ggKbase home page

scnpilot_p_inoc_scaffold_71_1

Organism: SCNpilot_P_inoc_Flavobacterium_40_86

near complete RP 52 / 55 MC: 2 BSCG 50 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: comp(3..3191)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Uncharacterized protein n=1 Tax=Flavobacterium limnosediminis JC2902 RepID=V6SQ40_9FLAO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 36.3
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 595
  • Evalue 1.20e-166
  • rbh
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:KIX22432.1}; TaxID=1603293 species="Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium.;" source="Flavobacterium sp. similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 41.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 746
  • Evalue 6.10e-212
PKD domain-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 30.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 370
  • Evalue 1.40e-99

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Flavobacterium sp. 316 → Flavobacterium → Flavobacteriales → Flavobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3189
ATGAAGAAATTTCTATTAGCATTGTTAGCCGTAATTTTCTCAAATGTGGCGATTGCTCAAAACCAGCCTAACGATTGCGTCAATGCCATTACGGTTTGCGGTAATGGTACTTTTAGTTCCAATGCCAGCGGTATTGGAGCGGTTCAGGAAGTTTCCGGTTGTGGGGGAGCGGAACACAATTCGATTTGGCTAAAAATCAATGTGGTTCAGGCGGGAACATTGGGTTTTAACATTATCCCTAATGATACCAATATTGTTGTGGATTACGATTTCTGGGTTTACGGGCCAAACAGAACCTGTTCGAATCTGGGCAGCCCGATACGCTGTGCAACCACCAATCCGCAACTGGCAGGAATGACCAATAATCATACGGGAATGAACGGGGCAACAACCCTAACGCAAACAGGCCCGGGTGCTAATGGTAACGGTTATGTCCGCTGGTTAAATGTTACGCCGGGACAATCCTATTATATTGCAATTGACCGGCCGGAAGGCGATGGCGGATTTGATCTGGAATGGACCGGAACGGCAACTCTGAACGGAGGCGCTTTTGCACCGCCGCCGGTTGCCAATACTATTGCCGATTTAAAAGTGTGCAGTGCAACCCCGAATATCGGTCTTTTTGACCTGAATAGTGTAAGAAGCCAGATCAATCCGGATCTTGCCAATAATACAATAACTTTTCATACAACGCTTGCCAACGCAAACGATGGTATTGCACCATTGCCTAATATTATAGCCAATACGGTTAATCCCCAGACAATTTATGCGAGAGTAACGAATACTACTTCCGGATGCTACAGTATCACGGATTTTAAACTGATTGTTTATCCGGTTCCTACGGCTAATTTAAGTGTTGCGCCAACGGCTATATGTGCCGGTGAAAATGCAACGGTTACTTTTACCGGAACTCCGGATGGAACTATTGAATATACGATTAACGGCGGTGCAGTTCAGACAGCAGTTTTAAATGCTGCCGGGACATTTACCTTGACACAGACACTAACAGCCGACACAACTTATACCTTAAGTTATATTAAGATCATCGATAATAACGGAACGATGCTCTGCTCGCAGGCGTTGAACGCTTCTGTAACCGTAACCGTTAGTCCGCTGCCGGTAGCAACGATATCCGGAACAGCCACTATATGTTCGGGCGACGCTGCAACAATTACCTTTAACGGAACACCTAACGCTACGGTTACTTATACTTTTAACGGAGGGGCAAACCAGCAAATTGTACTGGATGCTGCGGGAACCGCCACGCTTACCGGCGGAACGGCAGGAACCTACAACCTGGTTAGTGCTGCGACTACCGGAACACCGGCTTGCAGCCAGCCTCAAACGGGATCTGTGACCATTACAACCACGTCGTTGCCTACAGCTGCAATAACAGGAACAGCTCCGGTTTGTTCCGGTACCACGGCAACGATTACTTTTAGCGGAACGCCCGGCGCAACCGTTACCTATACTGTTGATGCTAACCCAAATGAGTTTATAACGCTAAACGGAACGGGAACAGCTACAGTAACAACACCAGTCTTAACGAATTCAAGTACATACACTTTGGTTGCTGTAGCTTCTGCCGGTACACCGTCCTGTAGCCAGCCGTTAACAGCTGCCCATACGGTAAACGTTATTCAGGCACCAGTTATCAATACGCCGGCAGCTTTTGAAGTGTGCAGCAACAACAGTACTAATGCGTTTGCGGTTTTTGACCTGACAACCAGGATCAATGAAATTACCGGCGGCTATACGGCCTATACGGTAACTTTTCATGAAACGCAGGCCGATGCCAATGCGGGAACCAACCCAAAAGGACCTTTATATACCAACATTAACCCGGTGACTCAAACCTTGTATGTCAGGGTGGTTAGTGGCGGAGCCAATCAGTGTGCTTCCTTTACAACCTTATTGTTAAAGGTAATTGCACGTCCGGCACTCAATCCGGATGTGACAAACTATGAAGTATGCGAAACAAGTGTACCGGGCGATGGTTTTGAAATATTTGATCTGACGGTTAAAAACACCCAGTTAATCAACGGCCAGACCGGCGTTTCGGTGTCGTATTATATCAGCCAGGCTGATGCCCAGTCCGGAACGGCTCCGATTGTTCCGGCAACAGCGTTTCCCAATACGGGGAACCCGCAGACCATCTGGTATCAGTTGAGAAATACAACCGGATGTATAAGTGTGGGCTCTTTCCAGTTAATTGTAAATCCGTCACCGGTCATTACGCCATTAAATCCAATGAATGCCTGTAGTAACGGAACAACTACCACGGCGGCGTTTGATCTGGCATTAAACAATCCGCTTGTAACGGGTGGTGTTGCCGGTTTGCAGGTGAGTTATCACTTAACGCAGGGAGATGCTAATACCGGACTGAATCCGTTACCGATACCGTATACCAGCGGACCGGCGACCATATTTGTTCGTGTTAAAAATCCGGTAACCGGATGTTTTGCAACCACCACTTTGGAACTGAATATCACTCAGGGACCGCTTGCGGTAACCCCGCAGCCTCTGGAATATTGCGATCCCAATAACGACGGATTCGGTCCGTTCGACTTAAACGGTGTTGCAGCAGTAATAGCCGGAGGAACTATTCCGCCCGGCGTTTCGGTGACTTTCCATGAAACACCGGAAGATGCGCAATTGGAACTGAATGCTCTTCAAAGCCCTTATACCAATATCAATCCGTGGACACAAACGCTTTATGTAAACGTTAGTTATACCTTAACCAGCTGTACCAATACGGTACAACTACAGTTAATCGTACATGAAACACCGGAAGCCGTGACACCAACACCGTTAGTGATTTGTGATGACAATACAGCCGATGGTTTTGCGGCTTTTGACCTTACCGTTAAGGCATCCGAAATTTTAGGGACATTAAATCCGGCCAACCATACGCTTAGCTATCATGTGAACCTGAATGATGCACAGGCAGGAATCAATATAATCAATAACATATTCAGCTATACCAACATTACGAATCCACAGGTTATTTATGTTCGTGTCACGCATAACACAACCGGCTGTTTTGATGTTGTTTCATTAAAACTAATAGTCAACCCATTACCGGTTGTGCCAATGCCAGTACCGGCTTACTCATTATGTGACTATACCGGACTACCGTTATATGAAGAATTCGATTTATCGACTAAGATTCCGGAAATCATCGGAACC
PROTEIN sequence
Length: 1063
MKKFLLALLAVIFSNVAIAQNQPNDCVNAITVCGNGTFSSNASGIGAVQEVSGCGGAEHNSIWLKINVVQAGTLGFNIIPNDTNIVVDYDFWVYGPNRTCSNLGSPIRCATTNPQLAGMTNNHTGMNGATTLTQTGPGANGNGYVRWLNVTPGQSYYIAIDRPEGDGGFDLEWTGTATLNGGAFAPPPVANTIADLKVCSATPNIGLFDLNSVRSQINPDLANNTITFHTTLANANDGIAPLPNIIANTVNPQTIYARVTNTTSGCYSITDFKLIVYPVPTANLSVAPTAICAGENATVTFTGTPDGTIEYTINGGAVQTAVLNAAGTFTLTQTLTADTTYTLSYIKIIDNNGTMLCSQALNASVTVTVSPLPVATISGTATICSGDAATITFNGTPNATVTYTFNGGANQQIVLDAAGTATLTGGTAGTYNLVSAATTGTPACSQPQTGSVTITTTSLPTAAITGTAPVCSGTTATITFSGTPGATVTYTVDANPNEFITLNGTGTATVTTPVLTNSSTYTLVAVASAGTPSCSQPLTAAHTVNVIQAPVINTPAAFEVCSNNSTNAFAVFDLTTRINEITGGYTAYTVTFHETQADANAGTNPKGPLYTNINPVTQTLYVRVVSGGANQCASFTTLLLKVIARPALNPDVTNYEVCETSVPGDGFEIFDLTVKNTQLINGQTGVSVSYYISQADAQSGTAPIVPATAFPNTGNPQTIWYQLRNTTGCISVGSFQLIVNPSPVITPLNPMNACSNGTTTTAAFDLALNNPLVTGGVAGLQVSYHLTQGDANTGLNPLPIPYTSGPATIFVRVKNPVTGCFATTTLELNITQGPLAVTPQPLEYCDPNNDGFGPFDLNGVAAVIAGGTIPPGVSVTFHETPEDAQLELNALQSPYTNINPWTQTLYVNVSYTLTSCTNTVQLQLIVHETPEAVTPTPLVICDDNTADGFAAFDLTVKASEILGTLNPANHTLSYHVNLNDAQAGINIINNIFSYTNITNPQVIYVRVTHNTTGCFDVVSLKLIVNPLPVVPMPVPAYSLCDYTGLPLYEEFDLSTKIPEIIGT