ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

scnpilot_p_inoc_scaffold_1291_20

Organism: SCNpilot_P_inoc_Flavobacterium_40_86

near complete RP 52 / 55 MC: 2 BSCG 50 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: 18991..23418

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
Conserved repeat domain protein n=1 Tax=Pedobacter heparinus (strain ATCC 13125 / DSM 2366 / NCIB 9290) RepID=C6Y085_PEDHD similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 35.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 714
  • Evalue 2.50e-202
  • rbh
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 35.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 714
  • Evalue 7.20e-203
Conserved repeat domain protein {ECO:0000313|EMBL:ACU04797.1}; TaxID=485917 species="Bacteria; Bacteroidetes; Sphingobacteriia; Sphingobacteriales; Sphingobacteriaceae; Pedobacter.;" source="Pedobacte similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 35.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 714
  • Evalue 3.60e-202

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Pedobacter heparinus → Pedobacter → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4428
ATGAACGAAAATTACAGTTATAGCGACAAGCATTTGTCCTATCGACAGAGAAGTGATTTTTTTCAATCCTTTACAATGGTTTTGAAAAAAATGATTTTCTTGTTCTTTATTTCAGTTATTACCAGTTTTTGGACACAAATGTCGGCGGAAGGTAGTAAAGATTTCTACCCGTCCGGCGTTAGCGGAAACCGGGCTTTTTTATACAGTAATAGTTATGAAGCCGGGGGAACGACTATCAGGTCATGGCCGTTTAAAACATTAGGGACGCACTATGTTTATGCCAAAGTTGGCGAAACGATTGCGGTAGCTTCCAGTGCTCAAAATGCCGGAAACGGTAAGATAAGACTGATTGCTCCGGATGGAACGGTTTATATTACGGCAAGTAATAATATTGGTAGGATTGCCAGCAGAACAGAAGAGCTTGCCGGACCTTTATATCCGGGTCAGGCTGCAGGCAGTAACCGCTACCAGCCGTTCAATACGGTTGTTGGTACCGGACAGGAAGGTGTATGGAGAGTTGAATTTCTGCCATCCGGTTCAGAGACCAGCAGCAGTACGCCGGGTGTAACCGATGTGGCAGCAGATGCCAACTGGACACAGGGAACCAATACGGAACTTATTGCTGCCTGGGATGTTTCGGTTAGAAACAGCGGCAACTCAGCCTGGGTTAACGGACGTGTTTATACAAATGTATTAAATCTGCATATATCCGGAAGCGCATTTACGGCTAACAAAGCATTCTACGGAAGCATGTATGTGTTAACAAGAGACGGTATTGCTTATAAAGTAGTTAATAATGGTTCGAATGGTGTTGGATTTACATTCTTTGTAAACAACAAAGGATTTTTAAATACGGCAAACTCACCGTCTTATAAGAGTTTGAATATTTCTGATCCGTTGGACAGCCAGTTCCGGATTCACGATCCGAGAAGTGCTGATGCTGCTTCCAATGTGACCCATAAGATATTTTACGGTAAACCTGCTTTAGATTTACCAACCAGCGGTAATATGAGTGGTGGAATGACCTGGCTGAAAAATGCCGTGCTAACACCAACAGCTACAAATATTACCTATACAGGAGTAGAAGGAACACCGGATTTGTCCGGTAATAAAGGAGCCCATATCGGCTTTGATTCCAATCTTTCCGGAACATACAGAATAGAAATTATAGGAGATTTTCCAACGAGAATTATCAACGGAAACTGTACGGTAGGAACCAATACGGTATTCTGGGATGGTAAAGACGGTAACGGGAACATACTTCCGGCCGGAACGAACATTGGCGAAATCAGAGTACAGTTATTCGGAGCAGAAGTCCATTTCCCTTTTATTGATATGGAAATTAATCCCGGCGGAATTATTATTGAACAATTGGATACCAATTATGATGTATATGTGCCGACCCGTGATTTGGTATATTGGGATGATTCCGATGTAACCGGCGGTATGGCAACACATAAGTCAAACCCGATTGCATCCGGAATTACCGGAATTTCCAGTAACAGTAACGGACACAAATGGGGCTTGTATACTTCCGGAAGCAGCGGCAGCGGAAATAGCGGTACCGGTTCTTCCAGTTTCGGAAATGAAAAATCAATGGATACCTGGAGCTTTGTTCCGGGTCAGGTAATTGTGAAAAATCTGGATGTGGTTGTTGCTGCAGCCGATTTAGAAGTGGTGAGCATTACGCCTTCCACAACAACCGTCAATGTCGGACAGCAAATGAACTATACCGTAACGGTAGTCAATAACGGACCAAGTGCGGTAACCGGTGCAGGCTTTACCTTTATAGTACCTTCCGGTTTTACAATTAATACGGTTTCCTATGTAAATAGCCAGGGAACTGTAGTAGTCGTGAATGGCACAATAGATCCGGTTACCGGTAACTATACGGCTAATCTGGATATGACCAATGGCGGACAGATTGTGTTCACTTTTACCGGAACGGTTGGTGCTGCTTTAGGTGGACAGCCGTTAACTGTGGAGGCGAGTATTATCAGACCGGCCGATGTAACCGATCCGGATGCGACAAATCCGGGAACGAATCCGCCAACAAATCCACATGTGGAATGTTTGAACGGAACAACAACCGAGAATTGTAATAATATCAAGTACAATACGATCACACCGGCTGTTACTGCTGATCTGGCAGTTTTAAAAATAGCCGATAATATGACACCTATGGTAGGTGAGTCGATAACTTTTACTATTGTAGCAACAAACAACGGACTGAACAATGCGACTAACGTAAGCGTTACCGATCAGTTACAGGACGGCTATGCGTATGTGTCTTCTACAGTTACTACAGGAACGTATAATGCTAATAACGGTTTGTGGACAATTGGTAACTTAGCCAATGGAGCAATAGCAACATTAACGATCACGGCTACCGTTACGGCAACAGGAAATTATGGAAATACAGCTACCATTACCGGAGCTGAAACAGATCCTAATGTAACGAACAACACATCGACTATCATACCGACAAGAAGATTAAACATTATCGATGCGGTTAACGATTCTGTAACAAACGTAAACGGTTATACCGGCGCAACAAACGTGGTGAATGTGTATACCAACGACACCTTAAACGGAACGGCGGTAAACCCATCTCAGGTAACGCTGACGACTACGGTTTCGAACCCGAATTTGATCTTAAATCCAAACGGAAGTGTGGATGTTATTCCGGGTACACCGGCAGGTCCATATACTTTGACTTACCAGATCTGCGAAATTGCCAATCCAACGAATTGCGATACAGCAACAGTAACAGTAACGGTGGTTGCACCAGTAATTGATGCGGTTAACGATTCGGCAACAAACGTAAACGGTTATACCGGCGCAACAAACGTGGTGAATGTATATACCAACGACACCTTAAACGGAACAGCGGTAACCCCATCTCAGGTAACGTTAACGACTACGGTTTCGAACCCGAATTTGATCTTAAATCCAAACGGAAGCGTGGATGTTATTCCTGGTACTCCTGCAGGTCCATATACTTTGACTTACCAGATCTGTGAAATTGCCAATCCAACGAATTGCGATACGGCAACAGTAACAGTAACGGTGGTAGCACCTGCAATTGATGCGGTTAACGATTCGGCAACAAACGTAAACGGTTATACTGGCGCAACGAATGTGGTGAATGTTTATACCAACGATACGTTAAACGGAACAGCGGTAACCCCATCTCAGGTTACATTAACGACTACAGTTTCGAACCCGAATTTAACTTTAAACCCTGACGGAAGTGTGGATGTTATTCCGGGTACACCGGCAGGACCATATACTTTAACCTATCAGATATGTGAAATTGCTAATCCAACGAATTGTGATACGGCAACAGTAACAGTAACGGTGGTAGCACCTGCAATTGATGCGGTTAACGATTCGGCAACAAACGTAAACGGTTATACCGGCGCAACAAACGTGGTGAATGTATATACCAACGATACGTTAAACGGAACAGCAGTAACCCCGTCTCAGGTAACGCTTACGACTACGGTTTCCAATCCGAATTTGATCTTAAATCCAAACGGAAGCGTGGATGTTATTCCGGGCACACCGGCAGGACCATATACTTTAACCTATCAGATATGTGAAATTGCCAATCCGACGAATTGTGATACAGCAATAGTAACGGTAACGGTGGTAGCACCGGTAATTGATGCGGTTAACGATTCGGCAACAAACGTAAACGGTTATACCGGGGCGACGAATGTGGTAAATGTGTATACCAACGATACGTTAAACGGAACAGCAGTAACTCCATCTCAGGTTACATTGACGACTACGGTTTCCAATCCGTATTTAACGCTAAATCCAAACGGAAGTGTGGATGTTATTCCGGGTACACCGGCAGGACCATATACCTTAACCTACCAGATATGTGAAATTGCCAATCCAACCAATTGTGATACGGCAACAGTAACGGTAACAGTGGTAGCTCCTGCAATTGATGCGGTTAACGATTCGGCAACAAACATAAACGGTTATACCGGCGCAACAAACGTGGTGAATGTGTATACCAACGATACCTTAAACGGAACAGCGGTAACTCCATCTCAGGTAACGTTGACGACTACGGTTTCGAACCCGAACCTGATCTTAAATCCAAATGGAAGTGTGGATGTTATTCCGGGCACTCCGGCAGGACCATATACCTTAACCTACCAGATCTGTGAAATTGCCAATCCAACCAATTGCGATACGGCAACAGTAACGGTAACGGTAGTAGCTCCTGCAATTGATGCAGTTAACGATTCGGCAACAAACATAAACGGTTATACCGGCGCAACGAATGTGGTGAATGTTTATACGAATGATACGTTAAACGGAACAGCGGTAACCCCATCTCAGGTAACGTTAACCACTACGGTTTCGAACCCGAATTTGATCTTAAATCCAAATGGAAGTGTACGATAA
PROTEIN sequence
Length: 1476
MNENYSYSDKHLSYRQRSDFFQSFTMVLKKMIFLFFISVITSFWTQMSAEGSKDFYPSGVSGNRAFLYSNSYEAGGTTIRSWPFKTLGTHYVYAKVGETIAVASSAQNAGNGKIRLIAPDGTVYITASNNIGRIASRTEELAGPLYPGQAAGSNRYQPFNTVVGTGQEGVWRVEFLPSGSETSSSTPGVTDVAADANWTQGTNTELIAAWDVSVRNSGNSAWVNGRVYTNVLNLHISGSAFTANKAFYGSMYVLTRDGIAYKVVNNGSNGVGFTFFVNNKGFLNTANSPSYKSLNISDPLDSQFRIHDPRSADAASNVTHKIFYGKPALDLPTSGNMSGGMTWLKNAVLTPTATNITYTGVEGTPDLSGNKGAHIGFDSNLSGTYRIEIIGDFPTRIINGNCTVGTNTVFWDGKDGNGNILPAGTNIGEIRVQLFGAEVHFPFIDMEINPGGIIIEQLDTNYDVYVPTRDLVYWDDSDVTGGMATHKSNPIASGITGISSNSNGHKWGLYTSGSSGSGNSGTGSSSFGNEKSMDTWSFVPGQVIVKNLDVVVAAADLEVVSITPSTTTVNVGQQMNYTVTVVNNGPSAVTGAGFTFIVPSGFTINTVSYVNSQGTVVVVNGTIDPVTGNYTANLDMTNGGQIVFTFTGTVGAALGGQPLTVEASIIRPADVTDPDATNPGTNPPTNPHVECLNGTTTENCNNIKYNTITPAVTADLAVLKIADNMTPMVGESITFTIVATNNGLNNATNVSVTDQLQDGYAYVSSTVTTGTYNANNGLWTIGNLANGAIATLTITATVTATGNYGNTATITGAETDPNVTNNTSTIIPTRRLNIIDAVNDSVTNVNGYTGATNVVNVYTNDTLNGTAVNPSQVTLTTTVSNPNLILNPNGSVDVIPGTPAGPYTLTYQICEIANPTNCDTATVTVTVVAPVIDAVNDSATNVNGYTGATNVVNVYTNDTLNGTAVTPSQVTLTTTVSNPNLILNPNGSVDVIPGTPAGPYTLTYQICEIANPTNCDTATVTVTVVAPAIDAVNDSATNVNGYTGATNVVNVYTNDTLNGTAVTPSQVTLTTTVSNPNLTLNPDGSVDVIPGTPAGPYTLTYQICEIANPTNCDTATVTVTVVAPAIDAVNDSATNVNGYTGATNVVNVYTNDTLNGTAVTPSQVTLTTTVSNPNLILNPNGSVDVIPGTPAGPYTLTYQICEIANPTNCDTAIVTVTVVAPVIDAVNDSATNVNGYTGATNVVNVYTNDTLNGTAVTPSQVTLTTTVSNPYLTLNPNGSVDVIPGTPAGPYTLTYQICEIANPTNCDTATVTVTVVAPAIDAVNDSATNINGYTGATNVVNVYTNDTLNGTAVTPSQVTLTTTVSNPNLILNPNGSVDVIPGTPAGPYTLTYQICEIANPTNCDTATVTVTVVAPAIDAVNDSATNINGYTGATNVVNVYTNDTLNGTAVTPSQVTLTTTVSNPNLILNPNGSVR*