ggKbase home page

scnpilot_p_inoc_scaffold_1350_9

Organism: SCNpilot_P_inoc_Chlorella_nuclear_28_4

partial RP 0 / 55 BSCG 4 / 51 ASCG 4 / 38
Location: 4842..6275

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Putative F-box/LRR-repeat protein n=1 Tax=Megavirus lba RepID=L7Y4Y8_9VIRU similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 28.0
  • Coverage: 461.0
  • Bit_score: 148
  • Evalue 1.40e-32
Marine sediment metagenome DNA, contig: S01H4_S01559 {ECO:0000313|EMBL:GAG84954.1}; Flags: Fragment;; TaxID=412755 species="unclassified sequences; metagenomes; ecological metagenomes.;" source="marin similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 42.2
  • Coverage: 256.0
  • Bit_score: 191
  • Evalue 2.00e-45
LRRCC1; leucine rich repeat and coiled-coil domain containing 1 similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 33.1
  • Coverage: 139.0
  • Bit_score: 63
  • Evalue 2.40e-07

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

marine sediment metagenome

Sequences

DNA sequence
Length: 1434
ATGGAATTGTGTAATGATATTTTAAATTTAATAGCCCACTATTTACCACTCAAAGATATTATAAAAATGTGCAATTTAAAAAAGAATTTTATGGATCTACATTTGGAACATTATGTTTGTGACAATTATAATGAATCATTTATAAGAAAATACGCTAATTATCTACAAAAAATTGTGATGACTAAAAAGCAAAAAAATACTGTTAACAATAATTTATTACTCGATCTCAAATATCTCCAGCATATCAGTTTAACAGAAAACAATCAAATAACAGATGAAGGATTACGCAATTTAAAAGGAATTAATTTTTTTGAAATGCGCTGTGGATCATGTTCTGATGTACCAGGAGAACATGATATTCACTGTCAGGATACAATAACTGATACTGGTTTAAAATATTTCAGAGGAATTCATACTTTAGAACTTGCCTGTAATAATTGTATCACTGACAAAGGTTTGGAACATTTAAAAGGTATTCACACTCTGAACTTAAGTAATAATAATAATATAACAGACGAAGGATTAAAATATTTGAAAGGTATCCACACTCTGAACTTAAGTATTAATAGTAATATAACAGATGAAGGATTAAAATATTTAACGGGAATTCATACTTTGGACATACGTGAAGGATTTCGTATCACAGACGAAGGATTAAAATATTTGAAAGGTATCCACACTTTGAACATTTGTTTTAATAATAATATTACAGATGAAGGTTTAAAACATTTAACAGGTATTAATACTTTATATGTTGGTGGTTATATAACGGACGAAGGATTAAAATATTTAAGTGGTGTGCATACTTTAAATCTGAATCATAACAATAATAATAACATAAGCGATGAAGGATTAAAACATTTAAAAGGTATTCACAAATTATGTATGTGTGGTCATCATGTGACTGATAAAGGATTAAAATATTTAAAAGGTATTCATACGTTGCGATTGTATCGGAATGGTAATATAACCGATAAAGGATTAAAATATTTAAAAGGTATTCATACTTTGCGTCTAAGTGGCAACAATAGTATTACCAATGGAGGATTAAAACATTTGAAAGGTATTCACACTTTGTATTTAGATTGTAATGATAAAATTTCAGACAATGGATTGAAATATTTGGAAGGTGTTCAAGTTTTATGTTTCACCGGAAATAAAAATATCACTGATGAAGAACTAAAACATTTAAAAGGAATTCAGAGTTTGTATTTAATATATGATAATATTACTGACCAAGGTTTAAAATATTTAGAAAGTATCCAGAATTTGTGTATGGAATATAATAAAAATATCACAGATGAAGGATTAAAATTCTTAAAAAATGTTAAGACTATTGATTTGCCAAAGAACAATAATATAACTAAAAAGGGATTAAAATATTTAAAAAGCGTTGAATTTTTCAATTTTGGATTATCATATTCATGGTTATAA
PROTEIN sequence
Length: 478
MELCNDILNLIAHYLPLKDIIKMCNLKKNFMDLHLEHYVCDNYNESFIRKYANYLQKIVMTKKQKNTVNNNLLLDLKYLQHISLTENNQITDEGLRNLKGINFFEMRCGSCSDVPGEHDIHCQDTITDTGLKYFRGIHTLELACNNCITDKGLEHLKGIHTLNLSNNNNITDEGLKYLKGIHTLNLSINSNITDEGLKYLTGIHTLDIREGFRITDEGLKYLKGIHTLNICFNNNITDEGLKHLTGINTLYVGGYITDEGLKYLSGVHTLNLNHNNNNNISDEGLKHLKGIHKLCMCGHHVTDKGLKYLKGIHTLRLYRNGNITDKGLKYLKGIHTLRLSGNNSITNGGLKHLKGIHTLYLDCNDKISDNGLKYLEGVQVLCFTGNKNITDEELKHLKGIQSLYLIYDNITDQGLKYLESIQNLCMEYNKNITDEGLKFLKNVKTIDLPKNNNITKKGLKYLKSVEFFNFGLSYSWL*