCCTTAACTATCACCATGTTTTTAATGATGTTCATTTATTTAATTTATTACTTGGAACAGAATCTAACCGCGAATCAGATAGACGATTGACAGGTTCAAGAAATGGTTATTTCTTACTGGGCGATCAGAATTATTATTATTTAAGCACAGGTTCTAATACAATTCAAAATTCAGAAGTTGGTAATTTAAATTCGCTTTTTTCAATTTTCGCGCGAGTAGATTATTCATTTAAAAACAGATATTTATTTAGTGGGACAATACGAAGGGACGGCTCATCAAAATTTGGACCTTTAAACAGATATGGGGTTTTCCCAGCCTTTAGTGCAGCATGGAGAGTGTCTAATGAATCCTTTATGAAAAGCATAAGCTGGTTGAACGATTTAAAATTGCGAATCGGTTATGGGGAAACAGGGAATCAGAATATCCCCTCTAATAATGCATTTGATCTCTTTACTCCGGTGATAGCTTCTGGCTCATATCCTATGAATCAGACAGGTTCCCTGACTCCGGGAATTAGTCAAAGTCAGTTTGGAAATGCTTCAATAGAATGGGAAAGACTAAAATCGGGAAATGTTGGGATCGATTTCACTGTTCTCAACGGGGCAATAGATGGATCTCTCGATTTATACAAACGAGTTACATCGGGAATGCTTTTCCCTGTTCCTCTTCCTTCACAAACAGTTGGGATGGCCAATAGCCCTTTCCAGAATGTTGGTTCTATGGAAAATAAGGGAATTGAGGTTTCGGTGAATTATCATCATACGCCGTCAACAGCAAAAGGGAATATTTTCAAGTGGGATTTAGGTTTGACAGTAGCTCATAATTCTAATATGATTAGAAGTCTTGCTCCTGGGGTAACACATACCATATATGGGACGGACGAACTTACTACGACTATTCTTGAAGTGGGTAAACCCTATGGAGAATTTTATGGCTATAAACAAGATGGGATTTTTCAAAATAGCCAGGAAGCGGCTTCAAGTACCCAACCTGGTGCGAGAGTCGGAGGCATGAAGTATGCACTGATAAATAATCATACAGCCTTCTCTCCGGATGATCGAACATATTTAGGTAGCCCGTTACCAAAGGTGACTTATGGAATTAATTGGACTGGTGAATACAAAGGGTTTGATGTTATACTCTTTTTCTACGGCAGCCAGGGGAATAAGAACTATAATGAGACAAAATTATTTACTGATTTTCAAGAATTCCCATCCGCAGCAAGTGCAAGATTGTTGAACGCTTGGTCACCATCGAATGTGAACTCGTTAATTCCGTCTGCTTCAGTACTTGCAACTCCTTTAGAATACCAGTCTTCATCGTATTACGTAGAAAATGGTTCTTATTTTAGATTAAAGAATTTGCAAATCGGATATACTTTTTCCAGGATTTTGAATGAGATCTCAAGTTTAAGAATTTATGGTTCAGTTACTAATCTGTTTACAATTACAAAATATTCGGGAATGGATCCTGAAGTAACTCAATTTATATCAACAGTCCAGCTTCCTGGTGTTGACCTTGGTGTATATCCAATTTCCCGTCAATATATTTTGGGTGTAAATATTAAGTTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1143
RITLNLKDVSITRVFSVIQEKTDYKFLYNNEDVQNIPLISISVRDATISQTLEECFKSFPLMYRFENKTIIIYKVHNENLNLLKKVYREEIKYRDLRPQFEISGKVVDHSGKPLAGVSVTLQGSPSIGTTTDQNGNYTLSLEKGTGTLIFTSVGFSDQEVQINGQHTINVSLEVSISSLNQVVVIGYGTQAKKDLTGAISVVDVNSVKAQPASSVTEALQGKAAGVNIINDGSPGSTPLIRIRGYSTINNNDPLYIIDGVPYEGNLNWLNQDDIQSIQVLKDASSASIYGSRANNGVVIITTKKGKEGPIQVTLNSYYGSSVPIRSRFPKFLTPTQYAEYLFRSYQNANLNPGQSIGIMYGTGSTPQLPEYLIAGNAAGMNVTSADADPSKYNHDPKNFYQITKANPNGTDWMREITRDAPVQNYQLGLSGGGKNSVYSLSFGYLDQQGIVRYTSFRRYNVRSNMEFHILKNHLTVGENILFSRTEGIGYSTNVGTAGAYQTKYDPVADVYKIQPIIPVYDIAGNFAGARGPTLGDAKNPLALLYRGKDNYTWENATFGNVYAETEIKGVKLRTSFGSNLTNYNSQIISYPAMEDAVSIPTNGYSATQGYGIQWTWTNTLNYHHVFNDVHLFNLLLGTESNRESDRRLTGSRNGYFLLGDQNYYYLSTGSNTIQNSEVGNLNSLFSIFARVDYSFKNRYLFSGTIRRDGSSKFGPLNRYGVFPAFSAAWRVSNESFMKSISWLNDLKLRIGYGETGNQNIPSNNAFDLFTPVIASGSYPMNQTGSLTPGISQSQFGNASIEWERLKSGNVGIDFTVLNGAIDGSLDLYKRVTSGMLFPVPLPSQTVGMANSPFQNVGSMENKGIEVSVNYHHTPSTAKGNIFKWDLGLTVAHNSNMIRSLAPGVTHTIYGTDELTTTILEVGKPYGEFYGYKQDGIFQNSQEAASSTQPGARVGGMKYALINNHTAFSPDDRTYLGSPLPKVTYGINWTGEYKGFDVILFFYGSQGNKNYNETKLFTDFQEFPSAASARLLNAWSPSNVNSLIPSASVLATPLEYQSSSYYVENGSYFRLKNLQIGYTFSRILNEISSLRIYGSVTNLFTITKYSGMDPEVTQFISTVQLPGVDLGVYPISRQYILGVNIKF*