ggKbase home page

SCNpilot_solid_1_scaffold_34_123

Organism: SCNPILOT_SOLID_1_Sphingobacteriales_41_19

near complete RP 53 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38
Location: 153786..157124

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-dependent receptor n=1 Tax=Pedobacter heparinus (strain ATCC 13125 / DSM 2366 / NCIB 9290) RepID=C6XTJ2_PEDHD similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 52.3
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1134
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 52.3
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1134
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor {ECO:0000313|EMBL:ACU05770.1}; TaxID=485917 species="Bacteria; Bacteroidetes; Sphingobacteriia; Sphingobacteriales; Sphingobacteriaceae; Pedobacter.;" source="Pedobacter hepari similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 52.3
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1134
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Pedobacter heparinus → Pedobacter → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3339
TTGATAAATAGTAAAATTAGATTTGAAACTGGAATTAACCATCCCGCTTGTGTTATGAATAGAAAACATTTTACAGATCATTCTGATTTCTTTAAACTGCCAAAAACTACGATTATGATTCGACAACTCCGAGAAAAGTTTCAATTACAGCATTCGCTGAAAAATTTTGCAGGAAAGATGTTCTCAATATTGATGGTTTTGCTTTTTAGCGTAGGATTTGCTCAAGGGCAAAATGCTGTTACAGGGAAAATAACAAATGAAAGAGGGGAGCCTTTGGCTGGAGCCAGCGTAAAAATTAAAAACTCCAACAGCGGCACTACAACAAATGAAGAAGGGTTGTTTAGCATTAATGTTGCTAATCTTAATATAACGCTCATTGTTAGTTCAGTTGGATTTCAAACAAGAGATATTCCTTTAAATGGCAAATCAAATATTGATATATCCCTGGAAGGTGGAGTTGATCCACTCTCTGAAGTTGTTGTTGTTGGGTTTGGGTCTCAGCAGCGCAGGAGTGAAATAACTACTGCCGTTTCAAAACTTGATAATAAAGTGCTGGAAAATATTCCTTACTCAAATGCTGCGGCTGCATTGCAGGGTACGCTGGCAGGGGTGCGTGTACAAACCAATTCAGGGCAACCCGGTGCAGCACCTAATATTATCGTTAGAGGCGGAACTTCCATAAATAGTCCAAATAGTTCGCCACCAATTTACATTATTGACGGAGTGTTGCGGGGTAATATGGATGATATCAGTGCACACGATATTAAATCTATACAGGTATTAAAGGATGCTGCGGCAACTGCAATTTATGGAGCGCAGGGGTCTAACGGCGTGGTAATTGTAGAAACAAAATCTGGTCAGTCGGGCAAAACGCAGGTTAATTATAAGTTTGATTTGGTGAGGTCTGAGGTTGCCAAAACTTATGATATTCTTACGGGAAAAGATGAAGCTTATTTTTCCCGCCTGGGTATATTAGCAACCGGGGGAATAAATCCCGCGTTTCTCGCACAATTAGATGGAAGCACCTACCTGGGGGGAGCTGGTAATGATCTTACCAATAAAACAACGGGTTCATTACAATATCTTACACCGGAGAACCAGTATAAGCTCAACGAAGGCTGGGAAAGTATTCCTGACCCCGCAGACCCGTCAAGAACTTTAATATTTAACAGTGTAGACTGGCAAAGTATGCTTTTTAGAAAGTCGCTTTCCCAAAATCATGCAATTTCAGTTTCAGGTGGAACTCAAAAGGCGAGATTTTATTTAGGTTTAGGATACCTGGATAGTAAAGGAATTGCTATACAAACAGATTACAAGCGGTTTACAATGAACCTTAATGGAGAGCTTAATATTAATGACAGAATAAAGATTTTCTCCAGAGTAATGTACTCTAATACAAGGAATACACAGGTGCCGACAACAGATATTTTTAAATCTTCCCTCATTGCGCCTGCAACCGATAAGCTATATTTTGAAGATGGAACCCTCTCCCCTGGACGTAGTTTAGGATATTCCAATCCATTTTATAGATCATCGGTTTATCATCCAAAAAATATCGCAAATGACCTGACCCTGATTGCGGGTGGTGAAGCTGAAATTATTGCAGGTTTGACTTTTAGTCCTCAGGTTTCCGTGCAATATAGAGGAGGTTACTCCAGGAATTTTTTACGGACCTACTTGAATGGACCAAGTACACTTGTAACCTCACGCACGGCTACCGGTTCATATGCAGAGAACTTTCGGCCACAGGTGAATGCTGTATTAAACTACGGTAAAGTATTTAACAATGATCACGATTTTGAGATAAAAGCAGGCTTGTCGTATTTATGGGCTAATAATATTTCGCTATCGGCTACAGGTCAAAACGCTGCAACCGATATCATCCCAACATTAAATGCTTCTGCAACACCAACAGCAGTTTCCGGTTCAGAAACACAACAGGTGTTGACAGGTTATTTTTCAAGGGCTGCATATAATTATAAAGGCAAGTATCTTTTTAGCGCAAGCTTGAGATATGACGGTGCATCAAACTTAGGCACAGATAATAAGTGGGGTTTCTTTCCTGGTGTATCTGCAGGATGGAATATTGACAGAGAGGATTTCTGGAAATTCTTACCTGCAGGTTTGGTTAAATTGAAATTAAGAGCCAGTTATGGTGTAACAGGTAATATTAGCGGATTGGGATTGTACCAGGCGCAGGGAGAATATAATGCTTCTTCGAGATATTATGGTTCTTCAGGTATTATGATATCAACTTTGCCGAATCAGAATTTAAAGTGGGAGCAATCAAAGACACTTGACATTGGAGCAGATTTGGGATTATTCGACAATAGAGTGAGTGTTATTTTTGATTACTACAGACGAGTTACTGAAAACCTTCTAACCTCTTTAACACTGCCTCCTTCAACAGGATTTCCCAGCATATTAACAAATTACGGATCTCTTGAAAACAAGGGGTATGAGATAGAATTGTCTGCCAGAGTATTATCTCCTGAATCTCCAGTTCAATGGAATATTGCGTTTAATACTGCGAAGGTTAATAGTAAAATTATGAAGTTGCCCGAAAACGGAATTGAGAATAACAGGGTAGGCGGCGTATATGTATATGATCCTGCCAGGGGAAGTTATGCATGGCTCGGTGGTTTGCAGGAAGGGCAAAGGATCGGGGACCAATATGCATATCAGCAGGTAAGCGTTTATTCAACCAATGCTGAAGCCGCAAAAGCACCTATTGATATGTTGCTACCCAGTGCAAGTAAGATGAAGTATGGCGGAGATGTAAATTGGATGGACGTTGACCGTAATGATACTATAGATACGAGGGATCGTATTTACATGGGAAATGTTATTCCACGAATAACAGGCGGTTTTACAAATACTGTTAATTATAAGGGACTGAGTCTAACAGTCAGAATGGATTATACATTGGGTGCAACCATTTATAATGAAACAGCTGCAAGGCTGGAAGGAAATTTTTCGGGGGCAAATGCGATAAGTGGGCATATGCTAAGATCCTGGCAGAAGGAAGGAGATGTTACGGATGTGCCCAGGTATTATTGGGCCGATCAGAATGCACAATGGAATGTGTGGAATAATAGAGGAAGTTCCCGGTTTTATCAAAGTACAGATTTCTTATGTTTAAGAGAAGTGACGCTTGCATACAGGTTGCCGCAAAGTCTGCTGAAACAGATAAAAATTTCTGATATCACATTAAATCTCACAGGAAGTAATTTGAAGTATTTTACGAATTACGAAGGGTTGAGTCCTGAACAAACAAATACAGAAACCGCGTATCCTAACCCAAGATCATTCATTTTCGGAGCTTCAATTACTTTCTAA
PROTEIN sequence
Length: 1113
LINSKIRFETGINHPACVMNRKHFTDHSDFFKLPKTTIMIRQLREKFQLQHSLKNFAGKMFSILMVLLFSVGFAQGQNAVTGKITNERGEPLAGASVKIKNSNSGTTTNEEGLFSINVANLNITLIVSSVGFQTRDIPLNGKSNIDISLEGGVDPLSEVVVVGFGSQQRRSEITTAVSKLDNKVLENIPYSNAAAALQGTLAGVRVQTNSGQPGAAPNIIVRGGTSINSPNSSPPIYIIDGVLRGNMDDISAHDIKSIQVLKDAAATAIYGAQGSNGVVIVETKSGQSGKTQVNYKFDLVRSEVAKTYDILTGKDEAYFSRLGILATGGINPAFLAQLDGSTYLGGAGNDLTNKTTGSLQYLTPENQYKLNEGWESIPDPADPSRTLIFNSVDWQSMLFRKSLSQNHAISVSGGTQKARFYLGLGYLDSKGIAIQTDYKRFTMNLNGELNINDRIKIFSRVMYSNTRNTQVPTTDIFKSSLIAPATDKLYFEDGTLSPGRSLGYSNPFYRSSVYHPKNIANDLTLIAGGEAEIIAGLTFSPQVSVQYRGGYSRNFLRTYLNGPSTLVTSRTATGSYAENFRPQVNAVLNYGKVFNNDHDFEIKAGLSYLWANNISLSATGQNAATDIIPTLNASATPTAVSGSETQQVLTGYFSRAAYNYKGKYLFSASLRYDGASNLGTDNKWGFFPGVSAGWNIDREDFWKFLPAGLVKLKLRASYGVTGNISGLGLYQAQGEYNASSRYYGSSGIMISTLPNQNLKWEQSKTLDIGADLGLFDNRVSVIFDYYRRVTENLLTSLTLPPSTGFPSILTNYGSLENKGYEIELSARVLSPESPVQWNIAFNTAKVNSKIMKLPENGIENNRVGGVYVYDPARGSYAWLGGLQEGQRIGDQYAYQQVSVYSTNAEAAKAPIDMLLPSASKMKYGGDVNWMDVDRNDTIDTRDRIYMGNVIPRITGGFTNTVNYKGLSLTVRMDYTLGATIYNETAARLEGNFSGANAISGHMLRSWQKEGDVTDVPRYYWADQNAQWNVWNNRGSSRFYQSTDFLCLREVTLAYRLPQSLLKQIKISDITLNLTGSNLKYFTNYEGLSPEQTNTETAYPNPRSFIFGASITF*