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scnpilot_p_inoc_scaffold_1328_15

Organism: SCNpilot_P_inoc_Chlorella_nuclear_28_4

partial RP 0 / 55 BSCG 4 / 51 ASCG 4 / 38
Location: 13253..15136

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
long-chain fatty-acid-CoA ligase (EC:6.2.1.3) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 32.4
  • Coverage: 620.0
  • Bit_score: 305
  • Evalue 3.30e-80
PREDICTED: long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1 n=1 Tax=Mesocricetus auratus RepID=UPI0003597E48 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 35.2
  • Coverage: 625.0
  • Bit_score: 358
  • Evalue 1.50e-95
Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1 {ECO:0000313|Ensembl:ENSRNOP00000074226}; TaxID=10116 species="Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Euarchonto similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 35.4
  • Coverage: 625.0
  • Bit_score: 357
  • Evalue 3.60e-95

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Rattus norvegicus → Rattus → Rodentia → Mammalia → Chordata → Metazoa

Sequences

DNA sequence
Length: 1884
ATGAATATAGTCGAACATTTAAATGATTACACATTGATATTTATTATTATATTGATTTTTTCCATTTTTATAATTTGTTCATTATATATATATTATTTTTATGATACCACTTCTGAATTAAAAGAAGGAATTATGATTCCTCCAGAAATATTCACAAAAGATCAAAAGCTCAGAGGAACAATTATTGACATATTTAATAAAGTATCCAACAAATACCCCAACTTATCAGCAATTATGTTTAAAAAAAGAAATGGTGAATATGAAAAGGTAACATATTCTGAATATTTTAATAAAGCATTAAATTTTGCCGAAAGTGTAAATTATTGGTTGGGACCCAAAATTAATACAGTAATCTTGGGATCTAATAGTGCTGGCTGGTTTTATTCTCATTTGGGAACTATGATAAATGGAGGTATATCCATTGGCATATATCCAACTAGTTCATCTGATCATATTCAATATGTATTAGCAAATAGTGACGCCAAAATATTAGTTGTGGATGGTGAAGAACAACTTCAAAAATTAATTGGTAATGATATTAACGAAATTAAAATGATAATCTATTACTCTCCTATTAAAAAAGAATTAATTGAAAAATTTACTATTCCTGTCGTAAATATGGTTAATTTTATGACTGAAACAAAATCCATCAACCGTGAAGATTATCCTCAACTTGATGATGTTGCAACTCTTATTTATACTTCTGGAACTACCGGTAATCCAAAAGGTGCTATGATCACTCATAAAAATATTATGGCTTCTGTTTATTCTATTGTAAATGATATACAAAATGTTAGTGGACAAAAATTATATATTGCCGAAAAATTTATAAGTTACTTGCCATTAAACCACATATTGGCACAGTTAATGGATATTTATATACCTATATGCACAATGGGAACTGTATGGATTGCCGACAAAAATTCACTTAAAAATAATTTTTCCGAAACTCTTAAACAAATACAACCAAGTGTCTTTATTTCTGTTCCAAGAATATGGGAAAAAATTACTGAAAAAATAAATGAAAAACTTGACGAATTAGGAATTAAGGGAAAGTTTATTAAATTTTTTAATAGTAAAAAAATAATTTCAGAAATAGGTCTTGATAAATGCAAATTATGTGTTACCTCAGGATCTCCCCTGTCATCTTCATCCAGAGATTTTCTTGGTAGTATTGGACTTCAATTATATGATGTTTATGGAATGACTGAATCGACTGGACCTATTTCTTTATCCTTTGATAATCAACACAAATTGAATAGTGTTGGTAAAGTTATTTCGTGCTGCAAAATTAAACTTGCGGATGATGGAGAAATTCTTGTCAAAGGTCCCACCATTTTCAAAGGATACTATAACGATGATAAAGCTACTGATAATATTATTGATGATGGATGGTTGAAAACTGGTGATTTAGGACATATTGACAATGATGACTTTCTATATATAAAAGGTAGAAAGAAGGACATAATTATAACAAGAGGAGGTGAAAATATTTCTGCCAATAATATGGAAGAGGCTCTCAAAATTAATTTACCTATTATAAACTATGCTGTTCTTGTTGGTGATAATAAAAAGTATCTTACTGCATTACTTGTCGTAAAAACTAAAAATGATTTTTCTGATGAAATTCACTCTGATCTTAAAAAAATTGATACAAACATCAATAATTTGGATGATGTTATTAAAAGTGATAAAATACAACAATTTATAAATAATGGCATTAATAATGTTAATAAAAAAGCTGATAATAATATAAATATTATTCAGAAATGGAAAATTGTGCCTGGTAATTTTAAAATTAATCAAGAACTTACACCAACATTAAAAATAAAAAGATTTTATATCTACAAAAAATACAAAAAACTTATAGATTCAATGTATTAA
PROTEIN sequence
Length: 628
MNIVEHLNDYTLIFIIILIFSIFIICSLYIYYFYDTTSELKEGIMIPPEIFTKDQKLRGTIIDIFNKVSNKYPNLSAIMFKKRNGEYEKVTYSEYFNKALNFAESVNYWLGPKINTVILGSNSAGWFYSHLGTMINGGISIGIYPTSSSDHIQYVLANSDAKILVVDGEEQLQKLIGNDINEIKMIIYYSPIKKELIEKFTIPVVNMVNFMTETKSINREDYPQLDDVATLIYTSGTTGNPKGAMITHKNIMASVYSIVNDIQNVSGQKLYIAEKFISYLPLNHILAQLMDIYIPICTMGTVWIADKNSLKNNFSETLKQIQPSVFISVPRIWEKITEKINEKLDELGIKGKFIKFFNSKKIISEIGLDKCKLCVTSGSPLSSSSRDFLGSIGLQLYDVYGMTESTGPISLSFDNQHKLNSVGKVISCCKIKLADDGEILVKGPTIFKGYYNDDKATDNIIDDGWLKTGDLGHIDNDDFLYIKGRKKDIIITRGGENISANNMEEALKINLPIINYAVLVGDNKKYLTALLVVKTKNDFSDEIHSDLKKIDTNINNLDDVIKSDKIQQFINNGINNVNKKADNNINIIQKWKIVPGNFKINQELTPTLKIKRFYIYKKYKKLIDSMY*