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scnpilot_p_inoc_scaffold_178_3

Organism: SCNpilot_P_inoc_Flavobacterium_40_86

near complete RP 52 / 55 MC: 2 BSCG 50 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: comp(10671..14120)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
PKD domain containing protein n=1 Tax=Flavobacterium johnsoniae (strain ATCC 17061 / DSM 2064 / UW101) RepID=A5FMD4_FLAJ1 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 48.6
  • Coverage: 729.0
  • Bit_score: 628
  • Evalue 1.10e-176
  • rbh
PKD domain-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 48.6
  • Coverage: 726.0
  • Bit_score: 628
  • Evalue 3.10e-177
PKD domain containing protein {ECO:0000313|EMBL:ABQ03639.1}; Flags: Precursor;; TaxID=376686 species="Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium.;" so similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 48.6
  • Coverage: 729.0
  • Bit_score: 628
  • Evalue 1.50e-176

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Flavobacterium johnsoniae → Flavobacterium → Flavobacteriales → Flavobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3450
ATGATTAGTATAAAATTGAAAAATTTAGTTTTAATAGTGTTTTTACTATTGTCTGGCATGACTGTTTTGGCTCAGGTTTCTCCGGAAGAAAGACAGGCACTGGTTGATATATATAACAGTACTAATGGTAAGCAATGGAAAAACAATAAAGGCTGGGATGTCACGAATCCTAAGGCAATTGTGACTTCCTGGGATGCTGCAAAGAAAACGGGATGGTATGGTGTAACGGTTAAAGACGGACATGTTACCGATATTGTTTTAAACGACAATAATCTTGTTGGAGAATTAAAAGCAGATCCGGATGCATTTCAGGCGTTGACCCGTTTTTTAATTAATGGGAATAGAGTAACCGGCGAATTAGCCGAAGATTTGCTGGAGCCAATGGGAGAGTTGCCTAAATATATGGACAGCGCTCCAATGGCGACACAAGCTACAGTGGCTAAGAGTGTAGTGGAATCAAAGGAGACAAAGGTTGTAGCGGATAACGCAACGACAGTAACAACCGATAAAAAGCGTTGGGAATCGTGTACCAGAAATAATGTCAATTCACCGATAGTAAAAAATATATTCCTGAAGTTTATAAAATACCTGGTTAATGCTAAAAATAGTGGTGTACCGGATTACCAGATTGAAGGAAGTAACCCTCCGGAATTTAACGCATTAAAACCATTTATTACAGATCCGAATCCTAAGATATCACATTTCGGTACCGATGTTGATCCTTCTAATAATCGTTTAAGGGAAATGCGTTTTTCTTTTACTGGGGATCATGGTGAGTATGATGTTCGGCTTTACGGTGATTTTTCGGATATCGCCTATGTTAATTTTGACATTGATTTAAGTGGTTATACCGATTTTCATCATTATTTGAATTTGCAAGGAGATTATTCAGATAATTATCCTGGCTATAGAATCCATTTAAAGGAATTTGAGTTTATGCACATTGATTTCTGCCCAGATAAATTACCCGTTTGTGGTGACAAAAACAGAATGATATTATCAAGTTCTTCCGGATTGGAAACCTTGTGTTCCGGGCAATTTATTAAGGCTACTTTCTATCCTTCTATGTCCAGTGCCGATTATAATATCACGGTTCAAAATTCAAGTGGCGTTACCGTGTATGCCGGTACATATAGCGGTGCAAGTGAGGTGTATATCAATGCGCTTGAAGCGGGTACGTATACGCTTTATATGGATGTTATGAATTATGATAGCGGCTGTACATTTTCGGTTCAACAACAGTTTACGGTTCAGAATTGTGGTACTTTTTGTGCTTCTAATAACCCAAATTCGATTATTGTAAGACATTTATATATTAACCTGATAAATCATTTGGTAACCAAAATGGTGACCGATGGTATGATAGCAGATGGGTATTTTCCACCACAATTGAGTGCTTTGGCGCCGTATATTTCGGATCCGAATCCTAAAATTTATAATGCACACTTTGCAAATCACGGGGAATATTTCCGTTTTTCATTTGCCAATCATGGAAGTGATTATGACGTTTCGCTTCGATATACGCCAAATACCACTGTAACCGGTATCGATTTGTCCGGATATTCATCGGCCAATTTAGTTTCGACTATTCCGGTGCTCTTAAATACGAATGCAATGGAGCCGAATCATACGGTAAAACATATCGATTTTTGTCCGGCAACACCTGTATATTGTACGACAACGAATCCAAATGCTCCGATAATTAAAACCTTGTTTCTTAATTTGATCAATAAATTAAGATCACTCCCTATCGGTGGTGTGCCTAATGGGTATACCTGTACGGAATTAACAGCTTTGGCGCCGTATATTTCGGATGCAAATCCTAAGATTTACAACTTTATGAATTCGGGAGGATCGATATCATTCTCCTTTAATCCACACGGATCGCAGTATGATGTGGTAGTGCCTCTTTTAGGTAATTTTAGTATCACAAATGTGGAGTTCAATAATTATGTTACGTCGGATATGCAGGCGACATTCAAAACGACTTTCAGTAATGGTTCGGTAAATAACAACGGCGGAAAGGTTAAGCATATCAATTTGTGTCCGGACGAACTGTACTGTGTGTCGCACGTGGCAATCGTAGTGGACGAATCCGGATCGCTTGATGATACCGAAATCCGAAAAATCAAAAAACAACTAAAAGCATTTGTTCAGCAACAGGCCGATACGAATGATAATTTAGGAACGAATATTTATATTTCCCTGATCGGTATGTCCGACAGTGATACCTATAACAGAACCGATGCGATTATGCAGGTTAAGGTTACCAATGGCTCGACTTTAAATCAGTTTAATAACTGGATTAACGGTTTTGGTGCCCGATACGGTCAATCGGGAATCAGTCATGGTTCCGATTACTGGAACGGTGCTTTACAAAAAGCATTAAGCACTACGATGAAACCGAAGGGGGTTATTATGATCACCGATGGTTGTCAGACAGCAAATGTTTCGCAGTTGGTTAACACGATGAAATTATTTGATAATTATAGAAATCCGGCGAATCCAACAACCCCATTAACACCAAATGGTTCGCATTTATATGTACTGGGAATCGAAAATGGTTTCTATGTGGATTCAGAAACGGTAGTAAGTCAGCGAATGGCTCAAAACCAGGATCCTAATCTAAATCCAGCTTTGGTAGCACCTACGTTGCAGACTAACGATTTTGCCCGAATTGCCGCGGTTGAACATACCGATGTGATTCAAACACAAGCGGAGTCACGCCTTAGAAAATCATTAAAATTCTTATTGGGTTATCCTGCAGATCAATTCCCGGTAGCGAGTATCGATTATTTTAAGCCAGCCGATTATTATGGTCATGATAACTTTAATATCCTGGGTTCAGATGATCGTTACCTTTCGGAGAAATTGGTAGACAGTCAGATTTCTTGTGGAATCTCCATTACAAAAGATTTTTGTGAGGATTGTTATTCGTTCCAACCGGAACCCGGAAAGGAATATATCTTAAGTGCCTGGGCAAAAGAAGAAACGAACGAGCAGTTTAAAACATTTGTGAATCCTGCGATTACACTGATTTTCTATCACAACAAACAGGCATTGCCGCAACACGAAATAGCGAGAATAACGGCAACACCTTCCGGTGAAATTATCGACGGATGGCAACGCATCTTTACCAAATTTAAGATTCCGTATTCGACAACAAGTGCTATCAATAATACCATTTCAATTGGAATTGAATTAACGAATAATAGCCCGAGTATTCCGGTTTATTTTGATGATATACGGGTGCATCCTTTAAAAGGTAGTATGAAATCATTTGTATACGATCCGGAAACCTTTAAGCTGATGTCGGAATTAGACGATAACAACTACGCTACTTTTTATGAGTATGACAATGAAGGCGGACTGGTGCGTGTTAAAAAAGAAACGGAGAGAGGTGTGAAAACCATTCAGGAAACCCGTTCCGGAAGTGTAATTAAAAACTAA
PROTEIN sequence
Length: 1150
MISIKLKNLVLIVFLLLSGMTVLAQVSPEERQALVDIYNSTNGKQWKNNKGWDVTNPKAIVTSWDAAKKTGWYGVTVKDGHVTDIVLNDNNLVGELKADPDAFQALTRFLINGNRVTGELAEDLLEPMGELPKYMDSAPMATQATVAKSVVESKETKVVADNATTVTTDKKRWESCTRNNVNSPIVKNIFLKFIKYLVNAKNSGVPDYQIEGSNPPEFNALKPFITDPNPKISHFGTDVDPSNNRLREMRFSFTGDHGEYDVRLYGDFSDIAYVNFDIDLSGYTDFHHYLNLQGDYSDNYPGYRIHLKEFEFMHIDFCPDKLPVCGDKNRMILSSSSGLETLCSGQFIKATFYPSMSSADYNITVQNSSGVTVYAGTYSGASEVYINALEAGTYTLYMDVMNYDSGCTFSVQQQFTVQNCGTFCASNNPNSIIVRHLYINLINHLVTKMVTDGMIADGYFPPQLSALAPYISDPNPKIYNAHFANHGEYFRFSFANHGSDYDVSLRYTPNTTVTGIDLSGYSSANLVSTIPVLLNTNAMEPNHTVKHIDFCPATPVYCTTTNPNAPIIKTLFLNLINKLRSLPIGGVPNGYTCTELTALAPYISDANPKIYNFMNSGGSISFSFNPHGSQYDVVVPLLGNFSITNVEFNNYVTSDMQATFKTTFSNGSVNNNGGKVKHINLCPDELYCVSHVAIVVDESGSLDDTEIRKIKKQLKAFVQQQADTNDNLGTNIYISLIGMSDSDTYNRTDAIMQVKVTNGSTLNQFNNWINGFGARYGQSGISHGSDYWNGALQKALSTTMKPKGVIMITDGCQTANVSQLVNTMKLFDNYRNPANPTTPLTPNGSHLYVLGIENGFYVDSETVVSQRMAQNQDPNLNPALVAPTLQTNDFARIAAVEHTDVIQTQAESRLRKSLKFLLGYPADQFPVASIDYFKPADYYGHDNFNILGSDDRYLSEKLVDSQISCGISITKDFCEDCYSFQPEPGKEYILSAWAKEETNEQFKTFVNPAITLIFYHNKQALPQHEIARITATPSGEIIDGWQRIFTKFKIPYSTTSAINNTISIGIELTNNSPSIPVYFDDIRVHPLKGSMKSFVYDPETFKLMSELDDNNYATFYEYDNEGGLVRVKKETERGVKTIQETRSGSVIKN*