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SCN18_31_3_15_R4_B_scaffold_836_8

Organism: SCN18_31_3_15_R4_B_SCNpilot_BF_INOC_Flavobacterium_39_30_40_63

near complete RP 50 / 55 BSCG 50 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: 10527..14108

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
PKD domain containing protein n=1 Tax=Flavobacterium johnsoniae (strain ATCC 17061 / DSM 2064 / UW101) RepID=A5FMD4_FLAJ1 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 48.1
  • Coverage: 684.0
  • Bit_score: 592
  • Evalue 9.00e-166
PKD domain-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 48.0
  • Coverage: 684.0
  • Bit_score: 592
  • Evalue 2.50e-166
PKD domain containing protein {ECO:0000313|EMBL:ABQ03639.1}; Flags: Precursor;; TaxID=376686 species="Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium.;" source="Flavobacterium johnsoniae (strain ATCC 17061 / DSM 2064 / UW101); (Cytophaga johnsonae).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 48.1
  • Coverage: 684.0
  • Bit_score: 592
  • Evalue 1.30e-165

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

SCNPILOT_SOLID2_TRIM150_Sphingobacteriales_40_586 → SCNPILOT_SOLID2_TRIM150_Sphingobacteriales_40_586 → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3582
ATGGAGATAAAATTAAGAAGTTTAGTTCTAACGGTATTCTTAACACTATGTAGTCTGAATATTTTTGCTCAGGTTTCGGCCGATCAAAGACAGGCGTTAATTGATTTGTATAACAGTACCAATGGAGCTGGCTGGACAAATAAAACGGGTTGGGATGTTAATAATCCTAATGCGGTAGTAACCTCCTGGAATGCAGCGACCCAAACAGGATGGTATGGTGTTACGGTTCACAATGGGAATGTTATCTATATATCGTTAAATAATAATAATCTTGTCGGAAATTTAAATAACAGCCTTAAAAATCTTAAAAATCTATTAACATTAAGCTGTTCAGGCAATAAAATAACGGGAGCAATACCCTCTGGAGTGTTTGAACTGCAATATTTACAGTATTTTAATTTCAATGATAATAATTTAAGCGGTGGGATTTCTCCATTATTTGGAAATTTGACAAATATAATAGAGATAAGATTAAGTAATAATGTAAACTTAGGAGGTACTATCCCTACCGAATTAGGAAATCTAACAAAATTAGATAGGCTTAACTTCGACAATTGTAGTTTAAGTGGAAGCATCCCTGCTTCAATTGGACAGTTGATAAACCTGACAAGTTTGTATGTATACAATAACAATTTAACAGGGCCGATTCCGGCGACATTAGGGAATCTTAAAAAATTAAATATCATTTGGGCCCATAATAATAAATTATCAGAAACAATACCGGCAACTTTATCAGGTCTTAAATCTGTAACTTCGTTTAATCTCCAAAATAATCAATTAACAGGCTCAATTCCTTCTCTTGTTGGAATGGAAAAAATTATAGGGATTGACTTAAGTGTAAATCAGCTTACCGGTAGTATCCCAAGCGAGTTTGGTTATCTAACAACATTACAAAACTTGGCTTTACAAGGAAACCAACTTTCGGGTAATATACCTGCTTCTTTAGGGAATTTATCGGAGTTAGTAGGACTTTCTTTATCTGGAAATAAATTGGAAGGGAGTATTCCGACAAGTTTTCAATCTTTAGCTAAATTAAAGCGACTTTATTTATGGGATAATAAACTTAGTGGAGCGATTCCTAATCTGTCAGGATTAAATAATCTAAGTGAGTTCCTATTTGAAAATAACCGATTTAGATTTGCTGATTTTGAAGCACAGTATGCTTTGTATAAACAAAAAATGGGCACTAGTTTTAGATATGCACCGCAAGCGAAAACAGATGTTGAAGAAACAATTACCAAAACAATTGGAAGTCCGGTAACCTTAAAAATGTATACGGATAATCGTTTTACGCAAACGGAAACGTATCAGTGGTACAAACAGGTTGGTACCGGTGTAGCACAACCAATTGCATTAGCGACAGACCGGACATATACAATAAATAATTTAAGTTCTAACGATCAGGCAGATTATTATTGTGTTGCCAGACACCCGCAAATTACAAATGCTTCAGTAAGTTGGCAAAATCTGATTCTAACCAGGAATCCGATACATTTAAAAGTAACGAATTGTGTTCCTATAAGTGGTGCTATAAGGGTTTTGGAACCTAATACGAATGTCTTATGTGTATCTAACAGGGTATATTTTATATTCGAAACAGGTGTGTCTAATATTGCAAATCATAAATGGACATTTTATGATACGAATGGATCAACTGTCTTGCAAACACAAACTACAGGTACTAATAACATTGCTTCGTTTACTTACAGTTCGGCCGGGGATTACACGGTAAAAGTAGAGGTAACAGATAGTAATGGATGTGTGACTACTTTTACAAAACTGATAAATGTTCGCGAATGTAATTCATGTACAATTAATAATCCGAAATCACAGATAATCAAACAACTTTATATCAATCTGCTGAATCATTTGCTGACCAAAATGATTACTGAAGGTTCCATTCCTAATGGCTATAACCCTCAGGAATTAATTGATTTGGCACCTTATATAACAGACCCTAATCCAAGAATTTATAATGCTTATTTTGAAGGATTATCGCAAAACTTTGGTTTTTCATTTGCAGATCATGGAACTGACTTTCAAAATATAGATGTAATTTTCAGAGACCACAACGGAGTACTTGTAACGGATATGGATATTTCTGTTTTTACTTCTCCTGATGAACCAACTCTTTATCCAACAGTATATGAAAATAATACTACAGAGCTTAAGCATAAGATACATCATATTAACTTCTGTCCAGTAGAAGAGATTCAGTGTGTATCCCATATCGCTATAGTGGTTGATGAGTCGGGATCGATTGACGAAACAGAGGCTAGAAAGATCCGAAAACAGTTAAAATCATTCATTAAGCAGCAGGCAGATATTAATGATAGTGAAAACTATAATATTCACATATCCTTAATCGGTATGTCTGATAATGATGCCGATCTCAGAGCTTCGGAACATATACCGGCAACAAGGGTAACCAACAATTCCGGAGTATTAGGAATGTTCAATCAATGGATTGATGCCTATAGGCTGAGAAGTGGAGCAGGTATCAGTCCGGCATCTGATTACTGGAAGAGCGGGTTAACGGTAGCCCTTAATGCTCCGATGAAACCAAATGCTGTTGTGATGATTACGGATGGCTGTGAAACGGCTAACGTAAACGGATTGGTAAACACAATGAAAAAATTCAGTAATTATAGGGACCCAGCAAATGTTTCACAATCGTTAACGCCGAATGGGCCACATTTATATGTTGTAGGAATAGAAGAAGGGTACTATGTTAATCAAAATACAGTTTCTCCATTCAGTAAAGTTTTACCTCGAAACCAGGATCCGAATTTTGTCCCGGAATTAGCGATAAGTGCTACGATGGCAACAGGTAGGGTGTATTCTACAGCTGCGGTGTCTTTAAGGAATTCGTTACAGTTTTTATTAGGATATCCAACTAATCAATATCCGGAAGCGGATATTAATCATTTTACCAAAGATTATTACGGTCACGCAGATTTCAATTTATTAGCCTCGGATGCACGCTATTTTTCAGATAAACTGGCGGATGGCAATTACATCTGTGGAGAAGCTATTGATAAAAATATTTGTGATGACTGTTTCTCCTTTCAACCGGAACCGGGTAAAGAGTACGTGATAAGTGCCTGGGTTAAAGAGGAAACAAAATTACAGCTTAAAACTTATGAAAATCCAGAGATAAAAATTGTCTACTACAATAACAAAAGAGCGGAAAGTTCTCATATAATCTTAACGGATACCGCGTCACCTTCCGGTGAAATTATTGACGGCTGGCAAAGAATTGTTAAAAGATTCAGAGTGCCGAAAAGCGAAACGGCTCCGTTGAGCAGTACCGTTGTAATTGAGTTTGTATTAGAAAACAAAGGAGGAAGTATGCCGGTATATTTTGATGATGTAAGAATTCATCCGTTGGAAGGTAGTATGAAAGCCTTTGTGTATGATCCGGAAACATTTAAACTGATGTCAGAATTGGATGAAAATAACTATGCTACTTTTTATGAATACGATAATGAAGGCGGACTTGTACGTGTGAAAAAAGAAACGGAAAAAGGTATTAAAACAATACAGGAAACGCGATCCGGAAACATAATCAAAATAAACTGA
PROTEIN sequence
Length: 1194
MEIKLRSLVLTVFLTLCSLNIFAQVSADQRQALIDLYNSTNGAGWTNKTGWDVNNPNAVVTSWNAATQTGWYGVTVHNGNVIYISLNNNNLVGNLNNSLKNLKNLLTLSCSGNKITGAIPSGVFELQYLQYFNFNDNNLSGGISPLFGNLTNIIEIRLSNNVNLGGTIPTELGNLTKLDRLNFDNCSLSGSIPASIGQLINLTSLYVYNNNLTGPIPATLGNLKKLNIIWAHNNKLSETIPATLSGLKSVTSFNLQNNQLTGSIPSLVGMEKIIGIDLSVNQLTGSIPSEFGYLTTLQNLALQGNQLSGNIPASLGNLSELVGLSLSGNKLEGSIPTSFQSLAKLKRLYLWDNKLSGAIPNLSGLNNLSEFLFENNRFRFADFEAQYALYKQKMGTSFRYAPQAKTDVEETITKTIGSPVTLKMYTDNRFTQTETYQWYKQVGTGVAQPIALATDRTYTINNLSSNDQADYYCVARHPQITNASVSWQNLILTRNPIHLKVTNCVPISGAIRVLEPNTNVLCVSNRVYFIFETGVSNIANHKWTFYDTNGSTVLQTQTTGTNNIASFTYSSAGDYTVKVEVTDSNGCVTTFTKLINVRECNSCTINNPKSQIIKQLYINLLNHLLTKMITEGSIPNGYNPQELIDLAPYITDPNPRIYNAYFEGLSQNFGFSFADHGTDFQNIDVIFRDHNGVLVTDMDISVFTSPDEPTLYPTVYENNTTELKHKIHHINFCPVEEIQCVSHIAIVVDESGSIDETEARKIRKQLKSFIKQQADINDSENYNIHISLIGMSDNDADLRASEHIPATRVTNNSGVLGMFNQWIDAYRLRSGAGISPASDYWKSGLTVALNAPMKPNAVVMITDGCETANVNGLVNTMKKFSNYRDPANVSQSLTPNGPHLYVVGIEEGYYVNQNTVSPFSKVLPRNQDPNFVPELAISATMATGRVYSTAAVSLRNSLQFLLGYPTNQYPEADINHFTKDYYGHADFNLLASDARYFSDKLADGNYICGEAIDKNICDDCFSFQPEPGKEYVISAWVKEETKLQLKTYENPEIKIVYYNNKRAESSHIILTDTASPSGEIIDGWQRIVKRFRVPKSETAPLSSTVVIEFVLENKGGSMPVYFDDVRIHPLEGSMKAFVYDPETFKLMSELDENNYATFYEYDNEGGLVRVKKETEKGIKTIQETRSGNIIKIN*