ggKbase home page

scnpilot_p_inoc_scaffold_1104_32

Organism: SCNpilot_P_inoc_Chlorella_nuclear_28_4

partial RP 0 / 55 BSCG 4 / 51 ASCG 4 / 38
Location: 26287..27462

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Putative F-box_LRR-repeat protein n=1 Tax=Megavirus courdo7 RepID=H2EBS9_9VIRU similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 31.1
  • Coverage: 376.0
  • Bit_score: 147
  • Evalue 2.50e-32
Marine sediment metagenome DNA, contig: S01H4_L05515 {ECO:0000313|EMBL:GAG82812.1}; Flags: Fragment;; TaxID=412755 species="unclassified sequences; metagenomes; ecological metagenomes.;" source="marin similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 50.5
  • Coverage: 208.0
  • Bit_score: 217
  • Evalue 4.70e-53
inlA; ChW repeat-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 32.7
  • Coverage: 376.0
  • Bit_score: 113
  • Evalue 1.90e-22

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

marine sediment metagenome

Sequences

DNA sequence
Length: 1176
ATGTCAATTTGTGGTGATATATACAATATTATAGCCAACTATCTTCCATTAAAGGACTCAATAAAACTGCAGTATTTGTGTAAAAATTTATTTGAATACAAAGCGGAACATTTTATATTTGACAAAATCAATATTAGTTTTTTAGAGAAACATTGTGATTCAATAGTCAGATTGGAAATTATAAATATGGATGAACATGATAATTATACTGACGATAAAATAAATGATAACATAATATCAAAATTTAAAAATCTAAAATGTGTTATATTACCAGGTAACAATAATATAACGGATAATGGATTAGTACATTTAAAGGGCATTCATACTTTAGATTTAAATTGGAACAATAATATAACGGACAATGGATTAAAACATTTAAAGGGTATTCATACTTTGGATTTAAATTGGAACATGAATATAACTGATAATGGATTAGTAAATTTAAAAGGTATTCACACTTTAAAGTTGAATTACAATGATAATATAACAGATGATGGGTTAATACATTTGACAGGAATTCACACTTTAAATTTGTTTTCGAGTAAAAATATAACAGATGACGGATTAAAACATTTAAAGAATATTCATACTTTAAATTTAAGTAATAACAAAAATATAACAGATGATGGATTGAAATATTTAAATGGTATTCATACTTTAAATTTAAGTAATAACAAAAATATAACAGACGATGGATTGAAATATTTAAATGGTATTCATACTTTAAATTTGAATAATAATGAAAACATTACAGATAATGGATTGAAACATTTAAATGGTATTCACACTTTAAGTTTGATTAATAATAAAAACATAACGGATAGCGGATTGGTTCATTTAAAAAATATCAATACATTGGATCTATGGTCAAATGTAAATATAACAAATAATGGATTACAACATTTAAAAGGTATTCATACTTTAATTTTGGGTGCGAACAAAAATATAACAGATAAAGGATTAAAACATTTAAAAGGCATTCATACTTTAGATTTATATTGGAATACAAATGTAACGGACAATGGACTAAAATATTTGAAGGGTATTCGCACTTTGAATTTACATAATAATACAATTATAACAGACAATGGCTTGGCACATTTAAAAGGGATTCATACTTTAATTTTGGATTGCGGCGAAAATATAACAGATAACGGATTAAAACATTTAAAATGA
PROTEIN sequence
Length: 392
MSICGDIYNIIANYLPLKDSIKLQYLCKNLFEYKAEHFIFDKINISFLEKHCDSIVRLEIINMDEHDNYTDDKINDNIISKFKNLKCVILPGNNNITDNGLVHLKGIHTLDLNWNNNITDNGLKHLKGIHTLDLNWNMNITDNGLVNLKGIHTLKLNYNDNITDDGLIHLTGIHTLNLFSSKNITDDGLKHLKNIHTLNLSNNKNITDDGLKYLNGIHTLNLSNNKNITDDGLKYLNGIHTLNLNNNENITDNGLKHLNGIHTLSLINNKNITDSGLVHLKNINTLDLWSNVNITNNGLQHLKGIHTLILGANKNITDKGLKHLKGIHTLDLYWNTNVTDNGLKYLKGIRTLNLHNNTIITDNGLAHLKGIHTLILDCGENITDNGLKHLK*