ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

scnpilot_p_inoc_scaffold_144_61

Organism: SCNpilot_P_inoc_Bacteroidetes_37_13

near complete RP 52 / 55 BSCG 50 / 51 ASCG 14 / 38
Location: 53637..57674

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
CzcA family heavy metal efflux pump n=1 Tax=Elizabethkingia meningoseptica ATCC 13253 = NBRC 12535 RepID=R9CHU7_ELIME similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 70.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1862
  • Evalue 0.0
Acriflavine resistance protein B {ECO:0000313|EMBL:KFF00661.1}; TaxID=236814 species="Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Chryseobacterium.;" source="Chryseob similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 70.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1876
  • Evalue 0.0
heavy metal efflux pump similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 70.3
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1855
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Chryseobacterium formosense → Chryseobacterium → Flavobacteriales → Flavobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4038
TTGCTTCCTTTTCTCTATGTACCTTTTGTTATAAGCCCCATAAAAGGAATTGGCACACCTGAGTTATCGCCTGTTTCAACCGGTTTGGGAGAAATTTATCAATATATTCTTCACCCGAAAAAAGGAAGCGAAAATAAGTACAATGCAAAAGACTTGCGCACCATGCAAGATTGGATTGTTGCGCGCCAGCTAAACGGAACAAAAGGAATTGCAGAAGTAAATAGTTTTGGTGGAGAATTAAAGCAATATGAAGTAGCTGTTAATCCAAACCGCCTTAGAGCAATGGGTGTTAGTATCACCGATATTTTTAATGCCTTAGAGCAAAACAATCAAAATACAGGCGGGGCTTATATTGATAAAAAGCCAGATGCACTTTTCATAAGAGGTGTTGGCGTGGTAACATCTTTAAATGATGTGCGAAATATTGCAATTAAAAACGCGAATAGAAGTACACCAATTTTTATTAGAGACGTGGCGGAAGTGCGCTTTGGCAATGCAATGCGCTATGGTGCTCTTACCTATAATGGCGAAGTTGATGCCGTTGGCGGAGTGGTAATGATGCTGAAAGGAGAAAATAGCAATGATGTAGTAAACCGTATTAAGGCTAAAATTCCTGAAATTCAGAAATCTTTACCAAGCGATATTGTAATTGAAGCCTATTTAGATCGCGCTGAATTGGTTTCTCGTGCCATAAAAACGGTAGAAAAAAATTTAATTGAAGGTGCATTGATTGTGATTTTTGTTTTGGTACTTTTCTTAGGAAATTTTAGAGCCGGACTTATTGTAGCATCAGCTATTCCGCTTGCCATGTTATTTGCTTTGGGCATGATGCGTGTATTTGGAGTGAGTGCCAATTTGATGAGTTTAGGTGCCATAGATTTTGGCTTAATTGTAGATGGTGCAGTAATTGTGGTTGAAGCTATATTACACCATTTGGGGCTGCGCAAAACAATGCACAGATTAACACAGCAAGAAATGGATGATGAAGTTTTTTCTGCAGCTTCAAAAATTAGGAAGAGCGCTGCATTTGGAGAAATTATTATTCTCATCGTTTATATCCCTATTTTGTCTTTAGTTGGTATAGAAGGTAAAATGTTTGGACCAATGGCTAAAACGGTGAGTTTTGCCATTTTAGGCGCATTGATTTTGTCGCTCACTTATATTCCAATGATGAGCGCTTTGTTTTTATCAAAGAATGCTTCTTCCAAAGAAACTTTTTCAGATAAGATGGTGGCAAGTATTCAAAAACGCTACCTGCCGCTATTGCAAAAAGCTGTGCAAGCAAAGTATAGCATTGTTGGAATTACAGTTGCTGTTTTTATTGCTTGCATTTTCATTTTTAAAAATTTAGGTGGTGAATTTATACCGCAGTTGCAGGAAGGTGATTTTGCTTTTCACTGTATTTTGCCGCAAGGAAGTTCACTCAATCAAAGTATAGAAACTTCAATGCAAGCTTCAAGAATTATCAAGCAATTTGATGAGGTGAAAATGGTGGTTGGAAAAACCGGCTCAGCAGAAATTCCAGCCGATCCAATGCCGTTTGAAGCTACAGATTTGGTAATTGTTTTAAAGCCGCAAAGCGAATGGAAAAGTAAAAAATCATATCAAGAACTAAGCGATGAAATTTATGAAAAGTTGAAGGTTATTCCAGGTGTGTTTTTTGAACAAAACCAACCGATACAAATGCGCTTTAATGAGTTGATGACAGGCATTCGGCAAGATGTAGCAGTAAAAATTTTTGGTGAAAACTTAGATAGCCTTCAGCAATATGCACAGCAAGTTGCTAATGTAATTTCTTCTGTAGAAGGTGCTTCTGCTCCGCAGGTTGAGCAAGCAAGTAAATTGCCACAAATAAATATTGATTACGACCGAACTCGCCTCGCAAATTATGGCATCACGGTGAAAGAAGTAAACGATGCAGTAAATACCGCGTTTGCAGGTAAAGTAGCCGGGCAAGTGTTTGAAAACGAAAGACGATTTGATTTGGTAGTCCGCTTAGATAGCTCATATAGAACAGATATTGATGATGTAAAGAACTTAACCATTACTACCGGCAATGGCATGCCAATTCCGCTTTCGCAAGTTGCTAATATAAGCTATAAATTAGGACAGTCGCAGATAAGCAGAGAGTGGAGCAAACGCAGAATTGTAATCGGTTTTAATGTGGAAGACAGAGATGTGCAAAGTGTGGTCAATGAAATTCAAGAAAAGCTGGATAAAAAAGTAAAACTGCCGGCAGGATATTATTTTACCTATGGCGGACAATTTGAGAATTTGCGCGAAGCAAGTAATCGCTTAATGATTGCCGTGCCTTTGGCGTTAGTTCTCATTTTCCTTTTGCTGTATCTCACATTCCATTCTGCCAAACAAGCAGCACTTATTTTCACAGCAATTCCAATGAGTGCCATTGGCGGAGTTTTGGCTTTGCTTGTTTGCGGTATGCCATTTAGCATAAGTGCCGGAATTGGCTTCATTGCTTTGTTTGGCGTTGCAGTTTTAAATGGAATTGTTCTTATTGGCACATTTAATCAATTGGAAAAAGAAGGCGTAACCGATATTATGAAGAGGATAATTGATGGCACAACAGAAAGACTTCGCCCGGTGCTAATGACTGCTACAGTTGCCAGTGTTGGGTTTTTACCAATGGCAATAAGCACAAGTGCGGGAGCTGAAGTTCAAAAACCCTTAGCAACAGTTGTGATTGGTGGTTTAATTTCGGCAACTTTTCTCACCTTGTTTGTGTTGCCACTTTTGTATTTAATATTTAATTCTAAACAAAAATTTGCGATGAATAAAAGCGCTATTTTGTGTGTGTTGTTGCTGCTTTGTTTCAGTGCCAATGAAAATTTGGTGGCACAAAATTCTTCAATCATAAGCATGGAAGAAGCCGTGAATTTAGCACTCAAAAATAATGGAACAGTAAAAGCAAAAGCCTTGGAATACAGTGCAGCAAAGAGTTTGAAAGGCACAGTTGGTGAAATTCCAAAATTGGAATTTAATGCACAGTTAGGTCAATACAACAGCATTGCTTTCGACCAATCGTATCAAGTTTCCCAAAGTATTCCTTTTCCAAGTTTATTTGTTGCCCGCAAAGCATTGGTGAATGCAGAAACAAAGAGCAAAGAAGTGCAAAAGCAATTGGCTGAAGTTGATTTAAAAAGCCAAGTGCGTGCTTACTATTGCGAGATTCAATACTTACAGCATAAGCAGGATAAGTTAAGGCATTTAGATAGCTTGTATCAAGATTTTATCAATATTGCAGCGCTAAGATTTCGCACTGGAGATACAAGAAAAGTAGAGGTGAGTTCTGCAAAAGCACAAAGAGGCGAAGTGAATTTATTACTGCTCCAGAATGAAGTACTATTGAAAAATGCGTTTCAAAATTTTTATGCTTTGCTTAATACAAACGAAACGTTTGAAATACTAAAAAGTGAAACACCAAAACCTTTAGTTCTAAATAATTCTTTGGATACAACTACATTGGCAAAACATCCACTAATTCAAAATTTATTGCAAGATGCAGAACTTGCAAAGCAAGCGCGAAACGTAGAAAAGTCGCAGGGTTTGCCCGATTTTACACTTGGATATGTGAACCAATCACTCACCGGTTATCAAACTATAAATGGAAGCGAAAAATATTTTAATTCTTCGAGTAGATTTCATTCTGTGAATGTTGGTATTTCAATTCCTTTAGCGTTTGCAGCAAATGCCGCGCGTATGAAATCGCTTAATTTTAAAAAGGAAGCTGCAGAAGCAAATGCGCAACAAGAAAAGAAAAAACTCACGGCAGATTTTCAAAATGTAATACAGCAATATGAGCAAAATATGGAGCAATATAATTACTATACACAGCAGGCTTTGCCCAATGCTGATGAAATAACTAATGCTGCTCGATTAAGTTACAGAACTGGAGATATTAGCTATGTTGAGTATCTTTTTAGTTTGCAAACAGCTACCAATATTCAGTTGGGTTATTTAGAAAGTATTCGCCAACTCAACTTATCAGTTATCAATATTTTTTCATTGCTAAATCAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1346
LLPFLYVPFVISPIKGIGTPELSPVSTGLGEIYQYILHPKKGSENKYNAKDLRTMQDWIVARQLNGTKGIAEVNSFGGELKQYEVAVNPNRLRAMGVSITDIFNALEQNNQNTGGAYIDKKPDALFIRGVGVVTSLNDVRNIAIKNANRSTPIFIRDVAEVRFGNAMRYGALTYNGEVDAVGGVVMMLKGENSNDVVNRIKAKIPEIQKSLPSDIVIEAYLDRAELVSRAIKTVEKNLIEGALIVIFVLVLFLGNFRAGLIVASAIPLAMLFALGMMRVFGVSANLMSLGAIDFGLIVDGAVIVVEAILHHLGLRKTMHRLTQQEMDDEVFSAASKIRKSAAFGEIIILIVYIPILSLVGIEGKMFGPMAKTVSFAILGALILSLTYIPMMSALFLSKNASSKETFSDKMVASIQKRYLPLLQKAVQAKYSIVGITVAVFIACIFIFKNLGGEFIPQLQEGDFAFHCILPQGSSLNQSIETSMQASRIIKQFDEVKMVVGKTGSAEIPADPMPFEATDLVIVLKPQSEWKSKKSYQELSDEIYEKLKVIPGVFFEQNQPIQMRFNELMTGIRQDVAVKIFGENLDSLQQYAQQVANVISSVEGASAPQVEQASKLPQINIDYDRTRLANYGITVKEVNDAVNTAFAGKVAGQVFENERRFDLVVRLDSSYRTDIDDVKNLTITTGNGMPIPLSQVANISYKLGQSQISREWSKRRIVIGFNVEDRDVQSVVNEIQEKLDKKVKLPAGYYFTYGGQFENLREASNRLMIAVPLALVLIFLLLYLTFHSAKQAALIFTAIPMSAIGGVLALLVCGMPFSISAGIGFIALFGVAVLNGIVLIGTFNQLEKEGVTDIMKRIIDGTTERLRPVLMTATVASVGFLPMAISTSAGAEVQKPLATVVIGGLISATFLTLFVLPLLYLIFNSKQKFAMNKSAILCVLLLLCFSANENLVAQNSSIISMEEAVNLALKNNGTVKAKALEYSAAKSLKGTVGEIPKLEFNAQLGQYNSIAFDQSYQVSQSIPFPSLFVARKALVNAETKSKEVQKQLAEVDLKSQVRAYYCEIQYLQHKQDKLRHLDSLYQDFINIAALRFRTGDTRKVEVSSAKAQRGEVNLLLLQNEVLLKNAFQNFYALLNTNETFEILKSETPKPLVLNNSLDTTTLAKHPLIQNLLQDAELAKQARNVEKSQGLPDFTLGYVNQSLTGYQTINGSEKYFNSSSRFHSVNVGISIPLAFAANAARMKSLNFKKEAAEANAQQEKKKLTADFQNVIQQYEQNMEQYNYYTQQALPNADEITNAARLSYRTGDISYVEYLFSLQTATNIQLGYLESIRQLNLSVINIFSLLNQ*